Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

S2J449

Protein Details
Accession S2J449    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
623-646AGDDDRPSKKKKKKEMGPGVTARYBasic
771-794DEDQPRGRGRPRRRKSGSGPDVMTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
628-637RPSKKKKKKE
776-790RGRGRPRRRKSGSGP
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MPAELHHLFDLPEPSYASPNTQSWNQSQSNNSTPNASFNTPPVVQDSTSYPMNSNNSNSTSPTVQEAAKPSPQASPSLPVQASSAPASIIPQSSPQPTAAATASAQTTPQATPTPTSSHPSPQISSPLATQASPQVNTQSPVIHIQPQTSQSPATNQSSPHQIKASPSPQLSVAPSQPASGTSTPIAVQSPQQPLAQKAQSSPVNVRSSPVAPQSSPKIIAPQQQQPLQPQPGNTAGATTSTPTVAAANPATSQPSSGATSMTLLDNLTAQLSPDRKERFIELFRQLQGNAVTANQFLAQARMLLDQQQYQQLENLKSKPAAAPNAAVAGRNPAIRPQQSPNIKQTMSSSQIRAEDTQRAMSGLIAPQAKRARTSDIPINTSQPLPMYRSNTAPVSQLQQQQLMQQQQLHLQQQQQQMLQHQQNQMKQHLIQQHQQQQLLQQQAQQAQQAQQQQLLPQQSPSQPQTPLIQPQPPQTNQSVAPDQTKAEIAPAKTEATEQASGIAQDFMNPDMLKEILGKYTTAAGLKLDNNVVALIALATEKRIHGLVQHMIFASKHRVDSQTFTQPAMDESGHLPFKIVDIQDIKKQLLAVERVEREEERKRKEILLERERKAQMGEEGGDAGDDDRPSKKKKKKEMGPGVTARYMSDDVRNKTTNETALMIAGGVMKSWMLTGSMGGGGGGSSKEKGSSSSAAAAPISRQNSNAVSGAPAATQNDTIVASSPSAISPLATNNLNSPVGNAPLSTSPTSATFSEAGANTGMPTTPTATIDEDQPRGRGRPRRRKSGSGPDVMTGKKSKGFGRANTSTEGGLFLPPSTIGRPHRLGEQGARKITVRDALFVLEDEYENSMDSARRTLLKAYSNYLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.23
3 0.24
4 0.24
5 0.25
6 0.26
7 0.29
8 0.32
9 0.35
10 0.35
11 0.42
12 0.42
13 0.42
14 0.45
15 0.47
16 0.51
17 0.51
18 0.48
19 0.45
20 0.41
21 0.43
22 0.43
23 0.39
24 0.32
25 0.3
26 0.36
27 0.31
28 0.32
29 0.3
30 0.27
31 0.25
32 0.25
33 0.27
34 0.24
35 0.26
36 0.26
37 0.23
38 0.26
39 0.3
40 0.31
41 0.31
42 0.32
43 0.34
44 0.34
45 0.36
46 0.34
47 0.32
48 0.29
49 0.29
50 0.27
51 0.23
52 0.26
53 0.29
54 0.3
55 0.33
56 0.33
57 0.31
58 0.33
59 0.34
60 0.33
61 0.3
62 0.3
63 0.29
64 0.35
65 0.34
66 0.29
67 0.29
68 0.26
69 0.27
70 0.23
71 0.21
72 0.13
73 0.13
74 0.14
75 0.15
76 0.14
77 0.13
78 0.15
79 0.18
80 0.21
81 0.22
82 0.22
83 0.21
84 0.2
85 0.22
86 0.19
87 0.17
88 0.14
89 0.14
90 0.15
91 0.14
92 0.14
93 0.12
94 0.13
95 0.12
96 0.14
97 0.15
98 0.15
99 0.18
100 0.21
101 0.25
102 0.26
103 0.31
104 0.32
105 0.35
106 0.41
107 0.42
108 0.41
109 0.39
110 0.42
111 0.38
112 0.37
113 0.31
114 0.29
115 0.26
116 0.24
117 0.22
118 0.24
119 0.26
120 0.26
121 0.26
122 0.25
123 0.27
124 0.28
125 0.28
126 0.22
127 0.2
128 0.22
129 0.24
130 0.26
131 0.24
132 0.25
133 0.28
134 0.3
135 0.3
136 0.27
137 0.27
138 0.21
139 0.26
140 0.29
141 0.3
142 0.29
143 0.29
144 0.3
145 0.39
146 0.4
147 0.38
148 0.35
149 0.32
150 0.34
151 0.41
152 0.43
153 0.39
154 0.37
155 0.35
156 0.34
157 0.35
158 0.34
159 0.29
160 0.26
161 0.24
162 0.23
163 0.22
164 0.21
165 0.2
166 0.22
167 0.18
168 0.19
169 0.15
170 0.16
171 0.16
172 0.16
173 0.16
174 0.12
175 0.14
176 0.18
177 0.23
178 0.24
179 0.26
180 0.27
181 0.29
182 0.35
183 0.36
184 0.31
185 0.27
186 0.32
187 0.33
188 0.34
189 0.36
190 0.37
191 0.38
192 0.37
193 0.36
194 0.32
195 0.31
196 0.31
