Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JIG7

Protein Details
Accession S2JIG7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-114PDYKYAPKKKVTPKRVYIRRNKKQQFTSRAKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-104KKKVTPKRVYIRRNK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 12.832, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MAKLNKNINNQHQHQSQIPRPLNCFLMYRLEKQKEIVAKCPTANHRDISKIIAKWWQEASDDEKEPFREKARIAKQEHNALYPDYKYAPKKKVTPKRVYIRRNKKQQFTSRAKENNMLMEMIYEDPTALKHLSPVEIKNKKSACISTSNIASTTQRLFSPEFEHSSCQVKIEGEDVYYRSCCPISPPMSFASYSSSATTPFDSPHVSPCSDYSEFEVSSPVSSCGTAGYYSPSSTTPSSCTTDNYNSPFSVLDSPFINDSNAYATNMNYDMDYFHFNHSDANNINNTFKPTTTQEFSWTEPCEAFTATEQHSLNNLMQQVYDPPVRYINPVLLQLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.63
3 0.6
4 0.61
5 0.62
6 0.58
7 0.58
8 0.57
9 0.53
10 0.46
11 0.42
12 0.33
13 0.37
14 0.36
15 0.4
16 0.47
17 0.48
18 0.47
19 0.47
20 0.5
21 0.48
22 0.48
23 0.48
24 0.45
25 0.44
26 0.45
27 0.51
28 0.51
29 0.5
30 0.5
31 0.46
32 0.43
33 0.44
34 0.43
35 0.42
36 0.42
37 0.36
38 0.35
39 0.37
40 0.35
41 0.34
42 0.35
43 0.31
44 0.26
45 0.27
46 0.31
47 0.31
48 0.31
49 0.29
50 0.3
51 0.3
52 0.32
53 0.33
54 0.31
55 0.29
56 0.29
57 0.38
58 0.44
59 0.51
60 0.54
61 0.59
62 0.61
63 0.66
64 0.65
65 0.57
66 0.49
67 0.42
68 0.39
69 0.31
70 0.27
71 0.2
72 0.24
73 0.29
74 0.36
75 0.41
76 0.44
77 0.53
78 0.62
79 0.7
80 0.75
81 0.77
82 0.79
83 0.83
84 0.87
85 0.87
86 0.88
87 0.89
88 0.88
89 0.89
90 0.87
91 0.85
92 0.85
93 0.85
94 0.84
95 0.82
96 0.79
97 0.77
98 0.75
99 0.69
100 0.64
101 0.56
102 0.49
103 0.4
104 0.33
105 0.23
106 0.18
107 0.16
108 0.12
109 0.11
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.09
119 0.12
120 0.14
121 0.18
122 0.26
123 0.32
124 0.33
125 0.38
126 0.38
127 0.37
128 0.37
129 0.35
130 0.28
131 0.28
132 0.29
133 0.25
134 0.25
135 0.24
136 0.22
137 0.21
138 0.19
139 0.15
140 0.14
141 0.12
142 0.11
143 0.13
144 0.13
145 0.13
146 0.17
147 0.17
148 0.18
149 0.18
150 0.2
151 0.19
152 0.22
153 0.21
154 0.18
155 0.17
156 0.14
157 0.13
158 0.13
159 0.11
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.1
170 0.17
171 0.2
172 0.2
173 0.22
174 0.23
175 0.24
176 0.24
177 0.22
178 0.19
179 0.16
180 0.16
181 0.15
182 0.14
183 0.13
184 0.14
185 0.15
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.12
190 0.12
191 0.17
192 0.19
193 0.18
194 0.18
195 0.18
196 0.24
197 0.22
198 0.22
199 0.2
200 0.21
201 0.2
202 0.2
203 0.2
204 0.13
205 0.13
206 0.14
207 0.11
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.15
221 0.15
222 0.16
223 0.15
224 0.18
225 0.21
226 0.21
227 0.22
228 0.24
229 0.28
230 0.32
231 0.33
232 0.31
233 0.29
234 0.29
235 0.27
236 0.24
237 0.24
238 0.2
239 0.18
240 0.16
241 0.17
242 0.18
243 0.18
244 0.16
245 0.1
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.13
250 0.12
251 0.12
252 0.14
253 0.14
254 0.14
255 0.11
256 0.1
257 0.09
258 0.11
259 0.14
260 0.14
261 0.16
262 0.17
263 0.17
264 0.21
265 0.2
266 0.24
267 0.21
268 0.23
269 0.25
270 0.25
271 0.28
272 0.25
273 0.3
274 0.26
275 0.25
276 0.26
277 0.27
278 0.32
279 0.34
280 0.34
281 0.35
282 0.37
283 0.4
284 0.41
285 0.39
286 0.34
287 0.3
288 0.3
289 0.25
290 0.23
291 0.21
292 0.18
293 0.2
294 0.21
295 0.27
296 0.26
297 0.25
298 0.26
299 0.28
300 0.26
301 0.25
302 0.25
303 0.18
304 0.19
305 0.19
306 0.2
307 0.22
308 0.25
309 0.22
310 0.22
311 0.26
312 0.27
313 0.3
314 0.3
315 0.31
316 0.3