Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JMW6

Protein Details
Accession S2JMW6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
192-218SRKLRAGQGKLRNRRHRQRRGPLVIYNHydrophilic
308-335VRPAGNKHHKRPFTQKKNPLKNQGVMNRHydrophilic
356-377AGKVAKVQKKKTPNTVASKKFLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
193-212RKLRAGQGKLRNRRHRQRRG
Subcellular Location(s) mito 9, cyto 9, cyto_mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025755  Ribos_L4_C_dom  
IPR002136  Ribosomal_L4/L1e  
IPR013000  Ribosomal_L4/L1e_euk/arc_CS  
IPR023574  Ribosomal_L4_dom_sf  
IPR045240  Ribosomal_L4_euk/arch  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF14374  Ribos_L4_asso_C  
PF00573  Ribosomal_L4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00939  RIBOSOMAL_L1E  
Amino Acid Sequences MDGIFSASAARPVLNVYTECGKNVASTVPLPAVFKAPIRPDIVNFVHTNMAKNKRQAYAVSDKAGEQTSAESWGTGRAVARIPRVNGSGTHRAGQAAFGNMCRGGRMFAPTKTWRKWHIKTNLNQKRFATASALAASALPSLVMARGHRVEKIEEVPLVVADSIEKLTKTKEAVALLKSLNAYSDVVKVSNSRKLRAGQGKLRNRRHRQRRGPLVIYNEDNGLVKAFRNLPGLELVNVRRLNLLQLAPGGHLGRFIIWTQSAIALLDELYGTYEAPATLKKDYVLPAHIMTNPDVARLINSDEIQSVVRPAGNKHHKRPFTQKKNPLKNQGVMNRLNPYAQVLRRAELVKAEKVAAGKVAKVQKKKTPNTVASKKFLETLRAD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.17
4 0.24
5 0.24
6 0.25
7 0.24
8 0.22
9 0.2
10 0.21
11 0.19
12 0.15
13 0.15
14 0.17
15 0.18
16 0.19
17 0.19
18 0.19
19 0.2
20 0.19
21 0.2
22 0.24
23 0.26
24 0.3
25 0.33
26 0.33
27 0.32
28 0.38
29 0.38
30 0.36
31 0.33
32 0.3
33 0.31
34 0.31
35 0.34
36 0.34
37 0.41
38 0.42
39 0.47
40 0.51
41 0.48
42 0.5
43 0.48
44 0.47
45 0.48
46 0.47
47 0.44
48 0.39
49 0.36
50 0.35
51 0.34
52 0.27
53 0.17
54 0.15
55 0.13
56 0.15
57 0.14
58 0.12
59 0.11
60 0.13
61 0.13
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.16
66 0.19
67 0.25
68 0.27
69 0.29
70 0.3
71 0.32
72 0.3
73 0.3
74 0.34
75 0.36
76 0.34
77 0.34
78 0.31
79 0.3
80 0.29
81 0.28
82 0.22
83 0.18
84 0.17
85 0.15
86 0.16
87 0.16
88 0.15
89 0.14
90 0.12
91 0.09
92 0.1
93 0.15
94 0.17
95 0.18
96 0.26
97 0.33
98 0.41
99 0.44
100 0.48
101 0.51
102 0.58
103 0.61
104 0.64
105 0.66
106 0.67
107 0.71
108 0.77
109 0.78
110 0.72
111 0.7
112 0.61
113 0.56
114 0.48
115 0.42
116 0.34
117 0.25
118 0.23
119 0.2
120 0.2
121 0.14
122 0.13
123 0.12
124 0.08
125 0.07
126 0.04
127 0.03
128 0.03
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.08
133 0.12
134 0.13
135 0.14
136 0.15
137 0.16
138 0.18
139 0.19
140 0.18
141 0.15
142 0.15
143 0.13
144 0.12
145 0.11
146 0.08
147 0.06
148 0.04
149 0.04
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.07
155 0.09
156 0.1
157 0.11
158 0.13
159 0.16
160 0.18
161 0.19
162 0.2
163 0.18
164 0.19
165 0.17
166 0.14
167 0.12
168 0.1
169 0.1
170 0.08
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.12
176 0.13
177 0.19
178 0.2
179 0.19
180 0.22
181 0.24
182 0.32
183 0.37
184 0.41
185 0.42
186 0.51
187 0.59
188 0.66
189 0.74
190 0.77
191 0.78
192 0.83
193 0.85
194 0.86
195 0.88
196 0.88
197 0.89
198 0.86
199 0.81
200 0.75
201 0.69
202 0.61
203 0.52
204 0.42
205 0.32
206 0.24
207 0.19
208 0.15
209 0.1
210 0.08
211 0.06
212 0.09
213 0.1
214 0.11
215 0.14
216 0.14
217 0.14
218 0.16
219 0.17
220 0.15
221 0.17
222 0.16
223 0.2
224 0.2
225 0.19
226 0.17
227 0.17
228 0.17
229 0.18
230 0.17
231 0.11
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.13
236 0.12
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.08
250 0.07
251 0.06
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.08
264 0.09
265 0.1
266 0.11
267 0.12
268 0.14
269 0.17
270 0.19
271 0.2
272 0.2
273 0.2
274 0.22
275 0.23
276 0.22
277 0.2
278 0.23
279 0.2
280 0.18
281 0.18
282 0.15
283 0.14
284 0.14
285 0.16
286 0.13
287 0.14
288 0.14
289 0.14
290 0.15
291 0.14
292 0.13
293 0.12
294 0.1
295 0.11
296 0.12
297 0.13
298 0.23
299 0.34
300 0.42
301 0.5
302 0.59
303 0.63
304 0.69
305 0.79
306 0.79
307 0.8
308 0.82
309 0.84
310 0.85
311 0.91
312 0.92
313 0.92
314 0.87
315 0.82
316 0.8
317 0.77
318 0.74
319 0.67
320 0.62
321 0.56
322 0.49
323 0.44
324 0.35
325 0.32
326 0.32
327 0.3
328 0.35
329 0.32
330 0.33
331 0.37
332 0.38
333 0.34
334 0.35
335 0.37
336 0.32
337 0.32
338 0.32
339 0.29
340 0.29
341 0.29
342 0.26
343 0.22
344 0.2
345 0.25
346 0.33
347 0.39
348 0.46
349 0.52
350 0.56
351 0.66
352 0.73
353 0.76
354 0.77
355 0.8
356 0.82
357 0.86
358 0.84
359 0.8
360 0.75
361 0.66
362 0.61
363 0.54