197 0.32
198 0.26
199 0.23
200 0.26
201 0.3
202 0.31
203 0.31
204 0.28
205 0.29
206 0.29
207 0.36
208 0.38
209 0.41
210 0.43
211 0.46
212 0.48
213 0.47
214 0.51
215 0.5
216 0.46
217 0.39
218 0.37
219 0.35
220 0.35
221 0.29
222 0.23
223 0.16
224 0.16
225 0.15
226 0.13
227 0.1
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.07
233 0.1
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.1
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.12
243 0.13
244 0.12
245 0.12
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.09
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.09
259 0.11
260 0.13
261 0.2
262 0.23
263 0.23
264 0.25
265 0.28
266 0.31
267 0.33
268 0.38
269 0.36
270 0.38
271 0.38
272 0.38
273 0.34
274 0.3
275 0.27
276 0.21
277 0.16
278 0.12
279 0.11
280 0.1
281 0.1
282 0.07
283 0.08
284 0.07
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.11
292 0.13
293 0.14
294 0.15
295 0.2
296 0.19
297 0.18
298 0.21
299 0.23
300 0.25
301 0.27
302 0.28
303 0.25
304 0.24
305 0.25
306 0.25
307 0.24
308 0.24
309 0.21
310 0.2
311 0.18
312 0.21
313 0.2
314 0.18
315 0.13
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.13
320 0.14
321 0.2
322 0.22
323 0.25
324 0.26
325 0.33
326 0.39
327 0.43
328 0.44
329 0.44
330 0.42
331 0.39
332 0.38
333 0.35
334 0.33
335 0.32
336 0.28
337 0.25
338 0.27
339 0.27
340 0.26
341 0.23
342 0.22
343 0.21
344 0.21
345 0.19
346 0.17
347 0.16
348 0.14
349 0.13
350 0.09
351 0.11
352 0.12
353 0.12
354 0.17
355 0.21
356 0.21
357 0.22
358 0.23
359 0.25
360 0.25
361 0.29
362 0.3
363 0.3
364 0.33
365 0.32
366 0.33
367 0.28
368 0.26
369 0.22
370 0.17
371 0.15
372 0.15
373 0.18
374 0.19
375 0.2
376 0.21
377 0.23
378 0.23
379 0.22
380 0.2
381 0.18
382 0.17
383 0.2
384 0.23
385 0.22
386 0.23
387 0.23
388 0.24
389 0.27
390 0.26
391 0.23
392 0.19
393 0.19
394 0.21
395 0.24
396 0.23
397 0.21
398 0.21
399 0.26
400 0.3
401 0.31
402 0.28
403 0.26
404 0.26
405 0.31
406 0.31
407 0.3
408 0.32
409 0.33
410 0.35
411 0.37
412 0.37
413 0.32
414 0.3
415 0.3
416 0.31
417 0.3
418 0.32
419 0.36
420 0.42
421 0.43
422 0.43
423 0.38
424 0.35
425 0.36
426 0.34
427 0.28
428 0.21
429 0.21
430 0.24
431 0.25
432 0.22
433 0.19
434 0.18
435 0.21
436 0.23
437 0.21
438 0.2
439 0.19
440 0.19
441 0.22
442 0.22
443 0.18
444 0.15
445 0.18
446 0.18
447 0.21
448 0.23
449 0.22
450 0.21
451 0.22
452 0.24
453 0.23
454 0.26
455 0.25
456 0.26
457 0.25
458 0.3
459 0.34
460 0.33
461 0.33
462 0.29
463 0.29
464 0.26
465 0.29
466 0.26
467 0.21
468 0.21
469 0.19
470 0.18
471 0.17
472 0.16
473 0.12
474 0.12
475 0.13
476 0.12
477 0.13
478 0.14
479 0.13
480 0.13
481 0.13
482 0.12
483 0.13
484 0.13
485 0.11
486 0.11
487 0.11
488 0.11
489 0.11
490 0.1
491 0.07
492 0.07
493 0.08
494 0.07
495 0.09
496 0.09
497 0.08
498 0.08
499 0.09
500 0.08
501 0.08
502 0.09
503 0.08
504 0.09
505 0.09
506 0.08
507 0.09
508 0.1
509 0.09
510 0.09
511 0.08
512 0.1
513 0.11
514 0.12
515 0.11
516 0.1
517 0.09
518 0.09
519 0.08
520 0.06
521 0.05
522 0.03
523 0.03
524 0.03
525 0.03
526 0.04
527 0.04
528 0.05
529 0.05
530 0.06
531 0.06
532 0.07
533 0.12
534 0.16
535 0.16
536 0.17
537 0.16
538 0.17
539 0.17
540 0.17
541 0.19
542 0.16
543 0.16
544 0.17
545 0.2
546 0.21
547 0.26
548 0.29
549 0.32
550 0.31
551 0.3
552 0.29
553 0.26
554 0.25
555 0.23
556 0.18
557 0.1
558 0.11
559 0.15
560 0.15
561 0.14
562 0.14
563 0.11
564 0.12
565 0.15
566 0.14
567 0.13
568 0.16
569 0.19
570 0.23
571 0.25
572 0.24
573 0.21
574 0.22
575 0.2
576 0.21
577 0.21
578 0.2
579 0.24
580 0.25
581 0.26
582 0.28
583 0.26
584 0.27
585 0.34
586 0.38
587 0.39
588 0.42
589 0.43
590 0.44
591 0.51
592 0.55
593 0.56
594 0.59
595 0.62
596 0.6
597 0.66
598 0.63
599 0.57
600 0.48
601 0.39
602 0.31
603 0.24
604 0.23
605 0.15
606 0.15
607 0.14
608 0.13
609 0.11
610 0.09
611 0.08
612 0.07
613 0.08
614 0.12
615 0.17
616 0.24
617 0.35
618 0.42
619 0.5
620 0.61
621 0.71
622 0.76
623 0.83
624 0.87
625 0.85
626 0.86
627 0.81
628 0.74
629 0.64
630 0.55
631 0.44
632 0.36
633 0.29
634 0.21
635 0.24
636 0.28
637 0.29
638 0.35
639 0.37
640 0.35
641 0.37
642 0.38
643 0.32
644 0.27
645 0.25
646 0.19
647 0.18
648 0.17
649 0.13
650 0.1
651 0.09
652 0.07
653 0.05
654 0.05
655 0.04
656 0.04
657 0.05
658 0.05
659 0.04
660 0.04
661 0.05
662 0.06
663 0.06
664 0.06
665 0.06
666 0.05
667 0.04
668 0.05
669 0.05
670 0.05
671 0.06
672 0.06
673 0.08
674 0.08
675 0.1
676 0.14
677 0.16
678 0.17
679 0.21
680 0.22
681 0.21
682 0.21
683 0.2
684 0.18
685 0.21
686 0.22
687 0.18
688 0.19
689 0.21
690 0.22
691 0.24
692 0.23
693 0.18
694 0.15
695 0.16
696 0.15
697 0.12
698 0.12
699 0.11
700 0.11
701 0.11
702 0.1
703 0.11
704 0.1
705 0.1
706 0.1
707 0.1
708 0.09
709 0.09
710 0.1
711 0.08
712 0.09
713 0.09
714 0.08
715 0.08
716 0.1
717 0.13
718 0.14
719 0.14
720 0.15
721 0.2
722 0.2
723 0.19
724 0.19
725 0.17
726 0.19
727 0.18
728 0.16
729 0.14
730 0.16
731 0.2
732 0.19
733 0.17
734 0.16
735 0.17
736 0.2
737 0.19
738 0.19
739 0.16
740 0.15
741 0.19
742 0.18
743 0.18
744 0.15
745 0.15
746 0.12
747 0.12
748 0.12
749 0.08
750 0.09
751 0.1
752 0.11
753 0.12
754 0.14
755 0.17
756 0.18
757 0.24
758 0.28
759 0.3
760 0.3
761 0.32
762 0.34
763 0.35
764 0.42
765 0.46
766 0.52
767 0.59
768 0.67
769 0.75
770 0.79
771 0.84
772 0.86
773 0.87
774 0.85
775 0.82
776 0.74
777 0.66
778 0.63
779 0.54
780 0.5
781 0.41
782 0.35
783 0.31
784 0.33
785 0.33
786 0.39
787 0.45
788 0.47
789 0.54
790 0.57
791 0.56
792 0.55
793 0.53
794 0.43
795 0.36
796 0.3
797 0.22
798 0.17
799 0.14
800 0.11
801 0.1
802 0.11
803 0.13
804 0.13
805 0.2
806 0.23
807 0.3
808 0.34
809 0.35
810 0.41
811 0.43
812 0.45
813 0.47
814 0.53
815 0.53
816 0.52
817 0.53
818 0.48
819 0.46
820 0.45
821 0.42
822 0.33
823 0.28
824 0.26
825 0.25
826 0.25
827 0.23
828 0.22
829 0.15
830 0.15
831 0.13
832 0.14
833 0.13
834 0.12
835 0.12
836 0.12
837 0.13
838 0.14
839 0.16
840 0.17
841 0.2
842 0.21
843 0.26
844 0.31
845 0.37
846 0.39