Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JJB6

Protein Details
Accession S2JJB6    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
158-182TNESVPTKRKYRRHAKPDRNAPIKPHydrophilic
490-522EENPSRSYETKRRSPRFNKSRPKPSQSSPPLQTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
165-176KRKYRRHAKPDR
274-277ARKR
501-510RRSPRFNKSR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MDEMRRINNSNSTSNSASNLYNNGAGNGLMNNNLPVYDNIVTGLTSPRSMNSGIGGNSSASSSNNSSSVPNNRRSRMHQQQPVTAHPHSSMDSGIGSLRNGSASSFTSKPSISSNSNSNDNGSSSINNASSSTNGRNDAIEARSNSISSNDDADSIDTNESVPTKRKYRRHAKPDRNAPIKPPSAYIMFSNDSRAELKNQNLSFAELAKIVGDQWKNLSHIEKQSYERRAMRAKDEYLAALEQYRQTPQYHRYQEYLNEFKSKQDAANRIIGRARKRAKQASPGSGSIADSSSNGNSNGNGSSGSGSADTYGDKESVMRRQRQPSEDEMTQPPTQQEQISSPSTANNQQQRNFSKYNENYTANAKTDADTLRPIYNHHHNHRHHHHQQPQQQTSSDSGYTSQSYYNGNADKMPSSQWNHRSNQIMRGMLPVEFVPQNHLVDPSGNSSPRPQPSSYNTKKIMNDVDMGDDQEDENENDNDNNDEDQDEYMEENPSRSYETKRRSPRFNKSRPKPSQSSPPLQT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.41
3 0.36
4 0.33
5 0.29
6 0.28
7 0.24
8 0.25
9 0.24
10 0.21
11 0.19
12 0.17
13 0.16
14 0.15
15 0.14
16 0.11
17 0.11
18 0.12
19 0.11
20 0.11
21 0.12
22 0.11
23 0.15
24 0.15
25 0.15
26 0.15
27 0.15
28 0.15
29 0.14
30 0.18
31 0.14
32 0.14
33 0.15
34 0.15
35 0.17
36 0.18
37 0.17
38 0.16
39 0.19
40 0.17
41 0.19
42 0.19
43 0.16
44 0.16
45 0.16
46 0.14
47 0.11
48 0.14
49 0.15
50 0.16
51 0.16
52 0.17
53 0.18
54 0.23
55 0.33
56 0.37
57 0.44
58 0.5
59 0.54
60 0.58
61 0.65
62 0.69
63 0.7
64 0.73
65 0.72
66 0.69
67 0.71
68 0.7
69 0.68
70 0.64
71 0.53
72 0.45
73 0.38
74 0.35
75 0.29
76 0.25
77 0.2
78 0.14
79 0.14
80 0.12
81 0.13
82 0.11
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.1
90 0.11
91 0.16
92 0.16
93 0.17
94 0.19
95 0.19
96 0.2
97 0.22
98 0.25
99 0.24
100 0.27
101 0.32
102 0.33
103 0.38
104 0.37
105 0.35
106 0.31
107 0.28
108 0.27
109 0.21
110 0.18
111 0.15
112 0.17
113 0.16
114 0.15
115 0.15
116 0.13
117 0.14
118 0.18
119 0.2
120 0.2
121 0.21
122 0.21
123 0.2
124 0.21
125 0.23
126 0.22
127 0.23
128 0.21
129 0.23
130 0.23
131 0.22
132 0.21
133 0.19
134 0.18
135 0.15
136 0.16
137 0.13
138 0.13
139 0.13
140 0.14
141 0.13
142 0.13
143 0.12
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.11
149 0.16
150 0.2
151 0.29
152 0.37
153 0.45
154 0.54
155 0.64
156 0.73
157 0.78
158 0.85
159 0.87
160 0.88
161 0.92
162 0.91
163 0.87
164 0.78
165 0.71
166 0.69
167 0.62
168 0.52
169 0.42
170 0.35
171 0.3
172 0.29
173 0.25
174 0.21
175 0.19
176 0.18
177 0.2
178 0.17
179 0.17
180 0.18
181 0.18
182 0.18
183 0.2
184 0.23
185 0.28
186 0.28
187 0.29
188 0.27
189 0.28
190 0.23
191 0.2
192 0.18
193 0.1
194 0.1
