Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JFE4

Protein Details
Accession S2JFE4    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-127NSSAISPLKRKYRRHPKPDKNAPIKPPSHydrophilic
208-229DATNRKIARLRKRAKRSSPGSGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-121KRKYRRHPKPDKNA
212-224RKIARLRKRAKRS
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSKPYVFPPSTSSYTTTTSSNNNNNNDINNTHPTVTIVGAEHRASHQHQPVHILHQNPTEPESQDMMDATQKESRSSYSSNEDEDEDEDMIEEEQSNNSNSSAISPLKRKYRRHPKPDKNAPIKPPSAYIMFSNDARAQLKGHNMTFVEIAKIVGDQWKNLGISQKQQYERTAMRAKDEYIDALNEYRKTNEYKEYQKYLNNFKAEQDATNRKIARLRKRAKRSSPGSGSLADNSSNDNARSSSSSGGSTDIYKVHRKTHINAKGSSSEEGSVLRSMDTTPTIEVSTSTTPPNEEVDDDDVDDNEENDMEECYSPQQKAPPLISDNMAESNYHRLPFNENPRPQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.36
3 0.33
4 0.29
5 0.31
6 0.37
7 0.43
8 0.47
9 0.47
10 0.5
11 0.5
12 0.5
13 0.47
14 0.41
15 0.38
16 0.36
17 0.34
18 0.3
19 0.28
20 0.26
21 0.24
22 0.22
23 0.19
24 0.14
25 0.15
26 0.17
27 0.17
28 0.17
29 0.16
30 0.2
31 0.22
32 0.29
33 0.33
34 0.34
35 0.35
36 0.41
37 0.42
38 0.46
39 0.46
40 0.41
41 0.38
42 0.39
43 0.4
44 0.35
45 0.35
46 0.3
47 0.27
48 0.27
49 0.26
50 0.2
51 0.19
52 0.18
53 0.16
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.18
58 0.18
59 0.19
60 0.19
61 0.21
62 0.22
63 0.23
64 0.25
65 0.28
66 0.29
67 0.29
68 0.3
69 0.28
70 0.25
71 0.24
72 0.21
73 0.15
74 0.12
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.08
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.08
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.13
90 0.15
91 0.18
92 0.22
93 0.28
94 0.38
95 0.46
96 0.51
97 0.58
98 0.67
99 0.74
100 0.8
101 0.86
102 0.87
103 0.9
104 0.94
105 0.94
106 0.91
107 0.88
108 0.83
109 0.79
110 0.7
111 0.6
112 0.5
113 0.42
114 0.34
115 0.28
116 0.22
117 0.2
118 0.19
119 0.18
120 0.19
121 0.17
122 0.18
123 0.17
124 0.17
125 0.14
126 0.15
127 0.19
128 0.21
129 0.2
130 0.2
131 0.19
132 0.2
133 0.19
134 0.17
135 0.13
136 0.09
137 0.09
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.1
145 0.12
146 0.12
147 0.13
148 0.18
149 0.14
150 0.2
151 0.25
152 0.3
153 0.31
154 0.32
155 0.32
156 0.32
157 0.32
158 0.33
159 0.34
160 0.28
161 0.28
162 0.28
163 0.27
164 0.24
165 0.23
166 0.18
167 0.12
168 0.12
169 0.1
170 0.1
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.14
176 0.16
177 0.18
178 0.23
179 0.26
180 0.32
181 0.38
182 0.41
183 0.41
184 0.42
185 0.45
186 0.47
187 0.47
188 0.42
189 0.37
190 0.34
191 0.36
192 0.34
193 0.31
194 0.3
195 0.31
196 0.31
197 0.36
198 0.36
199 0.32
200 0.37
201 0.43
202 0.46
203 0.5
204 0.57
205 0.61
206 0.71
207 0.8
208 0.83
209 0.85
210 0.81
211 0.79
212 0.75
213 0.69
214 0.61
215 0.53
216 0.46
217 0.37
218 0.32
219 0.23
220 0.18
221 0.15
222 0.15
223 0.14
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.13
228 0.15
229 0.15
230 0.15
231 0.15
232 0.15
233 0.15
234 0.16
235 0.15
236 0.14
237 0.14
238 0.15
239 0.17
240 0.23
241 0.25
242 0.29
243 0.36
244 0.39
245 0.43
246 0.51
247 0.56
248 0.55
249 0.55
250 0.54
251 0.51
252 0.5
253 0.45
254 0.36
255 0.27
256 0.23
257 0.21
258 0.18
259 0.14
260 0.12
261 0.11
262 0.1
263 0.1
264 0.11
265 0.12
266 0.11
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.14
273 0.16
274 0.16
275 0.17
276 0.17
277 0.18
278 0.19
279 0.21
280 0.18
281 0.16
282 0.17
283 0.19
284 0.2
285 0.2
286 0.19
287 0.16
288 0.17
289 0.16
290 0.13
291 0.1
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.13
300 0.18
301 0.18
302 0.21
303 0.26
304 0.3
305 0.37
306 0.39
307 0.41
308 0.4
309 0.42
310 0.41
311 0.37
312 0.34
313 0.3
314 0.27
315 0.21
316 0.19
317 0.25
318 0.26
319 0.26
320 0.24
321 0.23
322 0.3
323 0.39
324 0.48