Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JKD5

Protein Details
Accession S2JKD5    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-47NPSVEKSKTKKNLAKIFEKHHydrophilic
476-504LIKVRGDKFRAEKNKKKRGSYRGGQISFEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
482-494DKFRAEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MSDLDAAVYKYLLKNGNTEAAEALKKQNPSVEKSKTKKNLAKIFEKHQASSESSSDSSSSSSSSSSDSDSSSSSDEEEEKEKDVEMKEASASSDSDSSSSSDSDSDEAMEVDDKKAESSSSSSSSDSSSSSDSSSDEEEEEKKTTETKEDSSSSSSSSSSDEEEEEKKADSSSSSSSSSSSDSSSDEEEEEKAEEKKAESSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSDSSSDEEEEEKVEEKKADSSSSSSSSSSSSSSSSSSDSSSDEEEEEDKKSEATTTSEETLVEKKEESDSSSSSDSSSDGDSESSSDEEEEEEEEKKEEKKEEASSSSSSSSSESESSSSSSSESDSSSSESDSDDDSSDSDSSSSSSSSSSSSSSSDSSDSDSSSDSDSEAEEDTKMTEAESVKRKAEEASIEEPASKKSNSGPKVKRERVQGTPFQRVKPEEVEFLDERLKDNTYDAKGGSDMASYGWKASQDLIKVRGDKFRAEKNKKKRGSYRGGQISFESHSIKFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.29
3 0.37
4 0.34
5 0.34
6 0.3
7 0.28
8 0.29
9 0.27
10 0.3
11 0.27
12 0.28
13 0.29
14 0.34
15 0.34
16 0.39
17 0.46
18 0.5
19 0.56
20 0.6
21 0.7
22 0.73
23 0.79
24 0.78
25 0.79
26 0.79
27 0.76
28 0.81
29 0.76
30 0.75
31 0.74
32 0.71
33 0.61
34 0.56
35 0.52
36 0.46
37 0.44
38 0.38
39 0.32
40 0.29
41 0.29
42 0.25
43 0.21
44 0.18
45 0.15
46 0.14
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.13
51 0.14
52 0.15
53 0.16
54 0.16
55 0.16
56 0.17
57 0.17
58 0.17
59 0.16
60 0.14
61 0.15
62 0.15
63 0.16
64 0.19
65 0.19
66 0.2
67 0.2
68 0.19
69 0.22
70 0.22
71 0.23
72 0.2
73 0.19
74 0.18
75 0.18
76 0.18
77 0.15
78 0.15
79 0.13
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.13
84 0.13
85 0.13
86 0.13
87 0.11
88 0.1
89 0.11
90 0.12
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.12
100 0.11
101 0.11
102 0.12
103 0.11
104 0.1
105 0.13
106 0.16
107 0.18
108 0.2
109 0.2
110 0.2
111 0.21
112 0.2
113 0.18
114 0.16
115 0.14
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.12
120 0.13
121 0.14
122 0.13
123 0.12
124 0.13
125 0.14
126 0.16
127 0.17
128 0.16
129 0.15
130 0.17
131 0.18
132 0.21
133 0.23
134 0.23
135 0.27
136 0.28
137 0.3
138 0.3
139 0.29
140 0.25
141 0.23
142 0.2
143 0.16
144 0.15
145 0.14
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.15
150 0.16
151 0.16
152 0.16
153 0.15
154 0.14
155 0.13
156 0.13
157 0.11
158 0.12
159 0.14
160 0.16
161 0.17
162 0.17
163 0.17
164 0.18
165 0.18
166 0.16
167 0.14
168 0.12
169 0.11
170 0.13
171 0.14
172 0.14
173 0.13
174 0.13
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.15
184 0.15
185 0.15
186 0.15
187 0.17
188 0.18
189 0.2
190 0.21
191 0.18
192 0.17
193 0.17
194 0.17
195 0.15
196 0.13
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.12
201 0.12
202 0.12
203 0.12
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.13
211 0.14
212 0.14
213 0.13
214 0.13
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.13
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.15
228 0.17
229 0.2
230 0.21
231 0.18
232 0.17
233 0.17
234 0.17
235 0.15
236 0.13
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.13
247 0.14
248 0.14
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.13
254 0.12
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.11
262 0.12
263 0.13
264 0.13
265 0.14
266 0.14
267 0.16
268 0.14
269 0.13
270 0.11
271 0.1
272 0.12
273 0.13
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.16
278 0.17
279 0.16
280 0.14
281 0.14
282 0.12
283 0.1
284 0.1
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.09
301 0.1
302 0.11
303 0.13
304 0.16
305 0.17
306 0.18
307 0.21
308 0.25
309 0.28
310 0.3
311 0.31
312 0.29
313 0.29
314 0.28
315 0.24
316 0.2
317 0.17
318 0.15
319 0.13
320 0.13
321 0.11
322 0.11
323 0.12
324 0.13
325 0.12
326 0.11
327 0.1
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.11
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.1
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.1
343 0.09
344 0.09
345 0.11
346 0.1
347 0.1
348 0.08
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.08
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.1
361 0.12
362 0.12
363 0.13
364 0.13
365 0.13
366 0.16
367 0.16
368 0.15
369 0.14
370 0.14
371 0.14
372 0.14
373 0.14
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.08
386 0.1
387 0.12
388 0.18
389 0.26
390 0.29
391 0.3
392 0.31
393 0.32
394 0.3
395 0.32
396 0.29
397 0.27
398 0.28
399 0.29
400 0.29
401 0.3
402 0.29
403 0.28
404 0.27
405 0.21
406 0.18
407 0.22
408 0.32
409 0.36
410 0.46
411 0.51
412 0.58
413 0.69
414 0.76
415 0.74
416 0.75
417 0.75
418 0.74
419 0.75
420 0.74
421 0.7
422 0.72
423 0.71
424 0.64
425 0.64
426 0.57
427 0.53
428 0.51
429 0.47
430 0.41
431 0.38
432 0.42
433 0.36
434 0.36
435 0.35
436 0.29
437 0.28
438 0.25
439 0.25
440 0.19
441 0.21
442 0.26
443 0.25
444 0.27
445 0.25
446 0.25
447 0.23
448 0.24
449 0.22
450 0.15
451 0.12
452 0.1
453 0.13
454 0.12
455 0.13
456 0.13
457 0.13
458 0.13
459 0.17
460 0.2
461 0.23
462 0.28
463 0.31
464 0.36
465 0.4
466 0.42
467 0.46
468 0.45
469 0.47
470 0.48
471 0.54
472 0.59
473 0.65
474 0.73
475 0.76
476 0.84
477 0.85
478 0.89
479 0.88
480 0.88
481 0.88
482 0.86
483 0.86
484 0.86
485 0.81
486 0.72
487 0.64
488 0.57
489 0.49
490 0.43
491 0.35