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.11
199 0.1
200 0.1
201 0.12
202 0.14
203 0.15
204 0.16
205 0.19
206 0.17
207 0.22
208 0.26
209 0.27
210 0.29
211 0.35
212 0.37
213 0.4
214 0.39
215 0.38
216 0.41
217 0.4
218 0.41
219 0.39
220 0.37
221 0.33
222 0.31
223 0.27
224 0.21
225 0.19
226 0.14
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.1
233 0.12
234 0.15
235 0.2
236 0.28
237 0.32
238 0.34
239 0.34
240 0.34
241 0.38
242 0.41
243 0.41
244 0.33
245 0.31
246 0.29
247 0.28
248 0.29
249 0.25
250 0.2
251 0.21
252 0.25
253 0.23
254 0.31
255 0.3
256 0.29
257 0.31
258 0.33
259 0.31
260 0.35
261 0.38
262 0.36
263 0.42
264 0.49
265 0.5
266 0.56
267 0.58
268 0.57
269 0.55
270 0.51
271 0.45
272 0.37
273 0.34
274 0.24
275 0.19
276 0.12
277 0.08
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.1
303 0.18
304 0.25
305 0.31
306 0.37
307 0.45
308 0.51
309 0.53
310 0.55
311 0.52
312 0.52
313 0.46
314 0.44
315 0.38
316 0.37
317 0.34
318 0.31
319 0.26
320 0.21
321 0.21
322 0.18
323 0.17
324 0.15
325 0.18
326 0.19
327 0.19
328 0.18
329 0.18
330 0.2
331 0.24
332 0.28
333 0.31
334 0.35
335 0.38
336 0.45
337 0.48
338 0.52
339 0.5
340 0.46
341 0.49
342 0.46
343 0.5
344 0.49
345 0.46
346 0.41
347 0.43
348 0.44
349 0.35
350 0.33
351 0.26
352 0.2
353 0.22
354 0.22
355 0.19
356 0.18
357 0.18
358 0.19
359 0.19
360 0.2
361 0.23
362 0.32
363 0.39
364 0.44
365 0.52
366 0.54
367 0.64
368 0.71
369 0.75
370 0.74
371 0.75
372 0.76
373 0.75
374 0.79
375 0.79
376 0.76
377 0.69
378 0.61
379 0.53
380 0.47
381 0.41
382 0.34
383 0.23
384 0.19
385 0.18
386 0.18
387 0.18
388 0.16
389 0.14
390 0.15
391 0.17
392 0.2
393 0.2
394 0.2
395 0.2
396 0.21
397 0.21
398 0.2
399 0.21
400 0.22
401 0.25
402 0.33
403 0.41
404 0.47
405 0.48
406 0.53
407 0.58
408 0.55
409 0.58
410 0.55
411 0.48
412 0.41
413 0.41
414 0.37
415 0.28
416 0.27
417 0.18
418 0.16
419 0.16
420 0.15
421 0.17
422 0.19
423 0.2
424 0.19
425 0.2
426 0.17
427 0.18
428 0.2
429 0.2
430 0.22
431 0.21
432 0.22
433 0.26
434 0.33
435 0.37
436 0.4
437 0.38
438 0.4
439 0.47
440 0.57
441 0.6
442 0.61
443 0.59
444 0.61
445 0.61
446 0.6
447 0.59
448 0.51
449 0.46
450 0.38
451 0.38
452 0.32
453 0.31
454 0.25
455 0.2
456 0.17
457 0.15
458 0.16
459 0.12
460 0.15
461 0.15
462 0.16
463 0.16
464 0.17
465 0.17
466 0.16
467 0.16
468 0.13
469 0.13
470 0.13
471 0.13
472 0.13
473 0.12
474 0.11
475 0.12
476 0.16
477 0.15
478 0.16
479 0.16
480 0.16
481 0.2
482 0.22
483 0.29
484 0.35
485 0.43
486 0.53
487 0.63
488 0.7
489 0.76
490 0.84
491 0.87
492 0.88
493 0.9
494 0.91
495 0.91
496 0.94
497 0.93
498 0.92
499 0.88
500 0.85
501 0.85
502 0.83