FuNGI

R8BXX5

Protein Details

Accession

R8BXX5

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-47	MDGLKSEKRHKKDKSDRKRARDGDDGDAPRRHKKHRKQGSDETNDET	Basic
56-85	LALEIRDVERKKNKRKKSKQSRRSEAVPID	Hydrophilic
121-143	FMEEHTKSKKKSRKNMHGQDIIE	Hydrophilic
159-183	LEDHIELKKKKKKRKNADGAQNIAM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-37	SEKRHKKDKSDRKRARDGDDGDAPRRHKKHRK
65-78	RKKNKRKKSKQSRR
129-131	KKK
166-175	KKKKKKRKNA

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
KEGG	tmn:UCRPA7_255 -
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MDGLKSEKRHKKDKSDRKRARDGDDGDAPRRHKKHRKQGSDETNDETGDTSPNAQLALEIRDVERKKNKRKKSKQSRRSEAVPIDEAHNPVDVAPGMTKDSTALRTAGRMSVAEEHPSTGFMEEHTKSKKKSRKNMHGQDIIEAAANPSDLELRHTGSLEDHIELKKKKKKRKNADGAQNIAMEASRRSSTGKAEERKDKSRQRDKDLVAPPADVDFMDIDVPTKSHLQPVNAPATPSFPFFTQKVYLYLPLYPAGFATPISSIAKQHLEPLVNHYSPMLRGVVLGYSNVSIAHRPTTRGSPQADDTPAILESIDEYAVGFGWLTVDVSLFVPTRGAWMEGRVNLQNEGHVGVLCWEKFSASIDAKRLPPGWKWIDCLNADSEEGNGAIKPVESADGQLRDDTFADENQSLHQMHTTGYWVDASGNAVRGTLLFRIRDFEIGRVGDHGYLSIVGTMLSEEEEKTMEAEEREEQSRRRKQLNPAGLLRAETRRVPEFSITTFGKEDQEETAEQRLVYSKSRLNTPDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.88
2	0.9
3	0.93
4	0.92
5	0.94
6	0.89
7	0.85
8	0.84
9	0.77
10	0.73
11	0.72
12	0.67
13	0.62
14	0.61
15	0.57
16	0.57
17	0.59
18	0.63
19	0.64
20	0.7
21	0.75
22	0.81
23	0.88
24	0.88
25	0.92
26	0.92
27	0.91
28	0.83
29	0.77
30	0.68
31	0.57
32	0.47
33	0.37
34	0.27
35	0.2
36	0.17
37	0.14
38	0.13
39	0.13
40	0.13
41	0.12
42	0.12
43	0.12
44	0.15
45	0.14
46	0.14
47	0.15
48	0.23
49	0.25
50	0.33
51	0.41
52	0.48
53	0.58
54	0.67
55	0.77
56	0.8
57	0.9
58	0.93
59	0.94
60	0.95
61	0.95
62	0.96
63	0.95
64	0.91
65	0.86
66	0.83
67	0.76
68	0.7
69	0.63
70	0.53
71	0.46
72	0.41
73	0.36
74	0.28
75	0.23
76	0.17
77	0.14
78	0.15
79	0.11
80	0.1
81	0.1
82	0.1
83	0.11
84	0.11
85	0.11
86	0.11
87	0.13
88	0.14
89	0.15
90	0.15
91	0.14
92	0.16
93	0.18
94	0.18
95	0.16
96	0.15
97	0.15
98	0.2
99	0.2
100	0.22
101	0.21
102	0.2
103	0.19
104	0.2
105	0.18
106	0.13
107	0.12
108	0.1
109	0.16
110	0.16
111	0.22
112	0.28
113	0.33
114	0.35
115	0.45
116	0.52
117	0.56
118	0.65
119	0.71
120	0.75
121	0.81
122	0.88
123	0.87
124	0.87
125	0.77
126	0.69
127	0.58
128	0.47
129	0.36
130	0.26
131	0.16
132	0.09
133	0.08
134	0.06
135	0.05
136	0.06
137	0.06
138	0.09
139	0.1
140	0.12
141	0.13
142	0.13
143	0.13
144	0.13
145	0.16
146	0.14
147	0.13
148	0.14
149	0.15
150	0.22
151	0.25
152	0.34
153	0.39
154	0.47
155	0.57
156	0.64
157	0.74
158	0.79
159	0.86
160	0.88
161	0.9
162	0.92
163	0.89
164	0.83
165	0.74
166	0.63
167	0.51
168	0.4
169	0.3
170	0.2
171	0.12
172	0.1
173	0.08
174	0.08
175	0.1
176	0.12
177	0.15
178	0.23
179	0.31
180	0.35
181	0.41
182	0.5
183	0.54
184	0.59
185	0.65
186	0.65
187	0.67
188	0.71
189	0.72
190	0.71
191	0.74
192	0.69
193	0.7
194	0.67
195	0.61
196	0.51
197	0.44
198	0.36
199	0.27
200	0.25
