Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R8BFN1

Protein Details
Accession R8BFN1    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-120RGRGRGRGRGGRRLRGPRKAABasic
558-583LRILAPKKPREKKPGPKRAPREKEPHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-119ARGRGRGRGRGRGGRRLRGPRKA
551-599RGRKAKVLRILAPKKPREKKPGPKRAPREKEPHPTRYRPRRLGGGDKRR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10, cyto 8.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039340  Tfc4/TFIIIC-102/Sfc4  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
KEGG tmn:UCRPA7_6378  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MDARIQGMLRGNDFQDFADDEVLPDFPEESYGGNEDGDDANDDDGEEDGSEISDADSVVFQLQTDMAKLDADVAAFRAAQIEDGEDVDFPEGHQGAARGRGRGRGRGRGGRRLRGPRKAAEPTGEIKYRLGQASLAFMEERYEDAMAVVLEVIRVNAETHQAWVMLSSIFQEMGKTDEAMMSMVFAAHLRPKDYHGWMACAQFALDDIQGSREKNLYTAGLCFSAAIRANPKSIKARIGKANVSLEQGHATFAAAEYERVLKKRPYDIEVLRHFAEASFDAKDSHKYVQSSRDAYQRLITHARGGGEIKNGEFEWSDVFLYGEMFAFLEQYEAAIIAVRSLSRWLLGRNEESFWEQFEEDDREWDRDDGRRLDVLEYEAGRYPLELYGFSLPLDLRAKLGTYRLKLGHEDEGLRHLSWLNPFDPATEDLLQDTPFVVKEIATQLIENERIGMALQYFDLYRKIVIEPDPEVLVQQGQCYLQMQDESSAEECFLAAIEADDNNIDARFELAKMYEKAREDEEAFILVSEAMQLERRQAEDDEDGEEDTSAERGRKAKVLRILAPKKPREKKPGPKRAPREKEPHPTRYRPRRLGGGDKRRDYENQVTEKFKEKYNLVQQLRSQVASGDKDVVAMWMAAAKDLVDDFRSFKEFYPWEKYLQFLGHGSFFKENRKEAQRGIQVGDQGNRGLAAMAERLQHNLVPSETMEGAQQLAFQRHEHRGIPFDAWLELFLEYAISLAQAQQPQEAYLVCQSARDSIVYKSNDSMFLIHVAWAACAVQAGDEETCVAVARFFMRNNYAATDSYRMFAALCRVCQSPISWYASGPAQKYMLRQIKAMDKTLLPPEQAAKVVKGDAAAPEGKDDPRRHETLDVCLLMLYGHILLTSTSYTYALSYFLRALSIDPENPMVNLSIGIAYVHYAFKRQAENRQFLLLQGFNHLFRYYEDRIKSPLSAERQEAHYNLGRAYHLIGTYHLAAEYYARVLREASEHRRGDGSWKQEDFIVEAAMNLRTFAIINGDFTTAKQLAEEWLVLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.2
3 0.19
4 0.18
5 0.17
6 0.16
7 0.15
8 0.15
9 0.15
10 0.12
11 0.11
12 0.11
13 0.08
14 0.1
15 0.09
16 0.09
17 0.12
18 0.13
19 0.14
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.14
24 0.13
25 0.13
26 0.12
27 0.11
28 0.11
29 0.12
30 0.1
31 0.09
32 0.09
33 0.07
34 0.06
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.1
70 0.11
71 0.12
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.08
77 0.13
78 0.12
79 0.12
80 0.13
81 0.14
82 0.15
83 0.24
84 0.27
85 0.26
86 0.27
87 0.36
88 0.39
89 0.47
90 0.52
91 0.53
92 0.59
93 0.64
94 0.7
95 0.72
96 0.76
97 0.76
98 0.79
99 0.8
100 0.81
101 0.81
102 0.8
103 0.76
104 0.76
105 0.74
106 0.69
107 0.62
108 0.57
109 0.51
110 0.53
111 0.49
112 0.41
113 0.35
114 0.35
115 0.34
116 0.31
117 0.27
118 0.22
119 0.19
120 0.23
121 0.22
122 0.2
123 0.15
124 0.14
125 0.14
126 0.13
127 0.13
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.07
