Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JLP8

Protein Details
Accession S2JLP8    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-74APHSRHKSSRAPPPKKVVPIHydrophilic
328-353MLTTKERKKMRRQRRAEALKDKRDKIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
56-70PHSRHKSSRAPPPKK
332-354KERKKMRRQRRAEALKDKRDKIR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.666, mito_nucl 11.666, cyto 5, cyto_mito 4.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013881  Pre-mRNA_splic_Prp3_dom  
IPR027104  Prp3  
IPR010541  Prp3_C  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06544  DUF1115  
PF08572  PRP3  
Amino Acid Sequences MDPKQQALIEAKRAEILAKLQKFQKPGGSLNPTAPKPAPTKPQAPPPQPPSSSSAPHSRHKSSRAPPPKKVVPIPAPPPTGTSGGLNLVELQRRIAEAKTRLTGSPAGANGRSSAIGGPSTRTNQTKPPNMPFDKSGQIDLKAMMDTGIIPRRETTNSKALQRAKQTTSIPAAAEKKPLKIVDEVPAEFTDPTKNPYFDPSMEVKIAPKSRRSRQLKFVQPGKYIDIANQERAKAQLEKLKQEITESVKKAGMQTEFDVSDKVIKRDAPPAVEWWDAPFLANKTYDDLNENEINPDKFDTLVTLYVHHPVVIQPPGEVNAAPVVRSLMLTTKERKKMRRQRRAEALKDKRDKIRLGLLEPDAPKVKISNLMRVLGEEAIQDPTKVEAKVRKEMELRQKMHDKANEQRKLTPEERRAKILNKLKEDQKTSNEVAVFKIKSCSHPKLRYKIEMNAQQHQLTGIVIVHPKCNIVIVEGGPKAIKAYKKLMLRRIDWNDMPPPKNLEADEAAMDVDQPNPYGLAEGEENKCFLVWTGQVKSKSFKRFTWRSFESEKMAREELGKWNVENYWDVAMASTDEELAARQPQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.26
3 0.28
4 0.29
5 0.32
6 0.36
7 0.41
8 0.46
9 0.48
10 0.5
11 0.5
12 0.45
13 0.47
14 0.51
15 0.52
16 0.5
17 0.54
18 0.58
19 0.51
20 0.51
21 0.48
22 0.44
23 0.42
24 0.47
25 0.48
26 0.47
27 0.55
28 0.55
29 0.65
30 0.69
31 0.71
32 0.73
33 0.72
34 0.74
35 0.68
36 0.65
37 0.6
38 0.56
39 0.53
40 0.48
41 0.5
42 0.46
43 0.53
44 0.57
45 0.59
46 0.61
47 0.63
48 0.69
49 0.67
50 0.73
51 0.75
52 0.77
53 0.77
54 0.79
55 0.8
56 0.78
57 0.76
58 0.74
59 0.71
60 0.71
61 0.7
62 0.68
63 0.63
64 0.55
65 0.53
66 0.46
67 0.4
68 0.32
69 0.26
70 0.2
71 0.2
72 0.19
73 0.17
74 0.16
75 0.16
76 0.19
77 0.18
78 0.17
79 0.15
80 0.16
81 0.18
82 0.18
83 0.23
84 0.24
85 0.29
86 0.32
87 0.34
88 0.33
89 0.34
90 0.34
91 0.28
92 0.28
93 0.25
94 0.25
95 0.23
96 0.24
97 0.21
98 0.2
99 0.18
100 0.14
101 0.13
102 0.11
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.16
107 0.19
108 0.24
109 0.26
110 0.28
111 0.34
112 0.43
113 0.49
114 0.52
115 0.57
116 0.62
117 0.62
118 0.63
119 0.57
120 0.53
121 0.5
122 0.44
123 0.41
124 0.34
125 0.32
126 0.29
127 0.27
128 0.24
129 0.17
130 0.16
131 0.11
132 0.09
133 0.08
134 0.11
135 0.17
136 0.16
137 0.16
138 0.18
139 0.2
140 0.24
141 0.28
142 0.29
143 0.32
144 0.36
145 0.39
146 0.46
147 0.49
148 0.51
149 0.56
150 0.57
151 0.51
152 0.53
153 0.5
154 0.47
155 0.45
156 0.41
157 0.33
158 0.31
159 0.33
160 0.28
161 0.35
162 0.31
163 0.29
164 0.32
165 0.32
166 0.29
167 0.28
168 0.29
169 0.28
170 0.32
171 0.3
172 0.28
173 0.27
174 0.26
175 0.22
176 0.2
177 0.18
178 0.14
179 0.18
180 0.19
181 0.2
182 0.19
183 0.24
184 0.26
185 0.22
186 0.26
187 0.26
188 0.25
189 0.25
190 0.24
191 0.22
192 0.25
193 0.3
194 0.28
195 0.33
196 0.38
197 0.45
198 0.56
199 0.62
200 0.63
201 0.66
202 0.73
203 0.75
204 0.75
205 0.74
206 0.7
207 0.65
208 0.6
209 0.53
210 0.46
211 0.37
212 0.3
213 0.32
214 0.28
215 0.3
216 0.29
217 0.27
218 0.25
219 0.26
220 0.26
221 0.2
222 0.21
223 0.22
224 0.23
225 0.26
226 0.28
227 0.29
228 0.26
229 0.25
230 0.26
231 0.26
232 0.3
233 0.28
234 0.28
235 0.27
236 0.27
237 0.27
238 0.27
239 0.22
240 0.16
241 0.16
242 0.17
243 0.16
244 0.16
245 0.15
246 0.12
247 0.16
248 0.16
249 0.16
250 0.15
251 0.16
252 0.18
253 0.23
254 0.25
255 0.21
256 0.2
257 0.22
258 0.23
259 0.23
260 0.21
261 0.16
262 0.15
263 0.13
264 0.12
265 0.12
266 0.09
267 0.1
268 0.11
269 0.1
270 0.11
271 0.12
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.14
276 0.15
277 0.15
278 0.14
279 0.16
280 0.15
281 0.14
282 0.13
283 0.1
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.09
289 0.09
290 0.1
291 0.1
292 0.12
293 0.12
294 0.11
295 0.1
296 0.09
297 0.12
298 0.12
299 0.11
300 0.09
301 0.1
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.08
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.08
311 0.07
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.1
316 0.13
317 0.2
318 0.27
319 0.36
320 0.41
321 0.48
322 0.56
323 0.64
324 0.73
325 0.77
326 0.77
327 0.78
328 0.84
329 0.86
330 0.84
331 0.84
332 0.82
333 0.82
334 0.81
335 0.76
336 0.71
337 0.66
338 0.59
339 0.5
340 0.49
341 0.41
342 0.36
343 0.36
344 0.32
345 0.31
346 0.31
347 0.3
348 0.24
349 0.21
350 0.2
351 0.16
352 0.15
353 0.18
354 0.2
355 0.25
356 0.26
357 0.28
358 0.27
359 0.27
360 0.27
361 0.2
362 0.19
363 0.11
364 0.09
365 0.1
366 0.1
367 0.09
368 0.08
369 0.1
370 0.12
371 0.12
372 0.15
373 0.19
374 0.24
375 0.32
376 0.33
377 0.36
378 0.37
379 0.44
380 0.52
381 0.55
382 0.53
383 0.52
384 0.57
385 0.56
386 0.59
387 0.56
388 0.5
389 0.5
390 0.58
391 0.58
392 0.52
393 0.53
394 0.51
395 0.54
396 0.54
397 0.54
398 0.53
399 0.56
400 0.57
401 0.58
402 0.57
403 0.54
404 0.58
405 0.58
406 0.56
407 0.53
408 0.56
409 0.58
410 0.61
411 0.63
412 0.59
413 0.55
414 0.54
415 0.49
416 0.46
417 0.41
418 0.35
419 0.31
420 0.33
421 0.28
422 0.23
423 0.27
424 0.24
425 0.29
426 0.37
427 0.43
428 0.46
429 0.56
430 0.63
431 0.68
432 0.73
433 0.75
434 0.72
435 0.7
436 0.69
437 0.68
438 0.65
439 0.62
440 0.59
441 0.5
442 0.46
443 0.39
444 0.3
445 0.21
446 0.17
447 0.1
448 0.09
449 0.13
450 0.14
451 0.15
452 0.15
453 0.16
454 0.15
455 0.16
456 0.14
457 0.11
458 0.13
459 0.13
460 0.18
461 0.18
462 0.18
463 0.16
464 0.16
465 0.16
466 0.18
467 0.2
468 0.19
469 0.26
470 0.31
471 0.4
472 0.47
473 0.53
474 0.56
475 0.57
476 0.62
477 0.63
478 0.64
479 0.58
480 0.56
481 0.56
482 0.57
483 0.55
484 0.48
485 0.47
486 0.41
487 0.43
488 0.38
489 0.34
490 0.28
491 0.28
492 0.26
493 0.2
494 0.18
495 0.15
496 0.15
497 0.1
498 0.1
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.08
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.1
507 0.12
508 0.17
509 0.2
510 0.2
511 0.21
512 0.2
513 0.2
514 0.17
515 0.15
516 0.14
517 0.15
518 0.22
519 0.27
520 0.34
521 0.38
522 0.4
523 0.47
524 0.51
525 0.57
526 0.55
527 0.56
528 0.59
529 0.66
530 0.69
531 0.72
532 0.69
533 0.66
534 0.66
535 0.64
536 0.61
537 0.58
538 0.55
539 0.5
540 0.47
541 0.41
542 0.38
543 0.37
544 0.39
545 0.39
546 0.37
547 0.32
548 0.33
549 0.33
550 0.33
551 0.31
552 0.24
553 0.2
554 0.18
555 0.18
556 0.16
557 0.15
558 0.14
559 0.13
560 0.11
561 0.08
562 0.08
563 0.08
564 0.08
565 0.1