Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2KH38

Protein Details
Accession S2KH38    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
122-144DDGDRNFKHRRQRSNSPEEQPRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
314-320GRGRGRG
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 6, pero 3, mito 2, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR045137  RBM26/27  
IPR000504  RRM_dom  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd12257  RRM1_RBM26_like  
Amino Acid Sequences MANKQLPADLESFVSNEVASLCDADPVVLAQYIIALIGSGERNDSLKTSLESKLNEFFDDQTIPFIDRLFAKMNEGNPAGSFNSAAAAATTTATTATTTAAAPSSTSNTNKERFTDFSDDEDDGDRNFKHRRQRSNSPEEQPRSYNKRRYDDDNDTSSSSKYQRYDDRRSGSYSGGYNSNVYERGGRGGRGGMRGGRGGSGVNRGQNKPQCRDYNEKGFCMRGDMCPYDHGMDRIIVDEGANGPFPGAPFPNNGMPPMGRGGPGQPPFFGLPGVPDAYDPERSGLMGNADMGGFGGMMPPNADMMNMMRGGMRGRGRGRGRGGYQRHQHQNMNPLNTTLNVEKIPVEFCQISTVNDFFAKFGTITNISVQPQAQKAIIQYSTRAEAEAAYNSPDAIFDNRFVKVYWSKEDPTVPSSADKAGAGVGVGAQAPIAAPKVNEPDPELVAARAAEIAQAREEKQKKHQEQMKHILEIQKKRETQLQQQIDEQKRLLAKLTNSANMSQTEKAELLKALKNIQSDIDTSKNAAANEAAQAKAATPTAAVEPQGAEVKEGEETTEDLKKKLARLEAEAANLGIHGSGFRGGRGGYYGGRGRGGSWARGGGRGGAIAPRTMSLDNRPTKIAVKDIPESTNDTELRQHFQQFGNVTLFEQKDKEALVQYAQRFEAEKAMAAGSHFPKGTLQLDWFNQQTTTEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.11
3 0.1
4 0.09
5 0.09
6 0.08
7 0.1
8 0.09
9 0.1
10 0.11
11 0.1
12 0.1
13 0.09
14 0.1
15 0.08
16 0.08
17 0.06
18 0.07
19 0.06
20 0.06
21 0.05
22 0.04
23 0.03
24 0.07
25 0.08
26 0.08
27 0.09
28 0.1
29 0.12
30 0.13
31 0.14
32 0.14
33 0.16
34 0.18
35 0.21
36 0.25
37 0.29
38 0.3
39 0.33
40 0.38
41 0.36
42 0.36
43 0.33
44 0.3
45 0.28
46 0.28
47 0.24
48 0.2
49 0.2
50 0.2
51 0.18
52 0.17
53 0.16
54 0.14
55 0.18
56 0.2
57 0.2
58 0.23
59 0.27
60 0.28
61 0.32
62 0.31
63 0.28
64 0.24
65 0.26
66 0.21
67 0.18
68 0.17
69 0.11
70 0.11
71 0.1
72 0.09
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.13
92 0.17
93 0.2
94 0.25
95 0.3
96 0.34
97 0.36
98 0.37
99 0.38
100 0.36
101 0.4
102 0.42
103 0.37
104 0.37
105 0.38
106 0.35
107 0.32
108 0.31
109 0.25
110 0.18
111 0.2
112 0.16
113 0.17
114 0.23
115 0.27
116 0.36
117 0.44
118 0.54
119 0.6
120 0.7
121 0.76
122 0.81
123 0.85
124 0.82
125 0.84
126 0.78
127 0.74
128 0.68
129 0.66
130 0.65
131 0.66
132 0.66
133 0.64
134 0.68
135 0.67
136 0.71
137 0.71
138 0.71
139 0.69
140 0.65
141 0.59
142 0.52
143 0.49
144 0.41
145 0.36
146 0.29
147 0.28
148 0.26
149 0.29
150 0.37
151 0.45
152 0.53
153 0.58
154 0.61
155 0.58
156 0.6
157 0.56
158 0.48
159 0.43
160 0.36
161 0.29
162 0.26
163 0.24
164 0.2
165 0.19
166 0.19
167 0.16
168 0.15
169 0.15
170 0.13
171 0.17
172 0.18
173 0.17
174 0.16
175 0.19
176 0.21
177 0.21
178 0.22
179 0.19
180 0.2
181 0.2
182 0.2
183 0.16
184 0.14
185 0.13
186 0.12
187 0.16
188 0.17
189 0.2
190 0.25
191 0.26
192 0.34
193 0.39
194 0.45
195 0.45
196 0.51
197 0.53
198 0.54
199 0.61
200 0.6
201 0.64
202 0.61
203 0.58
204 0.51
205 0.46
206 0.4
207 0.36
208 0.3
209 0.22
210 0.24
211 0.23
212 0.22
213 0.22
214 0.23
215 0.21
216 0.2
217 0.18
218 0.14
219 0.13
220 0.12
221 0.12
222 0.11
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.1
237 0.13
238 0.16
239 0.16
240 0.17
241 0.16
242 0.15
243 0.16
244 0.16
245 0.14
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.18
250 0.22
251 0.21
252 0.19
253 0.21
254 0.21
255 0.21
256 0.19
257 0.11
258 0.09
259 0.1
260 0.11
261 0.08
262 0.08
263 0.1
264 0.11
265 0.13
266 0.12
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.09
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.03
281 0.03
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.05
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.06
296 0.07
297 0.08
298 0.12
299 0.13
300 0.16
301 0.17
302 0.25
303 0.27
304 0.31
305 0.34
306 0.34
307 0.36
308 0.4
309 0.44
310 0.44
311 0.49
312 0.52
313 0.56
314 0.55
315 0.55
316 0.49
317 0.53
318 0.49
319 0.47
320 0.39
321 0.32
322 0.29
323 0.26
324 0.25
325 0.16
326 0.14
327 0.1
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.11
332 0.09
333 0.11
334 0.09
335 0.09
336 0.12
337 0.12
338 0.13
339 0.13
340 0.13
341 0.11
342 0.12
343 0.12
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.06
348 0.06
349 0.08
350 0.08
351 0.09
352 0.1
353 0.12
354 0.12
355 0.13
356 0.13
357 0.13
358 0.13
359 0.13
360 0.12
361 0.11
362 0.11
363 0.13
364 0.15
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.15
369 0.14
370 0.14
371 0.11
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.1
376 0.09
377 0.09
378 0.08
379 0.08
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.09
384 0.09
385 0.11
386 0.12
387 0.13
388 0.13
389 0.16
390 0.18
391 0.21
392 0.23
393 0.25
394 0.26
395 0.27
396 0.3
397 0.27
398 0.25
399 0.23
400 0.2
401 0.17
402 0.17
403 0.15
404 0.14
405 0.12
406 0.1
407 0.08
408 0.07
409 0.06
410 0.05
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.03
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.07
423 0.11
424 0.13
425 0.14
426 0.15
427 0.17
428 0.17
429 0.18
430 0.17
431 0.12
432 0.11
433 0.11
434 0.08
435 0.07
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.07
440 0.08
441 0.1
442 0.12
443 0.2
444 0.24
445 0.26
446 0.35
447 0.46
448 0.48
449 0.56
450 0.61
451 0.61
452 0.67
453 0.74
454 0.69
455 0.6
456 0.58
457 0.56
458 0.56
459 0.55
460 0.52
461 0.49
462 0.45
463 0.45
464 0.51
465 0.49
466 0.51
467 0.55
468 0.54
469 0.48
470 0.53
471 0.6
472 0.57
473 0.54
474 0.44
475 0.37
476 0.32
477 0.31
478 0.28
479 0.23
480 0.2
481 0.25
482 0.28
483 0.28
484 0.28
485 0.29
486 0.29
487 0.26
488 0.28
489 0.22
490 0.2
491 0.18
492 0.17
493 0.16
494 0.16
495 0.16
496 0.17
497 0.19
498 0.2
499 0.22
500 0.24
501 0.25
502 0.24
503 0.24
504 0.21
505 0.19
506 0.21
507 0.2
508 0.18
509 0.19
510 0.21
511 0.22
512 0.2
513 0.19
514 0.16
515 0.14
516 0.17
517 0.18
518 0.15
519 0.13
520 0.13
521 0.12
522 0.14
523 0.13
524 0.09
525 0.07
526 0.08
527 0.1
528 0.11
529 0.11
530 0.1
531 0.1
532 0.12
533 0.15
534 0.14
535 0.13
536 0.12
537 0.12
538 0.13
539 0.12
540 0.11
541 0.08
542 0.1
543 0.12
544 0.18
545 0.18
546 0.18
547 0.22
548 0.24
549 0.27
550 0.31
551 0.34
552 0.31
553 0.35
554 0.41
555 0.4
556 0.39
557 0.36
558 0.31
559 0.24
560 0.21
561 0.15
562 0.09
563 0.06
564 0.04
565 0.04
566 0.08
567 0.08
568 0.08
569 0.1
570 0.1
571 0.1
572 0.12
573 0.14
574 0.12
575 0.17
576 0.21
577 0.21
578 0.22
579 0.22
580 0.2
581 0.26
582 0.28
583 0.25
584 0.23
585 0.27
586 0.26
587 0.28
588 0.28
589 0.22
590 0.2
591 0.18
592 0.17
593 0.15
594 0.15
595 0.14
596 0.14
597 0.13
598 0.15
599 0.15
600 0.17
601 0.21
602 0.3
603 0.35
604 0.36
605 0.37
606 0.37
607 0.41
608 0.41
609 0.41
610 0.36
611 0.36
612 0.39
613 0.41
614 0.4
615 0.38
616 0.4
617 0.36
618 0.38
619 0.33
620 0.29
621 0.33
622 0.33
623 0.37
624 0.35
625 0.36
626 0.33
627 0.35
628 0.39
629 0.34
630 0.35
631 0.33
632 0.3
633 0.28
634 0.3
635 0.29
636 0.26
637 0.25
638 0.22
639 0.21
640 0.21
641 0.23
642 0.21
643 0.21
644 0.24
645 0.3
646 0.31
647 0.34
648 0.33
649 0.32
650 0.3
651 0.29
652 0.3
653 0.24
654 0.23
655 0.2
656 0.2
657 0.19
658 0.18
659 0.24
660 0.2
661 0.24
662 0.22
663 0.21
664 0.22
665 0.26
666 0.28
667 0.24
668 0.26
669 0.28
670 0.31
671 0.36
672 0.36
673 0.33
674 0.31