FuNGI

S2JP20

Protein Details

Accession

S2JP20

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-26	DTPGVKKTTRRFAPVKRGGKS	Hydrophilic
108-131	GTMKMKFKPTIPHKRNKKEVSSSA	Hydrophilic
257-279	PWMTVKSQKKERKPSIQKVKAEP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
14-31	TRRFAPVKRGGKSPAAQR
113-125	KFKPTIPHKRNKK
138-165	KPGSGHHHGGERGRGGRGRGGRGRGRGR

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 11, cyto 9.5, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSEPNDTPGVKKTTRRFAPVKRGGKSPAAQRRAAAAAAAAAATATSEDADSSFKLEATESANASPSAESTSTEGHASAKSSPIGTIRPEGAGSGRLQSVNDGQKTRGGTMKMKFKPTIPHKRNKKEVSSSAIDEALSKPGSGHHHGGERGRGGRGRGGRGRGRGRGLVIVDESTASGIFSLGPSAVSRGRPGFGGGGFASYGGDVPSRAEGDDTNSDMVEMFTASAGKDTPVTFRHVSRLEGDIDPVTLKQTIGKIPWMTVKSQKKERKPSIQKVKAEPTDDVEMDTDDDVSKVLDTIDSLVDDAEEQEEEEDQAQPQELPKVYMDGDSPAQNIFALDEKQRLVCVAEEELLYFQLPTVVPAFEKPKNEDANADVTMSEDGGVKPEAVENTLPAAAKKTTLLEDAMANMGLEDMPDGQVGKLIVYKSGKVKMQFGSILLDVNQGMQSTFLENVMVVDHESEDSKKAIELGHIVQKFVCAPNMDALLNESLN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.68
3	0.7
4	0.73
5	0.79
6	0.81
7	0.82
8	0.75
9	0.74
10	0.71
11	0.7
12	0.65
13	0.64
14	0.64
15	0.61
16	0.59
17	0.54
18	0.53
19	0.48
20	0.42
21	0.32
22	0.21
23	0.16
24	0.15
25	0.13
26	0.08
27	0.05
28	0.05
29	0.04
30	0.04
31	0.04
32	0.04
33	0.04
34	0.05
35	0.06
36	0.08
37	0.08
38	0.1
39	0.1
40	0.1
41	0.11
42	0.11
43	0.12
44	0.15
45	0.18
46	0.17
47	0.18
48	0.19
49	0.19
50	0.19
51	0.17
52	0.13
53	0.13
54	0.12
55	0.13
56	0.13
57	0.15
58	0.15
59	0.16
60	0.16
61	0.14
62	0.14
63	0.15
64	0.14
65	0.15
66	0.15
67	0.15
68	0.16
69	0.17
70	0.19
71	0.2
72	0.22
73	0.2
74	0.2
75	0.19
76	0.19
77	0.17
78	0.17
79	0.16
80	0.15
81	0.15
82	0.15
83	0.15
84	0.16
85	0.22
86	0.26
87	0.3
88	0.29
89	0.28
90	0.31
91	0.33
92	0.33
93	0.31
94	0.27
95	0.3
96	0.34
97	0.44
98	0.45
99	0.5
100	0.49
101	0.48
102	0.54
103	0.59
104	0.64
105	0.62
106	0.67
107	0.72
108	0.8
109	0.87
110	0.84
111	0.83
112	0.8
113	0.77
114	0.74
115	0.68
116	0.6
117	0.51
118	0.44
119	0.35
120	0.27
121	0.23
122	0.19
123	0.15
124	0.12
125	0.11
126	0.14
127	0.19
128	0.22
129	0.24
130	0.23
131	0.27
132	0.3
133	0.32
134	0.31
135	0.3
136	0.28
137	0.28
138	0.27
139	0.24
140	0.27
141	0.29
142	0.33
143	0.34
144	0.39
145	0.41
146	0.47
147	0.52
148	0.51
149	0.5
150	0.45
151	0.41
152	0.38
153	0.33
154	0.26
155	0.21
156	0.17
157	0.14
158	0.12
159	0.1
160	0.07
161	0.06
162	0.05
163	0.04
164	0.04
165	0.04
166	0.03
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.04
171	0.07
172	0.09
173	0.09
174	0.11
175	0.12
176	0.13
177	0.12
178	0.13
179	0.13
180	0.11
181	0.12
182	0.1
183	0.1
