Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JMH3

Protein Details
Accession S2JMH3    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-77FDSHQNRQQQQQQQRIKAKAHydrophilic
569-599DEEIRDRRELFKKRRDERRRNIPVQKGGKLLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
575-627RRELFKKRRDERRRNIPVQKGGKLLKRGTMRGAIIHRAKEARYFVERAKTVRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000195  Rab-GAP-TBC_dom  
IPR035969  Rab-GAP_TBC_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00566  RabGAP-TBC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50086  TBC_RABGAP  
Amino Acid Sequences MSFPSRSEAVVDEQHNLRKYNGRARSSSFNHPAVRRQQSDSLFNTTPSPNVARRRPSFDSHQNRQQQQQQQRIKAKASHSNFLQVSQHHHVGGASSIDESGSEENDEDNDSLYHGNPQIPVAAISTHQLDANRTLVDSPTPISAEEHNKSLANSFKEKLVISRKNTRKGAHGSSLDKGGSQGGGGGVFGTILGSRSSSTTTTHSNQQLYDDGSNAIYPPPQKQTGQRDQYGFLKSSQWISEDAFNGFENYYAPIMKRRSLKWRQLLAENDDQWPARSSKIKRYIRKGIPPELRGQAWLHYSGAKAKMDANKGVYYDIVQQAEAMGSQNENLDIIERALDLHRTFPENNKFRPESHSQNNSTPEEKMNIPIIKSLRRVLLAFSIYTPSIGYCQSLNYIAGMLLLFMDEEEAFWTFVTLINDILPPNTYDVTMEGANVDQNVLMILISERFPHLWNRMSEGKSFWECEEQEGTGMPTCSLVTSHWFLTLFINILPIESVLRVWDCLFYDGQKVLFRVALGIFKLNENEIMAVHDPLEVFQVIQNMPKRMVDCHKLIDGTYLQYASATRVSDEEIRDRRELFKKRRDERRRNIPVQKGGKLLKRGTMRGAIIHRAKEARYFVERAKTVRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.41
3 0.4
4 0.38
5 0.4
6 0.45
7 0.51
8 0.55
9 0.55
10 0.56
11 0.6
12 0.67
13 0.64
14 0.67
15 0.64
16 0.61
17 0.63
18 0.62
19 0.65
20 0.65
21 0.68
22 0.62
23 0.6
24 0.62
25 0.59
26 0.63
27 0.59
28 0.56
29 0.48
30 0.45
31 0.43
32 0.36
33 0.32
34 0.29
35 0.31
36 0.3
37 0.38
38 0.45
39 0.51
40 0.55
41 0.63
42 0.64
43 0.65
44 0.67
45 0.69
46 0.71
47 0.7
48 0.75
49 0.76
50 0.75
51 0.77
52 0.76
53 0.75
54 0.75
55 0.76
56 0.76
57 0.76
58 0.8
59 0.78
60 0.74
61 0.71
62 0.68
63 0.67
64 0.63
65 0.6
66 0.53
67 0.56
68 0.51
69 0.47
70 0.45
71 0.36
72 0.39
73 0.38
74 0.38
75 0.3
76 0.3
77 0.27
78 0.24
79 0.23
80 0.17
81 0.11
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.14
101 0.14
102 0.15
103 0.15
104 0.15
105 0.15
106 0.15
107 0.15
108 0.12
109 0.11
110 0.1
111 0.11
112 0.12
113 0.12
114 0.13
115 0.13
116 0.14
117 0.16
118 0.18
119 0.16
120 0.14
121 0.15
122 0.14
123 0.14
124 0.13
125 0.12
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.13
130 0.17
131 0.24
132 0.24
133 0.25
134 0.25
135 0.25
136 0.25
137 0.27
138 0.28
139 0.25
140 0.27
141 0.26
142 0.27
143 0.28
144 0.28
145 0.31
146 0.36
147 0.39
148 0.41
149 0.51
150 0.57
151 0.64
152 0.69
153 0.64
154 0.62
155 0.61
156 0.61
157 0.58
158 0.56
159 0.5
160 0.46
161 0.47
162 0.39
163 0.32
164 0.26
165 0.19
166 0.13
167 0.1
168 0.09
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.03
177 0.03
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.08
184 0.09
185 0.11
186 0.13
187 0.18
188 0.2
189 0.27
190 0.3
191 0.3
192 0.3
193 0.3
194 0.29
195 0.27
196 0.24
197 0.18
198 0.15
199 0.13
200 0.13
201 0.11
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.12
206 0.16
207 0.19
208 0.21
209 0.28
210 0.37
211 0.46
212 0.51
213 0.52
214 0.49
215 0.49
216 0.52
217 0.47
218 0.38
219 0.29
220 0.26
221 0.22
222 0.23
223 0.21
224 0.17
225 0.15
226 0.15
227 0.17
228 0.16
229 0.16
230 0.14
231 0.14
232 0.14
233 0.12
234 0.11
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.13
241 0.16
242 0.2
243 0.24
244 0.27
245 0.37
246 0.45
247 0.54
