FuNGI

R8BB41

Protein Details

Accession

R8BB41

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-20	MDRPRKRKSLDSSMKKNTAF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1101-1122	KERGAQRVRKLQQGKDFSGKRR

Subcellular Location(s)

mito 11, cyto 8.5, cyto_nucl 7.5, nucl 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR003890 MIF4G-like_typ-3 IPR039762 Nmd2/UPF2 IPR007193 Upf2/Nmd2_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
KEGG	tmn:UCRPA7_7934 -
Pfam	View protein in Pfam PF02854 MIF4G PF04050 Upf2

Amino Acid Sequences

MDRPRKRKSLDSSMKKNTAFIKRLRTAVTAATLNTFVQEIRTLSLHKYLSEIISACYEGLCKLKTPGEIEAGVEIVSALHQRFGPEEFTEHLGWLLGKGLATPDKGFLKTLAPEAREKEEKDRLVRQRVLLRVVSELWLVGVLRTLDDVVRPDDATKGAAGKVPELKPRPSTSGKGGGAEPFPLEVLKDLLGHDRDHANLPLLVTFVKAFSWDILGVKAAGSEGRKTVEEDGATKSADPADREEGEENTSDDPPFTSPELQERFRNILRRYFDDVKSHLERDQKAIFSQSRRNAEAYVKSGEVFEDRQANFEKQVKSQERLVANAQVIADALGAEMPDLKNSEDSLGSTGGSIGIVKAGEYLRGQGDGSGIWEDEEERRFYENLVDLKGKVPGILLEDVKKKKPDTDEQVGKKIEPSENTETSKPTDTSADDQSTAIANKTIGAQVDALLLRLPDLATKDAIDQTAIDFCFLNSKASRNRLIKALTDVPKGRSDLLPSWARLVATLGQYMPDVPKALVEYLDAEFRSLQRRKEKDFLGQVRLSNIRYLAELTKFGMVPEHVVFHCLKVSLDDFSRMNIEIICNLLENCGRYLLRNPETSPRMASFLETLQRKKSVQHIGQAERMLIENAVYYVDPPERPAIQQKERTPMELFIRKLVYVDLTKRNYSKILKQIRRLHWEEKEKVFSKPGKVKYGNIHLLAILLSALYRYHADFVVTVIDNVVESVVFGLELNDFKYNQRRIAEVKYLGELYNYRMLEHPVIFDTMYKIMTLGHGGPPAPGRVNPLDLPDDYFRIRLIATILETCGIFFNRGAAGKKLDYFLSFFQYYIFTKNPLPMDIEFIVQDIFALTRPQWKLASNFDEASKAFQLAVAQDRKTSGLDKAIDQDDAPSEASSDDENADDLPDPDGDEESGSEEEEEAEVRAPKLTNKSVNYTNDDLAGQDIEQQASSRDSESEDEAIVVTRQEEEVDPEDEAEFEREYAKMMAESLESRKFDRKPLFDVPLPVRPRTARETTSTTEPGEMEAGLAPTMAFSLLTKRGNRQQVSRLTHVAMKNQQQAEWEEQQRIKNLVLNYDLRENEDQDGHETKPSTYHHNRADKTGKERGAQRVRKLQQGKDFSGKRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.77
3	0.72
4	0.69
5	0.68
6	0.65
7	0.61
8	0.62
9	0.59
10	0.63
11	0.62
12	0.56
13	0.48
14	0.45
15	0.43
16	0.34
17	0.3
18	0.27
19	0.25
20	0.22
21	0.2
22	0.17
23	0.12
24	0.12
25	0.14
26	0.13
27	0.14
28	0.16
29	0.18
30	0.19
31	0.26
32	0.26
33	0.23
34	0.25
35	0.25
36	0.24
37	0.26
38	0.24
39	0.19
40	0.2
41	0.2
42	0.17
43	0.15
44	0.14
45	0.12
46	0.16
47	0.16
48	0.15
49	0.19
50	0.23
51	0.27
52	0.29
53	0.31
54	0.31
55	0.31
56	0.3
57	0.27
58	0.23
59	0.18
60	0.15
61	0.11
62	0.06
63	0.07
64	0.09
65	0.08
66	0.1
67	0.11
68	0.12
69	0.14
70	0.16
71	0.18
72	0.17
73	0.19
74	0.2
75	0.23
76	0.23
77	0.22
78	0.2
79	0.17
80	0.16
81	0.13
82	0.13
83	0.09
84	0.09
85	0.09
86	0.12
87	0.14
88	0.16
89	0.17
90	0.2
91	0.23
92	0.24
93	0.25
94	0.23
95	0.24
96	0.24
97	0.31
98	0.31
99	0.3
100	0.34
101	0.37
102	0.43
103	0.44
104	0.45
105	0.46
106	0.49
107	0.53
108	0.54
109	0.6
110	0.62
111	0.66
112	0.68
113	0.66
114	0.65
115	0.63
116	0.62
117	0.54
118	0.47
119	0.4
120	0.36
121	0.31
122	0.24
123	0.19
124	0.13
125	0.12
126	0.11
127	0.08
128	0.09
129	0.08
130	0.08
131	0.08
132	0.09
133	0.08
134	0.1
135	0.12
136	0.12
137	0.14
138	0.14
139	0.14
140	0.15
141	0.16
142	0.15
143	0.14
144	0.14
145	0.13
146	0.16
147	0.15
148	0.18
149	0.25
150	0.27
151	0.35
152	0.38
153	0.41
154	0.44
155	0.48
156	0.51
157	0.49
158	0.49
159	0.47
160	0.52
161	0.49
162	0.46
163	0.43
164	0.39
165	0.34
166	0.31
167	0.25
168	0.15
169	0.14
170	0.12
171	0.11
172	0.08
173	0.09
174	0.09
175	0.09
176	0.1
177	0.15
178	0.17
179	0.17
180	0.19
181	0.2
182	0.2
183	0.23
184	0.23
185	0.19
186	0.19
187	0.19
188	0.16
189	0.15
190	0.13
191	0.11
192	0.1
193	0.08
194	0.07
195	0.08
196	0.08
197	0.08
198	0.1
199	0.1
200	0.1
201	0.1
202	0.11
203	0.1
204	0.09
205	0.09
206	0.07
207	0.09
208	0.1
209	0.11
210	0.12
211	0.14
212	0.15
213	0.16
214	0.19
215	0.2
216	0.2
217	0.2
218	0.23
219	0.23
220	0.22
221	0.2
222	0.18
223	0.18
224	0.19
225	0.19
226	0.18
227	0.22
228	0.22
229	0.25
230	0.26
231	0.23
232	0.23
233	0.22
234	0.19
235	0.16
236	0.17
237	0.14
238	0.13
239	0.13
240	0.12
241	0.14
242	0.15
243	0.15
244	0.15
245	0.23
246	0.28
247	0.3
248	0.33
249	0.34
250	0.38
251	0.4
252	0.47
253	0.42
254	0.44
255	0.46
256	0.48
257	0.52
258	0.53
259	0.52
260	0.49
261	0.49
262	0.49
263	0.48
264	0.44
265	0.4
266	0.4
267	0.38
268	0.38
269	0.4
270	0.34
271	0.31
272	0.35
273	0.36
274	0.35
275	0.42
276	0.44
277	0.45
278	0.45
279	0.46
280	0.42
281	0.42
282	0.41
283	0.37
284	0.32
285	0.27
286	0.25
287	0.24
288	0.22
289	0.19
290	0.15
291	0.14
292	0.19
293	0.18
294	0.21
295	0.24
296	0.25
297	0.27
298	0.32
299	0.32
300	0.28
301	0.38
302	0.4
303	0.4
304	0.43
305	0.45
306	0.4
307	0.4
308	0.4
309	0.34
310	0.29
311	0.28
312	0.23
313	0.16
314	0.15
315	0.12
316	0.1
317	0.05
318	0.05
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.05
323	0.05
324	0.06
325	0.07
326	0.08
327	0.08
328	0.09
329	0.1
330	0.09
331	0.1
332	0.11
333	0.1
334	0.1
335	0.09
336	0.08
337	0.07
338	0.07
339	0.06
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.06
345	0.06
346	0.08
347	0.08
348	0.1
349	0.09
350	0.1
351	0.1
352	0.08
353	0.09
354	0.07
355	0.08
356	0.07
357	0.07
358	0.06
359	0.06
360	0.07
361	0.1
362	0.12
363	0.11
364	0.12
365	0.14
366	0.14
367	0.14
368	0.17
369	0.19
370	0.19
371	0.21
372	0.21
373	0.19
374	0.2
375	0.22
376	0.18
377	0.13
378	0.12
379	0.09
380	0.11
381	0.13
382	0.13
383	0.15
384	0.23
385	0.26
386	0.29
387	0.32
388	0.3
389	0.32
390	0.37
391	0.42
392	0.43
393	0.5
394	0.56
395	0.57
396	0.63
397	0.59
398	0.53
399	0.46
400	0.41
401	0.34
402	0.27
403	0.3
404	0.29
405	0.32
406	0.35
407	0.34
408	0.32
409	0.32
410	0.33
411	0.26
412	0.2
413	0.19
414	0.18
415	0.2
416	0.23
417	0.21
418	0.19
419	0.18
420	0.18
421	0.17
422	0.16
423	0.12
424	0.09
425	0.07
426	0.07
427	0.08
428	0.09
429	0.07
430	0.08
431	0.07
432	0.07
433	0.09
434	0.09
435	0.08
436	0.07
437	0.07
438	0.06
439	0.06
440	0.06
441	0.05
442	0.07
443	0.08
444	0.08
445	0.08
446	0.1
447	0.1
448	0.1
449	0.09
450	0.08
451	0.07
452	0.1
453	0.09
454	0.09
455	0.08
456	0.08
457	0.12
458	0.12
459	0.15
460	0.12
461	0.17
462	0.22
463	0.26
464	0.34
465	0.32
466	0.33
467	0.35
468	0.36
469	0.33
470	0.33
471	0.36
472	0.32
473	0.34
474	0.34
475	0.32
476	0.32
477	0.32
478	0.28
479	0.21
480	0.21
481	0.19
482	0.23
483	0.23
484	0.21
485	0.22
486	0.22
487	0.21
488	0.17
489	0.16
490	0.13
491	0.11
492	0.12
493	0.1
494	0.09
495	0.09
496	0.1
497	0.09
498	0.07
499	0.07
500	0.06
501	0.07
502	0.07
503	0.07
504	0.07
505	0.07
506	0.08
507	0.08
508	0.09
509	0.09
510	0.08
511	0.08
512	0.09
513	0.18
514	0.19
515	0.24
516	0.32
517	0.36
518	0.41
519	0.47
520	0.48
521	0.46
522	0.52
523	0.51
524	0.48
525	0.46
526	0.41
527	0.38
528	0.38
529	0.31
530	0.23
531	0.19
532	0.13
533	0.11
534	0.12
535	0.11
536	0.1
537	0.1
538	0.1
539	0.11
540	0.11
541	0.1
542	0.1
543	0.08
544	0.09
545	0.09
546	0.1
547	0.08
548	0.1
549	0.1
550	0.1
551	0.1
552	0.09
553	0.08
554	0.08
555	0.09
556	0.08
557	0.09
558	0.11
559	0.1
560	0.1
561	0.12
562	0.11
563	0.1
564	0.09
565	0.09
566	0.07
567	0.07
568	0.07
569	0.06
570	0.05
571	0.06
572	0.07
573	0.07
574	0.07
575	0.09
576	0.08
577	0.09
578	0.13
579	0.2
580	0.22
581	0.24
582	0.25
583	0.3
584	0.32
585	0.32
586	0.3
587	0.23
588	0.22
589	0.2
590	0.19
591	0.14
592	0.13
593	0.18
594	0.19
595	0.2
596	0.2
597	0.22
598	0.22
599	0.23
600	0.29
601	0.32
602	0.32
603	0.37
604	0.42
605	0.42
606	0.45
607	0.43
608	0.35
609	0.26
610	0.24
611	0.18
612	0.11
613	0.08
614	0.05
615	0.04
616	0.05
617	0.04
618	0.04
619	0.06
620	0.07
621	0.07
622	0.08
623	0.1
624	0.11
625	0.12
626	0.2
627	0.26
628	0.31
629	0.38
630	0.4
631	0.46
632	0.46
633	0.48
634	0.42
635	0.37
636	0.37
637	0.36
638	0.33
639	0.28
640	0.28
641	0.25
642	0.24
643	0.21
644	0.17
645	0.14
646	0.18
647	0.23
648	0.25
649	0.27
650	0.28
651	0.29
652	0.32
653	0.32
654	0.34
655	0.36
656	0.44
657	0.48
658	0.57
659	0.65
660	0.67
661	0.72
662	0.7
663	0.67
664	0.64
665	0.67
666	0.63
667	0.58
668	0.58
669	0.52
670	0.48
671	0.48
672	0.44
673	0.43
674	0.46
675	0.47
676	0.48
677	0.49
678	0.51
679	0.51
680	0.56
681	0.53
682	0.46
683	0.4
684	0.31
685	0.29
686	0.25
687	0.18
688	0.09
689	0.04
690	0.03
691	0.03
692	0.03
693	0.04
694	0.05
695	0.05
696	0.06
697	0.07
698	0.07
699	0.07
700	0.08
701	0.11
702	0.1
703	0.1
704	0.08
705	0.08
706	0.07
707	0.07
708	0.07
709	0.03
710	0.03
711	0.03
712	0.03
713	0.03
714	0.03
715	0.03
716	0.04
717	0.05
718	0.07
719	0.08
720	0.09
721	0.11
722	0.19
723	0.22
724	0.25
725	0.26
726	0.28
727	0.3
728	0.35
729	0.39
730	0.34
731	0.32
732	0.29
733	0.29
734	0.26
735	0.24
736	0.19
737	0.15
738	0.19
739	0.18
740	0.17
741	0.17
742	0.19
743	0.2
744	0.2
745	0.18
746	0.13
747	0.14
748	0.13
749	0.12
750	0.12
751	0.11
752	0.11
753	0.09
754	0.08
755	0.08
756	0.08
757	0.09
758	0.09
759	0.09
760	0.1
761	0.11
762	0.12
763	0.13
764	0.14
765	0.14
766	0.13
767	0.16
768	0.16
769	0.19
770	0.19
771	0.2
772	0.21
773	0.2
774	0.24
775	0.21
776	0.22
777	0.19
778	0.19
779	0.16
780	0.14
781	0.14
782	0.1
783	0.1
784	0.09
785	0.1
786	0.1
787	0.1
788	0.1
789	0.1
790	0.09
791	0.1
792	0.09
793	0.08
794	0.08
795	0.09
796	0.1
797	0.14
798	0.16
799	0.16
800	0.19
801	0.2
802	0.21
803	0.21
804	0.2
805	0.18
806	0.18
807	0.18
808	0.2
809	0.19
810	0.18
811	0.17
812	0.19
813	0.19
814	0.2
815	0.2
816	0.16
817	0.17
818	0.22
819	0.22
820	0.21
821	0.23
822	0.2
823	0.24
824	0.23
825	0.22
826	0.17
827	0.16
828	0.15
829	0.11
830	0.11
831	0.06
832	0.05
833	0.05
834	0.06
835	0.07
836	0.14
837	0.16
838	0.19
839	0.2
840	0.23
841	0.26
842	0.32
843	0.36
844	0.32
845	0.32
846	0.3
847	0.31
848	0.28
849	0.29
850	0.22
851	0.18
852	0.14
853	0.14
854	0.14
855	0.14
856	0.21
857	0.21
858	0.21
859	0.21
860	0.22
861	0.23
862	0.23
863	0.23
864	0.18
865	0.2
866	0.21
867	0.22
868	0.26
869	0.26
870	0.25
871	0.23
872	0.22
873	0.17
874	0.17
875	0.16
876	0.11
877	0.1
878	0.1
879	0.1
880	0.09
881	0.09
882	0.08
883	0.08
884	0.08
885	0.08
886	0.09
887	0.08
888	0.09
889	0.09
890	0.08
891	0.08
892	0.09
893	0.09
894	0.09
895	0.08
896	0.08
897	0.09
898	0.09
899	0.09
900	0.09
901	0.08
902	0.08
903	0.08
904	0.08
905	0.06
906	0.08
907	0.1
908	0.1
909	0.12
910	0.13
911	0.17
912	0.23
913	0.3
914	0.35
915	0.37
916	0.43
917	0.48
918	0.52
919	0.54
920	0.5
921	0.44
922	0.38
923	0.35
924	0.29
925	0.23
926	0.18
927	0.12
928	0.12
929	0.13
930	0.12
931	0.12
932	0.12
933	0.13
934	0.14
935	0.15
936	0.12
937	0.11
938	0.13
939	0.15
940	0.17
941	0.17
942	0.15
943	0.15
944	0.14
945	0.14
946	0.12
947	0.1
948	0.08
949	0.08
950	0.08
951	0.09
952	0.09
953	0.13
954	0.15
955	0.16
956	0.16
957	0.16
958	0.16
959	0.15
960	0.16
961	0.13
962	0.1
963	0.09
964	0.1
965	0.1
966	0.11
967	0.12
968	0.12
969	0.1
970	0.1
971	0.11
972	0.12
973	0.15
974	0.18
975	0.23
976	0.24
977	0.27
978	0.34
979	0.35
980	0.42
981	0.49
982	0.48
983	0.49
984	0.56
985	0.6
986	0.55
987	0.61
988	0.57
989	0.57
990	0.56
991	0.5
992	0.47
993	0.42
994	0.44
995	0.44
996	0.45
997	0.4
998	0.42
999	0.47
1000	0.47
1001	0.52
1002	0.49
1003	0.43
1004	0.38
1005	0.35
1006	0.3
1007	0.24
1008	0.2
1009	0.13
1010	0.12
1011	0.11
1012	0.09
1013	0.09
1014	0.07
1015	0.06
1016	0.06
1017	0.06
1018	0.05
1019	0.05
1020	0.1
1021	0.16
1022	0.23
1023	0.25
1024	0.32
1025	0.41
1026	0.5
1027	0.54
1028	0.56
1029	0.59
1030	0.63
1031	0.68
1032	0.66
1033	0.61
1034	0.54
1035	0.57
1036	0.52
1037	0.52
1038	0.49
1039	0.5
1040	0.53
1041	0.51
1042	0.49
1043	0.46
1044	0.48
1045	0.47
1046	0.48
1047	0.44
1048	0.43
1049	0.46
1050	0.48
1051	0.5
1052	0.48
1053	0.42
1054	0.39
1055	0.37
1056	0.34
1057	0.35
1058	0.35
1059	0.34
1060	0.38
1061	0.37
1062	0.36
1063	0.37
1064	0.35
1065	0.32
1066	0.31
1067	0.29
1068	0.27
1069	0.3
1070	0.26
1071	0.28
1072	0.27
1073	0.24
1074	0.28
1075	0.3
1076	0.35
1077	0.4
1078	0.48
1079	0.54
1080	0.62
1081	0.64
1082	0.67
1083	0.73
1084	0.7
1085	0.69
1086	0.69
1087	0.65
1088	0.61
1089	0.66
1090	0.68
1091	0.7
1092	0.71
1093	0.72
1094	0.74
1095	0.73
1096	0.77
1097	0.77
1098	0.74
1099	0.73
1100	0.74
1101	0.71
1102	0.71

R8BB41

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer