FuNGI

R8BD80

Protein Details

Accession

R8BD80

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
131-157	SELAAHARRQEKKRKRKQDELDDLEGK	Basic
588-615	RDLKMGRKGSHKKGGVQKRPFKGKRPGK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
138-147	RRQEKKRKRK
455-485	ARAMEKSKKDKIIADGGKGKASFKDRKPPAA
510-545	GRSAAGPLREKERLAASEAARARISKSGKSGKRGST
578-615	RRASSRDGKPRDLKMGRKGSHKKGGVQKRPFKGKRPGK

Subcellular Location(s)

mito 10.5, cyto_mito 9.5, nucl 8, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	tmn:UCRPA7_7231 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12394 RRM1_RBM34

Amino Acid Sequences

MQRRVFLLSASFGFVTSVREGEVGCGRSSIFSVSSKAVDPALDALFSASAGPVKAPEKSRYAELVASRSKNPAKADEADEEVDDEELSSLGSDAGSDLEDESEDEKGDASEASGDSNEDSSEGEDQQETVSELAAHARRQEKKRKRKQDELDDLEGKYLDKLADDDDTPVIKRRKEETQAAGDEVIVHESLLKKPEEDSDSGSEIVHESLSKDSKVDEIEKAGRTVFLSNVSVEAITSRKAKKALLAHLSSVLDSSASPAQKIESIRFRSVAFSTAAVPKRAAYINKEVMDATTKSTNAYVVYSTPAAVRAAVTKLNGTTVLDRHLRVDSVAHPSEVDHRRCVFVGNLGFVDDETVLNVKIDEEGKEQTEKRKRTKVPMDVEEGLWRQFGERAGKVESVRVVRDSTTRVGKGIAYVQFYDANSVEAALLLNGKKFPPMLPRELRVSRCKAPYKTARAMEKSKKDKIIADGGKGKASFKDRKPPAAAQNGYVRKRTAEEQTLAGRAEKLLGRSAAGPLREKERLAASEAARARISKSGKSGKRGSTDSAPPRVNGKGYGRSSAGPADIKTPEAIVFEGRRASSRDGKPRDLKMGRKGSHKKGGVQKRPFKGKRPGK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.17
3	0.15
4	0.14
5	0.12
6	0.13
7	0.13
8	0.16
9	0.22
10	0.2
11	0.19
12	0.19
13	0.19
14	0.19
15	0.2
16	0.18
17	0.15
18	0.15
19	0.17
20	0.19
21	0.21
22	0.21
23	0.22
24	0.2
25	0.17
26	0.16
27	0.17
28	0.15
29	0.13
30	0.12
31	0.11
32	0.1
33	0.1
34	0.09
35	0.07
36	0.07
37	0.07
38	0.08
39	0.11
40	0.13
41	0.18
42	0.23
43	0.27
44	0.31
45	0.34
46	0.37
47	0.37
48	0.38
49	0.37
50	0.36
51	0.39
52	0.41
53	0.41
54	0.39
55	0.43
56	0.44
57	0.45
58	0.45
59	0.43
60	0.41
61	0.42
62	0.45
63	0.41
64	0.41
65	0.36
66	0.33
67	0.29
68	0.23
69	0.19
70	0.14
71	0.11
72	0.07
73	0.06
74	0.06
75	0.05
76	0.05
77	0.04
78	0.04
79	0.04
80	0.04
81	0.05
82	0.05
83	0.05
84	0.05
85	0.06
86	0.06
87	0.07
88	0.08
89	0.08
90	0.08
91	0.08
92	0.08
93	0.07
94	0.08
95	0.07
96	0.06
97	0.08
98	0.08
99	0.09
100	0.09
101	0.09
102	0.09
103	0.1
104	0.09
105	0.07
106	0.07
107	0.08
108	0.1
109	0.1
110	0.1
111	0.1
112	0.1
113	0.1
114	0.1
115	0.1
116	0.08
117	0.07
118	0.06
119	0.06
120	0.12
121	0.14
122	0.14
123	0.19
124	0.26
125	0.34
126	0.43
127	0.54
128	0.6
129	0.69
130	0.79
131	0.85
132	0.87
133	0.9
134	0.92
135	0.92
136	0.92
137	0.88
138	0.84
139	0.75
140	0.66
141	0.56
142	0.46
143	0.34
144	0.24
145	0.17
146	0.1
147	0.08
148	0.08
149	0.09
150	0.1
151	0.1
152	0.12
153	0.12
154	0.13
155	0.14
156	0.21
157	0.23
158	0.24
159	0.27
160	0.3
161	0.37
162	0.42
163	0.49
164	0.47
165	0.51
166	0.51
167	0.48
168	0.44
169	0.35
170	0.28
171	0.21
172	0.16
173	0.08
174	0.06
175	0.07
176	0.08
177	0.1
178	0.13
179	0.13
180	0.12
181	0.13
182	0.19
183	0.2
184	0.2
185	0.23
186	0.23
187	0.24
188	0.24
189	0.23
190	0.18
191	0.15
192	0.14
193	0.1
194	0.07
195	0.06
196	0.09
197	0.11
198	0.11
199	0.11
200	0.11
201	0.13
202	0.15
203	0.16
204	0.14
205	0.17
206	0.21
207	0.22
208	0.22
209	0.2
210	0.19
211	0.17
212	0.17
213	0.13
214	0.11
215	0.11
216	0.11
217	0.11
218	0.11
219	0.09
220	0.08
221	0.08
222	0.07
223	0.08
224	0.13
225	0.14
226	0.16
227	0.18
228	0.19
229	0.23
230	0.29
231	0.34
232	0.37
233	0.37
234	0.34
235	0.36
236	0.35
237	0.29
