Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2J9P9

Protein Details
Accession S2J9P9    Localization Confidence Low Confidence Score 7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
446-465YKTGRGNWGKQKNNKARNEDHydrophilic
579-598GFPLRAKVPKRQQQWIALRCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 19, E.R. 4, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008949  Isoprenoid_synthase_dom_sf  
IPR002060  Squ/phyt_synthse  
IPR044843  Trans_IPPS_bact-type  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0004311  F:farnesyltranstransferase activity  
GO:0016117  P:carotenoid biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00494  SQS_PSY  
Amino Acid Sequences MTYMYYASAALLVIFSVYRPFITKLDKVKYGALGGASFLAPFVIDYNNRATSTNQQQHQQQLNMTSILHLIHVNASNMPVSPTSSQSLFSDAVVLFMLTAFIVSVCGLFTRWHFPITFIKPNSSILVSGFVRHGLSILIILMAITSQYASLQSVSFALTTIGLLWYIAGPYFIRRARVIAATSMISTVLGFLVCCTAYTHSKLYATSILDCTLFVLVLVLSCNAIDYLDTILNTYPHLVQKDKTKQAALQDQASLAYWMAIAQLVSNMPNESDLHASPIDDLETAIRVLGPASRSWKTMAALFPVNLRQDLCLLYAFFRTADDLVDDAPTPKQCEQNLITIRRFLREVFFPAKADKQQYDQQDLTLPGHINWTYYATLLPNQDVLAIFRNFARISHYLCPRAMSELTDAWEHDLRGEPVKKQKDLLNYAALISGTFGELCTCAIMYKTGRGNWGKQKNNKARNEDVLSRARATGQCLQLINIARDVIADSLVGRCYVPLQYMPYPPQNMYHILKVARNPLLVGEQTLKSFSIRILGLADQISDRAQKGIDGLPEEVQDSIRAAFEIYMAIGPTLINDPGFPLRAKVPKRQQQWIALRCIYGFRGPVARAISSTFYEMISIYTRAFARLSNARKTATARTVVAAAAAAN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.07
4 0.08
5 0.09
6 0.12
7 0.15
8 0.19
9 0.26
10 0.33
11 0.4
12 0.46
13 0.5
14 0.5
15 0.51
16 0.49
17 0.44
18 0.39
19 0.31
20 0.24
21 0.2
22 0.18
23 0.14
24 0.12
25 0.1
26 0.08
27 0.06
28 0.06
29 0.07
30 0.1
31 0.11
32 0.14
33 0.19
34 0.23
35 0.24
36 0.25
37 0.26
38 0.31
39 0.41
40 0.47
41 0.45
42 0.47
43 0.52
44 0.6
45 0.64
46 0.59
47 0.51
48 0.46
49 0.45
50 0.4
51 0.35
52 0.27
53 0.21
54 0.17
55 0.15
56 0.12
57 0.1
58 0.13
59 0.15
60 0.15
61 0.15
62 0.15
63 0.15
64 0.15
65 0.16
66 0.13
67 0.14
68 0.14
69 0.17
70 0.19
71 0.19
72 0.2
73 0.19
74 0.23
75 0.2
76 0.18
77 0.19
78 0.16
79 0.16
80 0.14
81 0.13
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.04
86 0.04
87 0.03
88 0.03
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.06
95 0.07
96 0.09
97 0.15
98 0.16
99 0.19
100 0.19
101 0.22
102 0.3
103 0.37
104 0.44
105 0.39
106 0.41
107 0.41
108 0.43
109 0.42
110 0.33
111 0.26
112 0.18
113 0.22
114 0.19
115 0.19
116 0.17
117 0.16
118 0.15
119 0.14
120 0.14
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.06
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.04
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.07
158 0.13
159 0.15
160 0.17
161 0.17
162 0.19
163 0.21
164 0.24
165 0.24
166 0.19
167 0.19
168 0.17
169 0.17
170 0.15
171 0.12
172 0.09
173 0.08
174 0.06
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.07
183 0.09
184 0.12
185 0.16
186 0.17
187 0.18
188 0.19
189 0.19
190 0.2
191 0.21
192 0.2
193 0.19
194 0.18
195 0.17
196 0.16
197 0.15
198 0.14
199 0.1
200 0.08
201 0.06
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.11
224 0.14
225 0.15
226 0.16
227 0.26
228 0.35
229 0.4
230 0.4
231 0.39
232 0.39
233 0.44
234 0.49
235 0.41
236 0.34
237 0.29
238 0.27
239 0.25
240 0.23
241 0.17
242 0.09
243 0.07
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.03
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.07