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.11
161 0.12
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.08
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.06
174 0.11
175 0.13
176 0.15
177 0.16
178 0.2
179 0.26
180 0.29
181 0.35
182 0.32
183 0.35
184 0.36
185 0.36
186 0.33
187 0.27
188 0.23
189 0.16
190 0.15
191 0.12
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.11
196 0.14
197 0.14
198 0.15
199 0.16
200 0.16
201 0.16
202 0.18
203 0.16
204 0.15
205 0.16
206 0.16
207 0.14
208 0.14
209 0.13
210 0.11
211 0.14
212 0.14
213 0.15
214 0.18
215 0.19
216 0.23
217 0.24
218 0.29
219 0.31
220 0.32
221 0.39
222 0.39
223 0.45
224 0.49
225 0.53
226 0.52
227 0.5
228 0.52
229 0.45
230 0.42
231 0.36
232 0.29
233 0.25
234 0.22
235 0.18
236 0.13
237 0.11
238 0.08
239 0.08
240 0.1
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.13
245 0.15
246 0.17
247 0.21
248 0.22
249 0.26
250 0.34
251 0.37
252 0.36
253 0.42
254 0.46
255 0.51
256 0.52
257 0.51
258 0.44
259 0.4
260 0.36
261 0.28
262 0.25
263 0.17
264 0.14
265 0.11
266 0.11
267 0.13
268 0.13
269 0.16
270 0.17
271 0.19
272 0.22
273 0.23
274 0.25
275 0.32
276 0.37
277 0.38
278 0.38
279 0.42
280 0.39
281 0.38
282 0.41
283 0.34
284 0.33
285 0.33
286 0.31
287 0.27
288 0.27
289 0.26
290 0.23
291 0.23
292 0.19
293 0.19
294 0.19
295 0.16
296 0.16
297 0.15
298 0.15
299 0.13
300 0.12
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.06
310 0.05
311 0.05
312 0.04
313 0.05
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.07
330 0.08
331 0.1
332 0.14
333 0.17
334 0.2
335 0.21
336 0.22
337 0.22
338 0.24
339 0.22
340 0.19
341 0.18
342 0.15
343 0.13
344 0.15
345 0.18
346 0.15
347 0.19
348 0.19
349 0.18
350 0.19
351 0.2
352 0.19
353 0.19
354 0.24
355 0.23
356 0.23
357 0.23
358 0.23
359 0.23
360 0.22
361 0.19
362 0.17
363 0.15
364 0.14
365 0.14
366 0.13
367 0.12
368 0.11
369 0.1
370 0.09
371 0.09
372 0.08
373 0.09
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.09
379 0.12
380 0.14
381 0.12
382 0.11
383 0.11
384 0.12
385 0.11
386 0.17
387 0.18
388 0.18
389 0.22
390 0.23
391 0.25
392 0.26
393 0.27
394 0.26
395 0.23
396 0.22
397 0.18
398 0.2
399 0.2
400 0.18
401 0.16
402 0.12
403 0.13
404 0.14
405 0.16
406 0.13
407 0.13
408 0.13
409 0.14
410 0.15
411 0.15
412 0.16
413 0.14
414 0.14
415 0.13
416 0.14
417 0.14
418 0.12
419 0.1
420 0.07
421 0.06
422 0.07
423 0.06
424 0.05
425 0.07
426 0.08
427 0.1
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.12
432 0.12
433 0.1
434 0.09
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.05
