Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PGR8

Protein Details
Accession A0A1D8PGR8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
197-218QFSSRKPYNNKPDQKNGSNRKSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0000243  C:commitment complex  
GO:0016607  C:nuclear speck  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0089701  C:U2AF complex  
GO:0008187  F:poly-pyrimidine tract binding  
GO:0030628  F:pre-mRNA 3'-splice site binding  
KEGG cal:CAALFM_C202770WA  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MSSSSQRQANSYSRRAPFHDDTNNQSSFRNQPNRNEPPLNRGRGYNEHQGRRSDAMPNRGDPRRPDNCNDGYNDRRDDGRGDKNKRFQHPGRSEEQPKYFGRGNRESSQHQSPQSSRHSGREGQGQGPDRNRNDQRYDPRRNDGRTGNNPPHYKPNRSNDVPIANRGTKRSNQEHDAGPFKQPRLSDEYTQRSQQQQFSSRKPYNNKPDQKNGSNRKSDSKFSQPKFQKSRSSFQNRGRGNDWDRSGEAYTPSSKRSDNPNFSGQRKFEPQSSLARARTISVAKPKSINEILKEIDRLQNRVQDLQSVQPIEEVKVIDSRWNKVPEGFENLSAARAKLSGLFPLPGYPRPIDFTKLEGTIKNRLNNSDDILNETSRIDPVDSKAARTLIVKNDLSQISHLKLVEFFNDYLKAIDFEKGSSNNIKKQKKAQDNKFMIIEFNNAECATIIYSLNETELLFNAYKEEKVPARQMEKFKLLIARPSEYVVQDLEPVKSDEIEEVVRDNSRKISLTIVPNATPSKVIESLEKNVGALQGIQFLRQKGTKNLLGLVFVEFKDSSNDVIGKLRRLPFITRAFHSCILPNKTPIQKGPIDFHSLKNLVENKNVAPHPSSRVIRLLNAVTESELADDATYSFIRNDMYNEASKYGEVVNVRIPRPSRNHTPGILQFNTSTGLGTIYIEFKDEKIALAAMMELAGKSYNDRTVLATFYDFDDFLMGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.62
3 0.65
4 0.61
5 0.61
6 0.63
7 0.58
8 0.61
9 0.63
10 0.62
11 0.54
12 0.49
13 0.44
14 0.42
15 0.48
16 0.51
17 0.5
18 0.57
19 0.66
20 0.74
21 0.78
22 0.79
23 0.71
24 0.71
25 0.74
26 0.71
27 0.62
28 0.57
29 0.55
30 0.55
31 0.59
32 0.59
33 0.59
34 0.61
35 0.63
36 0.63
37 0.61
38 0.57
39 0.53
40 0.51
41 0.49
42 0.49
43 0.49
44 0.51
45 0.54
46 0.57
47 0.59
48 0.56
49 0.6
50 0.6
51 0.61
52 0.61
53 0.62
54 0.62
55 0.61
56 0.6
57 0.59
58 0.56
59 0.57
60 0.55
61 0.48
62 0.44
63 0.41
64 0.4
65 0.39
66 0.43
67 0.47
68 0.52
69 0.59
70 0.66
71 0.73
72 0.76
73 0.78
74 0.74
75 0.75
76 0.76
77 0.73
78 0.69
79 0.7
80 0.7
81 0.68
82 0.66
83 0.61
84 0.53
85 0.53
86 0.53
87 0.48
88 0.5
89 0.5
90 0.53
91 0.53
92 0.57
93 0.56
94 0.57
95 0.6
96 0.58
97 0.53
98 0.53
99 0.49
100 0.51
101 0.54
102 0.56
103 0.51
104 0.51
105 0.52
106 0.5
107 0.51
108 0.53
109 0.49
110 0.43
111 0.47
112 0.47
113 0.47
114 0.49
115 0.54
116 0.48
117 0.54
118 0.57
119 0.57
120 0.58
121 0.61
122 0.66
123 0.68
124 0.75
125 0.71
126 0.74
127 0.76
128 0.74
129 0.71
130 0.68
131 0.67
132 0.66
133 0.7
134 0.69
135 0.69
136 0.68
137 0.64
138 0.67
139 0.64
140 0.63
141 0.63
142 0.63
143 0.65
144 0.65
