Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2J449

Protein Details
Accession S2J449    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
623-646AGDDDRPSKKKKKKEMGPGVTARYBasic
771-794DEDQPRGRGRPRRRKSGSGPDVMTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
628-637RPSKKKKKKE
776-790RGRGRPRRRKSGSGP
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MPAELHHLFDLPEPSYASPNTQSWNQSQSNNSTPNASFNTPPVVQDSTSYPMNSNNSNSTSPTVQEAAKPSPQASPSLPVQASSAPASIIPQSSPQPTAAATASAQTTPQATPTPTSSHPSPQISSPLATQASPQVNTQSPVIHIQPQTSQSPATNQSSPHQIKASPSPQLSVAPSQPASGTSTPIAVQSPQQPLAQKAQSSPVNVRSSPVAPQSSPKIIAPQQQQPLQPQPGNTAGATTSTPTVAAANPATSQPSSGATSMTLLDNLTAQLSPDRKERFIELFRQLQGNAVTANQFLAQARMLLDQQQYQQLENLKSKPAAAPNAAVAGRNPAIRPQQSPNIKQTMSSSQIRAEDTQRAMSGLIAPQAKRARTSDIPINTSQPLPMYRSNTAPVSQLQQQQLMQQQQLHLQQQQQQMLQHQQNQMKQHLIQQHQQQQLLQQQAQQAQQAQQQQLLPQQSPSQPQTPLIQPQPPQTNQSVAPDQTKAEIAPAKTEATEQASGIAQDFMNPDMLKEILGKYTTAAGLKLDNNVVALIALATEKRIHGLVQHMIFASKHRVDSQTFTQPAMDESGHLPFKIVDIQDIKKQLLAVERVEREEERKRKEILLERERKAQMGEEGGDAGDDDRPSKKKKKKEMGPGVTARYMSDDVRNKTTNETALMIAGGVMKSWMLTGSMGGGGGGSSKEKGSSSSAAAAPISRQNSNAVSGAPAATQNDTIVASSPSAISPLATNNLNSPVGNAPLSTSPTSATFSEAGANTGMPTTPTATIDEDQPRGRGRPRRRKSGSGPDVMTGKKSKGFGRANTSTEGGLFLPPSTIGRPHRLGEQGARKITVRDALFVLEDEYENSMDSARRTLLKAYSNYLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.23
3 0.24
4 0.24
5 0.25
6 0.26
7 0.29
8 0.32
9 0.35
10 0.35
11 0.42
12 0.42
13 0.42
14 0.45
15 0.47
16 0.51
17 0.51
18 0.48
19 0.45
20 0.41
21 0.43
22 0.43
23 0.39
24 0.32
25 0.3
26 0.36
27 0.31
28 0.32
29 0.3
30 0.27
31 0.25
32 0.25
33 0.27
34 0.24
35 0.26
36 0.26
37 0.23
38 0.26
39 0.3
40 0.31
41 0.31
42 0.32
43 0.34
44 0.34
45 0.36
46 0.34
47 0.32
48 0.29
49 0.29
50 0.27
51 0.23
52 0.26
53 0.29
54 0.3
55 0.33
56 0.33
57 0.31
58 0.33
59 0.34
60 0.33
61 0.3
62 0.3
63 0.29
64 0.35
65 0.34
66 0.29
67 0.29
68 0.26
69 0.27
70 0.23
71 0.21
72 0.13
73 0.13
74 0.14
75 0.15
76 0.14
77 0.13
78 0.15
79 0.18
80 0.21
81 0.22
82 0.22
83 0.21
84 0.2
85 0.22
86 0.19
87 0.17
88 0.14
89 0.14
90 0.15
91 0.14
92 0.14
93 0.12
94 0.13
95 0.12
96 0.14
97 0.15
98 0.15
99 0.18
100 0.21
101 0.25
102 0.26
103 0.31
104 0.32
105 0.35
106 0.41
107 0.42
108 0.41
109 0.39
110 0.42
111 0.38
112 0.37
113 0.31
114 0.29
115 0.26
116 0.24
117 0.22
118 0.24
119 0.26
120 0.26
121 0.26
122 0.25
123 0.27
124 0.28
125 0.28
126 0.22
127 0.2
128 0.22
129 0.24
130 0.26
131 0.24
132 0.25
133 0.28
134 0.3
135 0.3
136 0.27
137 0.27
138 0.21
139 0.26
140 0.29
141 0.3
142 0.29
143 0.29
144 0.3
145 0.39
146 0.4
147 0.38
148 0.35
149 0.32
150 0.34
151 0.41
152 0.43
153 0.39
154 0.37
155 0.35
156 0.34
157 0.35
158 0.34
159 0.29
160 0.26
161 0.24
162 0.23
163 0.22
164 0.21
165 0.2
166 0.22
167 0.18
168 0.19
169 0.15
170 0.16
171 0.16
172 0.16
173 0.16
174 0.12
175 0.14
176 0.18
177 0.23
178 0.24
179 0.26
180 0.27
181 0.29
182 0.35
183 0.36
184 0.31
185 0.27
186 0.32
187 0.33
188 0.34
189 0.36
190 0.37
191 0.38
192 0.37
193 0.36
194 0.32
195 0.31
196 0.31
197 0.32
198 0.26
199 0.23
200 0.26
201 0.3
202 0.31
203 0.31
204 0.28
205 0.29
206 0.29
207 0.36
208 0.38
209 0.41
210 0.43
211 0.46
212 0.48
213 0.47
214 0.51
215 0.5
216 0.46
217 0.39
218 0.37
219 0.35
220 0.35
221 0.29
222 0.23
223 0.16
224 0.16
225 0.15
226 0.13
227 0.1
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.07
233 0.1
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.1
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.12
243 0.13
244 0.12
245 0.12
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.09
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.09
259 0.11
260 0.13
261 0.2
262 0.23
263 0.23
264 0.25
265 0.28
266 0.31
267 0.33
268 0.38
269 0.36
270 0.38
271 0.38
272 0.38
273 0.34
274 0.3
275 0.27
276 0.21
277 0.16
278 0.12
279 0.11
280 0.1
281 0.1
282 0.07
283 0.08
284 0.07
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.11
292 0.13
293 0.14
294 0.15
295 0.2
296 0.19
297 0.18
298 0.21
299 0.23
300 0.25
301 0.27
302 0.28
303 0.25
304 0.24
305 0.25
306 0.25
307 0.24
308 0.24
309 0.21
310 0.2
311 0.18
312 0.21
313 0.2
314 0.18
315 0.13
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.13
320 0.14
321 0.2
322 0.22
323 0.25
324 0.26
325 0.33
326 0.39
327 0.43
328 0.44
329 0.44
330 0.42
331 0.39
332 0.38
333 0.35
334 0.33
335 0.32
336 0.28
337 0.25
338 0.27
339 0.27
340 0.26
341 0.23
342 0.22
343 0.21
344 0.21
345 0.19
346 0.17
347 0.16
348 0.14
349 0.13
350 0.09
351 0.11
352 0.12
353 0.12
354 0.17
355 0.21
356 0.21
357 0.22
358 0.23
359 0.25
360 0.25
361 0.29
362 0.3
363 0.3
364 0.33
365 0.32
366 0.33
367 0.28
368 0.26
369 0.22
370 0.17
371 0.15
372 0.15
373 0.18
374 0.19
375 0.2
376 0.21
377 0.23
378 0.23
379 0.22
380 0.2
381 0.18
382 0.17
383 0.2
384 0.23
385 0.22
386 0.23
387 0.23
388 0.24
389 0.27
390 0.26
391 0.23
392 0.19
393 0.19
394 0.21
395 0.24
396 0.23
397 0.21
398 0.21
399 0.26
400 0.3
401 0.31
402 0.28
403 0.26
404 0.26
405 0.31
406 0.31
407 0.3
408 0.32
409 0.33
410 0.35
411 0.37
412 0.37
413 0.32
414 0.3
415 0.3
416 0.31
417 0.3
418 0.32
419 0.36
420 0.42
421 0.43
422 0.43
423 0.38
424 0.35
425 0.36
426 0.34
427 0.28
428 0.21
429 0.21
430 0.24
431 0.25
432 0.22
433 0.19
434 0.18
435 0.21
436 0.23
437 0.21
438 0.2
439 0.19
440 0.19
441 0.22
442 0.22
443 0.18
444 0.15
445 0.18
446 0.18
447 0.21
448 0.23
449 0.22
450 0.21
451 0.22
452 0.24
453 0.23
454 0.26
455 0.25
456 0.26
457 0.25
458 0.3
459 0.34
460 0.33
461 0.33
462 0.29
463 0.29
464 0.26
465 0.29
466 0.26
467 0.21
468 0.21
469 0.19
470 0.18
471 0.17
472 0.16
473 0.12
474 0.12
475 0.13
476 0.12
477 0.13
478 0.14
479 0.13
480 0.13
481 0.13
482 0.12
483 0.13
484 0.13
485 0.11
486 0.11
487 0.11
488 0.11
489 0.11
490 0.1
491 0.07
492 0.07
493 0.08
494 0.07
495 0.09
496 0.09
497 0.08
498 0.08
499 0.09
500 0.08
501 0.08
502 0.09
503 0.08
504 0.09
505 0.09
506 0.08
507 0.09
508 0.1
509 0.09
510 0.09
511 0.08
512 0.1
513 0.11
514 0.12
515 0.11
516 0.1
517 0.09
518 0.09