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.05
444 0.05
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.07
449 0.08
450 0.09
451 0.11
452 0.12
453 0.13
454 0.13
455 0.14
456 0.12
457 0.12
458 0.1
459 0.1
460 0.08
461 0.07
462 0.07
463 0.06
464 0.07
465 0.07
466 0.08
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.08
471 0.08
472 0.09
473 0.09
474 0.08
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.05
479 0.05
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.03
492 0.04
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.06
497 0.09
498 0.11
499 0.12
500 0.15
501 0.16
502 0.17
503 0.18
504 0.19
505 0.16
506 0.16
507 0.15
508 0.12
509 0.11
510 0.09
511 0.08
512 0.06
513 0.05
514 0.04
515 0.03
516 0.03
517 0.05
518 0.05
519 0.07
520 0.08
521 0.08
522 0.1
523 0.1
524 0.12
525 0.12
526 0.12
527 0.12
528 0.12
529 0.11
530 0.1
531 0.09
532 0.07
533 0.06
534 0.06
535 0.05
536 0.05
537 0.07
538 0.09
539 0.11
540 0.16
541 0.17
542 0.21
543 0.27
544 0.31
545 0.35
546 0.44
547 0.49
548 0.5
549 0.57
550 0.59
551 0.63
552 0.67
553 0.68
554 0.68
555 0.73
556 0.77
557 0.8
558 0.85
559 0.84
560 0.86
561 0.88
562 0.89
563 0.87
564 0.83
565 0.8
566 0.77
567 0.79
568 0.76
569 0.76
570 0.72
571 0.72
572 0.75
573 0.78
574 0.8
575 0.75
576 0.7
577 0.68
578 0.65
579 0.68
580 0.68
581 0.68
582 0.66
583 0.62
584 0.61
585 0.55
586 0.52
587 0.48
588 0.46
589 0.42
590 0.41
591 0.41
592 0.42
593 0.41
594 0.47
595 0.42
596 0.36
597 0.33
598 0.28
599 0.32
600 0.39
601 0.47
602 0.41
603 0.43
604 0.42
605 0.44
606 0.45
607 0.37
608 0.28
609 0.2
610 0.21
611 0.19
612 0.18
613 0.14
614 0.13
615 0.13
616 0.13
617 0.11
618 0.08
619 0.07
620 0.06
621 0.06
622 0.06
623 0.05
624 0.05
625 0.05
626 0.05
627 0.05
628 0.06
629 0.05
630 0.06
631 0.08
632 0.09
633 0.12
634 0.13
635 0.13
636 0.2
637 0.21
638 0.25
639 0.32
640 0.31
641 0.33
642 0.32
643 0.33
644 0.28
645 0.26
646 0.23
647 0.16
648 0.15
649 0.15
650 0.15
651 0.16
652 0.18
653 0.19
654 0.25
655 0.27
656 0.28
657 0.32
658 0.38
659 0.38
660 0.37
661 0.44
662 0.43
663 0.41
664 0.42
665 0.36
666 0.34
667 0.33
668 0.32
669 0.25
670 0.19
671 0.17
672 0.14
673 0.12
674 0.09
675 0.07
676 0.06
677 0.06
678 0.07
679 0.09
680 0.09
681 0.11
682 0.11
683 0.12
684 0.12
685 0.12
686 0.11
687 0.1
688 0.1
689 0.11
690 0.11
691 0.11
692 0.1
693 0.09
694 0.09
695 0.08
696 0.1
697 0.09
698 0.12
699 0.12
700 0.14
701 0.18
702 0.22
703 0.25
704 0.25
705 0.25
706 0.26
707 0.27
708 0.27
709 0.23
710 0.2
711 0.17
712 0.15
713 0.14
714 0.11
715 0.09
716 0.08
717 0.06
718 0.06
719 0.05
720 0.05
721 0.04
722 0.03
723 0.03
