Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JMN3

Protein Details
Accession S2JMN3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
336-363SREVDPNKKVSSRKKKKNNASMYQVLEKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
344-352KVSSRKKKK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10.666, mito 7, cyto_mito 6.666, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR001900  RNase_II/R  
IPR022966  RNase_II/R_CS  
IPR033770  RRP44_S1  
Gene Ontology GO:0000178  C:exosome (RNase complex)  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0004540  F:RNA nuclease activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00773  RNB  
PF17215  Rrp44_S1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01175  RIBONUCLEASE_II  
Amino Acid Sequences MILANASVGKRIYDGFKDAAILRHHPPPTLGQFEKLVKAANSRGFSVDFSSNKALAKSLETITLGCKNDPEIAKLLKTMATIAMNEAGYISSGHYPVNQYYHYGLALEFYTHFTSPIRRYADVIAHRQLLMCVQDPTTVADAKARGSVMLKDATISDICDNLNLKSRESKFAQRDSTELFQSLYVLQHTSNETTLIERGVVSEIRSNGFYVFVPRLGLKGPVYLKDKDGQPHVPLSLISGKNSDETIPNCFIEVNMPTNISVHSADLPQPIQFNLFDNVRVSLNIRKSHAHRHMVYMTLVDLEHVELTGKKDASAAVARMTNTEMMHAIEVEEEASREVDPNKKVSSRKKKKNNASMYQVLEKFRKLSIIENTSVNE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.24
4 0.26
5 0.27
6 0.3
7 0.3
8 0.3
9 0.3
10 0.36
11 0.37
12 0.35
13 0.35
14 0.37
15 0.39
16 0.44
17 0.41
18 0.36
19 0.41
20 0.43
21 0.44
22 0.37
23 0.34
24 0.27
25 0.3
26 0.34
27 0.35
28 0.34
29 0.32
30 0.34
31 0.31
32 0.31
33 0.3
34 0.31
35 0.25
36 0.27
37 0.3
38 0.29
39 0.29
40 0.28
41 0.25
42 0.2
43 0.22
44 0.21
45 0.18
46 0.19
47 0.19
48 0.19
49 0.21
50 0.26
51 0.25
52 0.21
53 0.21
54 0.2
55 0.26
56 0.27
57 0.26
58 0.24
59 0.25
60 0.26
61 0.26
62 0.25
63 0.2
64 0.19
65 0.17
66 0.15
67 0.14
68 0.13
69 0.13
70 0.15
71 0.13
72 0.13
73 0.12
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.07
79 0.08
80 0.09
81 0.1
82 0.12
83 0.14
84 0.17
85 0.16
86 0.16
87 0.17
88 0.18
89 0.16
90 0.15
91 0.13
92 0.11
93 0.1
94 0.09
95 0.08
96 0.1
97 0.12
98 0.11
99 0.12
100 0.12
101 0.17
102 0.19
103 0.26
104 0.27
105 0.26
106 0.28
107 0.3
108 0.36
109 0.36
110 0.38
111 0.34
112 0.31
113 0.31
114 0.29
115 0.26
116 0.2
117 0.17
118 0.13
119 0.11
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.14
124 0.14
125 0.13
126 0.11
127 0.13
128 0.13
129 0.12
130 0.13
131 0.11
132 0.1
133 0.11
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.1
148 0.09
149 0.17
150 0.17
151 0.17
152 0.24
153 0.26
154 0.29
155 0.32
156 0.4
157 0.37
158 0.43
159 0.46
160 0.39
161 0.39
162 0.37
163 0.36
164 0.28
165 0.23
166 0.17
167 0.14
168 0.13
169 0.12
170 0.09
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.08
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.12
205 0.09
206 0.13
207 0.14
208 0.18
209 0.22
210 0.23
211 0.24
212 0.26
213 0.29
214 0.27
215 0.3
216 0.27
217 0.25
218 0.26
219 0.25
220 0.21
221 0.18
222 0.18
223 0.21
224 0.19
225 0.18
226 0.17
227 0.18
228 0.18
229 0.19
230 0.17
231 0.13
232 0.13
233 0.17
234 0.18
235 0.18
236 0.17
237 0.17
238 0.16
239 0.15
240 0.16
241 0.14
242 0.12
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.14
247 0.13
248 0.11
249 0.09
250 0.1
251 0.11
252 0.13
253 0.14
254 0.15
255 0.13
256 0.14
257 0.13
258 0.14
259 0.13
260 0.13
261 0.15
262 0.15
263 0.15
264 0.15
265 0.16
266 0.15
267 0.15
268 0.15
269 0.19
270 0.24
271 0.27
272 0.28
273 0.32
274 0.36
275 0.46
276 0.52
277 0.54
278 0.49
279 0.52
280 0.52
281 0.49
282 0.46
283 0.35
284 0.27
285 0.19
286 0.18
287 0.11
288 0.09
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.11
295 0.16
296 0.15
297 0.15
298 0.16
299 0.16
300 0.19
301 0.22
302 0.2
303 0.18
304 0.2
305 0.2
306 0.2
307 0.22
308 0.2
309 0.16
310 0.17
311 0.14
312 0.13
313 0.13
314 0.12
315 0.11
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.1
325 0.14
326 0.2
327 0.23
328 0.27
329 0.32
330 0.37
331 0.46
332 0.55
333 0.63
334 0.67
335 0.75
336 0.82
337 0.87
338 0.92
339 0.95
340 0.94
341 0.92
342 0.89
343 0.86
344 0.8
345 0.78
346 0.71
347 0.66
348 0.58
349 0.52
350 0.45
351 0.38
352 0.37
353 0.3
354 0.33
355 0.38
356 0.41
357 0.41