Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JNX4

Protein Details
Accession S2JNX4    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
91-111APFSSSERKKRSKNDKRSLEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-101KR
Subcellular Location(s) mito 22.5, cyto_mito 12, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001247  ExoRNase_PH_dom1  
IPR015847  ExoRNase_PH_dom2  
IPR036345  ExoRNase_PH_dom2_sf  
IPR027408  PNPase/RNase_PH_dom_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
Pfam View protein in Pfam  
PF01138  RNase_PH  
PF03725  RNase_PH_C  
CDD cd11370  RNase_PH_RRP41  
Amino Acid Sequences MVSKPSSSSNRPRSSRLELLTPEGLRIDGRRANELRKITAKTSVFSQADGSAYIEQGNTKCLAAVYGPRELRFRQQGHADRALINVEFNVAPFSSSERKKRSKNDKRSLEVAAFIRQTFEPVIFTTQFPKTQISIYLQIFQNDGGLLQACINAATMALIDAGIPMMDYVCACSAGCIDKEPVLDLNNLEEASDTPELTVAILPRTGKVTLLEMESRLHVDKLASVTELATEGCMKIHTILDAVIRENTEHLMSKLKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.7
3 0.63
4 0.6
5 0.52
6 0.54
7 0.54
8 0.47
9 0.39
10 0.31
11 0.28
12 0.22
13 0.21
14 0.22
15 0.19
16 0.21
17 0.28
18 0.31
19 0.36
20 0.41
21 0.43
22 0.43
23 0.46
24 0.48
25 0.42
26 0.47
27 0.44
28 0.38
29 0.38
30 0.41
31 0.35
32 0.31
33 0.31
34 0.24
35 0.23
36 0.22
37 0.2
38 0.12
39 0.12
40 0.12
41 0.1
42 0.11
43 0.11
44 0.12
45 0.11
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.15
52 0.15
53 0.22
54 0.23
55 0.24
56 0.27
57 0.27
58 0.33
59 0.36
60 0.36
61 0.33
62 0.41
63 0.48
64 0.51
65 0.54
66 0.48
67 0.4
68 0.39
69 0.36
70 0.27
71 0.19
72 0.13
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.11
81 0.16
82 0.21
83 0.29
84 0.36
85 0.43
86 0.5
87 0.6
88 0.68
89 0.72
90 0.79
91 0.82
92 0.83
93 0.8
94 0.76
95 0.69
96 0.58
97 0.5
98 0.4
99 0.33
100 0.24
101 0.2
102 0.18
103 0.15
104 0.15
105 0.12
106 0.11
107 0.08
108 0.08
109 0.11
110 0.1
111 0.11
112 0.13
113 0.14
114 0.15
115 0.15
116 0.16
117 0.14
118 0.14
119 0.16
120 0.16
121 0.19
122 0.19
123 0.22
124 0.21
125 0.21
126 0.21
127 0.19
128 0.16
129 0.1
130 0.09
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.02
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.03
154 0.03
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.12
166 0.12
167 0.13
168 0.14
169 0.13
170 0.14
171 0.12
172 0.13
173 0.13
174 0.12
175 0.11
176 0.1
177 0.09
178 0.12
179 0.13
180 0.11
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.11
186 0.07
187 0.08
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.13
192 0.13
193 0.13
194 0.13
195 0.15
196 0.15
197 0.18
198 0.18
199 0.17
200 0.18
201 0.18
202 0.19
203 0.17
204 0.16
205 0.13
206 0.12
207 0.14
208 0.15
209 0.15
210 0.14
211 0.13
212 0.12
213 0.12
214 0.12
215 0.1
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.1
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.12
227 0.15
228 0.16
229 0.17
230 0.17
231 0.16
232 0.16
233 0.17
234 0.17
235 0.16
236 0.17
237 0.16