724 0.04
725 0.08
726 0.1
727 0.1
728 0.12
729 0.12
730 0.12
731 0.13
732 0.12
733 0.11
734 0.11
735 0.12
736 0.11
737 0.11
738 0.11
739 0.13
740 0.13
741 0.13
742 0.13
743 0.14
744 0.21
745 0.22
746 0.23
747 0.23
748 0.23
749 0.24
750 0.23
751 0.21
752 0.14
753 0.15
754 0.14
755 0.12
756 0.12
757 0.11
758 0.1
759 0.1
760 0.09
761 0.06
762 0.06
763 0.06
764 0.04
765 0.04
766 0.06
767 0.06
768 0.05
769 0.06
770 0.06
771 0.06
772 0.06
773 0.05
774 0.04
775 0.05
776 0.08
777 0.1
778 0.11
779 0.14
780 0.17
781 0.19
782 0.2
783 0.22
784 0.22
785 0.2
786 0.22
787 0.23
788 0.2
789 0.19
790 0.18
791 0.15
792 0.13
793 0.14
794 0.19
795 0.18
796 0.18
797 0.21
798 0.21
799 0.22
800 0.23
801 0.23
802 0.2
803 0.23
804 0.28
805 0.25
806 0.24
807 0.26
808 0.29
809 0.32
810 0.28
811 0.24
812 0.21
813 0.22
814 0.25
815 0.33
816 0.36
817 0.33
818 0.33
819 0.35
820 0.42
821 0.44
822 0.45
823 0.37
824 0.31
825 0.33
826 0.38
827 0.36
828 0.28
829 0.26
830 0.26
831 0.25
832 0.27
833 0.25
834 0.21
835 0.2
836 0.2
837 0.19
838 0.17
839 0.15
840 0.13
841 0.15
842 0.15
843 0.14
844 0.15
845 0.17
846 0.2
847 0.26
848 0.28
849 0.32
850 0.37
851 0.39
852 0.4
853 0.44
854 0.43
855 0.42
856 0.46
857 0.39
858 0.32
859 0.3
860 0.27
861 0.2
862 0.18
863 0.12
864 0.05
865 0.05
866 0.04
867 0.05
868 0.05
869 0.06
870 0.07
871 0.07
872 0.07
873 0.08
874 0.08
875 0.09
876 0.09
877 0.1
878 0.1
879 0.11
880 0.11
881 0.11
882 0.11
883 0.11
884 0.12
885 0.14
886 0.17
887 0.16
888 0.17
889 0.19
890 0.19
891 0.19
892 0.19
893 0.15
894 0.12
895 0.1
896 0.1
897 0.07
898 0.07
899 0.07
900 0.06
901 0.06
902 0.08
903 0.1
904 0.1
905 0.12
906 0.14
907 0.18
908 0.27
909 0.31
910 0.4
911 0.46
912 0.52
913 0.52
914 0.55
915 0.51
916 0.43
917 0.44
918 0.36
919 0.28
920 0.28
921 0.28
922 0.24
923 0.26
924 0.25
925 0.2
926 0.2
927 0.27
928 0.26
929 0.32
930 0.34
931 0.35
932 0.38
933 0.4
934 0.39
935 0.35
936 0.37
937 0.37
938 0.38
939 0.4
940 0.4
941 0.43
942 0.45
943 0.42
944 0.4
945 0.38
946 0.35
947 0.32
948 0.31
949 0.26
950 0.23
951 0.24
952 0.21
953 0.17
954 0.16
955 0.17
956 0.18
957 0.18
958 0.18
959 0.16
960 0.13
961 0.12
962 0.13
963 0.13
964 0.12
965 0.13
966 0.13
967 0.14
968 0.14
969 0.15
970 0.21
971 0.28
972 0.33
973 0.41
974 0.42
975 0.43
976 0.45
977 0.44
978 0.45
979 0.44
980 0.43
981 0.42
982 0.43
983 0.42
984 0.42
985 0.42
986 0.36
987 0.3
988 0.24
989 0.15
990 0.15
991 0.16
992 0.16
993 0.15
994 0.13
995 0.11
996 0.1
997 0.1
998 0.1
999 0.14
1000 0.13
1001 0.15
1002 0.16
1003 0.19
1004 0.18
1005 0.18
1006 0.25
1007 0.2
1008 0.19
1009 0.17
1010 0.16
1011 0.17
1012 0.19