Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R8BI45

Protein Details
Accession R8BI45    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-27QKPFSLRPWPHGDRKPKNLGEFHydrophilic
626-645GGKANKKKWAWNIKDASKSAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019313  Mediator_Med17  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG tmn:UCRPA7_5396  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10156  Med17  
Amino Acid Sequences MASAPQKPFSLRPWPHGDRKPKNLGEFIARVNAERGGFRTVTEESLRKEIEAQENGVDETNGADEMDLDSEDEAESTNIKLEDIVEARNEVIKNAEVAHQNAMLALDFVSLLLTKEIPNQARTTLSNALRDHVGLGTLGATKLATSNLSEARLQDNKMVSTGWKFTDIDRTVNSVLTSASRLQKEISLETKYWAEVLAVSDSGWAVSRVPNERHTLGVREEGTVDLDCGRTIGESQRLLVTIEKNGKVVGRSSLPKPLPSDAALQDRVLEARDTIFNQELWHEINREGRSLLSYNVRLEESSITYDMEEDTKVIFSLQALGDEMDHSQDKHSEDGQAASISVMLNLLLSYAHEQNNHRRSQPSAIARFQSSIPPPYALLRPIIAHLQHGRTLAKATKFISDLTTILQSAGISTAHYKLTEPPISPSMARNTPGSRSLPSEALIHTLLEPLKFQFQLVITPEAQLLIHGQTTFFPIVTTMYQIRLLPPSVPSNQDASPSYNTLASSFPPTDAREGYPDLRDVIYYVRQATARALTDHLEASVYEWTSAADGTAEETKDEDTDDGARDEPKTWIKTIKGTVLQNPAKTHELIVEVANEGDEDLVDEPAPETDDLQPLELRLYGVWQAGGKANKKKWAWNIKDASKSAEQKNLVDAAKAVVKGQVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.67
3 0.72
4 0.77
5 0.76
6 0.81
7 0.84
8 0.8
9 0.78
10 0.73
11 0.68
12 0.64
13 0.58
14 0.51
15 0.47
16 0.41
17 0.37
18 0.33
19 0.33
20 0.26
21 0.24
22 0.24
23 0.22
24 0.22
25 0.21
26 0.23
27 0.21
28 0.24
29 0.28
30 0.29
31 0.28
32 0.34
33 0.34
34 0.3
35 0.32
36 0.35
37 0.38
38 0.37
39 0.35
40 0.31
41 0.32
42 0.32
43 0.29
44 0.22
45 0.14
46 0.12
47 0.1
48 0.08
49 0.07
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.08
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.06
62 0.07
63 0.07
64 0.1
65 0.09
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.14
70 0.15
71 0.16
72 0.14
73 0.15
74 0.16
75 0.2
76 0.19
77 0.15
78 0.16
79 0.15
80 0.15
81 0.16
82 0.2
83 0.19
84 0.2
85 0.22
86 0.2
87 0.19
88 0.19
89 0.18
90 0.13
91 0.1
92 0.08
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.07
102 0.12
103 0.19
104 0.22
105 0.24
106 0.25
107 0.26
108 0.28
109 0.29
110 0.29
111 0.31
112 0.31
113 0.36
114 0.35
115 0.35
116 0.32
117 0.31
118 0.27
119 0.19
120 0.16
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.11
134 0.13
135 0.15
136 0.16
137 0.17
138 0.22
139 0.24
140 0.24
141 0.25
142 0.25
143 0.24
144 0.24
145 0.23
146 0.19
147 0.19
148 0.21
149 0.18
150 0.19
151 0.19
152 0.19
153 0.29
154 0.29
155 0.28
156 0.27
157 0.3
158 0.27
159 0.28
160 0.27
161 0.17
162 0.16
163 0.14
164 0.15
165 0.14
166 0.19
167 0.19
168 0.2
169 0.2
170 0.22
171 0.24
172 0.25
173 0.26
174 0.24
175 0.23
176 0.25
177 0.25
178 0.22
179 0.19
180 0.16
181 0.11
182 0.09
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.06
192 0.05
193 0.08
194 0.12
195 0.17
196 0.2
197 0.24
198 0.28
199 0.28
200 0.3
201 0.3
202 0.29
203 0.25
204 0.28
205 0.25
206 0.21
207 0.2
208 0.18
209 0.18
210 0.14
211 0.13
212 0.09
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.05
218 0.06
219 0.09
220 0.13
221 0.13
222 0.14
223 0.15
224 0.15
225 0.16
226 0.17
227 0.15
228 0.16
229 0.21
230 0.21
231 0.2
232 0.2
233 0.21
234 0.19
235 0.19
236 0.16
237 0.15
238 0.18
239 0.19
240 0.27
241 0.27
242 0.29
243 0.3
244 0.29
245 0.27
246 0.25
247 0.27
248 0.22
249 0.26
250 0.24
251 0.22
252 0.2
253 0.19
254 0.17
255 0.14
256 0.11
257 0.07
258 0.07
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.11
263 0.1
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.12
269 0.11
270 0.12
271 0.18
272 0.18
273 0.18
274 0.17
275 0.15
276 0.16
277 0.16
278 0.16
279 0.14
280 0.15
281 0.15
282 0.16
283 0.16
284 0.14
285 0.14
286 0.14
287 0.11
288 0.11
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.07
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.09
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.12
322 0.12
323 0.09
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.05
328 0.05
329 0.04
330 0.03
331 0.03
332 0.03
333 0.03
334 0.02
335 0.03
336 0.05
337 0.08
338 0.09
339 0.12
340 0.15
341 0.24
342 0.3
343 0.32
344 0.32
345 0.31
346 0.32
347 0.34
348 0.39
349 0.38
350 0.37
351 0.37
352 0.37
353 0.36
354 0.35
355 0.31
356 0.28
357 0.22
358 0.2
359 0.18
360 0.17
361 0.17
362 0.18
363 0.18
364 0.15
365 0.14
366 0.12
367 0.12
368 0.12
369 0.14
370 0.12
371 0.13
372 0.15
373 0.15
374 0.16
375 0.18
376 0.17
377 0.15
378 0.18
379 0.19
380 0.18
381 0.19
382 0.18
383 0.19
384 0.2
385 0.2
386 0.19
387 0.16
388 0.15
389 0.13
390 0.13
391 0.11
392 0.1
393 0.1
394 0.08
395 0.07
396 0.07
397 0.06
398 0.05
399 0.06
400 0.08
401 0.08
402 0.09
403 0.09
404 0.12
405 0.19
406 0.21
407 0.21
408 0.22
409 0.24
410 0.25
411 0.25
412 0.24
413 0.23
414 0.22
415 0.23
416 0.23
417 0.23
418 0.24
419 0.27
420 0.27
421 0.23
422 0.24
423 0.25
424 0.23
425 0.23
426 0.22
427 0.18
428 0.18
429 0.17
430 0.14
431 0.11
432 0.13
433 0.12
434 0.11
435 0.11
436 0.1
437 0.12
438 0.12
439 0.12
440 0.12
441 0.12
442 0.15
443 0.17
444 0.2
445 0.17
446 0.18
447 0.18
448 0.15
449 0.15
450 0.11
451 0.1
452 0.07
453 0.08
454 0.07
455 0.08
456 0.08
457 0.11
458 0.11
459 0.1
460 0.09
461 0.08
462 0.1
463 0.1
464 0.13
465 0.11
466 0.12
467 0.14
468 0.14
469 0.15
470 0.16
471 0.16
472 0.15
473 0.16
474 0.19
475 0.2
476 0.23
477 0.23
478 0.24
479 0.24
480 0.26
481 0.25
482 0.24
483 0.25
484 0.24
485 0.23
486 0.21
487 0.2
488 0.18
489 0.17
490 0.14
491 0.17
492 0.16
493 0.16
494 0.18
495 0.19
496 0.21
497 0.22
498 0.22
499 0.21
500 0.24
501 0.25
502 0.24
503 0.24
504 0.22
505 0.2
506 0.19
507 0.16
508 0.16
509 0.17
510 0.17
511 0.17
512 0.18
513 0.18
514 0.19
515 0.21
516 0.22
517 0.2
518 0.19
519 0.2
520 0.19
521 0.2
522 0.19
523 0.17
524 0.13
525 0.11
526 0.11
527 0.13
528 0.12
529 0.1
530 0.1
531 0.1
532 0.1
533 0.1
534 0.08
535 0.05
536 0.05
537 0.07
538 0.11
539 0.11
540 0.1
541 0.11
542 0.12
543 0.12
544 0.13
545 0.1
546 0.09
547 0.11
548 0.12
549 0.13
550 0.14
551 0.15
552 0.16
553 0.17
554 0.21
555 0.25
556 0.27
557 0.28
558 0.33
559 0.34
560 0.4
561 0.43
562 0.45
563 0.45
564 0.45
565 0.49
566 0.54
567 0.55
568 0.53
569 0.5
570 0.47
571 0.43
572 0.4
573 0.35
574 0.27
575 0.25
576 0.22
577 0.21
578 0.17
579 0.15
580 0.14
581 0.13
582 0.11
583 0.08
584 0.07
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.07
591 0.07
592 0.08
593 0.1
594 0.09
595 0.1
596 0.12
597 0.16
598 0.17
599 0.18
600 0.18
601 0.17
602 0.18
603 0.17
604 0.15
605 0.1
606 0.12
607 0.13
608 0.13
609 0.14
610 0.13
611 0.15
612 0.2
613 0.27
614 0.32
615 0.39
616 0.44
617 0.51
618 0.54
619 0.6
620 0.65
621 0.69
622 0.7
623 0.71
624 0.75
625 0.75
626 0.8
627 0.73
628 0.69
629 0.67
630 0.66
631 0.61
632 0.6
633 0.54
634 0.47
635 0.5
636 0.5
637 0.42
638 0.35
639 0.31
640 0.26
641 0.27
642 0.26
643 0.22