201	0.15
202	0.11
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.06
210	0.06
211	0.09
212	0.09
213	0.14
214	0.16
215	0.17
216	0.21
217	0.25
218	0.29
219	0.27
220	0.27
221	0.22
222	0.23
223	0.22
224	0.19
225	0.16
226	0.12
227	0.14
228	0.14
229	0.17
230	0.16
231	0.16
232	0.17
233	0.17
234	0.18
235	0.17
236	0.17
237	0.15
238	0.14
239	0.13
240	0.1
241	0.09
242	0.07
243	0.07
244	0.06
245	0.06
246	0.05
247	0.07
248	0.08
249	0.09
250	0.09
251	0.11
252	0.12
253	0.12
254	0.14
255	0.15
256	0.15
257	0.15
258	0.2
259	0.24
260	0.22
261	0.22
262	0.2
263	0.18
264	0.16
265	0.17
266	0.12
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.07
271	0.06
272	0.06
273	0.05
274	0.05
275	0.05
276	0.05
277	0.06
278	0.05
279	0.06
280	0.11
281	0.11
282	0.13
283	0.15
284	0.2
285	0.22
286	0.27
287	0.28
288	0.26
289	0.27
290	0.29
291	0.28
292	0.23
293	0.21
294	0.17
295	0.15
296	0.13
297	0.1
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.05
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.04
314	0.04
315	0.05
316	0.07
317	0.07
318	0.06
319	0.07
320	0.06
321	0.08
322	0.08
323	0.09
324	0.08
325	0.11
326	0.14
327	0.15
328	0.18
329	0.18
330	0.19
331	0.19
332	0.19
333	0.16
334	0.14
335	0.13
336	0.11
337	0.08
338	0.07
339	0.08
340	0.11
341	0.1
342	0.1
343	0.09
344	0.09
345	0.09
346	0.12
347	0.15
348	0.16
349	0.19
350	0.22
351	0.26
352	0.27
353	0.3
354	0.3
355	0.28
356	0.27
357	0.32
358	0.36
359	0.34
360	0.35
361	0.35
362	0.38
363	0.36
364	0.35
365	0.29
366	0.23
367	0.21
368	0.19
369	0.16
370	0.11
371	0.1
372	0.09
373	0.07
374	0.06
375	0.06
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.07
380	0.07
381	0.09
382	0.14
383	0.16
384	0.16
385	0.17
386	0.17
387	0.17
388	0.17
389	0.17
390	0.14
391	0.12
392	0.15
393	0.14
394	0.14
395	0.14
396	0.18
397	0.16
398	0.15
399	0.15
400	0.13
401	0.12
402	0.13
403	0.14
404	0.11
405	0.11
406	0.11
407	0.1
408	0.1
409	0.1
410	0.11
411	0.11
412	0.12
413	0.12
414	0.12
415	0.11
416	0.11
417	0.13
418	0.14
419	0.17
420	0.16
421	0.16
422	0.2
423	0.21
424	0.26
425	0.25
426	0.23
427	0.25
428	0.24
429	0.24
430	0.22
431	0.22
432	0.18
433	0.17
434	0.15
435	0.1
436	0.09
437	0.09
438	0.08
439	0.07
440	0.05
441	0.06
442	0.05
443	0.05
444	0.06
445	0.07
446	0.06
447	0.07
448	0.08
449	0.08
450	0.09
451	0.1
452	0.11
453	0.11
454	0.13
455	0.16
456	0.2
457	0.24
458	0.28
459	0.32
460	0.41
461	0.49
462	0.54
463	0.59
464	0.62
465	0.68
466	0.75
467	0.79
468	0.76
469	0.72
470	0.71
471	0.63
472	0.58
473	0.52
474	0.46
475	0.4
476	0.34
477	0.34
478	0.34
479	0.35
480	0.36
481	0.37
482	0.34
483	0.33
484	0.38
485	0.34
486	0.32
487	0.32
488	0.3
489	0.28
490	0.26
491	0.25
492	0.21
493	0.23
494	0.22
495	0.23
496	0.27
497	0.25
498	0.24
499	0.24
500	0.26
501	0.26
502	0.29
503	0.32
504	0.32
505	0.33
506	0.41

R8BXX5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer