FuNGI

S2K4B1

Protein Details

Accession

S2K4B1

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
488-507	LTNIIKKKIRHDDKSAAGKC	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
219-238	RIRQKLKKDAVSREGRQKGK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005607 BSD_dom IPR035925 BSD_dom_sf IPR011993 PH-like_dom_sf IPR027079 Tfb1/GTF2H1 IPR013876 TFIIH_BTF_p62_N
Gene Ontology	GO:0000439 C:transcription factor TFIIH core complex GO:0006351 P:DNA-templated transcription GO:0006289 P:nucleotide-excision repair
Pfam	View protein in Pfam PF03909 BSD PF08567 PH_TFIIH
PROSITE	View protein in PROSITE PS50858 BSD
CDD	cd13229 PH_TFIIH

Amino Acid Sequences

MWEPNEQLLLRAAVRYKKHEGTLFVTPRRVAWQQQGSSQLTPSIYYNDIGSLAQTPESSPKVLLKISAKPPVSKDYTFQFTSAKNIQERESIKAQIAELLARVRGLSSSSAVGTPAPITPSSVAASPSPSTPQTATASPAPPSLQQQAAANIRPSTPLNNTPSPSANGASPKSWRHEEFADRRALLTSSKELQILHKELVVVGRSVDEEEFWSSPYVKRIRQKLKKDAVSREGRQKGKSSRMVELKPGQQEGSDIKYTLTSQIIHNIFTEFPSVKRAYDTNVPDKMTEQSFWKRFLASEFFHRSRTGGRSQLTPYDDIFDRCLQEEDDENSKPPPMSRMDKIRFDLDLSATAEDHLESGNAPDFTMKAGREAQSLPLIRRFNKHSSRVLETTPSKTKRPEPTFEDEIQKDIIITDLLDEKPPEKIILDIQDTRRYFESQTGGLDEKKLSENDTINLLVGYKRKFGGWQPEMTNDIINPRAADKVCVELTNIIKKKIRHDDKSAAGKCVFCVKYM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.39
3	0.44
4	0.46
5	0.52
6	0.53
7	0.53
8	0.51
9	0.57
10	0.58
11	0.55
12	0.54
13	0.48
14	0.45
15	0.47
16	0.45
17	0.39
18	0.41
19	0.46
20	0.44
21	0.49
22	0.55
23	0.52
24	0.5
25	0.45
26	0.39
27	0.3
28	0.28
29	0.25
30	0.21
31	0.19
32	0.18
33	0.17
34	0.15
35	0.16
36	0.14
37	0.14
38	0.12
39	0.12
40	0.12
41	0.12
42	0.12
43	0.17
44	0.19
45	0.19
46	0.18
47	0.21
48	0.23
49	0.24
50	0.28
51	0.27
52	0.34
53	0.4
54	0.47
55	0.45
56	0.46
57	0.49
58	0.51
59	0.52
60	0.45
61	0.41
62	0.39
63	0.43
64	0.41
65	0.38
66	0.34
67	0.29
68	0.34
69	0.36
70	0.35
71	0.33
72	0.34
73	0.35
74	0.38
75	0.4
76	0.38
77	0.38
78	0.34
79	0.32
80	0.32
81	0.3
82	0.25
83	0.24
84	0.19
85	0.16
86	0.15
87	0.14
88	0.12
89	0.12
90	0.09
91	0.09
92	0.09
93	0.09
94	0.09
95	0.1
96	0.11
97	0.11
98	0.11
99	0.11
100	0.1
101	0.1
102	0.09
103	0.1
104	0.09
105	0.11
106	0.11
107	0.13
108	0.13
109	0.13
110	0.14
111	0.12
112	0.15
113	0.14
114	0.15
115	0.16
116	0.16
117	0.17
118	0.16
119	0.2
120	0.2
121	0.2
122	0.22
123	0.23
124	0.24
125	0.23
126	0.24
127	0.21
128	0.2
129	0.22
130	0.23
131	0.2
132	0.19
133	0.19
134	0.24
135	0.26
136	0.27
137	0.25
138	0.22
139	0.21
140	0.22
141	0.22
142	0.2
143	0.21
144	0.25
145	0.29
146	0.33
147	0.34
148	0.34
149	0.35
150	0.34
151	0.31
152	0.25
153	0.21
154	0.21
155	0.22
156	0.22
157	0.23
158	0.24
159	0.27
160	0.31
161	0.3
162	0.3
163	0.33
164	0.4
165	0.42
166	0.45
167	0.44
168	0.4
169	0.39
170	0.36
171	0.32
172	0.24
173	0.2
174	0.18
175	0.16
176	0.17
177	0.17
178	0.17
179	0.19
180	0.23
181	0.23
182	0.2
183	0.19
184	0.18
185	0.17
186	0.19
187	0.16
188	0.11
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.08
193	0.08
194	0.06
195	0.07
196	0.09
197	0.09
198	0.09
199	0.1
200	0.1
201	0.12
202	0.18
203	0.21
204	0.24
205	0.31
206	0.4
207	0.5
208	0.59
209	0.66
210	0.7
211	0.75
212	0.78
213	0.78
214	0.74
215	0.72
216	0.7
217	0.65
218	0.64
219	0.63
220	0.58
221	0.53
222	0.54
223	0.51
224	0.51
225	0.55
226	0.48
227	0.47
228	0.5
229	0.49
230	0.48
231	0.47
232	0.43
233	0.37
234	0.35
235	0.28
236	0.22
237	0.22
238	0.18
239	0.18
240	0.14
241	0.12
242	0.12
243	0.12
244	0.12
245	0.12
246	0.12
247	0.09
248	0.09
249	0.16
250	0.16
251	0.16
252	0.16
253	0.16
254	0.14
255	0.14
256	0.15
257	0.09
258	0.09
259	0.13
260	0.13
261	0.13
262	0.14
263	0.14
264	0.15
265	0.22
266	0.26
267	0.28
268	0.31
269	0.31
270	0.3
271	0.3
272	0.3
273	0.24
274	0.2
275	0.19
276	0.23
277	0.25
278	0.28
279	0.27
280	0.25
281	0.24
282	0.27
283	0.27
284	0.2
285	0.26
286	0.31
287	0.32
288	0.33
289	0.33
290	0.3
291	0.29
292	0.32
293	0.29
294	0.27
295	0.27
296	0.29
297	0.3
298	0.35
299	0.33
300	0.3
301	0.25
302	0.23
303	0.23
304	0.2
305	0.21
306	0.18
307	0.17
308	0.16
309	0.17
310	0.14
311	0.14
312	0.15
313	0.16
314	0.18
315	0.18
316	0.18
317	0.18
318	0.19
319	0.18
320	0.16
321	0.16
322	0.18
323	0.23
324	0.27
325	0.37
326	0.41
327	0.46
328	0.48
329	0.46
330	0.41
331	0.37
332	0.34
333	0.24
334	0.22
335	0.18
336	0.16
337	0.14
338	0.14
339	0.12
340	0.1
341	0.09
342	0.06
343	0.05
344	0.04
345	0.06
346	0.08
347	0.08
348	0.08
349	0.08
350	0.08
351	0.1
352	0.13
353	0.12
354	0.12
355	0.16
356	0.17
357	0.19
358	0.2
359	0.21
360	0.24
361	0.27
362	0.26
363	0.29
364	0.32
365	0.32
366	0.36
367	0.4
368	0.43
369	0.49
370	0.54
371	0.54
372	0.56
373	0.6
374	0.58
375	0.54
376	0.52
377	0.47
378	0.48
379	0.5
380	0.48
381	0.45
382	0.47
383	0.54
384	0.57
385	0.6
386	0.6
387	0.58
388	0.62
389	0.65
390	0.63
391	0.62
392	0.52
393	0.47
394	0.4
395	0.33
396	0.25
397	0.19
398	0.16
399	0.08
400	0.07
401	0.07
402	0.1
403	0.11
404	0.12
405	0.13
406	0.13
407	0.15
408	0.16
409	0.16
410	0.12
411	0.13
412	0.16
413	0.21
414	0.26
415	0.3
416	0.33
417	0.41
418	0.41
419	0.42
420	0.4
421	0.37
422	0.33
423	0.32
424	0.32
425	0.25
426	0.27
427	0.28
428	0.28
429	0.26
430	0.27
431	0.22
432	0.2
433	0.22
434	0.21
435	0.2
436	0.23
437	0.25
438	0.24
439	0.27
440	0.24
441	0.21
442	0.2
443	0.19
444	0.16
445	0.19
446	0.2
447	0.2
448	0.21
449	0.21
450	0.25
451	0.31
452	0.39
453	0.39
454	0.44
455	0.44
456	0.47
457	0.49
458	0.46
459	0.4
460	0.3
461	0.29
462	0.24
463	0.22
464	0.19
465	0.18
466	0.22
467	0.22
468	0.24
469	0.21
470	0.25
471	0.26
472	0.25
473	0.26
474	0.26
475	0.31
476	0.38
477	0.4
478	0.4
479	0.43
480	0.45
481	0.54
482	0.59
483	0.64
484	0.61
485	0.67
486	0.71
487	0.75
488	0.83
489	0.77
490	0.71
491	0.63
492	0.56
493	0.49
494	0.5

S2K4B1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer