Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JHR1

Protein Details
Accession S2JHR1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
263-289KSIETKQTMANIKKKKRRKKEENEEDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
275-282KKKKRRKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 13.5, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13041  PPR_2  
Amino Acid Sequences MASPPMTPSISRRYLASSSKYANLHANARPAEPSIAITKLATQGRPNEALAVYLQLIQDGGFPSRESLYQLTRALYKSSNLQGMYAIHDTLISYYNIHPASNKSARSMIYMYTMLINLIAKHKPVNFETIRFLCKEMSQFTTTSNVVLYNTLIKTLLDNDQVTQAHALFKDLLCNNTLNPTIITYTILMKDASRRKDYNRILEYLQDIQSREIIMNYAVVSIVTDTLCDINEFDKAIQVVNAIHHPKKRDELSSPKYRLQLLKSIETKQTMANIKKKKRRKKEENEEDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.45
3 0.46
4 0.43
5 0.42
6 0.47
7 0.47
8 0.43
9 0.44
10 0.41
11 0.41
12 0.38
13 0.42
14 0.37
15 0.37
16 0.36
17 0.31
18 0.29
19 0.24
20 0.22
21 0.18
22 0.18
23 0.17
24 0.16
25 0.16
26 0.21
27 0.23
28 0.23
29 0.24
30 0.28
31 0.32
32 0.35
33 0.33
34 0.29
35 0.26
36 0.25
37 0.22
38 0.18
39 0.13
40 0.13
41 0.12
42 0.1
43 0.09
44 0.09
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.11
51 0.12
52 0.12
53 0.13
54 0.15
55 0.17
56 0.21
57 0.22
58 0.22
59 0.24
60 0.25
61 0.24
62 0.22
63 0.21
64 0.22
65 0.23
66 0.26
67 0.23
68 0.22
69 0.21
70 0.21
71 0.23
72 0.19
73 0.15
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.1
78 0.11
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.15
87 0.23
88 0.27
89 0.27
90 0.24
91 0.26
92 0.27
93 0.29
94 0.27
95 0.2
96 0.18
97 0.17
98 0.15
99 0.13
100 0.13
101 0.09
102 0.09
103 0.08
104 0.06
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.11
109 0.13
110 0.16
111 0.16
112 0.23
113 0.21
114 0.23
115 0.28
116 0.27
117 0.28
118 0.25
119 0.25
120 0.18
121 0.18
122 0.18
123 0.15
124 0.17
125 0.17
126 0.17
127 0.17
128 0.19
129 0.18
130 0.16
131 0.14
132 0.1
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.08
142 0.09
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.14
148 0.15
149 0.15
150 0.13
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.09
156 0.08
157 0.14
158 0.14
159 0.14
160 0.14
161 0.15
162 0.14
163 0.16
164 0.17
165 0.12
166 0.11
167 0.11
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.1
176 0.1
177 0.17
178 0.23
179 0.28
180 0.32
181 0.34
182 0.37
183 0.48
184 0.53
185 0.56
186 0.52
187 0.5
188 0.45
189 0.45
190 0.43
191 0.37
192 0.34
193 0.26
194 0.24
195 0.21
196 0.22
197 0.2
198 0.17
199 0.13
200 0.11
201 0.08
202 0.09
203 0.08
204 0.07
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.11
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.12
228 0.18
229 0.21
230 0.26
231 0.29
232 0.33
233 0.36
234 0.43
235 0.46
236 0.45
237 0.48
238 0.54
239 0.59
240 0.66
241 0.67
242 0.64
243 0.62
244 0.62
245 0.59
246 0.53
247 0.52
248 0.47
249 0.51
250 0.5
251 0.52
252 0.51
253 0.48
254 0.45
255 0.39
256 0.41
257 0.41
258 0.45
259 0.5
260 0.56
261 0.64
262 0.73
263 0.81
264 0.85
265 0.87
266 0.9
267 0.93
268 0.94
269 0.95