Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2IXH5

Protein Details
Accession S2IXH5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
347-375LSPAEQRKWEEKERARNMKKQQKKQGRKMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
317-375FAKKLAADRAEELAKKKAEAKRAEEERVKKLSPAEQRKWEEKERARNMKKQQKKQGRKM
Subcellular Location(s) plas 8, nucl 7, cyto 6, golg 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MSKLFTCLAIAATASVASAVVDENVVEPKKAVIDVPADNVMVRPLRIMDFQMEIVLVSVFVLYFFVWLRGKKANLNRAKDWLNGQVDYLQSQFALVGDKKSNDQSILMMDGPADYLLYTTGRRNVQFGHWWLKLKPRNDILTYFSTTVLSKLTSATKPATDRVELKLHLDKGLTEKFVVGVVRKDLTTELFKRRFDLNRVGKIASNKAISSSEYTIYAETQKLADSILTSKVTDIINKSDGRLESLIISSLPDEEPEMFETDSYITISLNFLMPTSNGFDPLVELVGDLPDAISQLRLTGDVKTKINKNREELGKEFAKKLAADRAEELAKKKAEAKRAEEERVKKLSPAEQRKWEEKERARNMKKQQKKQGRKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.06
3 0.05
4 0.04
5 0.05
6 0.05
7 0.05
8 0.05
9 0.05
10 0.06
11 0.12
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.14
16 0.15
17 0.16
18 0.15
19 0.13
20 0.17
21 0.19
22 0.22
23 0.23
24 0.21
25 0.21
26 0.21
27 0.2
28 0.17
29 0.15
30 0.13
31 0.13
32 0.15
33 0.16
34 0.18
35 0.17
36 0.17
37 0.17
38 0.17
39 0.15
40 0.13
41 0.12
42 0.1
43 0.07
44 0.05
45 0.05
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.04
50 0.05
51 0.05
52 0.09
53 0.12
54 0.13
55 0.17
56 0.22
57 0.25
58 0.32
59 0.4
60 0.46
61 0.52
62 0.58
63 0.57
64 0.58
65 0.59
66 0.54
67 0.49
68 0.47
69 0.42
70 0.35
71 0.33
72 0.29
73 0.26
74 0.25
75 0.22
76 0.14
77 0.1
78 0.1
79 0.09
80 0.07
81 0.11
82 0.1
83 0.14
84 0.16
85 0.17
86 0.19
87 0.22
88 0.23
89 0.19
90 0.19
91 0.16
92 0.15
93 0.16
94 0.14
95 0.12
96 0.1
97 0.09
98 0.09
99 0.07
100 0.06
101 0.04
102 0.03
103 0.04
104 0.05
105 0.07
106 0.08
107 0.14
108 0.17
109 0.18
110 0.19
111 0.2
112 0.23
113 0.28
114 0.31
115 0.33
116 0.32
117 0.35
118 0.35
119 0.42
120 0.44
121 0.41
122 0.43
123 0.42
124 0.43
125 0.43
126 0.44
127 0.39
128 0.37
129 0.37
130 0.31
131 0.26
132 0.22
133 0.2
134 0.18
135 0.14
136 0.1
137 0.08
138 0.09
139 0.12
140 0.12
141 0.14
142 0.15
143 0.17
144 0.18
145 0.21
146 0.21
147 0.2
148 0.22
149 0.23
150 0.26
151 0.23
152 0.25
153 0.26
154 0.25
155 0.23
156 0.21
157 0.18
158 0.19
159 0.2
160 0.18
161 0.13
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.09
167 0.08
168 0.09
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.1
174 0.14
175 0.17
176 0.24
177 0.28
178 0.28
179 0.3
180 0.35
181 0.36
182 0.36
183 0.43
184 0.41
185 0.43
186 0.46
187 0.44
188 0.41
189 0.4
190 0.38
191 0.31
192 0.25
193 0.19
194 0.18
195 0.18
196 0.17
197 0.18
198 0.16
199 0.13
200 0.13
201 0.14
202 0.12
203 0.12
204 0.13
205 0.1
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.07
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.13
219 0.13
220 0.14
221 0.15
222 0.15
223 0.19
224 0.19
225 0.2
226 0.21
227 0.2
228 0.21
229 0.2
230 0.17
231 0.14
232 0.14
233 0.14
234 0.1
235 0.1
236 0.07
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.09
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.08
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.12
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.11
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.04
282 0.06
283 0.06
284 0.08
285 0.08
286 0.13
287 0.19
288 0.24
289 0.27
290 0.32
291 0.4
292 0.47
293 0.55
294 0.56
295 0.55
296 0.59
297 0.64
298 0.64
299 0.59
300 0.57
301 0.56
302 0.53
303 0.49
304 0.42
305 0.38
306 0.32
307 0.33
308 0.35
309 0.3
310 0.29
311 0.3
312 0.32
313 0.34
314 0.36
315 0.36
316 0.34
317 0.33
318 0.32
319 0.38
320 0.39
321 0.43
322 0.48
323 0.51
324 0.55
325 0.6
326 0.67
327 0.68
328 0.69
329 0.68
330 0.67
331 0.61
332 0.53
333 0.51
334 0.51
335 0.53
336 0.58
337 0.58
338 0.62
339 0.68
340 0.74
341 0.76
342 0.77
343 0.77
344 0.75
345 0.78
346 0.78
347 0.83
348 0.82
349 0.84
350 0.86
351 0.87
352 0.88
353 0.88
354 0.88
355 0.89