Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R8BU40

Protein Details
Accession R8BU40    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
160-182VDETHQKLSKSRKKRPVPSDWASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
172-172K
Subcellular Location(s) cyto 17, cyto_nucl 13.166, cyto_mito 10.332, nucl 6, mito_nucl 4.832
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018910  Lipoprotein_LpqB_C  
IPR013915  Pre-mRNA_splic_Prp19  
IPR038959  Prp19  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0070534  P:protein K63-linked ubiquitination  
KEGG tmn:UCRPA7_1607  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10647  Gmad1  
PF08606  Prp19  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
PS50082  WD_REPEATS_2  
CDD cd16656  RING-Ubox_PRP19  
Amino Acid Sequences MLCAISGEAPQEPVVSKKTGTVFEKRLIEKYIEENGKDPVTGDELDLEDLLPLKSSRIVYPRPPTLTSIPALLSTFQNEWDSLALETYKLKQQLAQTREELATALYQHDAAVRVIARLTKERDEARDALSKVTVTAGSAGNGEAMAVDNEALPEELAAKVDETHQKLSKSRKKRPVPSDWASADDVASFDVKSSESLPVPQATSIALETGYAAISGLKGDVAIFSVDAAKVERSLRIGEPVTDTAWTGQSVIFATSKGSVKVFQGGNQVASFSEHAGPATALALHPGEEILASVGTDKSFVFYDLNELKRVTRVYTESSLTACAFHPDGHLFAAGTTSGDIKLYMTKTGEEAASFSLGAPVQALVFSENGYWIAATAKGQTTVTIFDLRKEGDAATAKVLDIGSSVQSLAWDYTGQFLATAGPAGLTVQQYSKSSRKWSEPLRSATPAVAVRWGPNASELIAVNEDGVLSILGTQESS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.19
4 0.23
5 0.27
6 0.33
7 0.38
8 0.43
9 0.44
10 0.49
11 0.57
12 0.54
13 0.54
14 0.5
15 0.47
16 0.41
17 0.42
18 0.44
19 0.41
20 0.39
21 0.36
22 0.37
23 0.35
24 0.32
25 0.27
26 0.2
27 0.18
28 0.18
29 0.17
30 0.15
31 0.15
32 0.15
33 0.15
34 0.13
35 0.09
36 0.1
37 0.1
38 0.09
39 0.08
40 0.09
41 0.13
42 0.15
43 0.19
44 0.26
45 0.31
46 0.38
47 0.47
48 0.53
49 0.54
50 0.54
51 0.54
52 0.51
53 0.49
54 0.42
55 0.36
56 0.28
57 0.25
58 0.24
59 0.21
60 0.17
61 0.16
62 0.16
63 0.16
64 0.16
65 0.15
66 0.15
67 0.14
68 0.14
69 0.11
70 0.12
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.13
75 0.18
76 0.18
77 0.19
78 0.21
79 0.29
80 0.37
81 0.39
82 0.42
83 0.38
84 0.4
85 0.4
86 0.36
87 0.28
88 0.2
89 0.17
90 0.13
91 0.12
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.11
97 0.09
98 0.11
99 0.1
100 0.1
101 0.11
102 0.13
103 0.14
104 0.18
105 0.22
106 0.23
107 0.28
108 0.31
109 0.34
110 0.37
111 0.37
112 0.35
113 0.38
114 0.35
115 0.32
116 0.29
117 0.25
118 0.2
119 0.2
120 0.15
121 0.09
122 0.1
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.05
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.1
148 0.16
149 0.18
150 0.22
151 0.25
152 0.27
153 0.32
154 0.43
155 0.48
156 0.53
157 0.61
158 0.67
159 0.74
160 0.81
161 0.85
162 0.85
163 0.85
164 0.79
165 0.77
166 0.67
167 0.61
168 0.51
169 0.42
170 0.32
171 0.22
172 0.17
173 0.1
174 0.09
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.09
182 0.09
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.13
187 0.12
188 0.11
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.1
222 0.1
223 0.13
224 0.13
225 0.12
226 0.14
227 0.14
228 0.13
229 0.11
230 0.11
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.07
240 0.06
241 0.07
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.16
249 0.16
250 0.16
251 0.2
252 0.2
253 0.21
254 0.19
255 0.19
256 0.13
257 0.14
258 0.12
259 0.08
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.07
266 0.06
267 0.05
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.03
279 0.03
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.14
291 0.18
292 0.2
293 0.2
294 0.21
295 0.2
296 0.23
297 0.24
298 0.18
299 0.17
300 0.18
301 0.21
302 0.24
303 0.25
304 0.22
305 0.22
306 0.22
307 0.19
308 0.18
309 0.13
310 0.12
311 0.11
312 0.11
313 0.12
314 0.11
315 0.12
316 0.11
317 0.11
318 0.09
319 0.08
320 0.09
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.1
330 0.11
331 0.13
332 0.13
333 0.13
334 0.14
335 0.16
336 0.15
337 0.11
338 0.11
339 0.1
340 0.1
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.07
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.05
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.06
359 0.05
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.1
364 0.1
365 0.12
366 0.12
367 0.13
368 0.13
369 0.14
370 0.16
371 0.2
372 0.19
373 0.19
374 0.23
375 0.23
376 0.22
377 0.21
378 0.19
379 0.18
380 0.21
381 0.2
382 0.2
383 0.2
384 0.18
385 0.19
386 0.19
387 0.13
388 0.1
389 0.1
390 0.08
391 0.08
392 0.09
393 0.07
394 0.08
395 0.09
396 0.09
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.11
401 0.12
402 0.11
403 0.1
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.07
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.09
413 0.09
414 0.1
415 0.11
416 0.14
417 0.16
418 0.22
419 0.28
420 0.31
421 0.39
422 0.44
423 0.5
424 0.56
425 0.64
426 0.69
427 0.71
428 0.73
429 0.71
430 0.69
431 0.63
432 0.55
433 0.5
434 0.42
435 0.34
436 0.32
437 0.26
438 0.24
439 0.27
440 0.27
441 0.22
442 0.22
443 0.22
444 0.18
445 0.19
446 0.18
447 0.16
448 0.17
449 0.16
450 0.14
451 0.13
452 0.12
453 0.09
454 0.09
455 0.06
456 0.05
457 0.05
458 0.06