Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

R8BQ30

Protein Details
Accession R8BQ30    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
379-400AREEARKEKRRDEERKLRQSRMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
221-240LEPPKFKHKKVPRGPPSPPP
380-399REEARKEKRRDEERKLRQSR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG tmn:UCRPA7_3043  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MASIASALAQSLPKPKYTGEDEDVPTRAQPRGPRIVGAGQLDESQIVLRRAGPPPYGQRSGWRPRSQEDFGDGGAFPEIAVAQYPLDMGKKGSSTSNALAIQVDGEGKVKYDAIARQGHAANRIVQAKFSDLIPLRQRAEAGEINLERPSQEEVEATTEKTKNALAALVSGAVAAQKPKNLNIGQRNDPTFVRYTPANQMGNNTKGRDRVMKIVERQKDPLEPPKFKHKKVPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAQDQEDWKIPPPVSNWKNPKGFTIALDKRLAADGRGMQDVTINDKFAQFSEALFMADRHAREEVKQRALMQQRLAEKEKAQKEETLRSLAQKAREERAGGGRRDSRSRSGSYSGSDSASDSEDSEIRAREEARKEKRRDEERKLRQSRMGAERRIQVMAREQNRDISEKIALGLAKPTQTQESMYDSRLFNQTSGFDSGINEDNPYDKPLFAAQDAISSIYRPRANVDDDDEEAGDREMDKIQKSSRFGEVLGKGKFKGAEDAEAREGPVQFEKDAGDPFNVEKFLTEVEQSSSKRSYGLQDEESRQSKRPRVDDDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.3
4 0.36
5 0.42
6 0.39
7 0.45
8 0.46
9 0.49
10 0.49
11 0.43
12 0.39
13 0.34
14 0.31
15 0.28
16 0.31
17 0.35
18 0.43
19 0.44
20 0.44
21 0.45
22 0.47
23 0.47
24 0.42
25 0.36
26 0.27
27 0.26
28 0.24
29 0.2
30 0.16
31 0.13
32 0.15
33 0.14
34 0.14
35 0.15
36 0.2
37 0.25
38 0.29
39 0.29
40 0.32
41 0.4
42 0.47
43 0.49
44 0.45
45 0.49
46 0.54
47 0.63
48 0.66
49 0.64
50 0.6
51 0.6
52 0.68
53 0.63
54 0.58
55 0.52
56 0.44
57 0.37
58 0.35
59 0.3
60 0.22
61 0.19
62 0.15
63 0.1
64 0.08
65 0.07
66 0.05
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.12
77 0.13
78 0.14
79 0.17
80 0.19
81 0.22
82 0.23
83 0.28
84 0.25
85 0.25
86 0.24
87 0.21
88 0.18
89 0.14
90 0.13
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.13
99 0.15
100 0.19
101 0.24
102 0.24
103 0.28
104 0.31
105 0.33
106 0.32
107 0.32
108 0.29
109 0.3
110 0.35
111 0.29
112 0.28
113 0.27
114 0.25
115 0.24
116 0.21
117 0.23
118 0.19
119 0.26
120 0.3
121 0.34
122 0.33
123 0.33
124 0.33
125 0.26
126 0.31
127 0.26
128 0.22
129 0.24
130 0.22
131 0.23
132 0.23
133 0.22
134 0.17
135 0.16
136 0.17
137 0.11
138 0.12
139 0.11
140 0.11
141 0.17
142 0.17
143 0.17
144 0.2
145 0.21
146 0.2
147 0.21
148 0.2
149 0.15
150 0.15
151 0.15
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.07
158 0.06
159 0.05
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.11
164 0.12
165 0.14
166 0.2
167 0.23
168 0.3
169 0.37
170 0.42
171 0.46
172 0.5
173 0.5
174 0.46
175 0.44
176 0.39
177 0.32
178 0.26
179 0.22
180 0.18
181 0.19
182 0.23
183 0.29
184 0.28
185 0.25
186 0.3
187 0.32
188 0.37
189 0.37
190 0.33
191 0.28
192 0.29
193 0.31
194 0.33
195 0.3
196 0.32
197 0.35
198 0.39
199 0.44
200 0.5
201 0.53
202 0.5
203 0.5
204 0.44
205 0.43
206 0.41
207 0.44
208 0.44
209 0.41
210 0.42
211 0.51
212 0.55
213 0.53
214 0.6
215 0.6
216 0.63
217 0.68
218 0.77
219 0.75
220 0.77
221 0.79
222 0.78
223 0.75
224 0.71
225 0.65
226 0.55
227 0.52
228 0.48
229 0.49
230 0.49
231 0.49
232 0.47
233 0.48
234 0.49
235 0.44
236 0.41
237 0.43
238 0.43
239 0.39
240 0.38
241 0.37
242 0.36
243 0.37
244 0.36
245 0.31
246 0.25
247 0.21
248 0.19
249 0.19
250 0.27
251 0.28
252 0.36
253 0.41
254 0.45
255 0.49
256 0.48
257 0.47
258 0.41
259 0.38
260 0.31
261 0.35
262 0.3
263 0.3
264 0.3
265 0.28
266 0.24
267 0.25
268 0.23
269 0.13
270 0.12
271 0.1
272 0.11
273 0.12
274 0.11
275 0.1
276 0.12
277 0.12
278 0.15
279 0.13
280 0.12
281 0.12
282 0.13
283 0.13
284 0.11
285 0.13
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.11
299 0.13
300 0.22
301 0.26
302 0.28
303 0.3
304 0.29
305 0.35
306 0.4
307 0.41
308 0.34
309 0.33
310 0.33
311 0.36
312 0.38
313 0.33
314 0.3
315 0.36
316 0.39
317 0.38
318 0.36
319 0.35
320 0.36
321 0.41
322 0.4
323 0.36
324 0.31
325 0.29
326 0.33
327 0.32
328 0.33
329 0.33
330 0.34
331 0.32
332 0.34
333 0.32
334 0.29
335 0.36
336 0.38
337 0.33
338 0.35
339 0.37
340 0.38
341 0.42
342 0.43
343 0.39
344 0.37
345 0.39
346 0.37
347 0.35
348 0.34
349 0.31
350 0.31
351 0.27
352 0.23
353 0.21
354 0.17
355 0.15
356 0.14
357 0.13
358 0.1
359 0.1
360 0.09
361 0.11
362 0.12
363 0.12
364 0.11
365 0.13
366 0.14
367 0.19
368 0.27
369 0.35
370 0.44
371 0.53
372 0.57
373 0.63
374 0.72
375 0.76
376 0.77
377 0.78
378 0.79
379 0.8
380 0.87
381 0.85
382 0.79
383 0.74
384 0.69
385 0.66
386 0.65
387 0.62
388 0.56
389 0.53
390 0.54
391 0.51
392 0.49
393 0.41
394 0.32
395 0.33
396 0.37
397 0.37
398 0.37
399 0.35
400 0.39
401 0.4
402 0.41
403 0.33
404 0.27
405 0.24
406 0.19
407 0.19
408 0.16
409 0.14
410 0.12
411 0.14
412 0.13
413 0.13
414 0.14
415 0.15
416 0.15
417 0.16
418 0.17
419 0.16
420 0.22
421 0.23
422 0.25
423 0.28
424 0.26
425 0.28
426 0.31
427 0.29
428 0.22
429 0.22
430 0.21
431 0.2
432 0.22
433 0.2
434 0.16
435 0.16
436 0.18
437 0.2
438 0.19
439 0.16
440 0.13
441 0.15
442 0.16
443 0.19
444 0.17
445 0.13
446 0.14
447 0.16
448 0.18
449 0.17
450 0.19
451 0.15
452 0.17
453 0.17
454 0.18
455 0.15
456 0.14
457 0.15
458 0.18
459 0.2
460 0.18
461 0.21
462 0.23
463 0.27
464 0.29
465 0.33
466 0.3
467 0.3
468 0.31
469 0.28
470 0.24
471 0.21
472 0.18
473 0.13
474 0.09
475 0.09
476 0.11
477 0.15
478 0.16
479 0.2
480 0.26
481 0.32
482 0.35
483 0.38
484 0.39
485 0.37
486 0.36
487 0.4
488 0.41
489 0.42
490 0.43
491 0.42
492 0.37
493 0.38
494 0.39
495 0.32
496 0.34
497 0.28
498 0.31
499 0.32
500 0.36
501 0.37
502 0.35
503 0.34
504 0.3
505 0.28
506 0.23
507 0.25
508 0.23
509 0.19
510 0.2
511 0.21
512 0.2
513 0.22
514 0.22
515 0.18
516 0.17
517 0.19
518 0.22
519 0.21
520 0.18
521 0.16
522 0.16
523 0.17
524 0.17
525 0.16
526 0.14
527 0.17
528 0.24
529 0.25
530 0.29
531 0.29
532 0.28
533 0.28
534 0.29
535 0.32
536 0.33
537 0.39
538 0.41
539 0.46
540 0.51
541 0.58
542 0.62
543 0.58
544 0.57
545 0.59
546 0.59
547 0.61
548 0.63
549 0.64