Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4RIM6

Protein Details
Accession F4RIM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-58ETSPKDQPEIKRPNPPKKPKYNHPITPTETHydrophilic
260-283TIPIISPKKKSKSKTNLIKPDEETHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito_nucl 13.166, mito 10.5, cyto_nucl 9.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
Gene Ontology GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
KEGG mlr:MELLADRAFT_43085  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MPLTRSSRRLAATTLTSHKSPTLQSNQLETSPKDQPEIKRPNPPKKPKYNHPITPTETLPKPLSSHQDTTPSSPFDLEDAKSHLIKVDRRFKLLFESLPCKPFESSQLNAKPEPFQSLCKSILGQQVSWLAARSITHKFVRLFFPELPEKADDLDPSDSSFPTPSQVSTCSMERLRSAGASQRKAEYLLDLSNRFVNGQLSSEKLLAMNPDEIMEELCAVRGIGRWTVEMFLIFTVKHPNILPVSDLGIQKGLLRWYTNTIPIISPKKKSKSKTNLIKPDEETQVLENQSEKVLWNQFDPAPLPQSCSLTISSMKTRLSKPIKSGLYLTPKEMEELTEPWKPFRSIAIWYLWSLTDASAAPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.41
3 0.38
4 0.38
5 0.37
6 0.35
7 0.33
8 0.36
9 0.38
10 0.41
11 0.43
12 0.48
13 0.48
14 0.49
15 0.5
16 0.43
17 0.4
18 0.4
19 0.39
20 0.37
21 0.4
22 0.43
23 0.48
24 0.57
25 0.57
26 0.61
27 0.7
28 0.77
29 0.82
30 0.86
31 0.86
32 0.87
33 0.91
34 0.9
35 0.92
36 0.91
37 0.88
38 0.84
39 0.82
40 0.76
41 0.71
42 0.63
43 0.59
44 0.5
45 0.46
46 0.41
47 0.35
48 0.33
49 0.32
50 0.37
51 0.37
52 0.39
53 0.37
54 0.44
55 0.43
56 0.46
57 0.45
58 0.39
59 0.34
60 0.3
61 0.28
62 0.21
63 0.23
64 0.19
65 0.17
66 0.19
67 0.21
68 0.21
69 0.21
70 0.22
71 0.24
72 0.28
73 0.35
74 0.42
75 0.41
76 0.46
77 0.46
78 0.44
79 0.46
80 0.44
81 0.39
82 0.33
83 0.37
84 0.36
85 0.38
86 0.37
87 0.32
88 0.29
89 0.26
90 0.28
91 0.28
92 0.27
93 0.34
94 0.4
95 0.41
96 0.41
97 0.41
98 0.37
99 0.32
100 0.36
101 0.28
102 0.26
103 0.26
104 0.29
105 0.29
106 0.27
107 0.27
108 0.25
109 0.3
110 0.27
111 0.23
112 0.21
113 0.22
114 0.21
115 0.21
116 0.17
117 0.11
118 0.1
119 0.11
120 0.12
121 0.13
122 0.17
123 0.18
124 0.22
125 0.24
126 0.26
127 0.29
128 0.29
129 0.3
130 0.26
131 0.3
132 0.29
133 0.28
134 0.27
135 0.24
136 0.21
137 0.19
138 0.19
139 0.14
140 0.13
141 0.14
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.11
146 0.11
147 0.12
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.09
152 0.09
153 0.11
154 0.13
155 0.15
156 0.15
157 0.17
158 0.17
159 0.18
160 0.17
161 0.16
162 0.14
163 0.12
164 0.12
165 0.15
166 0.2
167 0.22
168 0.22
169 0.22
170 0.22
171 0.23
172 0.22
173 0.17
174 0.13
175 0.13
176 0.14
177 0.14
178 0.14
179 0.14
180 0.14
181 0.13
182 0.12
183 0.1
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.06
209 0.07
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.11
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.12
223 0.12
224 0.14
225 0.14
226 0.16
227 0.17
228 0.17
229 0.17
230 0.12
231 0.15
232 0.17
233 0.17
234 0.15
235 0.14
236 0.14
237 0.14
238 0.15
239 0.14
240 0.11
241 0.12
242 0.13
243 0.18
244 0.19
245 0.22
246 0.21
247 0.21
248 0.21
249 0.26
250 0.34
251 0.34
252 0.39
253 0.44
254 0.53
255 0.59
256 0.64
257 0.69
258 0.7
259 0.76
260 0.8
261 0.82
262 0.84
263 0.81
264 0.8
265 0.73
266 0.68
267 0.61
268 0.51
269 0.41
270 0.32
271 0.32
272 0.27
273 0.24
274 0.19
275 0.16
276 0.16
277 0.15
278 0.14
279 0.14
280 0.19
281 0.2
282 0.2
283 0.23
284 0.23
285 0.25
286 0.26
287 0.24
288 0.24
289 0.23
290 0.26
291 0.25
292 0.27
293 0.25
294 0.25
295 0.24
296 0.21
297 0.24
298 0.24
299 0.26
300 0.28
301 0.31
302 0.33
303 0.35
304 0.42
305 0.47
306 0.48
307 0.49
308 0.54
309 0.54
310 0.51
311 0.53
312 0.51
313 0.53
314 0.49
315 0.47
316 0.41
317 0.39
318 0.38
319 0.34
320 0.28
321 0.21
322 0.23
323 0.25
324 0.27
325 0.28
326 0.29
327 0.34
328 0.32
329 0.3
330 0.32
331 0.31
332 0.29
333 0.33
334 0.36
335 0.33
336 0.33
337 0.33
338 0.28
339 0.26
340 0.21
341 0.17
342 0.14