258 0.08
259 0.1
260 0.09
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.1
265 0.1
266 0.09
267 0.07
268 0.07
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.12
280 0.13
281 0.14
282 0.16
283 0.18
284 0.17
285 0.19
286 0.19
287 0.17
288 0.17
289 0.16
290 0.16
291 0.17
292 0.17
293 0.14
294 0.13
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.1
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.08
317 0.1
318 0.12
319 0.15
320 0.15
321 0.2
322 0.21
323 0.28
324 0.34
325 0.36
326 0.35
327 0.35
328 0.35
329 0.31
330 0.3
331 0.23
332 0.19
333 0.16
334 0.2
335 0.19
336 0.2
337 0.2
338 0.21
339 0.23
340 0.23
341 0.25
342 0.21
343 0.22
344 0.26
345 0.28
346 0.32
347 0.29
348 0.27
349 0.27
350 0.27
351 0.23
352 0.2
353 0.18
354 0.12
355 0.15
356 0.14
357 0.12
358 0.11
359 0.12
360 0.1
361 0.1
362 0.1
363 0.09
364 0.11
365 0.12
366 0.12
367 0.1
368 0.09
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.12
373 0.11
374 0.11
375 0.11
376 0.13
377 0.12
378 0.13
379 0.16
380 0.14
381 0.18
382 0.24
383 0.29
384 0.3
385 0.3
386 0.31
387 0.27
388 0.28
389 0.24
390 0.19
391 0.17
392 0.15
393 0.16
394 0.15
395 0.15
396 0.14
397 0.15
398 0.13
399 0.12
400 0.13
401 0.13
402 0.19
403 0.21
404 0.22
405 0.3
406 0.35
407 0.36
408 0.36
409 0.39
410 0.4
411 0.44
412 0.43
413 0.38
414 0.33
415 0.32
416 0.3
417 0.26
418 0.17
419 0.12
420 0.09
421 0.06
422 0.05
423 0.05
424 0.04
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.04
429 0.04
430 0.05
431 0.08
432 0.08
433 0.14
434 0.17
435 0.18
436 0.25
437 0.28
438 0.34
439 0.42
440 0.51
441 0.54
442 0.59
443 0.68
444 0.72
445 0.79
446 0.8
447 0.77
448 0.72
449 0.72
450 0.7
451 0.62
452 0.58
453 0.54
454 0.49
455 0.43
456 0.38
457 0.33
458 0.28
459 0.29
460 0.3
461 0.26
462 0.27
463 0.27
464 0.27
465 0.28
466 0.3
467 0.26
468 0.2
469 0.17
470 0.14
471 0.14
472 0.14
473 0.09
474 0.07
475 0.06
476 0.06
477 0.07
478 0.07
479 0.08
480 0.07
481 0.06
482 0.08
483 0.09
484 0.1
485 0.1
486 0.15
487 0.19
488 0.23
489 0.27
490 0.31
491 0.33
492 0.32
493 0.34
494 0.31
495 0.33
496 0.32
497 0.31
498 0.3
499 0.29
500 0.32
501 0.32
502 0.36
503 0.33
504 0.3
505 0.27
506 0.24
507 0.25
508 0.23
509 0.22
510 0.19
511 0.17
512 0.18
513 0.18
514 0.17
515 0.15
516 0.15
517 0.13
518 0.14
519 0.13
520 0.13
521 0.14
522 0.14
523 0.15
524 0.15
525 0.15
526 0.11
527 0.11
528 0.12
529 0.12
530 0.12
531 0.11
532 0.11
533 0.11
534 0.13
535 0.16
536 0.17
537 0.18
538 0.19
539 0.19
540 0.2
541 0.2
542 0.18
543 0.15
544 0.12
545 0.11
546 0.1
547 0.09
548 0.09
549 0.09
550 0.08
551 0.08
552 0.08
553 0.07
554 0.07
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.06
559 0.07
560 0.09
561 0.09
562 0.08
563 0.08
564 0.11
565 0.14
566 0.16
567 0.15
568 0.16
569 0.22
570 0.3
571 0.35
572 0.43
573 0.51
574 0.58
575 0.65
576 0.72
577 0.72
578 0.74
579 0.8
580 0.77
581 0.74
582 0.67
583 0.6
584 0.52
585 0.47
586 0.39
587 0.32
588 0.26
589 0.21
590 0.25
591 0.25
592 0.29
593 0.29
594 0.27
595 0.25
596 0.26
597 0.27
598 0.23
599 0.25
600 0.21
601 0.17
602 0.17
603 0.16
604 0.16
605 0.15
606 0.15
607 0.13
608 0.16
609 0.16
610 0.17
611 0.18
612 0.17
613 0.21
614 0.29
615 0.35
616 0.39
617 0.43
618 0.43
619 0.46
620 0.5
621 0.52
622 0.49
623 0.48
624 0.41
625 0.39
626 0.39
627 0.35
628 0.31