Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2KA03

Protein Details
Accession S2KA03    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
347-369RDDLERLKKIRNHRGLRHYWGVRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
355-364KIRNHRGLRH
368-391VRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSKKK
Subcellular Location(s) cyto 16, nucl 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027437  30s_Rbsml_prot_S13_C  
IPR036412  HAD-like_sf  
IPR006384  HAD_hydro_PyrdxlP_Pase-like  
IPR023214  HAD_sf  
IPR001892  Ribosomal_S13  
IPR010979  Ribosomal_S13-like_H2TH  
IPR018269  Ribosomal_S13_CS  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0016791  F:phosphatase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF12710  HAD  
PF00416  Ribosomal_S13  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00646  RIBOSOMAL_S13_1  
PS50159  RIBOSOMAL_S13_2  
Amino Acid Sequences MTKTNVQVFTDFDGTLSLDDTGLLLIDDHRSMGPERRRVLEHEILDGTKTYRDALQEMWDSVHISWDEAWAEYLDKCTIDPGFPSFNDYCRENNFPVTIISSGLLPLLSKIMTNFLGDKAKDIEIVSNNGKVEGRNWKIIWRDDSIYGNDKSKTLAKAREQANKDTIFVFCGDGVSDISAAKHADVLFARKDRDLEFYCKREDIPYIPFDTFAEVESVVRKLVDGKARIEKSSSGFCKSLVVPERNHFQHIIRLLNTNVDGRVKIQIALTSVKGVGRRFANIACKKADIDLTKRAGELSSEELERIVTILQNPAQYKIPTWFLNRQKDIVDGKSSQVISNVLDTKYRDDLERLKKIRNHRGLRHYWGVRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.15
4 0.1
5 0.08
6 0.08
7 0.08
8 0.07
9 0.06
10 0.06
11 0.05
12 0.06
13 0.08
14 0.08
15 0.09
16 0.09
17 0.11
18 0.14
19 0.23
20 0.3
21 0.36
22 0.4
23 0.43
24 0.46
25 0.49
26 0.54
27 0.53
28 0.46
29 0.43
30 0.42
31 0.37
32 0.36
33 0.32
34 0.25
35 0.19
36 0.18
37 0.15
38 0.15
39 0.16
40 0.17
41 0.18
42 0.23
43 0.23
44 0.23
45 0.23
46 0.21
47 0.21
48 0.19
49 0.22
50 0.16
51 0.14
52 0.13
53 0.14
54 0.14
55 0.13
56 0.14
57 0.1
58 0.11
59 0.11
60 0.12
61 0.11
62 0.11
63 0.1
64 0.12
65 0.12
66 0.12
67 0.13
68 0.14
69 0.17
70 0.17
71 0.23
72 0.22
73 0.24
74 0.27
75 0.27
76 0.27
77 0.28
78 0.33
79 0.29
80 0.31
81 0.28
82 0.26
83 0.25
84 0.23
85 0.19
86 0.14
87 0.13
88 0.1
89 0.09
90 0.08
91 0.07
92 0.05
93 0.05
94 0.06
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.09
99 0.09
100 0.1
101 0.11
102 0.13
103 0.18
104 0.18
105 0.19
106 0.19
107 0.19
108 0.19
109 0.18
110 0.19
111 0.16
112 0.21
113 0.21
114 0.2
115 0.2
116 0.2
117 0.2
118 0.16
119 0.18
120 0.23
121 0.25
122 0.27
123 0.28
124 0.31
125 0.35
126 0.39
127 0.39
128 0.33
129 0.32
130 0.29
131 0.32
132 0.3
133 0.3
134 0.28
135 0.27
136 0.24
137 0.22
138 0.21
139 0.23
140 0.24
141 0.24
142 0.29
143 0.31
144 0.38
145 0.44
146 0.5
147 0.49
148 0.49
149 0.49
150 0.43
151 0.4
152 0.33
153 0.27
154 0.2
155 0.17
156 0.14
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.05
169 0.07
170 0.06
171 0.08
172 0.08
173 0.11
174 0.13
175 0.15
176 0.16
177 0.15
178 0.16
179 0.15
180 0.21
181 0.21
182 0.25
183 0.28
184 0.29
185 0.3
186 0.3
187 0.29
188 0.24
189 0.23
190 0.19
191 0.18
192 0.18
193 0.19
194 0.18
195 0.18
196 0.17
197 0.17
198 0.14
199 0.11
200 0.1
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.11
210 0.16
211 0.17
212 0.2
213 0.29
214 0.3
215 0.3
216 0.3
217 0.28
218 0.25
219 0.31
220 0.3
221 0.26
222 0.25
223 0.24
224 0.26
225 0.24
226 0.29
227 0.27
228 0.29
229 0.27
230 0.3
231 0.37
232 0.35
233 0.37
234 0.31
235 0.25
236 0.27
237 0.28
238 0.28
239 0.22
240 0.24
241 0.22
242 0.22
243 0.23
244 0.19
245 0.16
246 0.14
247 0.13
248 0.12
249 0.15
250 0.14
251 0.14
252 0.13
253 0.14
254 0.15
255 0.16
256 0.16
257 0.13
258 0.13
259 0.14
260 0.16
261 0.15
262 0.18
263 0.17
264 0.18
265 0.19
266 0.22
267 0.31
268 0.33
269 0.36
270 0.33
271 0.33
272 0.32
273 0.32
274 0.34
275 0.28
276 0.29
277 0.33
278 0.35
279 0.34
280 0.34
281 0.32
282 0.27
283 0.23
284 0.2
285 0.17
286 0.16
287 0.15
288 0.15
289 0.15
290 0.15
291 0.14
292 0.12
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.11
297 0.13
298 0.18
299 0.19
300 0.21
301 0.24
302 0.23
303 0.24
304 0.24
305 0.27
306 0.27
307 0.32
308 0.39
309 0.44
310 0.54
311 0.55
312 0.53
313 0.5
314 0.52
315 0.51
316 0.45
317 0.41
318 0.33
319 0.32
320 0.35
321 0.35
322 0.29
323 0.26
324 0.23
325 0.19
326 0.23
327 0.25
328 0.2
329 0.23
330 0.24
331 0.26
332 0.29
333 0.3
334 0.26
335 0.27
336 0.36
337 0.43
338 0.52
339 0.51
340 0.55
341 0.6
342 0.68
343 0.74
344 0.75
345 0.75
346 0.75
347 0.81
348 0.81
349 0.83
350 0.83
351 0.75
352 0.72
353 0.69
354 0.64
355 0.59
356 0.58
357 0.56
358 0.55
359 0.56
360 0.55
361 0.55
362 0.6
363 0.62
364 0.66
365 0.68
366 0.65
367 0.68
368 0.65
369 0.65
370 0.64
371 0.68