238	0.23
239	0.16
240	0.09
241	0.07
242	0.09
243	0.09
244	0.09
245	0.09
246	0.09
247	0.1
248	0.13
249	0.14
250	0.16
251	0.21
252	0.25
253	0.27
254	0.28
255	0.28
256	0.26
257	0.26
258	0.24
259	0.17
260	0.13
261	0.14
262	0.19
263	0.2
264	0.19
265	0.18
266	0.16
267	0.18
268	0.2
269	0.19
270	0.17
271	0.22
272	0.27
273	0.28
274	0.28
275	0.26
276	0.24
277	0.25
278	0.21
279	0.16
280	0.13
281	0.12
282	0.12
283	0.12
284	0.12
285	0.1
286	0.1
287	0.08
288	0.07
289	0.08
290	0.08
291	0.08
292	0.07
293	0.08
294	0.07
295	0.07
296	0.06
297	0.07
298	0.08
299	0.08
300	0.08
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.08
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.12
309	0.13
310	0.13
311	0.14
312	0.14
313	0.14
314	0.12
315	0.13
316	0.12
317	0.17
318	0.17
319	0.15
320	0.15
321	0.15
322	0.24
323	0.29
324	0.28
325	0.25
326	0.26
327	0.27
328	0.27
329	0.28
330	0.2
331	0.17
332	0.17
333	0.14
334	0.13
335	0.13
336	0.12
337	0.11
338	0.11
339	0.07
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.06
348	0.07
349	0.08
350	0.09
351	0.11
352	0.12
353	0.16
354	0.17
355	0.25
356	0.33
357	0.39
358	0.44
359	0.53
360	0.56
361	0.62
362	0.7
363	0.7
364	0.7
365	0.67
366	0.65
367	0.57
368	0.53
369	0.47
370	0.38
371	0.29
372	0.21
373	0.17
374	0.11
375	0.12
376	0.14
377	0.16
378	0.16
379	0.18
380	0.2
381	0.23
382	0.23
383	0.23
384	0.23
385	0.2
386	0.2
387	0.19
388	0.18
389	0.16
390	0.18
391	0.19
392	0.2
393	0.23
394	0.22
395	0.21
396	0.21
397	0.2
398	0.2
399	0.22
400	0.21
401	0.17
402	0.17
403	0.18
404	0.2
405	0.19
406	0.2
407	0.15
408	0.13
409	0.11
410	0.11
411	0.09
412	0.07
413	0.07
414	0.05
415	0.07
416	0.07
417	0.08
418	0.09
419	0.09
420	0.1
421	0.1
422	0.13
423	0.19
424	0.24
425	0.32
426	0.36
427	0.39
428	0.45
429	0.51
430	0.54
431	0.52
432	0.54
433	0.51
434	0.55
435	0.6
436	0.56
437	0.59
438	0.63
439	0.64
440	0.66
441	0.67
442	0.66
443	0.64
444	0.71
445	0.71
446	0.71
447	0.71
448	0.69
449	0.68
450	0.62
451	0.59
452	0.55
453	0.56
454	0.49
455	0.47
456	0.47
457	0.43
458	0.44
459	0.4
460	0.36
461	0.31
462	0.35
463	0.38
464	0.37
465	0.47
466	0.48
467	0.55
468	0.6
469	0.62
470	0.63
471	0.65
472	0.6
473	0.53
474	0.59
475	0.6
476	0.57
477	0.53
478	0.45
479	0.36
480	0.38
481	0.38
482	0.37
483	0.35
484	0.34
485	0.35
486	0.38
487	0.39
488	0.36
489	0.33
490	0.25
491	0.19
492	0.2
493	0.18
494	0.16
495	0.18
496	0.17
497	0.18
498	0.18
499	0.22
500	0.22
501	0.23
502	0.25
503	0.24
504	0.3
505	0.31
506	0.3
507	0.29
508	0.3
509	0.29
510	0.3
511	0.34
512	0.28
513	0.34
514	0.35
515	0.35
516	0.31
517	0.3
518	0.27
519	0.28
520	0.31
521	0.27
522	0.34
523	0.42
524	0.47
525	0.54
526	0.6
527	0.6
528	0.64
529	0.63
530	0.6
531	0.57
532	0.61
533	0.6
534	0.61
535	0.56
536	0.5
537	0.5
538	0.48
539	0.43
540	0.39
541	0.38
542	0.39
543	0.4
544	0.43
545	0.42
546	0.39
547	0.4
548	0.35
549	0.33
550	0.26
551	0.24
552	0.25
553	0.24
554	0.24
555	0.22
556	0.21
557	0.18
558	0.16
559	0.17
560	0.17
561	0.17
562	0.19
563	0.22
564	0.22
565	0.23
566	0.26
567	0.32
568	0.37
569	0.44
570	0.52
571	0.56
572	0.65
573	0.7
574	0.72
575	0.76
576	0.74
577	0.74
578	0.73
579	0.77
580	0.72
581	0.75
582	0.79
583	0.78
584	0.8
585	0.76
586	0.75
587	0.75
588	0.81
589	0.81
590	0.82
591	0.82
592	0.82
593	0.89
594	0.87
595	0.86

R8BD80

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer