Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

S2JJS5

Protein Details
Accession S2JJS5    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-44LGEQCAKTPRGRIRKPRVRKTVPGHIGRPBasic
101-129HLEKHPGYTFRPKPKKNKKPTATKAKEAVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-36PRGRIRKPRVRKT
111-126RPKPKKNKKPTATKAK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MSKCFTKDQQKDVLDLGEQCAKTPRGRIRKPRVRKTVPGHIGRPINSFMAYRSKVQADIRQFCPTANHRVISKIIAKWWKAIDEKEKDVYRVIADQAKKDHLEKHPGYTFRPKPKKNKKPTATKAKEAVKSATQEDVKDPDYIPSPLFSCKVEKDYHYQQQSQQQAQLGYVDTAMNEDASSCYFQSIANYAPVPLEEDSLNLDTNNATMYVDPALLHNDYMDINAAEPIPFDFEADPAMFALLANSTPASQMLETPSLEYYQSPVSLSHPLLGHQVGFQQTIQQAMQHQHQQQQQQEQQLDTPHLLDYTVIPAGYSNEYGKLFDSLDSSSSVSSSDLLHTPISNTQANNDFVNFIYGTGNPNIIFLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.34
3 0.31
4 0.28
5 0.26
6 0.24
7 0.29
8 0.3
9 0.3
10 0.37
11 0.44
12 0.48
13 0.58
14 0.69
15 0.73
16 0.82
17 0.9
18 0.92
19 0.93
20 0.9
21 0.9
22 0.88
23 0.87
24 0.86
25 0.82
26 0.74
27 0.71
28 0.68
29 0.6
30 0.55
31 0.46
32 0.38
33 0.32
34 0.29
35 0.25
36 0.28
37 0.28
38 0.28
39 0.29
40 0.29
41 0.32
42 0.36
43 0.41
44 0.41
45 0.45
46 0.46
47 0.47
48 0.46
49 0.42
50 0.45
51 0.42
52 0.42
53 0.4
54 0.38
55 0.34
56 0.37
57 0.38
58 0.36
59 0.37
60 0.29
61 0.32
62 0.37
63 0.37
64 0.38
65 0.39
66 0.39
67 0.37
68 0.41
69 0.43
70 0.42
71 0.45
72 0.48
73 0.48
74 0.44
75 0.42
76 0.37
77 0.29
78 0.25
79 0.24
80 0.23
81 0.23
82 0.25
83 0.27
84 0.29
85 0.29
86 0.29
87 0.34
88 0.33
89 0.41
90 0.39
91 0.43
92 0.45
93 0.46
94 0.48
95 0.51
96 0.54
97 0.55
98 0.64
99 0.65
100 0.71
101 0.8
102 0.87
103 0.87
104 0.9
105 0.88
106 0.89
107 0.92
108 0.92
109 0.87
110 0.82
111 0.79
112 0.75
113 0.7
114 0.62
115 0.54
116 0.46
117 0.42
118 0.38
119 0.35
120 0.28
121 0.25
122 0.24
123 0.24
124 0.22
125 0.21
126 0.2
127 0.16
128 0.17
129 0.17
130 0.15
131 0.13
132 0.13
133 0.13
134 0.14
135 0.13
136 0.14
137 0.15
138 0.18
139 0.19
140 0.2
141 0.25
142 0.32
143 0.38
144 0.39
145 0.39
146 0.4
147 0.45
148 0.48
149 0.43
150 0.38
151 0.33
152 0.29
153 0.27
154 0.24
155 0.17
156 0.12
157 0.11
158 0.08
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.09
186 0.1
187 0.1
188 0.08
189 0.08
190 0.06
191 0.07
192 0.06
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.1
240 0.12
241 0.12
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.11
248 0.1
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.12
253 0.16
254 0.16
255 0.17
256 0.16
257 0.16
258 0.18
259 0.18
260 0.16
261 0.12
262 0.15
263 0.13
264 0.14
265 0.13
266 0.14
267 0.14
268 0.17
269 0.16
270 0.14
271 0.16
272 0.19
273 0.24
274 0.27
275 0.3
276 0.34
277 0.39
278 0.44
279 0.47
280 0.53
281 0.53
282 0.53
283 0.52
284 0.46
285 0.44
286 0.4
287 0.37
288 0.28
289 0.24
290 0.17
291 0.15
292 0.14
293 0.12
294 0.1
295 0.11
296 0.11
297 0.1
298 0.09
299 0.1
300 0.12
301 0.14
302 0.15
303 0.12
304 0.15
305 0.16
306 0.17
307 0.17
308 0.17
309 0.16
310 0.15
311 0.16
312 0.13
313 0.14
314 0.15
315 0.15
316 0.13
317 0.12
318 0.12
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.11
323 0.12
324 0.14
325 0.15
326 0.15
327 0.17
328 0.19
329 0.23
330 0.23
331 0.22
332 0.25
333 0.3
334 0.32
335 0.31
336 0.29
337 0.25
338 0.22
339 0.25
340 0.2
341 0.15
342 0.15
343 0.14
344 0.17
345 0.17
346 0.19
347 0.16