145 0.67
146 0.62
147 0.65
148 0.59
149 0.54
150 0.52
151 0.47
152 0.46
153 0.44
154 0.44
155 0.4
156 0.46
157 0.5
158 0.49
159 0.49
160 0.5
161 0.52
162 0.51
163 0.51
164 0.44
165 0.42
166 0.41
167 0.38
168 0.37
169 0.32
170 0.31
171 0.34
172 0.37
173 0.36
174 0.41
175 0.47
176 0.47
177 0.5
178 0.5
179 0.48
180 0.48
181 0.47
182 0.46
183 0.47
184 0.51
185 0.55
186 0.62
187 0.61
188 0.64
189 0.66
190 0.69
191 0.7
192 0.74
193 0.77
194 0.74
195 0.79
196 0.79
197 0.8
198 0.81
199 0.8
200 0.78
201 0.76
202 0.71
203 0.7
204 0.66
205 0.63
206 0.58
207 0.59
208 0.6
209 0.55
210 0.63
211 0.61
212 0.67
213 0.71
214 0.71
215 0.7
216 0.66
217 0.71
218 0.71
219 0.74
220 0.72
221 0.72
222 0.75
223 0.67
224 0.66
225 0.61
226 0.58
227 0.53
228 0.51
229 0.44
230 0.37
231 0.36
232 0.33
233 0.31
234 0.25
235 0.22
236 0.18
237 0.2
238 0.19
239 0.2
240 0.2
241 0.2
242 0.22
243 0.31
244 0.39
245 0.41
246 0.44
247 0.51
248 0.54
249 0.56
250 0.59
251 0.5
252 0.46
253 0.45
254 0.42
255 0.37
256 0.35
257 0.35
258 0.36
259 0.41
260 0.41
261 0.36
262 0.36
263 0.32
264 0.3
265 0.31
266 0.25
267 0.23
268 0.26
269 0.27
270 0.27
271 0.3
272 0.29
273 0.32
274 0.35
275 0.34
276 0.27
277 0.28
278 0.28
279 0.26
280 0.27
281 0.23
282 0.23
283 0.22
284 0.23
285 0.22
286 0.25
287 0.25
288 0.27
289 0.25
290 0.22
291 0.22
292 0.21
293 0.22
294 0.18
295 0.17
296 0.15
297 0.16
298 0.14
299 0.14
300 0.12
301 0.1
302 0.11
303 0.12
304 0.15
305 0.16
306 0.18
307 0.22
308 0.25
309 0.25
310 0.25
311 0.27
312 0.24
313 0.3
314 0.28
315 0.23
316 0.22
317 0.21
318 0.2
319 0.18
320 0.16
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.09
330 0.12
331 0.14
332 0.13
333 0.15
334 0.14
335 0.14
336 0.17
337 0.18
338 0.18
339 0.17
340 0.18
341 0.18
342 0.19
343 0.19
344 0.18
345 0.2
346 0.25
347 0.27
348 0.29
349 0.28
350 0.28
351 0.29
352 0.28
353 0.27
354 0.22
355 0.18
356 0.19
357 0.19
358 0.17
359 0.15
360 0.14
361 0.13
362 0.1
363 0.11
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.16
368 0.16
369 0.16
370 0.18
371 0.18
372 0.18
373 0.19
374 0.21
375 0.16
376 0.22
377 0.21
378 0.21
379 0.25
380 0.24
381 0.23
382 0.21
383 0.19
384 0.14
385 0.16
386 0.16
387 0.12
388 0.13
389 0.13
390 0.13
391 0.13
392 0.13
393 0.12
394 0.13
395 0.13
396 0.11
397 0.11
398 0.11
399 0.09
400 0.11
401 0.1
402 0.1
403 0.12
404 0.13
405 0.15
406 0.2
407 0.23
408 0.28
409 0.37
410 0.4
411 0.41
412 0.49
413 0.57
414 0.61
415 0.69
416 0.71
417 0.73
418 0.73
419 0.72
420 0.64
421 0.55
422 0.45
423 0.35
424 0.28
425 0.18
426 0.13
427 0.12
428 0.1
429 0.1
430 0.09
431 0.09
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.06
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.06
442 0.06
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.1
447 0.1
448 0.1
449 0.11
450 0.14
451 0.14
452 0.17
453 0.23
454 0.26
455 0.31
456 0.36
457 0.41
458 0.43
459 0.44
460 0.41
461 0.38
462 0.38
463 0.34
464 0.33
465 0.31
466 0.28
467 0.25
468 0.26
469 0.26
470 0.21
471 0.21
472 0.16
473 0.13
474 0.14
475 0.15
476 0.14
477 0.13
478 0.14
479 0.13
480 0.12
481 0.12
482 0.09
483 0.1
484 0.1
485 0.09
486 0.09
487 0.1
488 0.12
489 0.12
490 0.13
491 0.13
492 0.15
493 0.16
494 0.15
495 0.18
496 0.22
497 0.26
498 0.31
499 0.3
500 0.29
501 0.3
502 0.31
503 0.27
504 0.22
505 0.18
506 0.17
507 0.16
508 0.17
509 0.2
510 0.22
511 0.26
512 0.28
513 0.27
514 0.23
515 0.21
516 0.21
517 0.16
518 0.13
519 0.1
520 0.13
521 0.13
522 0.16
523 0.18
524 0.18
525 0.22
526 0.24
527 0.27
528 0.26
529 0.32
530 0.33
531 0.32
532 0.35
533 0.32
534 0.3
535 0.27
536 0.24
537 0.2
538 0.16
539 0.18
540 0.14
541 0.14
542 0.16
543 0.16
544 0.15
545 0.15
546 0.16
547 0.14
548 0.21
549 0.23
550 0.23
551 0.29
552 0.31
553 0.32
554 0.34
555 0.37
556 0.38
557 0.45
558 0.46
559 0.43
560 0.44
561 0.46
562 0.46
563 0.43
564 0.39
565 0.39
566 0.42
567 0.41
568 0.4
569 0.43
570 0.46
571 0.48
572 0.47
573 0.45
574 0.42
575 0.43
576 0.45
577 0.41
578 0.43
579 0.41
580 0.4
581 0.42
582 0.38
583 0.35
584 0.37
585 0.4
586 0.35
587 0.37
588 0.38
589 0.31
590 0.37
591 0.38
592 0.33
593 0.29
594 0.3
595 0.32
596 0.38
597 0.38
598 0.33
599 0.38
600 0.37
601 0.37
602 0.38
603 0.34
604 0.27
605 0.27
606 0.24
607 0.19
608 0.18
609 0.16
610 0.13
611 0.11
612 0.09
613 0.07
614 0.07
615 0.07
616 0.08
617 0.08
618 0.08
619 0.08
620 0.09
621 0.11
622 0.11
623 0.14
624 0.16
625 0.2
626 0.23
627 0.24
628 0.24
629 0.24
630 0.23
631 0.22
632 0.18
633 0.18
634 0.15
635 0.16
636 0.22
637 0.27
638 0.28
639 0.32
640 0.33
641 0.38
642 0.45
643 0.5
644 0.53
645 0.54
646 0.59
647 0.56
648 0.63
649 0.62
650 0.62
651 0.56
652 0.48
653 0.41
654 0.36
655 0.36
656 0.28
657 0.2
658 0.12
659 0.12
660 0.1
661 0.11
662 0.11
663 0.11
664 0.11
665 0.13
666 0.13
667 0.13
668 0.17
669 0.16
670 0.15
671 0.15
672 0.15
673 0.13
674 0.13
675 0.13
676 0.08
677 0.08
678 0.08
679 0.06
680 0.06
681 0.07
682 0.07
683 0.1
684 0.13
685 0.16
686 0.18
687 0.19
688 0.22
689 0.23
690 0.24
691 0.24
692 0.22
693 0.19
694 0.2
695 0.21
696 0.18
697 0.16