184	0.09
185	0.09
186	0.08
187	0.06
188	0.06
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.05
193	0.06
194	0.06
195	0.06
196	0.06
197	0.06
198	0.1
199	0.12
200	0.12
201	0.12
202	0.11
203	0.11
204	0.1
205	0.1
206	0.06
207	0.05
208	0.04
209	0.03
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.06
216	0.06
217	0.09
218	0.1
219	0.15
220	0.16
221	0.17
222	0.22
223	0.21
224	0.22
225	0.22
226	0.22
227	0.2
228	0.19
229	0.19
230	0.14
231	0.13
232	0.12
233	0.1
234	0.09
235	0.06
236	0.06
237	0.07
238	0.09
239	0.1
240	0.11
241	0.14
242	0.13
243	0.14
244	0.19
245	0.18
246	0.19
247	0.26
248	0.33
249	0.36
250	0.46
251	0.53
252	0.57
253	0.66
254	0.72
255	0.75
256	0.77
257	0.82
258	0.83
259	0.84
260	0.8
261	0.75
262	0.76
263	0.68
264	0.6
265	0.5
266	0.42
267	0.37
268	0.32
269	0.26
270	0.18
271	0.14
272	0.13
273	0.12
274	0.09
275	0.06
276	0.06
277	0.05
278	0.05
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.05
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.11
306	0.11
307	0.12
308	0.12
309	0.14
310	0.14
311	0.14
312	0.14
313	0.12
314	0.13
315	0.12
316	0.13
317	0.11
318	0.11
319	0.1
320	0.09
321	0.08
322	0.08
323	0.09
324	0.1
325	0.12
326	0.13
327	0.13
328	0.13
329	0.13
330	0.12
331	0.11
332	0.11
333	0.11
334	0.11
335	0.11
336	0.11
337	0.11
338	0.1
339	0.09
340	0.07
341	0.06
342	0.07
343	0.07
344	0.08
345	0.09
346	0.09
347	0.09
348	0.13
349	0.18
350	0.2
351	0.23
352	0.27
353	0.33
354	0.36
355	0.36
356	0.35
357	0.32
358	0.33
359	0.3
360	0.26
361	0.18
362	0.15
363	0.15
364	0.13
365	0.11
366	0.07
367	0.07
368	0.09
369	0.09
370	0.08
371	0.08
372	0.11
373	0.11
374	0.12
375	0.12
376	0.1
377	0.12
378	0.14
379	0.14
380	0.12
381	0.15
382	0.13
383	0.14
384	0.14
385	0.15
386	0.15
387	0.17
388	0.17
389	0.15
390	0.15
391	0.15
392	0.15
393	0.13
394	0.1
395	0.08
396	0.08
397	0.06
398	0.06
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.06
403	0.07
404	0.06
405	0.08
406	0.09
407	0.09
408	0.11
409	0.11
410	0.16
411	0.18
412	0.21
413	0.25
414	0.31
415	0.35
416	0.34
417	0.4
418	0.37
419	0.4
420	0.38
421	0.33
422	0.31
423	0.27
424	0.26
425	0.21
426	0.2
427	0.15
428	0.14
429	0.14
430	0.1
431	0.1
432	0.09
433	0.09
434	0.1
435	0.1
436	0.09
437	0.09
438	0.08
439	0.09
440	0.09
441	0.09
442	0.07
443	0.07
444	0.08
445	0.09
446	0.11
447	0.12
448	0.13
449	0.13
450	0.14
451	0.13
452	0.14
453	0.15
454	0.15
455	0.19
456	0.22
457	0.3
458	0.3
459	0.3
460	0.28
461	0.29
462	0.29
463	0.27
464	0.26
465	0.19
466	0.2
467	0.24
468	0.27
469	0.26
470	0.23
471	0.24

S2JP20

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer