Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2J2L9

Protein Details
Accession S2J2L9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
406-432EEKARERDQLRHERQKQRQREMRMSKMBasic
574-594DTFLNKAKKGKRAREDDGDSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
580-586AKKGKRA
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito_nucl 13.5, mito 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MASLSSLLPKPRQTLASAPSAAPQLEKQINQLITKSTQSRIPPYGQRKSFRPRVAEDFGNGGAFPEVHIAQYPLNMGRKDQKASADRKGGALTLQVDEDGNVKYDAIARQGHSDDRIVHSSYKDMVPINERKDMDVDKLVMDRPGAEEVQSVAEKTRLALEKIVNTKIKALQPKNVGPPNGSGTNKDPTYIRYTPSQSQAGEGFNSGAKQRIIRMVDAPSDPMEPPSHLHKKVPRGPPSPPAPVMHSPPRKLTAKEQAEWVIPPCVSNWKNTKGYTIPLDKRLAADGRGLQELTINDNFAKFSEALYAADRHARDEVRQRNLMQQKLAQKQKEAEEDKLRQLAQKAREERAGFKPSTSVDAAPANANRPSASSLMVDYESSDESGSDKSDSEDESPARRAVEDSDEEKARERDQLRHERQKQRQREMRMSKMGTEAKAKHLARESGRDISEKIALGLAKPSLSKESMYDARLFNQSEGIGSGFKDDDAYNTYDKPLFNQSGSSIYRFRGDNNESEVLGSTNAEDLERSIRQDKFGVRKGFQGTEGGESSSGPVEFEKETLAQPKKVEKDVFGLDTFLNKAKKGKRAREDDGDSDDDRRKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.41
3 0.45
4 0.43
5 0.39
6 0.37
7 0.37
8 0.33
9 0.27
10 0.24
11 0.24
12 0.28
13 0.28
14 0.29
15 0.34
16 0.38
17 0.37
18 0.38
19 0.34
20 0.32
21 0.37
22 0.37
23 0.32
24 0.34
25 0.37
26 0.43
27 0.43
28 0.47
29 0.51
30 0.57
31 0.65
32 0.67
33 0.68
34 0.7
35 0.75
36 0.77
37 0.75
38 0.72
39 0.68
40 0.68
41 0.68
42 0.63
43 0.54
44 0.48
45 0.42
46 0.35
47 0.29
48 0.21
49 0.15
50 0.12
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.13
59 0.15
60 0.16
61 0.22
62 0.22
63 0.25
64 0.32
65 0.37
66 0.39
67 0.4
68 0.44
69 0.46
70 0.53
71 0.58
72 0.57
73 0.52
74 0.51
75 0.48
76 0.4
77 0.32
78 0.29
79 0.23
80 0.16
81 0.15
82 0.14
83 0.13
84 0.13
85 0.14
86 0.11
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.13
92 0.14
93 0.16
94 0.18
95 0.18
96 0.22
97 0.24
98 0.26
99 0.24
100 0.25
101 0.23
102 0.25
103 0.27
104 0.25
105 0.26
106 0.24
107 0.25
108 0.25
109 0.23
110 0.21
111 0.19
112 0.2
113 0.25
114 0.31
115 0.33
116 0.37
117 0.36
118 0.35
119 0.37
120 0.37
121 0.33
122 0.29
123 0.26
124 0.21
125 0.22
126 0.22
127 0.19
128 0.17
129 0.14
130 0.12
131 0.14
132 0.13
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.14
137 0.14
138 0.12
139 0.11
140 0.12
141 0.11
142 0.11
143 0.17
144 0.16
145 0.17
146 0.21
147 0.23
148 0.28
149 0.32
150 0.38
151 0.34
152 0.32
153 0.34
154 0.35
155 0.38
156 0.41
157 0.4
158 0.41
159 0.45
160 0.5
161 0.55
162 0.55
163 0.5
164 0.42
165 0.42
166 0.4
167 0.4
168 0.35
169 0.29
170 0.28
171 0.33
172 0.31
173 0.29
174 0.25
175 0.22
176 0.3
177 0.29
178 0.27
179 0.27
180 0.31
181 0.34
182 0.39
183 0.39
184 0.31
185 0.31
186 0.31
187 0.27
188 0.22
189 0.19
190 0.15
191 0.12
192 0.12
193 0.11
194 0.12
195 0.11
196 0.11
197 0.13
198 0.18
199 0.19
200 0.2
201 0.22
202 0.21
203 0.24
204 0.23
205 0.22
206 0.17
207 0.17
208 0.16
209 0.15
210 0.14
211 0.12
212 0.13
213 0.21
214 0.27
215 0.27
216 0.32
217 0.36
218 0.45
219 0.53
220 0.6
221 0.6
222 0.57
223 0.59
224 0.62
225 0.61
226 0.57
227 0.5
228 0.42
229 0.39
230 0.38
231 0.39
232 0.41
233 0.41
234 0.38
235 0.38
236 0.42
237 0.4
238 0.4
239 0.41
240 0.42
241 0.42
242 0.41
243 0.41
244 0.37
245 0.35
246 0.33
247 0.28
248 0.19
249 0.14
250 0.13
251 0.11
252 0.18
253 0.17
254 0.22
255 0.26
256 0.3
257 0.35
258 0.35
259 0.38
260 0.31
261 0.33
262 0.33
263 0.36
264 0.32
265 0.33
266 0.34
267 0.31
268 0.3
269 0.3
270 0.25
271 0.18
272 0.17
273 0.14
274 0.14
275 0.15
276 0.14
277 0.12
278 0.13
279 0.12
280 0.13
281 0.12
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.08
287 0.1
288 0.07
289 0.06
290 0.08
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.11
295 0.1
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.13
300 0.13
301 0.14
302 0.23
303 0.29
304 0.31
305 0.34
306 0.34
307 0.4
308 0.45
309 0.45
310 0.37
311 0.35
312 0.38
313 0.44
314 0.49
315 0.42
316 0.38
317 0.4
318 0.42
319 0.46
320 0.41
321 0.38
322 0.39
323 0.41
324 0.41
325 0.4
326 0.36
327 0.3
328 0.31
329 0.32
330 0.31
331 0.36
332 0.37
333 0.37
334 0.42
335 0.41
336 0.42
337 0.43
338 0.42
339 0.34
340 0.3
341 0.3
342 0.26
343 0.28
344 0.24
345 0.17
346 0.14
347 0.15
348 0.15
349 0.15
350 0.16
351 0.14
352 0.14
353 0.14
354 0.12
355 0.12
356 0.14
357 0.12
358 0.13
359 0.11
360 0.1
361 0.12
362 0.12
363 0.11
364 0.09
365 0.1
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.06
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.09
377 0.11
378 0.12
379 0.15
380 0.16
381 0.18
382 0.2
383 0.2
384 0.19
385 0.18
386 0.16
387 0.15
388 0.18
389 0.19
390 0.19
391 0.22
392 0.23
393 0.23
394 0.26
395 0.25
396 0.21
397 0.25
398 0.26
399 0.29
400 0.38
401 0.49
402 0.54
403 0.64
404 0.73
405 0.76
406 0.84
407 0.86
408 0.86
409 0.86
410 0.85
411 0.82
412 0.83
413 0.81
414 0.8
415 0.78
416 0.69
417 0.6
418 0.6
419 0.54
420 0.46
421 0.44
422 0.37
423 0.34
424 0.42
425 0.4
426 0.37
427 0.39
428 0.43
429 0.39
430 0.44
431 0.43
432 0.39
433 0.4
434 0.38
435 0.33
436 0.3
437 0.29
438 0.23
439 0.19
440 0.15
441 0.14
442 0.13
443 0.14
444 0.13
445 0.11
446 0.11
447 0.12
448 0.13
449 0.15
450 0.15
451 0.14
452 0.2
453 0.23
454 0.25
455 0.28
456 0.25
457 0.27
458 0.31
459 0.31
460 0.24
461 0.22
462 0.2
463 0.17
464 0.17
465 0.15
466 0.11
467 0.1
468 0.11
469 0.09
470 0.09
471 0.1
472 0.09
473 0.1
474 0.14
475 0.16
476 0.16
477 0.17
478 0.19
479 0.21
480 0.21
481 0.22
482 0.26
483 0.26
484 0.24
485 0.25
486 0.24
487 0.28
488 0.31
489 0.31
490 0.25
491 0.24
492 0.27
493 0.26
494 0.27
495 0.3
496 0.31
497 0.32
498 0.36
499 0.37
500 0.33
501 0.34
502 0.32
503 0.23
504 0.2
505 0.16
506 0.1
507 0.09
508 0.09
509 0.08
510 0.08
511 0.09
512 0.14
513 0.15
514 0.18
515 0.23
516 0.24
517 0.27
518 0.32
519 0.38
520 0.42
521 0.5
522 0.53
523 0.48
524 0.54
525 0.57
526 0.54
527 0.48
528 0.42
529 0.35
530 0.32
531 0.32
532 0.26
533 0.21
534 0.18
535 0.19
536 0.17
537 0.15
538 0.11
539 0.1
540 0.12
541 0.12
542 0.13
543 0.14
544 0.13
545 0.16
546 0.25
547 0.3
548 0.31
549 0.34
550 0.43
551 0.46
552 0.52
553 0.52
554 0.45
555 0.46
556 0.48
557 0.48
558 0.4
559 0.36
560 0.29
561 0.29
562 0.29
563 0.28
564 0.25
565 0.23
566 0.31
567 0.37
568 0.46
569 0.54
570 0.62
571 0.66
572 0.73
573 0.79
574 0.81
575 0.81
576 0.77
577 0.73
578 0.67
579 0.58
580 0.54