FuNGI

S2JLY3

Protein Details

Accession

S2JLY3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-38	AHNGGHQQKQQNRNNNSNKKWANN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 15

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045117 ATXN2-like IPR009604 LsmAD_domain IPR025852 SM_dom_ATX
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF06741 LsmAD PF14438 SM-ATX

Amino Acid Sequences

MSFSKSQGKKQEGSAHNGGHQQKQQNRNNNSNKKWANNAATRSHASTGIEQDAATTKQLHDRMLFLLGNLTGTLVEATVKDGCKFKGIFHGASTEGDLGIALKLAQKIYDPNVPIDKNKTNPNPIKNTMLIFSNDLVEMNAVNVDFTTSNTETSDRNTFKTDTDISGRLDIKERELHKWAPTEDDGHDGLLEGGLESSDNGGSWDQFAANEKLFGLKTDFDEEIYTTPLNRSAPGYKDREKRAIKMANEIQKTATTNVHMLEERGLAVDDSGMDEEDLYGAVVRDSNPNKYVPPALRKLQQQQQQVKKEKTNPLNKLITSDLPKAASNPSPIANLPTTRRESSEKNNNNNNSSSSSNEPPKRIEAEIATTFRHFAMMEKDKLHAKKQALQKKEKDGRLAELKAFHQSFKLNVPIPADLVPLLSKKKATAVSNDEKMTSPDVNKNNSPVKKTSTPPPQATSTTAATTTAAKKASSPVPAAVASSSPASSSPAPATTTTTPTASSPATSNSFKFNVKASSFKPNPSAAAFVPGGSATAARSPAPVHMGMPIPHTSTTSEDNSHPHTFFGGRQLKKGGSVEHLTMTEAFVPSFIDKNIPASSVGPTWPFGHKSYRVQFSQFGYDEDVYNYPSPNYGYYPQYRYPFPQMPYPQFVQPPMPPTYSPQMANVSPHGSPFPPPVPPPVPPQGYPSPQQRSPMVPQQMPPPQIYQYGGAPMMMRYPPDMMMQRPVMVETVPYSPHHQQQQPQQQDTPGN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.57
3	0.54
4	0.58
5	0.55
6	0.51
7	0.53
8	0.54
9	0.56
10	0.64
11	0.69
12	0.72
13	0.76
14	0.79
15	0.84
16	0.85
17	0.83
18	0.83
19	0.8
20	0.75
21	0.75
22	0.74
23	0.72
24	0.69
25	0.69
26	0.63
27	0.62
28	0.6
29	0.55
30	0.48
31	0.41
32	0.36
33	0.34
34	0.33
35	0.3
36	0.27
37	0.23
38	0.23
39	0.24
40	0.23
41	0.2
42	0.18
43	0.16
44	0.23
45	0.26
46	0.28
47	0.25
48	0.26
49	0.26
50	0.29
51	0.28
52	0.21
53	0.21
54	0.18
55	0.17
56	0.15
57	0.13
58	0.08
59	0.08
60	0.08
61	0.05
62	0.06
63	0.05
64	0.08
65	0.12
66	0.13
67	0.15
68	0.19
69	0.19
70	0.25
71	0.25
72	0.25
73	0.31
74	0.35
75	0.35
76	0.33
77	0.35
78	0.3
79	0.3
80	0.3
81	0.2
82	0.15
83	0.13
84	0.12
85	0.09
86	0.07
87	0.07
88	0.05
89	0.08
90	0.09
91	0.1
92	0.1
93	0.11
94	0.15
95	0.19
96	0.25
97	0.24
98	0.26
99	0.33
100	0.35
101	0.37
102	0.41
103	0.43
104	0.42
105	0.5
106	0.53
107	0.56
108	0.62
109	0.67
110	0.68
111	0.66
112	0.67
113	0.59
114	0.54
115	0.45
116	0.4
117	0.33
118	0.27
119	0.23
120	0.19
121	0.17
122	0.15
123	0.13
124	0.11
125	0.09
126	0.07
127	0.07
128	0.06
129	0.05
130	0.05
131	0.07
132	0.06
133	0.07
134	0.14
135	0.14
136	0.15
137	0.16
138	0.17
139	0.17
140	0.21
141	0.29
142	0.24
143	0.26
144	0.29
145	0.29
146	0.29
147	0.33
148	0.31
149	0.26
150	0.29
151	0.29
152	0.27
153	0.31
154	0.32
155	0.27
156	0.31
157	0.28
158	0.27
159	0.31
160	0.32
161	0.32
162	0.35
163	0.37
164	0.36
165	0.4
166	0.37
167	0.35
168	0.34
169	0.32
170	0.28
171	0.29
172	0.25
173	0.2
174	0.19
175	0.14
176	0.13
177	0.09
178	0.08
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.03
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.05
188	0.06
189	0.06
190	0.07
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.11
195	0.13
196	0.13
197	0.13
198	0.12
199	0.14
200	0.14
201	0.15
202	0.13
203	0.12
204	0.14
205	0.17
206	0.17
207	0.15
208	0.16
209	0.16
210	0.14
211	0.15
212	0.13
213	0.1
214	0.1
215	0.13
216	0.13
217	0.13
218	0.15
219	0.17
220	0.21
221	0.28
222	0.34
223	0.39
224	0.46
225	0.51
226	0.57
227	0.56
228	0.56
229	0.58
230	0.59
231	0.52
232	0.53
233	0.55
234	0.53
235	0.51
236	0.48
237	0.4
238	0.34
239	0.35
240	0.28
241	0.23
242	0.16
243	0.16
244	0.16
245	0.17
246	0.15
247	0.14
248	0.13
249	0.12
250	0.11
251	0.1
252	0.09
253	0.07
254	0.06
255	0.06
256	0.04
257	0.05
258	0.05
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.03
266	0.03
267	0.03
268	0.03
269	0.04
270	0.05
271	0.12
272	0.14
273	0.17
274	0.18
275	0.19
276	0.2
277	0.21
278	0.26
279	0.24
280	0.29
281	0.31
282	0.34
283	0.38
284	0.42
285	0.47
286	0.49
287	0.51
288	0.54
289	0.58
290	0.63
291	0.67
292	0.71
293	0.69
294	0.68
295	0.69
296	0.68
297	0.68
298	0.69
299	0.64
300	0.63
301	0.62
302	0.56
303	0.51
304	0.44
305	0.38
306	0.33
307	0.3
308	0.24
309	0.21
310	0.21
311	0.2
312	0.2
313	0.19
314	0.17
315	0.16
316	0.16
317	0.15
318	0.16
319	0.17
320	0.16
321	0.16
322	0.17
323	0.21
324	0.24
325	0.23
326	0.26
327	0.27
328	0.3
329	0.36
330	0.44
331	0.47
332	0.51
333	0.58
334	0.58
335	0.57
336	0.54
337	0.47
338	0.39
339	0.32
340	0.27
341	0.23
342	0.25
343	0.3
344	0.32
345	0.31
346	0.3
347	0.31
348	0.31
349	0.28
350	0.25
351	0.18
352	0.2
353	0.21
354	0.21
355	0.19
356	0.17
357	0.17
358	0.15
359	0.15
360	0.1
361	0.08
362	0.14
363	0.18
364	0.21
365	0.21
366	0.23
367	0.27
368	0.29
369	0.3
370	0.28
371	0.25
372	0.3
373	0.38
374	0.44
375	0.46
376	0.53
377	0.55
378	0.6
379	0.66
380	0.62
381	0.58
382	0.51
383	0.49
384	0.47
385	0.44
386	0.35
387	0.29
388	0.27
389	0.28
390	0.27
391	0.23
392	0.18
393	0.17
394	0.17
395	0.17
396	0.2
397	0.16
398	0.17
399	0.18
400	0.17
401	0.17
402	0.16
403	0.14
404	0.1
405	0.09
406	0.08
407	0.09
408	0.1
409	0.1
410	0.1
411	0.1
412	0.14
413	0.18
414	0.19
415	0.23
416	0.3
417	0.35
418	0.39
419	0.39
420	0.36
421	0.32
422	0.31
423	0.28
424	0.21
425	0.18
426	0.21
427	0.25
428	0.28
429	0.28
430	0.32
431	0.38
432	0.39
433	0.4
434	0.36
435	0.38
436	0.39
437	0.41
438	0.45
439	0.48
440	0.52
441	0.51
442	0.52
443	0.49
444	0.45
445	0.45
446	0.4
447	0.31
448	0.25
449	0.21
450	0.18
451	0.15
452	0.16
453	0.15
454	0.15
455	0.15
456	0.14
457	0.14
458	0.18
459	0.21
460	0.21
461	0.21
462	0.18
463	0.2
464	0.2
465	0.19
466	0.16
467	0.12
468	0.1
469	0.09
470	0.09
471	0.07
472	0.07
473	0.09
474	0.09
475	0.11
476	0.11
477	0.12
478	0.13
479	0.14
480	0.18
481	0.17
482	0.2
483	0.2
484	0.19
485	0.18
486	0.17
487	0.19
488	0.15
489	0.14
490	0.12
491	0.14
492	0.18
493	0.19
494	0.19
495	0.21
496	0.23
497	0.23
498	0.23
499	0.23
500	0.25
501	0.25
502	0.29
503	0.27
504	0.35
505	0.37
506	0.38
507	0.39
508	0.34
509	0.34
510	0.31
511	0.31
512	0.21
513	0.23
514	0.21
515	0.17
516	0.16
517	0.13
518	0.12
519	0.1
520	0.1
521	0.05
522	0.07
523	0.08
524	0.08
525	0.09
526	0.09
527	0.1
528	0.13
529	0.13
530	0.11
531	0.13
532	0.16
533	0.16
534	0.18
535	0.18
536	0.17
537	0.17
538	0.18
539	0.16
540	0.17
541	0.2
542	0.2
543	0.21
544	0.21
545	0.24
546	0.29
547	0.31
548	0.28
549	0.24
550	0.23
551	0.22
552	0.22
553	0.29
554	0.32
555	0.3
556	0.32
557	0.36
558	0.34
559	0.37
560	0.38
561	0.3
562	0.26
563	0.28
564	0.26
565	0.25
566	0.25
567	0.22
568	0.2
569	0.18
570	0.15
571	0.12
572	0.1
573	0.08
574	0.09
575	0.1
576	0.11
577	0.11
578	0.11
579	0.11
580	0.15
581	0.15
582	0.15
583	0.15
584	0.15
585	0.17
586	0.16
587	0.17
588	0.15
589	0.16
590	0.17
591	0.2
592	0.22
593	0.22
594	0.28
595	0.32
596	0.4
597	0.46
598	0.5
599	0.49
600	0.49
601	0.51
602	0.47
603	0.49
604	0.41
605	0.35
606	0.32
607	0.31
608	0.29
609	0.26
610	0.24
611	0.19
612	0.2
613	0.19
614	0.14
615	0.15
616	0.16
617	0.15
618	0.19
619	0.19
620	0.25
621	0.3
622	0.36
623	0.4
624	0.43
625	0.44
626	0.45
627	0.49
628	0.5
629	0.46
630	0.5
631	0.52
632	0.54
633	0.57
634	0.55
635	0.51
636	0.47
637	0.47
638	0.43
639	0.38
640	0.37
641	0.35
642	0.35
643	0.31
644	0.33
645	0.38
646	0.37
647	0.35
648	0.34
649	0.35
650	0.33
651	0.35
652	0.33
653	0.29
654	0.25
655	0.26
656	0.24
657	0.2
658	0.21
659	0.24
660	0.24
661	0.26
662	0.27
663	0.34
664	0.35
665	0.37
666	0.42
667	0.45
668	0.46
669	0.43
670	0.48
671	0.48
672	0.49
673	0.53
674	0.55
675	0.54
676	0.53
677	0.56
678	0.52
679	0.51
680	0.54
681	0.57
682	0.56
683	0.51
684	0.5
685	0.55
686	0.59
687	0.55
688	0.5
689	0.44
690	0.38
691	0.38
692	0.38
693	0.31
694	0.25
695	0.26
696	0.24
697	0.22
698	0.2
699	0.17
700	0.2
701	0.18
702	0.17
703	0.15
704	0.17
705	0.17
706	0.23
707	0.26
708	0.24
709	0.3
710	0.31
711	0.31
712	0.3
713	0.29
714	0.24
715	0.21
716	0.2
717	0.15
718	0.16
719	0.17
720	0.18
721	0.24
722	0.28
723	0.35
724	0.43
725	0.46
726	0.5
727	0.59
728	0.68
729	0.71
730	0.71
731	0.67

S2JLY3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer