Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JZC4

Protein Details
Accession S2JZC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
110-136SSFWHASRGHHHHKKPKNSLSKLKSCFHydrophilic
455-480LFNKPLQPPSPLKKFRKRSSIFGNNEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.833, mito_nucl 11.166, cyto 4, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MSTVEPRFATPKQQQQSTQFLSIPYNYSSTTTSSISDEGGDFLSSVEEEELDNNSSTSNNSTQNSPSDLLSVPIELFSSSTSRSGPPSPKPPTADIAIEPSSSTNSSSLSSFWHASRGHHHHKKPKNSLSKLKSCFIEYMTPHEQLQKMLSERTPLNCNVFYNVGLNLIWQDEKGQPREALSKITFGKAYPTCHDVNTMTSSMNHLDVIIGFSSGDFIWYDTVCNRYTRLNKNGIMNGSSVTMVKWIPGSEDLFMASFDDGSILILDKDRDDQAFILPEPQSWAEEHFQITKPNKHSKHNPVAHWRVIAFAFSPNNQYVATVGKDGLMRTVDYTNERLCDVFVGYFGRLLCVAWSPDGKYILTGGQDDLVTIWSFKENKIIARCQGHRSWVTGVAFDPLHCDDKDYRFASVGEDCKILLWDFSVNALHKPKQRRASIITLAGEPNSHQIPIQDSLFNKPLQPPSPLKKFRKRSSIFGNNESTLLLQPVEAAQHVKLPTIHPALKKIQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.63
3 0.71
4 0.68
5 0.63
6 0.54
7 0.48
8 0.45
9 0.41
10 0.37
11 0.29
12 0.26
13 0.22
14 0.23
15 0.23
16 0.22
17 0.23
18 0.21
19 0.21
20 0.21
21 0.21
22 0.19
23 0.19
24 0.16
25 0.14
26 0.13
27 0.12
28 0.1
29 0.09
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.08
37 0.1
38 0.12
39 0.12
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.12
44 0.16
45 0.18
46 0.21
47 0.23
48 0.26
49 0.28
50 0.31
51 0.34
52 0.31
53 0.27
54 0.24
55 0.23
56 0.22
57 0.19
58 0.17
59 0.13
60 0.11
61 0.11
62 0.09
63 0.09
64 0.08
65 0.1
66 0.1
67 0.11
68 0.13
69 0.14
70 0.18
71 0.24
72 0.3
73 0.36
74 0.44
75 0.5
76 0.55
77 0.57
78 0.57
79 0.54
80 0.5
81 0.45
82 0.36
83 0.35
84 0.3
85 0.26
86 0.23
87 0.19
88 0.18
89 0.16
90 0.16
91 0.11
92 0.11
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.13
97 0.16
98 0.17
99 0.17
100 0.22
101 0.22
102 0.24
103 0.33
104 0.39
105 0.46
106 0.54
107 0.62
108 0.65
109 0.74
110 0.82
111 0.83
112 0.84
113 0.84
114 0.83
115 0.86
116 0.85
117 0.85
118 0.79
119 0.73
120 0.65
121 0.56
122 0.49
123 0.42
124 0.39
125 0.3
126 0.34
127 0.33
128 0.32
129 0.3
130 0.33
131 0.31
132 0.25
133 0.26
134 0.22
135 0.2
136 0.22
137 0.22
138 0.22
139 0.23
140 0.26
141 0.28
142 0.25
143 0.28
144 0.27
145 0.27
146 0.25
147 0.24
148 0.21
149 0.18
150 0.16
151 0.13
152 0.11
153 0.1
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.06
158 0.09
159 0.12
160 0.17
161 0.19
162 0.22
163 0.21
164 0.23
165 0.28
166 0.26
167 0.27
168 0.24
169 0.27
170 0.25
171 0.26
172 0.24
173 0.2
174 0.26
175 0.24
176 0.26
177 0.23
178 0.26
179 0.25
180 0.25
181 0.27
182 0.21
183 0.2
184 0.2
185 0.19
186 0.15
187 0.14
188 0.16
189 0.14
190 0.14
191 0.11
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.04
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.12
213 0.17
214 0.25
215 0.31
216 0.36
217 0.4
218 0.42
219 0.45
220 0.47
221 0.42
222 0.36
223 0.29
224 0.23
225 0.17
226 0.15
227 0.11
228 0.08
229 0.08
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.08
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.03
249 0.04
250 0.03
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.05
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.1
270 0.13
271 0.11
272 0.12
273 0.13
274 0.14
275 0.15
276 0.21
277 0.25
278 0.28
279 0.33
280 0.42
281 0.45
282 0.49
283 0.57
284 0.61
285 0.67
286 0.68
287 0.67
288 0.67
289 0.69
290 0.64
291 0.56
292 0.46
293 0.37
294 0.3
295 0.25
296 0.16
297 0.13
298 0.13
299 0.12
300 0.15
301 0.13
302 0.15
303 0.14
304 0.13
305 0.11
306 0.12
307 0.12
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.11
312 0.11
313 0.12
314 0.11
315 0.1
316 0.11
317 0.12
318 0.12
319 0.13
320 0.16
321 0.16
322 0.16
323 0.16
324 0.14
325 0.13
326 0.12
327 0.11
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.11
333 0.1
334 0.1
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.1
341 0.11
342 0.12
343 0.15
344 0.16
345 0.16
346 0.14
347 0.14
348 0.14
349 0.14
350 0.13
351 0.11
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.08
360 0.1
361 0.11
362 0.12
363 0.18
364 0.19
365 0.24
366 0.3
367 0.33
368 0.36
369 0.43
370 0.47
371 0.46
372 0.47
373 0.48
374 0.44
375 0.43
376 0.39
377 0.37
378 0.34
379 0.29
380 0.26
381 0.23
382 0.21
383 0.18
384 0.19
385 0.15
386 0.18
387 0.17
388 0.2
389 0.22
390 0.26
391 0.34
392 0.32
393 0.3
394 0.29
395 0.29
396 0.28
397 0.3
398 0.28
399 0.22
400 0.21
401 0.2
402 0.19
403 0.2
404 0.17
405 0.11
406 0.1
407 0.09
408 0.09
409 0.11
410 0.14
411 0.14
412 0.19
413 0.24
414 0.29
415 0.35
416 0.43
417 0.5
418 0.56
419 0.6
420 0.62
421 0.63
422 0.66
423 0.66
424 0.63
425 0.56
426 0.49
427 0.45
428 0.38
429 0.32
430 0.24
431 0.22
432 0.17
433 0.15
434 0.13
435 0.13
436 0.17
437 0.2
438 0.22
439 0.22
440 0.22
441 0.28
442 0.32
443 0.31
444 0.29
445 0.31
446 0.37
447 0.36
448 0.41
449 0.44
450 0.49
451 0.59
452 0.67
453 0.71
454 0.75
455 0.82
456 0.85
457 0.87
458 0.83
459 0.81
460 0.82
461 0.83
462 0.79
463 0.75
464 0.72
465 0.62
466 0.58
467 0.49
468 0.39
469 0.29
470 0.24
471 0.17
472 0.1
473 0.1
474 0.1
475 0.11
476 0.11
477 0.12
478 0.11
479 0.17
480 0.17
481 0.19
482 0.2
483 0.21
484 0.28
485 0.34
486 0.39
487 0.37
488 0.43