519 0.08
520 0.06
521 0.05
522 0.03
523 0.03
524 0.03
525 0.03
526 0.04
527 0.04
528 0.05
529 0.05
530 0.06
531 0.06
532 0.07
533 0.12
534 0.16
535 0.16
536 0.17
537 0.16
538 0.17
539 0.17
540 0.17
541 0.19
542 0.16
543 0.16
544 0.17
545 0.2
546 0.21
547 0.26
548 0.29
549 0.32
550 0.31
551 0.3
552 0.29
553 0.26
554 0.25
555 0.23
556 0.18
557 0.1
558 0.11
559 0.15
560 0.15
561 0.14
562 0.14
563 0.11
564 0.12
565 0.15
566 0.14
567 0.13
568 0.16
569 0.19
570 0.23
571 0.25
572 0.24
573 0.21
574 0.22
575 0.2
576 0.21
577 0.21
578 0.2
579 0.24
580 0.25
581 0.26
582 0.28
583 0.26
584 0.27
585 0.34
586 0.38
587 0.39
588 0.42
589 0.43
590 0.44
591 0.51
592 0.55
593 0.56
594 0.59
595 0.62
596 0.6
597 0.66
598 0.63
599 0.57
600 0.48
601 0.39
602 0.31
603 0.24
604 0.23
605 0.15
606 0.15
607 0.14
608 0.13
609 0.11
610 0.09
611 0.08
612 0.07
613 0.08
614 0.12
615 0.17
616 0.24
617 0.35
618 0.42
619 0.5
620 0.61
621 0.71
622 0.76
623 0.83
624 0.87
625 0.85
626 0.86
627 0.81
628 0.74
629 0.64
630 0.55
631 0.44
632 0.36
633 0.29
634 0.21
635 0.24
636 0.28
637 0.29
638 0.35
639 0.37
640 0.35
641 0.37
642 0.38
643 0.32
644 0.27
645 0.25
646 0.19
647 0.18
648 0.17
649 0.13
650 0.1
651 0.09
652 0.07
653 0.05
654 0.05
655 0.04
656 0.04
657 0.05
658 0.05
659 0.04
660 0.04
661 0.05
662 0.06
663 0.06
664 0.06
665 0.06
666 0.05
667 0.04
668 0.05
669 0.05
670 0.05
671 0.06
672 0.06
673 0.08
674 0.08
675 0.1
676 0.14
677 0.16
678 0.17
679 0.21
680 0.22
681 0.21
682 0.21
683 0.2
684 0.18
685 0.21
686 0.22
687 0.18
688 0.19
689 0.21
690 0.22
691 0.24
692 0.23
693 0.18
694 0.15
695 0.16
696 0.15
697 0.12
698 0.12
699 0.11
700 0.11
701 0.11
702 0.1
703 0.11
704 0.1
705 0.1
706 0.1
707 0.1
708 0.09
709 0.09
710 0.1
711 0.08
712 0.09
713 0.09
714 0.08
715 0.08
716 0.1
717 0.13
718 0.14
719 0.14
720 0.15
721 0.2
722 0.2
723 0.19
724 0.19
725 0.17
726 0.19
727 0.18
728 0.16
729 0.14
730 0.16
731 0.2
732 0.19
733 0.17
734 0.16
735 0.17
736 0.2
737 0.19
738 0.19
739 0.16
740 0.15
741 0.19
742 0.18
743 0.18
744 0.15
745 0.15
746 0.12
747 0.12
748 0.12
749 0.08
750 0.09
751 0.1
752 0.11
753 0.12
754 0.14
755 0.17
756 0.18
757 0.24
758 0.28
759 0.3
760 0.3
761 0.32
762 0.34
763 0.35
764 0.42
765 0.46
766 0.52
767 0.59
768 0.67
769 0.75
770 0.79
771 0.84
772 0.86
773 0.87
774 0.85
775 0.82
776 0.74
777 0.66
778 0.63
779 0.54
780 0.5
781 0.41
782 0.35
783 0.31
784 0.33
785 0.33
786 0.39
787 0.45
788 0.47
789 0.54
790 0.57
791 0.56
792 0.55
793 0.53
794 0.43
795 0.36
796 0.3
797 0.22
798 0.17
799 0.14
800 0.11
801 0.1
802 0.11
803 0.13
804 0.13
805 0.2
806 0.23
807 0.3
808 0.34
809 0.35
810 0.41
811 0.43
812 0.45
813 0.47
814 0.53
815 0.53
816 0.52
817 0.53
818 0.48
819 0.46
820 0.45
821 0.42
822 0.33
823 0.28
824 0.26
825 0.25
826 0.25
827 0.23
828 0.22
829 0.15
830 0.15
831 0.13
832 0.14
833 0.13
834 0.12
835 0.12
836 0.12
837 0.13
838 0.14
839 0.16
840 0.17
841 0.2
842 0.21
843 0.26
844 0.31
845 0.37
846 0.39