FuNGI

S2JF60

Protein Details

Accession

S2JF60

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
460-496	SSSTRDRSRSNSRYNQKRHSSRSRSPRRDSRRHDEGS	Hydrophilic
571-641	REDDFKRRDHSSRRSRSPKEERSSSRHGHSSSSSRRHHRSSRYSNRSHERERDKPREKSSSDRDRRRNDRR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
476-492	KRHSSRSRSPRRDSRRH
576-641	KRRDHSSRRSRSPKEERSSSRHGHSSSSSRRHHRSSRYSNRSHERERDKPREKSSSDRDRRRNDRR

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR033489 RBBP6 IPR003613 Ubox_domain IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf IPR001841 Znf_RING IPR013083 Znf_RING/FYVE/PHD
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0061630 F:ubiquitin protein ligase activity GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006397 P:mRNA processing GO:0016567 P:protein ubiquitination
Pfam	View protein in Pfam PF04564 U-box
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC PS50089 ZF_RING_2
CDD	cd16620 vRING-HC-C4C4_RBBP6

Amino Acid Sequences

MADELNSRDDDKQLQQQNSEQYNDQQQKPPFRGGQNMMNNMAFDPSVMKMGMMNPMQYQQRLQQMMMMQQFQRQQTQRYMSSAAAMAAAANSNSNASNIPPETQKPPSGYVCFKCSQPGHWIYYCPNVPKGQFVQRAGGARNNNTSNQFDDQDGNNQKPQELTCMICDKLMTDAVVVPCCGKSFCKECITNTLEKSNHCPFCNQENISVDQLIPNRTLRLAIQIKIEEDDKKKQEQMDIDESPQQQQHQDQQQDEPIKDEESNKVVEERKVPMRMMNPHNQAHNYPHPPPPNPDMFNAGGMPDMSWMNMGRPPFMNNRFPGFGAPDMNWMRNNNSKSNGGDNEMDMDMSQRPPPHPPFMPGFPGAFNPNGNGDMPPFPGMPPPQEFFGFGGNMPFNNNTNNMRGGFSPMRGGRGGGRGGPGGGRGGYYQGGARRRSDYQQGNNHQYDDDKQKPSHADHSSSSTRDRSRSNSRYNQKRHSSRSRSPRRDSRRHDEGSSSSRRYRDESTRSGSRRREESSHGNSGRHYDDSKHRDDKSRDESSRRRGSKDDSSRHRDDKQSSRKYDMDDYSDREDDFKRRDHSSRRSRSPKEERSSSRHGHSSSSSRRHHRSSRYSNRSHERERDKPREKSSSDRDRRRNDRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.45
3	0.5
4	0.57
5	0.56
6	0.54
7	0.47
8	0.43
9	0.5
10	0.55
11	0.54
12	0.53
13	0.55
14	0.61
15	0.63
16	0.66
17	0.62
18	0.59
19	0.63
20	0.6
21	0.63
22	0.62
23	0.62
24	0.57
25	0.51
26	0.47
27	0.38
28	0.34
29	0.24
30	0.15
31	0.13
32	0.1
33	0.12
34	0.11
35	0.11
36	0.11
37	0.13
38	0.2
39	0.19
40	0.19
41	0.18
42	0.24
43	0.27
44	0.27
45	0.28
46	0.27
47	0.34
48	0.35
49	0.34
50	0.33
51	0.32
52	0.38
53	0.39
54	0.38
55	0.3
56	0.32
57	0.38
58	0.36
59	0.42
60	0.39
61	0.4
62	0.44
63	0.5
64	0.48
65	0.47
66	0.47
67	0.39
68	0.37
69	0.33
70	0.24
71	0.18
72	0.15
73	0.11
74	0.09
75	0.09
76	0.06
77	0.06
78	0.06
79	0.07
80	0.07
81	0.08
82	0.08
83	0.09
84	0.14
85	0.15
86	0.17
87	0.2
88	0.23
89	0.28
90	0.32
91	0.35
92	0.33
93	0.37
94	0.4
95	0.42