248 0.57
249 0.62
250 0.6
251 0.61
252 0.61
253 0.56
254 0.53
255 0.46
256 0.38
257 0.32
258 0.29
259 0.24
260 0.22
261 0.18
262 0.14
263 0.2
264 0.22
265 0.3
266 0.41
267 0.49
268 0.54
269 0.61
270 0.69
271 0.69
272 0.75
273 0.7
274 0.69
275 0.67
276 0.62
277 0.58
278 0.5
279 0.43
280 0.36
281 0.31
282 0.24
283 0.18
284 0.17
285 0.13
286 0.12
287 0.12
288 0.13
289 0.16
290 0.14
291 0.13
292 0.16
293 0.2
294 0.22
295 0.23
296 0.22
297 0.2
298 0.21
299 0.2
300 0.16
301 0.13
302 0.14
303 0.14
304 0.12
305 0.11
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.06
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.04
323 0.05
324 0.05
325 0.08
326 0.07
327 0.09
328 0.1
329 0.13
330 0.14
331 0.2
332 0.29
333 0.33
334 0.35
335 0.39
336 0.4
337 0.38
338 0.44
339 0.42
340 0.4
341 0.43
342 0.49
343 0.46
344 0.49
345 0.52
346 0.49
347 0.45
348 0.38
349 0.31
350 0.25
351 0.23
352 0.2
353 0.21
354 0.2
355 0.18
356 0.21
357 0.22
358 0.24
359 0.25
360 0.25
361 0.21
362 0.22
363 0.22
364 0.19
365 0.21
366 0.18
367 0.16
368 0.15
369 0.15
370 0.13
371 0.13
372 0.12
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.06
378 0.07
379 0.08
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.06
387 0.05
388 0.04
389 0.04
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.04
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.06
400 0.05
401 0.08
402 0.09
403 0.09
404 0.08
405 0.09
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.08
410 0.07
411 0.09
412 0.09
413 0.08
414 0.08
415 0.09
416 0.1
417 0.1
418 0.09
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.07
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.03
429 0.03
430 0.04
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.07
435 0.08
436 0.09
437 0.13
438 0.18
439 0.22
440 0.23
441 0.28
442 0.34
443 0.35
444 0.35
445 0.33
446 0.34
447 0.31
448 0.32
449 0.27
450 0.27
451 0.25
452 0.27
453 0.27
454 0.21
455 0.19
456 0.18
457 0.18
458 0.14
459 0.14
460 0.11
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.09
465 0.09
466 0.11
467 0.13
468 0.14
469 0.15
470 0.16
471 0.16
472 0.17
473 0.17
474 0.14
475 0.11
476 0.13
477 0.11
478 0.1
479 0.1
480 0.08
481 0.08
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.08
487 0.09
488 0.1
489 0.11
490 0.13
491 0.14
492 0.13
493 0.16
494 0.17
495 0.19
496 0.19
497 0.19
498 0.18
499 0.18
500 0.16
501 0.15
502 0.15
503 0.16
504 0.14
505 0.16
506 0.16
507 0.16
508 0.17
509 0.16
510 0.16
511 0.13
512 0.13
513 0.1
514 0.13
515 0.13
516 0.12
517 0.12
518 0.12
519 0.11
520 0.11
521 0.13
522 0.09
523 0.08
524 0.09
525 0.13
526 0.13
527 0.19
528 0.24
529 0.24
530 0.26
531 0.28
532 0.28
533 0.3
534 0.37
535 0.38
536 0.36
537 0.38
538 0.4
539 0.38
540 0.37
541 0.36
542 0.3
543 0.26
544 0.24
545 0.2
546 0.17
547 0.17
548 0.17
549 0.15
550 0.16
551 0.14
552 0.13
553 0.13
554 0.17
555 0.21
556 0.24
557 0.31
558 0.34
559 0.38
560 0.4
561 0.41
562 0.46
563 0.51
564 0.58
565 0.59
566 0.63
567 0.69
568 0.77
569 0.86
570 0.89
571 0.91
572 0.91
573 0.92
574 0.93
575 0.92
576 0.92
577 0.91
578 0.89
579 0.86
580 0.8
581 0.77
582 0.73
583 0.7
584 0.68
585 0.61
586 0.59
587 0.58
588 0.56
589 0.54
590 0.53
591 0.47
592 0.46
593 0.48
594 0.5
595 0.49
596 0.48
597 0.48
598 0.44
599 0.44
600 0.44
601 0.43
602 0.4
603 0.4
604 0.42
605 0.42
606 0.48
607 0.5