Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2IUH2

Protein Details
Accession S2IUH2    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
342-377MHVLSIKKSKAKTNKRKRHHHHHSKKDSNVKSNNDHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
348-367KKSKAKTNKRKRHHHHHSKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MIVGTADDDANGQQHMVEVRNKIEELNRTISTIKHSIKLSGERVTASIKGVSAGSSNAATGGISLSKRDLPKFQLKSDSVKYFHGEESFDSIFHFLAVFEKVVSSSGQDVESVWKRYLPLTIPYEYDMWLKQELLLVNTWKEAKDAFVKKFNSSLHRLSARRAVQSSTMQGGETTEQYLNRFSRSCVEAGYNSNDAAIADAFLNGFPTDWQIQITALLCNTFPGQDSWTTNQVAGAATNILGNVKRPMSFVGRAGGNSSGYSKGGFGDGKASGQQGYRSKREDSRNSESTFSRSREGGKRNVPTNATSPTFCLYCGKRWIKGHSCPEYHAAMKANGGQKPTMHVLSIKKSKAKTNKRKRHHHHHSKKDSNVKSNNDHDEETNWLRQAYENQND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.12
3 0.15
4 0.2
5 0.22
6 0.25
7 0.28
8 0.28
9 0.28
10 0.32
11 0.35
12 0.36
13 0.39
14 0.37
15 0.35
16 0.36
17 0.35
18 0.36
19 0.38
20 0.35
21 0.34
22 0.34
23 0.36
24 0.41
25 0.47
26 0.44
27 0.41
28 0.4
29 0.35
30 0.36
31 0.34
32 0.3
33 0.24
34 0.21
35 0.16
36 0.15
37 0.15
38 0.14
39 0.12
40 0.11
41 0.11
42 0.1
43 0.09
44 0.09
45 0.08
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.12
53 0.17
54 0.21
55 0.23
56 0.27
57 0.31
58 0.42
59 0.46
60 0.48
61 0.52
62 0.51
63 0.56
64 0.58
65 0.57
66 0.49
67 0.47
68 0.45
69 0.39
70 0.38
71 0.33
72 0.26
73 0.21
74 0.25
75 0.22
76 0.2
77 0.17
78 0.16
79 0.14
80 0.13
81 0.12
82 0.06
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.16
98 0.21
99 0.22
100 0.21
101 0.21
102 0.21
103 0.22
104 0.25
105 0.21
106 0.23
107 0.24
108 0.25
109 0.25
110 0.26
111 0.26
112 0.24
113 0.23
114 0.17
115 0.15
116 0.14
117 0.13
118 0.12
119 0.14
120 0.14
121 0.13
122 0.15
123 0.14
124 0.13
125 0.15
126 0.15
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.19
132 0.25
133 0.26
134 0.33
135 0.35
136 0.36
137 0.4
138 0.41
139 0.37
140 0.36
141 0.36
142 0.34
143 0.39
144 0.39
145 0.37
146 0.42
147 0.39
148 0.37
149 0.35
150 0.31
151 0.27
152 0.28
153 0.28
154 0.22
155 0.19
156 0.16
157 0.15
158 0.14
159 0.12
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.14
166 0.14
167 0.15
168 0.15
169 0.13
170 0.17
171 0.18
172 0.17
173 0.15
174 0.16
175 0.16
176 0.17
177 0.2
178 0.16
179 0.15
180 0.14
181 0.13
182 0.11
183 0.1
184 0.07
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.08
212 0.1
213 0.13
214 0.15
215 0.18
216 0.18
217 0.18
218 0.17
219 0.16
220 0.14
221 0.11
222 0.09
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.08
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.13
235 0.17
236 0.19
237 0.19
238 0.2
239 0.2
240 0.19
241 0.2
242 0.19
243 0.14
244 0.13
245 0.13
246 0.11
247 0.1
248 0.11
249 0.09
250 0.09
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.11
255 0.11
256 0.12
257 0.12
258 0.13
259 0.12
260 0.13
261 0.18
262 0.22
263 0.28
264 0.32
265 0.35
266 0.39
267 0.45
268 0.53
269 0.57
270 0.58
271 0.61
272 0.62
273 0.61
274 0.6
275 0.54
276 0.5
277 0.47
278 0.41
279 0.35
280 0.3
281 0.34
282 0.39
283 0.44
284 0.47
285 0.49
286 0.53
287 0.55
288 0.58
289 0.54
290 0.48
291 0.47
292 0.44
293 0.38
294 0.32
295 0.29
296 0.27
297 0.25
298 0.22
299 0.24
300 0.22
301 0.25
302 0.35
303 0.38
304 0.42
305 0.47
306 0.56
307 0.59
308 0.65
309 0.69
310 0.67
311 0.65
312 0.61
313 0.6
314 0.55
315 0.47
316 0.41
317 0.35
318 0.27
319 0.26
320 0.3
321 0.31
322 0.29
323 0.3
324 0.28
325 0.25
326 0.29
327 0.32
328 0.27
329 0.23
330 0.25
331 0.29
332 0.37
333 0.45
334 0.45
335 0.47
336 0.49
337 0.58
338 0.64
339 0.7
340 0.71
341 0.75
342 0.8
343 0.85
344 0.93
345 0.94
346 0.94
347 0.94
348 0.95
349 0.94
350 0.95
351 0.96
352 0.94
353 0.93
354 0.92
355 0.89
356 0.88
357 0.86
358 0.82
359 0.79
360 0.77
361 0.76
362 0.69
363 0.63
364 0.54
365 0.48
366 0.47
367 0.45
368 0.41
369 0.34
370 0.3
371 0.29
372 0.3
373 0.36