96	0.46
97	0.44
98	0.45
99	0.43
100	0.4
101	0.43
102	0.39
103	0.36
104	0.38
105	0.4
106	0.4
107	0.4
108	0.42
109	0.37
110	0.44
111	0.44
112	0.38
113	0.37
114	0.35
115	0.33
116	0.37
117	0.39
118	0.41
119	0.43
120	0.42
121	0.42
122	0.42
123	0.45
124	0.42
125	0.42
126	0.37
127	0.33
128	0.38
129	0.36
130	0.36
131	0.36
132	0.35
133	0.33
134	0.33
135	0.31
136	0.26
137	0.26
138	0.25
139	0.31
140	0.33
141	0.32
142	0.32
143	0.31
144	0.3
145	0.28
146	0.28
147	0.24
148	0.22
149	0.21
150	0.22
151	0.25
152	0.25
153	0.23
154	0.23
155	0.17
156	0.17
157	0.16
158	0.12
159	0.09
160	0.12
161	0.13
162	0.14
163	0.13
164	0.12
165	0.11
166	0.12
167	0.12
168	0.1
169	0.14
170	0.18
171	0.24
172	0.3
173	0.32
174	0.33
175	0.41
176	0.44
177	0.44
178	0.41
179	0.43
180	0.38
181	0.37
182	0.42
183	0.42
184	0.42
185	0.38
186	0.38
187	0.34
188	0.39
189	0.46
190	0.4
191	0.36
192	0.34
193	0.36
194	0.35
195	0.32
196	0.25
197	0.21
198	0.22
199	0.18
200	0.17
201	0.15
202	0.15
203	0.14
204	0.15
205	0.12
206	0.19
207	0.21
208	0.21
209	0.24
210	0.24
211	0.24
212	0.25
213	0.26
214	0.22
215	0.23
216	0.29
217	0.29
218	0.31
219	0.33
220	0.33
221	0.36
222	0.34
223	0.36
224	0.36
225	0.34
226	0.33
227	0.35
228	0.34
229	0.32
230	0.29
231	0.24
232	0.18
233	0.19
234	0.25
235	0.27
236	0.31
237	0.3
238	0.31
239	0.36
240	0.38
241	0.36
242	0.31
243	0.24
244	0.21
245	0.21
246	0.21
247	0.17
248	0.16
249	0.17
250	0.14
251	0.17
252	0.18
253	0.19
254	0.2
255	0.22
256	0.26
257	0.27
258	0.27
259	0.27
260	0.29
261	0.35
262	0.38
263	0.42
264	0.42
265	0.42
266	0.44
267	0.42
268	0.39
269	0.37
270	0.38
271	0.34
272	0.32
273	0.36
274	0.38
275	0.38
276	0.41
277	0.4
278	0.38
279	0.36
280	0.34
281	0.32
282	0.29
283	0.28
284	0.23
285	0.19
286	0.13
287	0.11
288	0.09
289	0.06
290	0.06
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.06
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.09
299	0.12
300	0.18
301	0.22
302	0.26
303	0.26
304	0.29
305	0.28
306	0.28
307	0.26
308	0.21
309	0.18
310	0.14
311	0.13
312	0.17
313	0.17
314	0.18
315	0.18
316	0.18
317	0.2
318	0.24
319	0.27
320	0.23
321	0.25
322	0.26
323	0.26
324	0.3
325	0.28
326	0.25
327	0.22
328	0.19
329	0.18
330	0.16
331	0.15
332	0.1
333	0.1
334	0.08
335	0.09
336	0.1
337	0.1
338	0.11
339	0.17
340	0.21
341	0.24
342	0.25
343	0.27
344	0.29
345	0.3
346	0.32
347	0.27
348	0.24
349	0.2
350	0.2
351	0.19
352	0.16
353	0.14
354	0.11
355	0.11
356	0.11
357	0.11
358	0.1
359	0.1
360	0.1
361	0.11
362	0.12
363	0.11
364	0.1
365	0.13
366	0.14
367	0.15
368	0.17
369	0.17
370	0.17
371	0.17
372	0.18
373	0.16
374	0.17
375	0.14
376	0.11
377	0.13
378	0.11
379	0.11
380	0.11
381	0.12
382	0.11
383	0.12
384	0.15
385	0.14
386	0.16
387	0.18
388	0.18
389	0.18
390	0.17
391	0.22
392	0.2
393	0.19
394	0.23
395	0.21
396	0.23
397	0.22
398	0.22
399	0.18
400	0.2
401	0.2
402	0.16
403	0.16
404	0.14
405	0.14
406	0.14
407	0.12
408	0.09
409	0.08
410	0.07
411	0.06
412	0.08
413	0.08
414	0.08
415	0.1
416	0.14
417	0.19
418	0.21
419	0.23
420	0.25
421	0.28
422	0.31
423	0.38
424	0.41
425	0.44
426	0.52
427	0.57
428	0.61
429	0.6
430	0.57
431	0.49
432	0.42
433	0.38
434	0.37
435	0.37
436	0.34
437	0.33
438	0.37
439	0.4
440	0.42
441	0.46
442	0.41
443	0.38
444	0.34
445	0.41
446	0.41
447	0.39
448	0.39
449	0.37
450	0.36
451	0.36
452	0.38
453	0.38
454	0.45
455	0.52
456	0.58
457	0.62
458	0.69
459	0.76
460	0.81
461	0.83
462	0.83
463	0.83
464	0.83
465	0.84
466	0.84
467	0.82
468	0.85
469	0.87
470	0.86
471	0.86
472	0.87
473	0.87
474	0.88
475	0.88
476	0.86
477	0.84
478	0.79
479	0.72
480	0.66
481	0.62
482	0.59
483	0.58
484	0.54
485	0.48
486	0.47
487	0.46
488	0.46
489	0.47
490	0.48
491	0.48
492	0.5
493	0.53
494	0.59
495	0.62
496	0.66
497	0.66
498	0.62
499	0.61
500	0.59
501	0.56
502	0.54
503	0.6
504	0.59
505	0.62
506	0.59
507	0.54
508	0.49
509	0.49
510	0.44
511	0.37
512	0.32
513	0.27
514	0.34
515	0.4
516	0.47
517	0.5
518	0.52
519	0.58
520	0.61
521	0.65
522	0.63
523	0.67
524	0.64
525	0.67
526	0.71
527	0.72
528	0.78
529	0.72
530	0.68
531	0.62
532	0.64
533	0.66
534	0.68
535	0.68
536	0.67
537	0.71
538	0.75
539	0.76
540	0.75
541	0.72
542	0.7
543	0.71
544	0.72
545	0.74
546	0.72
547	0.72
548	0.69
549	0.66
550	0.66
551	0.6
552	0.56
553	0.51
554	0.5
555	0.49
556	0.48
557	0.43
558	0.37
559	0.36
560	0.36
561	0.36
562	0.39
563	0.38
564	0.42
565	0.51
566	0.58
567	0.65
568	0.69
569	0.75
570	0.79
571	0.85
572	0.86
573	0.88
574	0.9
575	0.89
576	0.87
577	0.87
578	0.84
579	0.81
580	0.83
581	0.78
582	0.73
583	0.7
584	0.62
585	0.56
586	0.54
587	0.56
588	0.58
589	0.61
590	0.63
591	0.66
592	0.72
593	0.76
594	0.79
595	0.8
596	0.81
597	0.82
598	0.85
599	0.86
600	0.87
601	0.88
602	0.89
603	0.87
604	0.85
605	0.84
606	0.82
607	0.82
608	0.85
609	0.86
610	0.85
611	0.86
612	0.86
613	0.86
614	0.81
615	0.81
616	0.81
617	0.81
618	0.82
619	0.83
620	0.84
621	0.85

S2JF60

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer