Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2J7X1

Protein Details
Accession S2J7X1    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-194VNGFRATQKTNKKKKKGSKAAANAPPQHydrophilic
219-242RRELKEQQKRKREWEKKQDVDRSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
177-187TNKKKKKGSKA
222-254LKEQQKRKREWEKKQDVDRSRSPSRSRSNSRSR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, mito_nucl 13, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR034653  SPF45_RRM  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12647  RRM_UHM_SPF45  
Amino Acid Sequences MSFSLYGALPPSKSDKAVADSTKKETSSSQLSSLYSSLPAPESGSTVFKSNPQQPSSESTTKATVAAATTATASTANAPPPNKPAGWSAINTFRPVLRRPTIQAKPKLNKPFIPAGATIVSTKTITKEDREKELQMEFEAKKASVEEQKKNDNIDLGAIPLLTTADDVNGFRATQKTNKKKKKGSKAAANAPPQPVVFNMLEDYDPHRPNDYEQYKEERRELKEQQKRKREWEKKQDVDRSRSPSRSRSNSRSRSNSRSRSPTVSPQRHAPVDSTTVKINVNETAEDAYLRRLKMSQQHQQQPSSIPEPPRTEELHPAQAIAQHLAANITKEIPSQVILLTNMVGPGEVDDMLQEETAEECSKYGKVERCLIFEVPKGKISDDRAVRIFVQFSSIDSARNAIQDLDGRFFGGRIVSATFYDMKRFERLDLAPSKEEWRRVAAPF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.31
4 0.38
5 0.43
6 0.44
7 0.46
8 0.51
9 0.53
10 0.49
11 0.45
12 0.4
13 0.39
14 0.4
15 0.38
16 0.36
17 0.34
18 0.34
19 0.35
20 0.33
21 0.28
22 0.21
23 0.18
24 0.16
25 0.14
26 0.14
27 0.14
28 0.14
29 0.15
30 0.15
31 0.18
32 0.17
33 0.18
34 0.19
35 0.23
36 0.29
37 0.35
38 0.41
39 0.4
40 0.41
41 0.42
42 0.48
43 0.51
44 0.48
45 0.42
46 0.37
47 0.38
48 0.36
49 0.34
50 0.28
51 0.2
52 0.16
53 0.15
54 0.12
55 0.1
56 0.1
57 0.09
58 0.09
59 0.08
60 0.07
61 0.1
62 0.12
63 0.15
64 0.19
65 0.21
66 0.23
67 0.27
68 0.31
69 0.27
70 0.27
71 0.26
72 0.28
73 0.3
74 0.29
75 0.29
76 0.34
77 0.35
78 0.34
79 0.32
80 0.29
81 0.3
82 0.32
83 0.35
84 0.31
85 0.34
86 0.38
87 0.47
88 0.53
89 0.58
90 0.63
91 0.66
92 0.69
93 0.74
94 0.79
95 0.74
96 0.69
97 0.65
98 0.64
99 0.56
100 0.52
101 0.43
102 0.36
103 0.32
104 0.29
105 0.24
106 0.16
107 0.15
108 0.12
109 0.12
110 0.11
111 0.15
112 0.16
113 0.21
114 0.29
115 0.32
116 0.39
117 0.42
118 0.42
119 0.4
120 0.4
121 0.36
122 0.28
123 0.31
124 0.24
125 0.22
126 0.22
127 0.19
128 0.17
129 0.17
130 0.19
131 0.21
132 0.28
133 0.33
134 0.37
135 0.44
136 0.46
137 0.47
138 0.44
139 0.37
140 0.3
141 0.24
142 0.19
143 0.13
144 0.11
145 0.09
146 0.08
147 0.07
148 0.06
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.1
160 0.12
161 0.19
162 0.3
163 0.39
164 0.5
165 0.6
166 0.68
167 0.76
168 0.84
169 0.88
170 0.88
171 0.87
172 0.86
173 0.84
174 0.84
175 0.82
176 0.77
177 0.69
178 0.59
179 0.5
180 0.4
181 0.32
182 0.22
183 0.19
184 0.14
185 0.11
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.14
191 0.16
192 0.17
193 0.17
194 0.19
195 0.18
196 0.2
197 0.29
198 0.29
199 0.26
200 0.28
201 0.35
202 0.37
203 0.39
204 0.42
205 0.38
206 0.38
207 0.42
208 0.47
209 0.5
210 0.55
211 0.62
212 0.66
213 0.7
214 0.7
215 0.73
216 0.76
217 0.76
218 0.78
219 0.81
220 0.82
221 0.8
222 0.84
223 0.84
224 0.79
225 0.75
226 0.7
227 0.67
228 0.61
229 0.59
230 0.54
231 0.53
232 0.55
233 0.58
234 0.6
235 0.61
236 0.67
237 0.7
238 0.74
239 0.76
240 0.74
241 0.74
242 0.77
243 0.75
244 0.71
245 0.7
246 0.66
247 0.62
248 0.59
249 0.59
250 0.6
251 0.59
252 0.55
253 0.53
254 0.54
255 0.5
256 0.47
257 0.39
258 0.3
259 0.29
260 0.29
261 0.25
262 0.21
263 0.21
264 0.21
265 0.19
266 0.18
267 0.14
268 0.14
269 0.13
270 0.13
271 0.12
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.15
277 0.14
278 0.14
279 0.14
280 0.18
281 0.26
282 0.33
283 0.38
284 0.44
285 0.53
286 0.57
287 0.58
288 0.57
289 0.52
290 0.48
291 0.43
292 0.38
293 0.33
294 0.34
295 0.36
296 0.36
297 0.37
298 0.35
299 0.34
300 0.37
301 0.38
302 0.39
303 0.35
304 0.33
305 0.29
306 0.29
307 0.27
308 0.21
309 0.17
310 0.11
311 0.11
312 0.12
313 0.12
314 0.11
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.11
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.1
329 0.09
330 0.08
331 0.07
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.05
337 0.05
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.08
345 0.09
346 0.08
347 0.08
348 0.1
349 0.11
350 0.12
351 0.19
352 0.24
353 0.28
354 0.37
355 0.4
356 0.42
357 0.45
358 0.45
359 0.41
360 0.39
361 0.39
362 0.32
363 0.34
364 0.31
365 0.29
366 0.32
367 0.35
368 0.39
369 0.38
370 0.41
371 0.39
372 0.4
373 0.4
374 0.37
375 0.33
376 0.24
377 0.23
378 0.18
379 0.17
380 0.21
381 0.21
382 0.2
383 0.19
384 0.2
385 0.18
386 0.19
387 0.18
388 0.13
389 0.14
390 0.18
391 0.2
392 0.22
393 0.2
394 0.2
395 0.19
396 0.19
397 0.18
398 0.14
399 0.12
400 0.1
401 0.12
402 0.12
403 0.13
404 0.16
405 0.19
406 0.2
407 0.24
408 0.25
409 0.26
410 0.31
411 0.32
412 0.31
413 0.34
414 0.34
415 0.38
416 0.42
417 0.45
418 0.42
419 0.43
420 0.48
421 0.46
422 0.49
423 0.44
424 0.43