FuNGI

R8BCI1

Protein Details

Accession

R8BCI1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
105-124	GVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
412-429	RRKETEDRREANAKRRRL

Subcellular Location(s)

cyto 9.5, mito 8, cyto_nucl 7.5, nucl 4.5, E.R. 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
KEGG	tmn:UCRPA7_7491 -
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGIPAAFRWLSTKYPKIISPVIEDQPLTMDDGSVIPVDATRPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPPPKDEEEMMVEIFKYTDRVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQDAKEKEEDKQELLKLLKQQNGGAVTEETVETVAKKAFDSNSITPGTPFMDILAASLRYWCAYKLNTDPAWAKMKIIISDASVPGEGEHKIMNFVRSQRSSPEHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQEGKARMCKLCGQKGHDAQACRGAAKEKDGESDEKDKAHPLKPFIWLHVSVLREYLAIELDVPGLPFRFDLERAIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPALEIRENGIDTLMAIWKDNLPHMGGYVTKDGHVDLERAQYILAGLAKQEDAIFRRRKETEDRREANAKRRRLQDQANGRNGHNGSPSNKRPRNRNAPEYPPSNVPLIPLSSLAKPAPMAITHDMVVNRGALRDANVANKSAASVLKSQIQGLMSQAQPANSVAEPADGAAKGNSDAAVPDEQSPASALGKRKASLMEDDVSTPGTSTAETGTPSVGQEEEGPVDSVRLWEEGYADRYYEQKFHVDPKDIEFRHKVARAYVEGLAWVLMYYFQGCPSWEWYYPYHYAPFAADFVDLKDMRLSFEKGRISKPFEQLMSVLPAASRHSIPEIFHDLMTEPDSEIIDFYPEDFEVDLNGKKMAWQGVALLPFIDMPRLLNAVEKRYPLLSVEDQARNEMGADVLLISDAHPHLYDDITAHFYSKKQGAPKYKLDPRVSDGLAGKIEKIKEYLPHGALVYPLSRNAMPDIDYDRSLRKVTKATRAKGMMIVVIDRTGMIVVAVVTREATECWWE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.46
3	0.49
4	0.51
5	0.47
6	0.47
7	0.47
8	0.45
9	0.43
10	0.41
11	0.34
12	0.32
13	0.29
14	0.24
15	0.16
16	0.13
17	0.11
18	0.12
19	0.12
20	0.1
21	0.1
22	0.07
23	0.08
24	0.1
25	0.13
26	0.16
27	0.21
28	0.24
29	0.26
30	0.29
31	0.31
32	0.33
33	0.31
34	0.33
35	0.3
36	0.3
37	0.28
38	0.26
39	0.24
40	0.2
41	0.18
42	0.13
43	0.1
44	0.08
45	0.08
46	0.09
47	0.09
48	0.1
49	0.12
50	0.18
51	0.21
52	0.23
53	0.31
54	0.41
55	0.5
56	0.57
57	0.58
58	0.59
59	0.6
60	0.62
61	0.55
62	0.49
63	0.44
64	0.39
65	0.35
66	0.29
67	0.25
68	0.21
69	0.19
70	0.14
71	0.11
72	0.1
73	0.13
74	0.13
75	0.17
76	0.19
77	0.27
78	0.37
79	0.44
80	0.46
81	0.44
82	0.45
83	0.44
84	0.43
85	0.38
86	0.31
87	0.28
88	0.26
89	0.24
90	0.23
91	0.2
92	0.2
93	0.17
94	0.15
95	0.1
96	0.13
97	0.19
98	0.25
99	0.36
100	0.45
101	0.54
102	0.65
103	0.74
104	0.8
105	0.81
106	0.78
107	0.75
108	0.76
109	0.76
110	0.74
111	0.77
112	0.71
113	0.67
114	0.71
115	0.65
116	0.57
117	0.55
118	0.49
119	0.41
120	0.43
121	0.4
122	0.38
123	0.38
124	0.39
125	0.39
126	0.43
127	0.44
128	0.4
129	0.39
130	0.38
131	0.38
132	0.35
133	0.28
134	0.23
135	0.18
136	0.17
137	0.16
138	0.11
139	0.09
140	0.09
141	0.07
142	0.09
143	0.1
144	0.1
145	0.1
146	0.14
147	0.14
148	0.18
149	0.25
150	0.25
151	0.28
152	0.3
153	0.3
154	0.26
155	0.27
156	0.24
157	0.17
158	0.15
159	0.11
160	0.1
161	0.09
162	0.1
163	0.11
164	0.1
165	0.09
166	0.1
167	0.1
168	0.1
169	0.11
170	0.11
171	0.12
172	0.13
173	0.18
174	0.22
175	0.3
176	0.3
177	0.33
178	0.34
179	0.35
180	0.4
181	0.35
182	0.3
183	0.26
184	0.28
185	0.25
186	0.25
187	0.22
188	0.17
189	0.2
190	0.2
191	0.17
192	0.14
193	0.13
194	0.12
195	0.13
196	0.11
197	0.09
198	0.1
199	0.09
200	0.12
201	0.14
202	0.15
203	0.17
204	0.21
205	0.28
206	0.29
207	0.31
208	0.33
209	0.37
210	0.42
211	0.45
212	0.51
213	0.5
214	0.54
215	0.56
216	0.55
217	0.58
218	0.51
219	0.45
220	0.35
221	0.3
222	0.24
223	0.23
224	0.18
225	0.1
226	0.1
227	0.09
228	0.09
229	0.07
230	0.06
231	0.03
232	0.02
233	0.02
234	0.03
235	0.04
236	0.05
237	0.06
238	0.07
239	0.1
240	0.12
241	0.12
242	0.17
243	0.18
244	0.22
245	0.23
246	0.24
247	0.23
248	0.25
249	0.24
250	0.2
251	0.23
252	0.21
253	0.21
254	0.23
255	0.24
256	0.2
257	0.23
258	0.29
259	0.31
260	0.36
261	0.39
262	0.42
263	0.48
264	0.52
265	0.58
266	0.54
267	0.48
268	0.42
269	0.44
270	0.39
271	0.3
272	0.27
273	0.23
274	0.2
275	0.22
276	0.25
277	0.18
278	0.21
279	0.23
280	0.25
281	0.25
282	0.3
283	0.28
284	0.25
285	0.25
286	0.28
287	0.3
288	0.32
289	0.31
290	0.3
291	0.31
292	0.37
293	0.38
294	0.35
295	0.35
296	0.3
297	0.29
298	0.29
299	0.27
300	0.19
301	0.19
302	0.17
303	0.12
304	0.12
305	0.1
306	0.07
307	0.06
308	0.06
309	0.05
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.06
318	0.07
319	0.08
320	0.1
321	0.12
322	0.13
323	0.14
324	0.16
325	0.15
326	0.13
327	0.13
328	0.11
329	0.09
330	0.08
331	0.07
332	0.04
333	0.04
334	0.05
335	0.06
336	0.05
337	0.06
338	0.07
339	0.06
340	0.07
341	0.07
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.1
346	0.11
347	0.12
348	0.12
349	0.12
350	0.12
351	0.12
352	0.11
353	0.07
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.07
361	0.08
362	0.09
363	0.08
364	0.08
365	0.07
366	0.08
367	0.08
368	0.08
369	0.09
370	0.11
371	0.1
372	0.1
373	0.1
374	0.1
375	0.11
376	0.11
377	0.1
378	0.09
379	0.12
380	0.11
381	0.11
382	0.11
383	0.09
384	0.08
385	0.08
386	0.08
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.06
393	0.06
394	0.08
395	0.16
396	0.21
397	0.21
398	0.27
399	0.28
400	0.31
401	0.4
402	0.48
403	0.51
404	0.56
405	0.58
406	0.58
407	0.65
408	0.65
409	0.65
410	0.62
411	0.58
412	0.54
413	0.56
414	0.56
415	0.53
416	0.56
417	0.55
418	0.58
419	0.6
420	0.6
421	0.57
422	0.53
423	0.52
424	0.46
425	0.39
426	0.31
427	0.25
428	0.21
429	0.27
430	0.34
431	0.39
432	0.44
433	0.46
434	0.52
435	0.59
436	0.67
437	0.67
438	0.69
439	0.65
440	0.68
441	0.7
442	0.64
443	0.57
444	0.47
445	0.41
446	0.33
447	0.27
448	0.2
449	0.15
450	0.13
451	0.11
452	0.1
453	0.1
454	0.1
455	0.11
456	0.11
457	0.1
458	0.09
459	0.09
460	0.09
461	0.08
462	0.1
463	0.1
464	0.12
465	0.11
466	0.13
467	0.13
468	0.13
469	0.13
470	0.1
471	0.09
472	0.08
473	0.08
474	0.06
475	0.07
476	0.1
477	0.1
478	0.14
479	0.14
480	0.15
481	0.15
482	0.15
483	0.13
484	0.12
485	0.12
486	0.09
487	0.1
488	0.11
489	0.15
490	0.16
491	0.16
492	0.16
493	0.16
494	0.14
495	0.14
496	0.16
497	0.12
498	0.14
499	0.14
500	0.12
501	0.13
502	0.13
503	0.14
504	0.1
505	0.1
506	0.08
507	0.08
508	0.07
509	0.07
510	0.08
511	0.05
512	0.06
513	0.05
514	0.06
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.05
519	0.05
520	0.07
521	0.07
522	0.08
523	0.09
524	0.09
525	0.09
526	0.09
527	0.1
528	0.09
529	0.1
530	0.13
531	0.14
532	0.18
533	0.2
534	0.21
535	0.22
536	0.22
537	0.22
538	0.22
539	0.23
540	0.2
541	0.18
542	0.18
543	0.17
544	0.16
545	0.14
546	0.11
547	0.08
548	0.07
549	0.06
550	0.06
551	0.07
552	0.07
553	0.08
554	0.08
555	0.08
556	0.08
557	0.08
558	0.09
559	0.07
560	0.07
561	0.07
562	0.08
563	0.08
564	0.08
565	0.09
566	0.08
567	0.08
568	0.08
569	0.08
570	0.08
571	0.07
572	0.07
573	0.06
574	0.08
575	0.1
576	0.13
577	0.13
578	0.12
579	0.12
580	0.15
581	0.16
582	0.17
583	0.17
584	0.17
585	0.19
586	0.26
587	0.3
588	0.33
589	0.33
590	0.35
591	0.44
592	0.4
593	0.44
594	0.39
595	0.37
596	0.39
597	0.42
598	0.37
599	0.31
600	0.34
601	0.31
602	0.31
603	0.3
604	0.22
605	0.19
606	0.18
607	0.14
608	0.1
609	0.08
610	0.05
611	0.04
612	0.04
613	0.05
614	0.05
615	0.06
616	0.07
617	0.08
618	0.1
619	0.14
620	0.18
621	0.18
622	0.21
623	0.22
624	0.27
625	0.29
626	0.29
627	0.27
628	0.23
629	0.22
630	0.2
631	0.2
632	0.15
633	0.13
634	0.11
635	0.1
636	0.1
637	0.16
638	0.15
639	0.14
640	0.16
641	0.16
642	0.17
643	0.2
644	0.23
645	0.19
646	0.25
647	0.31
648	0.31
649	0.36
650	0.4
651	0.45
652	0.48
653	0.51
654	0.5
655	0.44
656	0.43
657	0.38
658	0.35
659	0.31
660	0.24
661	0.19
662	0.14
663	0.14
664	0.15
665	0.16
666	0.14
667	0.11
668	0.15
669	0.17
670	0.17
671	0.22
672	0.26
673	0.24
674	0.24
675	0.24
676	0.21
677	0.2
678	0.21
679	0.16
680	0.1
681	0.1
682	0.11
683	0.1
684	0.1
685	0.09
686	0.08
687	0.08
688	0.08
689	0.09
690	0.08
691	0.09
692	0.09
693	0.08
694	0.09
695	0.12
696	0.12
697	0.12
698	0.12
699	0.11
700	0.12
701	0.16
702	0.17
703	0.15
704	0.14
705	0.15
706	0.19
707	0.2
708	0.19
709	0.16
710	0.13
711	0.13
712	0.13
713	0.11
714	0.08
715	0.07
716	0.09
717	0.1
718	0.1
719	0.16
720	0.18
721	0.24
722	0.27
723	0.28
724	0.28
725	0.27
726	0.28
727	0.23
728	0.27
729	0.23
730	0.24
731	0.3
732	0.33
733	0.32
734	0.33
735	0.32
736	0.26
737	0.24
738	0.19
739	0.12
740	0.07
741	0.07
742	0.06
743	0.05
744	0.05
745	0.05
746	0.04
747	0.08
748	0.08
749	0.09
750	0.09
751	0.1
752	0.11
753	0.12
754	0.12
755	0.1
756	0.12
757	0.16
758	0.15
759	0.16
760	0.17
761	0.17
762	0.22
763	0.26
764	0.29
765	0.32
766	0.41
767	0.5
768	0.55
769	0.63
770	0.68
771	0.71
772	0.76
773	0.74
774	0.7
775	0.65
776	0.65
777	0.56
778	0.51
779	0.45
780	0.39
781	0.37
782	0.33
783	0.29
784	0.27
785	0.27
786	0.24
787	0.24
788	0.23
789	0.25
790	0.3
791	0.36
792	0.33
793	0.34
794	0.33
795	0.31
796	0.29
797	0.27
798	0.23
799	0.17
800	0.17
801	0.18
802	0.17
803	0.18
804	0.2
805	0.2
806	0.18
807	0.2
808	0.25
809	0.25
810	0.26
811	0.27
812	0.28
813	0.3
814	0.32
815	0.32
816	0.32
817	0.38
818	0.43
819	0.52
820	0.58
821	0.59
822	0.65
823	0.65
824	0.62
825	0.57
826	0.51
827	0.43
828	0.35
829	0.31
830	0.23
831	0.19
832	0.17
833	0.13
834	0.12
835	0.09
836	0.07
837	0.06
838	0.05
839	0.05
840	0.07
841	0.07
842	0.07
843	0.07
844	0.08
845	0.09
846	0.09

R8BCI1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer