Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R8BLP1

Protein Details
Accession R8BLP1    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-124VSAAPVKKKRGRKSKAEKAREQTPSHydrophilic
300-320KDKMHPFVKRKEPPRGPLRPDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-119VKKKRGRKSKAEKAR
308-318KRKEPPRGPLR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10, cyto 5.5, mito 4, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
KEGG tmn:UCRPA7_4318  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MATSPPYHSYSPSAGSPPYPSHSQLPTLNTLNVNKKRTAAGDAASPALKRRKGSVLSVASSTLSAHPLRQTSFPPDESPFGARSPSVDMDSVSMISGSAVSAAPVKKKRGRKSKAEKAREQTPSVVGGRAMTAVSGVSGGGEKGAAADAAADDDDDVNVTMGVANAVRTAEEKVEEKERLRVLTSQMDQDQLERYEMFRASRVSDAVIKRVGRFHPLCLKPAKLTPSLQVVNAAVSQSVPANVTAAVKSVAKVFIGDLIESARRIQCEWITNTDEKQSEVPFPDWPYDEDEHYIDPEPGKDKMHPFVKRKEPPRGPLRPDHVREAWRRYKQSVEGGAVGTLGLWHVQQHSGVDRFGARTGGKRLFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.31
4 0.3
5 0.32
6 0.32
7 0.32
8 0.34
9 0.36
10 0.4
11 0.4
12 0.4
13 0.41
14 0.41
15 0.41
16 0.39
17 0.43
18 0.48
19 0.51
20 0.5
21 0.46
22 0.45
23 0.45
24 0.44
25 0.42
26 0.35
27 0.29
28 0.3
29 0.29
30 0.29
31 0.28
32 0.25
33 0.27
34 0.31
35 0.33
36 0.29
37 0.33
38 0.39
39 0.41
40 0.46
41 0.5
42 0.48
43 0.47
44 0.46
45 0.42
46 0.34
47 0.3
48 0.26
49 0.17
50 0.15
51 0.13
52 0.14
53 0.17
54 0.19
55 0.21
56 0.23
57 0.25
58 0.29
59 0.33
60 0.33
61 0.33
62 0.33
63 0.34
64 0.33
65 0.33
66 0.27
67 0.22
68 0.21
69 0.18
70 0.16
71 0.19
72 0.18
73 0.17
74 0.16
75 0.15
76 0.16
77 0.16
78 0.15
79 0.1
80 0.08
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.04
85 0.05
86 0.04
87 0.04
88 0.08
89 0.1
90 0.17
91 0.22
92 0.29
93 0.36
94 0.45
95 0.55
96 0.63
97 0.69
98 0.73
99 0.8
100 0.83
101 0.87
102 0.87
103 0.85
104 0.8
105 0.82
106 0.75
107 0.67
108 0.58
109 0.48
110 0.43
111 0.35
112 0.3
113 0.2
114 0.16
115 0.14
116 0.12
117 0.1
118 0.06
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.04
150 0.03
151 0.03
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.09
160 0.1
161 0.14
162 0.16
163 0.16
164 0.2
165 0.21
166 0.2
167 0.2
168 0.2
169 0.19
170 0.23
171 0.23
172 0.2
173 0.2
174 0.2
175 0.19
176 0.18
177 0.18
178 0.12
179 0.12
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.13
188 0.14
189 0.13
190 0.12
191 0.17
192 0.17
193 0.18
194 0.21
195 0.2
196 0.2
197 0.24
198 0.23
199 0.25
200 0.26
201 0.27
202 0.34
203 0.34
204 0.38
205 0.36
206 0.37
207 0.31
208 0.34
209 0.34
210 0.28
211 0.27
212 0.26
213 0.3
214 0.29
215 0.27
216 0.25
217 0.21
218 0.18
219 0.17
220 0.15
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.1
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.09
245 0.11
246 0.12
247 0.12
248 0.14
249 0.11
250 0.11
251 0.12
252 0.15
253 0.17
254 0.22
255 0.25
256 0.28
257 0.32
258 0.33
259 0.33
260 0.35
261 0.32
262 0.27
263 0.27
264 0.24
265 0.22
266 0.24
267 0.24
268 0.22
269 0.24
270 0.25
271 0.24
272 0.24
273 0.26
274 0.24
275 0.25
276 0.24
277 0.23
278 0.21
279 0.21
280 0.21
281 0.17
282 0.16
283 0.17
284 0.17
285 0.18
286 0.2
287 0.22
288 0.25
289 0.32
290 0.4
291 0.47
292 0.51
293 0.58
294 0.67
295 0.72
296 0.76
297 0.79
298 0.78
299 0.79
300 0.82
301 0.83
302 0.78
303 0.78
304 0.79
305 0.78
306 0.74
307 0.72
308 0.68
309 0.66
310 0.67
311 0.68
312 0.69
313 0.68
314 0.69
315 0.65
316 0.66
317 0.63
318 0.65
319 0.61
320 0.55
321 0.48
322 0.44
323 0.4
324 0.33
325 0.26
326 0.17
327 0.11
328 0.07
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.08
333 0.1
334 0.11
335 0.14
336 0.2
337 0.21
338 0.21
339 0.22
340 0.23
341 0.23
342 0.24
343 0.25
344 0.21
345 0.25
346 0.32