FuNGI

F4RTL5

Protein Details

Accession

F4RTL5

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
63-82	TTAPSKFKPRMVKRVEKVEP	Hydrophilic
374-398	AATTVPARKKLLKKKKPQVDDWAGW	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-26	RGGRGGRGRGRGRGRG
94-111	RGRGRGRGRGAERGGRGR
381-390	RKKLLKKKKP

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, mito 11, cyto_nucl 9, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
KEGG	mlr:MELLADRAFT_108593 -
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSELPGATFARGGRGGRGRGRGRGRGAISESVPPIPPPDSNDPPGNFTSNRPISVNPSDASVTTAPSKFKPRMVKRVEKVEPIDLDSHDQSSSRGRGRGRGRGAERGGRGRAEIVMTASGAFAMGPAEGGPRTGRIQGPTRSGMRKIDNSVTSTGPSSRAQSGSVTPWDGGPSDMFDLYSDIDENPEDEMDGDEGEGDRGKVADLNDISNEHPMAPLTLPWDPNRIAERERLMAERDAKLRKLAELKLKSEDEKPVIEGLGDDLKPNGSRSTNSPALFSGSVTPAVTRASTITATESVVKSETVEEQTLEAMKSDVKLKLEQIEEMATPDTNTTSSSSKSGPPLYIFQFPRHFPQFRKASDIALNPPTDPAADAATTVPARKKLLKKKKPQVDDWAGWGKGGRRDDCPGVPLGEEDKPVEGQIGELVIRRSGRVQMLIGEVAYDVLPAAQPTFHQEVAVIDPKPESSLRAMFVLGPTNKKFIVAPDVSSLLERDERERKVKSEKSSTDV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.38
3	0.42
4	0.52
5	0.52
6	0.57
7	0.65
8	0.65
9	0.63
10	0.65
11	0.61
12	0.58
13	0.58
14	0.53
15	0.47
16	0.44
17	0.41
18	0.35
19	0.33
20	0.27
21	0.25
22	0.23
23	0.22
24	0.24
25	0.31
26	0.35
27	0.39
28	0.46
29	0.45
30	0.47
31	0.48
32	0.46
33	0.38
34	0.36
35	0.41
36	0.37
37	0.38
38	0.35
39	0.35
40	0.37
41	0.41
42	0.42
43	0.31
44	0.3
45	0.29
46	0.27
47	0.3
48	0.23
49	0.2
50	0.21
51	0.23
52	0.23
53	0.26
54	0.34
55	0.33
56	0.4
57	0.49
58	0.53
59	0.61
60	0.68
61	0.75
62	0.74
63	0.81
64	0.79
65	0.75
66	0.69
67	0.65
68	0.57
69	0.49
70	0.45
71	0.35
72	0.35
73	0.29
74	0.26
75	0.2
76	0.19
77	0.17
78	0.21
79	0.26
80	0.26
81	0.29
82	0.3
83	0.38
84	0.45
85	0.53
86	0.53
87	0.56
88	0.56
89	0.6
90	0.63
91	0.61
92	0.59
93	0.55
94	0.51
95	0.43
96	0.39
97	0.32
98	0.28
99	0.22
100	0.18
101	0.14
102	0.11
103	0.11
104	0.1
105	0.09
106	0.07
107	0.06
108	0.05
109	0.04
110	0.04
111	0.03
112	0.03
113	0.03
114	0.05
115	0.05
116	0.06
117	0.07
118	0.09
119	0.11
120	0.14
121	0.16
122	0.19
123	0.26
124	0.3
125	0.34
126	0.37
127	0.4
128	0.4
129	0.41
130	0.43
131	0.41
132	0.41
133	0.4
134	0.42
135	0.4
136	0.39
137	0.38
138	0.33
139	0.29
140	0.26
141	0.22
142	0.19
143	0.18
144	0.18
145	0.18
146	0.18
147	0.18
148	0.18
149	0.2
150	0.2
151	0.21
152	0.19
153	0.16
154	0.15
155	0.15
156	0.14
157	0.12
158	0.09
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.08
163	0.08
164	0.08
165	0.08
166	0.08
167	0.07
168	0.06
169	0.07
170	0.07
171	0.07
172	0.07
173	0.06
174	0.06
175	0.05
176	0.06
177	0.05
178	0.05
179	0.05
180	0.04
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.06
189	0.07
190	0.11
191	0.11
192	0.12
193	0.13
194	0.14
195	0.14
196	0.13
197	0.13
198	0.09
199	0.08
200	0.07
201	0.08
202	0.07
203	0.07
204	0.09
205	0.11
206	0.12
207	0.13
208	0.16
209	0.16
210	0.18
211	0.2
212	0.2
213	0.19
214	0.21
215	0.22
216	0.21
217	0.22
218	0.2
219	0.2
220	0.21
221	0.22
222	0.22
223	0.25
224	0.25
225	0.24
226	0.25
227	0.24
228	0.23
229	0.25
230	0.26
231	0.3
232	0.32
233	0.33
234	0.36
235	0.36
236	0.35
237	0.33
238	0.32
239	0.24
240	0.21
241	0.2
242	0.16
243	0.14
244	0.12
245	0.1
246	0.08
247	0.1
248	0.09
249	0.08
250	0.08
251	0.09
252	0.09
253	0.1
254	0.11
255	0.08
256	0.1
257	0.13
258	0.2
259	0.25
260	0.25
261	0.25
262	0.23
263	0.25
264	0.24
265	0.21
266	0.15
267	0.11
268	0.11
269	0.1
270	0.1
271	0.08
272	0.08
273	0.08
274	0.06
275	0.06
276	0.07
277	0.07
278	0.08
279	0.08
280	0.09
281	0.09
282	0.11
283	0.11
284	0.1
285	0.1
286	0.1
287	0.09
288	0.09
289	0.11
290	0.1
291	0.11
292	0.1
293	0.1
294	0.11
295	0.11
296	0.1
297	0.08
298	0.07
299	0.06
300	0.07
301	0.1
302	0.12
303	0.13
304	0.14
305	0.15
306	0.2
307	0.2
308	0.19
309	0.17
310	0.17
311	0.15
312	0.15
313	0.14
314	0.09
315	0.08
316	0.08
317	0.08
318	0.07
319	0.08
320	0.09
321	0.1
322	0.11
323	0.13
324	0.14
325	0.17
326	0.2
327	0.22
328	0.21
329	0.22
330	0.25
331	0.26
332	0.32
333	0.31
334	0.32
335	0.35
336	0.35
337	0.39
338	0.42
339	0.42
340	0.37
341	0.45
342	0.48
343	0.45
344	0.51
345	0.45
346	0.41
347	0.43
348	0.44
349	0.39
350	0.36
351	0.34
352	0.27
353	0.26
354	0.23
355	0.18
356	0.15
357	0.11
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.11
363	0.11
364	0.13
365	0.15
366	0.16
367	0.19
368	0.27
369	0.36
370	0.44
371	0.56
372	0.64
373	0.73
374	0.8
375	0.87
376	0.87
377	0.84
378	0.83
379	0.81
380	0.73
381	0.68
382	0.64
383	0.54
384	0.46
385	0.42
386	0.35
387	0.32
388	0.36
389	0.32
390	0.28
391	0.33
392	0.38
393	0.37
394	0.35
395	0.31
396	0.26
397	0.24
398	0.21
399	0.2
400	0.18
401	0.18
402	0.16
403	0.16
404	0.15
405	0.15
406	0.15
407	0.11
408	0.09
409	0.09
410	0.09
411	0.08
412	0.1
413	0.11
414	0.12
415	0.13
416	0.14
417	0.15
418	0.18
419	0.2
420	0.2
421	0.2
422	0.2
423	0.22
424	0.22
425	0.2
426	0.16
427	0.13
428	0.11
429	0.1
430	0.08
431	0.05
432	0.04
433	0.05
434	0.05
435	0.06
436	0.06
437	0.06
438	0.13
439	0.17
440	0.17
441	0.17
442	0.17
443	0.18
444	0.24
445	0.29
446	0.23
447	0.2
448	0.2
449	0.21
450	0.23
451	0.22
452	0.18
453	0.18
454	0.21
455	0.22
456	0.23
457	0.23
458	0.21
459	0.23
460	0.29
461	0.27
462	0.3
463	0.31
464	0.33
465	0.32
466	0.32
467	0.31
468	0.27
469	0.33
470	0.28
471	0.28
472	0.29
473	0.3
474	0.3
475	0.3
476	0.26
477	0.2
478	0.22
479	0.21
480	0.24
481	0.31
482	0.36
483	0.43
484	0.47
485	0.49
486	0.56
487	0.62
488	0.64
489	0.67

F4RTL5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer