Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PT99

Protein Details
Accession A0A1D8PT99    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
161-199IKEVIIKKSSRKRKSGKNGGGKRGGKAGRRTRKPDPDAEBasic
294-342STPVNDPKNKPKPDSKPKNKAVNEKLENASNTKPKPKIDKKTPTEKAENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
167-196KKSSRKRKSGKNGGGKRGGKAGRRTRKPDP
300-398PKNKPKPDSKPKNKAVNEKLENASNTKPKPKIDKKTPTEKAENKSKSKENNTSSPKEPKGQAPTKLGSKKSPEKDKTKESSSKTGKKPESAVKSDKKQK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR045055  DNA2/NAM7-like  
IPR041679  DNA2/NAM7-like_C  
IPR041677  DNA2/NAM7_AAA_11  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR047187  SF1_C_Upf1  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0010494  C:cytoplasmic stress granule  
GO:0005844  C:polysome  
GO:0003678  F:DNA helicase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0006449  P:regulation of translational termination  
KEGG cal:CAALFM_CR06680CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13086  AAA_11  
PF13087  AAA_12  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd18808  SF1_C_Upf1  
Amino Acid Sequences MTSEKYTCLTCSEQFSEAGQIQKHLSTTRHKSVRLESLDETLECEECSDSNIHQLSIVRYGFNDMSLLCQICLEKDNKKTGETPSASYTLSNGAFFNKLPQYLKFRDIECMECGDDTHLSVANTSSGQLVICRKCLPKYESDNVKFISEDSDDFLSELLGIKEVIIKKSSRKRKSGKNGGGKRGGKAGRRTRKPDPDAEARKAHYLQSKQTAKDIKSGTTVKAIGSNGAANNKTSTTGTKNNTKPTSRYGKSPSVSGKSTPKPGKSPATSGKSTPHFGKSPSVSGTTTPKARSSTPVNDPKNKPKPDSKPKNKAVNEKLENASNTKPKPKIDKKTPTEKAENKSKSKENNTSSPKEPKGQAPTKLGSKKSPEKDKTKESSSKTGKKPESAVKSDKKQKSNVPQSYSKTKSGSKAQQTANDNKKSGANLPSSKESSLVLPPYITKFHPSEKPKLTYDSMNEYFKEISFNVFLEDQLNNESNIIDSSNFTISWYEDLDKKNNQFQLHIPMRPEIIDKFLSQKLKKFKKNPFSVDQAIFLILDDEIMWSGYIATVDEIASKKGRRVKKDVIELIIMLHPWSQALPRTVHVSNLKILPASQPVSRVLNAMKTINNAGFTRMLLGKEPIKQIDFKNFLKFQGQNLNESQKKGVQSVLNNSITVLQGPPGTGKTSTIYEIILQLLDSLNTYPILVVAASNIAIDNIAEKLMTKHGKDILRITAAEKERDYNRSHPLASICLHHKMYDAMPMKYQQVMDEMKRGMAPSIGTTAYKKYAQERFFLSNQIVTQAKVVLATPVVAGGIKSLNNVRVVIIDEATQSSEPTTLIPLALPSVEKLVLVGDQKQLSCFSLIPNLSLSLFERVLLNGTYKTPHMLDTQYRMHPEISEFPRTKFYGGLLKDGIDANARQSEGVISSPLYFWDTKGNAREQSVRNFLREDGGYTYTNRDEIGYIQQVLRTLIITKGVKPEQIGIITPYSGQRDLISATLVKDDVINPSNEQMKTEVDIDDLKNDSKPVTIHIVSGIMIASIDAFQGREKDYMIMSCVRSNTKGVIGFLRDERRLNVALTRAKYGLIMVGDKKCLQNGDKLWKEYLQYLDSKKAIHDNDTFGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.33
3 0.34
4 0.32
5 0.34
6 0.28
7 0.27
8 0.27
9 0.27
10 0.28
11 0.27
12 0.29
13 0.34
14 0.42
15 0.5
16 0.56
17 0.57
18 0.61
19 0.64
20 0.69
21 0.64
22 0.6
23 0.52
24 0.49
25 0.48
26 0.42
27 0.37
28 0.28
29 0.23
30 0.18
31 0.17
32 0.14
33 0.11
34 0.14
35 0.13
36 0.12
37 0.2
38 0.21
39 0.2
40 0.21
41 0.24
42 0.24
43 0.29
44 0.3
45 0.22
46 0.22
47 0.27
48 0.25
49 0.22
50 0.21
51 0.13
52 0.16
53 0.19
54 0.2
55 0.15
56 0.16
57 0.16
58 0.17
59 0.22
60 0.23
61 0.26
62 0.32
63 0.42
64 0.42
65 0.45
66 0.47
67 0.48
68 0.55
69 0.5
70 0.47
71 0.43
72 0.43
73 0.4
74 0.36
75 0.31
76 0.26
77 0.24
78 0.21
79 0.17
80 0.17
81 0.18
82 0.18
83 0.23
84 0.21
85 0.25
86 0.26
87 0.31
88 0.37
89 0.4
90 0.46
91 0.43
92 0.4
93 0.44
94 0.44
95 0.42
96 0.36
97 0.35
98 0.3
99 0.26
100 0.25
101 0.2
102 0.18
103 0.15
104 0.15
105 0.14
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.11
113 0.09
114 0.09
115 0.12
116 0.19
117 0.2
118 0.23
119 0.28
120 0.3
121 0.34
122 0.42
123 0.43
124 0.45
125 0.51
126 0.58
127 0.64
128 0.65
129 0.66
130 0.59
131 0.55
132 0.46
133 0.37
134 0.32
135 0.23
136 0.2
137 0.18
138 0.17
139 0.16
140 0.16
141 0.16
142 0.11
143 0.1
144 0.11
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.12
150 0.15
151 0.17
152 0.18
153 0.2
154 0.29
155 0.39
156 0.5
157 0.54
158 0.62
159 0.69
160 0.77
161 0.86
162 0.88
163 0.88
164 0.89
165 0.89
166 0.88
167 0.89
168 0.8
169 0.7
170 0.68
171 0.63
172 0.59
173 0.6
174 0.62
175 0.63
176 0.69
177 0.75
178 0.76
179 0.81
180 0.8
181 0.78
182 0.75
183 0.75
184 0.74
185 0.72
186 0.68
187 0.59
188 0.58
189 0.51
190 0.48
191 0.45
192 0.42
193 0.42
194 0.47
195 0.51
196 0.47
197 0.53
198 0.56
199 0.49
200 0.53
201 0.48
202 0.4
203 0.41
204 0.42
205 0.36
206 0.34
207 0.33
208 0.26
209 0.28
210 0.26
211 0.2
212 0.19
213 0.2
214 0.17
215 0.21
216 0.21
217 0.18
218 0.19
219 0.18
220 0.19
221 0.17
222 0.19
223 0.21
224 0.28
225 0.32
226 0.4
227 0.45
228 0.53
229 0.59
230 0.59
231 0.56
232 0.57
233 0.62
234 0.54
235 0.57
236 0.54
237 0.56
238 0.53
239 0.56
240 0.54
241 0.49
242 0.49
243 0.46
244 0.48
245 0.44
246 0.52
247 0.53
248 0.5
249 0.5
250 0.55
251 0.59
252 0.54
253 0.57
254 0.57
255 0.57
256 0.54
257 0.51
258 0.52
259 0.47
260 0.47
261 0.42
262 0.39
263 0.34
264 0.34
265 0.39
266 0.35
267 0.35
268 0.34
269 0.33
270 0.28
271 0.28
272 0.32
273 0.3
274 0.31
275 0.29
276 0.3
277 0.3
278 0.31
279 0.34
280 0.35
281 0.38
282 0.43
283 0.52
284 0.55
285 0.62
286 0.67
287 0.73
288 0.75
289 0.73
290 0.69
291 0.68
292 0.73
293 0.75
294 0.8
295 0.8
296 0.81
297 0.85
298 0.9
299 0.86
300 0.86
301 0.82
302 0.82
303 0.75
304 0.69
305 0.62
306 0.56
307 0.51
308 0.44
309 0.41
310 0.37
311 0.36
312 0.38
313 0.4
314 0.41
315 0.51
316 0.58
317 0.63
318 0.67
319 0.74
320 0.74
321 0.81
322 0.85
323 0.8
324 0.8
325 0.77
326 0.73
327 0.73
328 0.73
329 0.68
330 0.66
331 0.65
332 0.64
333 0.65
334 0.68
335 0.62
336 0.64
337 0.66
338 0.65
339 0.64
340 0.64
341 0.58
342 0.54
343 0.51
344 0.48
345 0.5
346 0.52
347 0.52
348 0.49
349 0.49
350 0.53
351 0.56
352 0.52
353 0.48
354 0.49
355 0.53
356 0.56
357 0.63
358 0.62
359 0.65
360 0.7
361 0.74
362 0.72
363 0.7
364 0.7
365 0.64
366 0.67
367 0.67
368 0.7
369 0.66
370 0.7
371 0.65
372 0.61
373 0.61
374 0.59
375 0.58
376 0.55
377 0.57
378 0.55
379 0.61
380 0.68
381 0.69
382 0.66
383 0.63
384 0.65
385 0.68
386 0.71
387 0.69
388 0.65
389 0.65
390 0.65
391 0.69
392 0.65
393 0.58
394 0.5
395 0.47
396 0.46
397 0.47
398 0.51
399 0.49
400 0.52
401 0.51
402 0.55
403 0.57
404 0.61
405 0.61
406 0.57
407 0.5
408 0.43
409 0.43
410 0.37
411 0.36
412 0.32
413 0.29
414 0.28
415 0.31
416 0.34
417 0.34
418 0.33
419 0.29
420 0.24
421 0.2
422 0.19
423 0.17
424 0.13
425 0.12
426 0.13
427 0.14
428 0.16
429 0.14
430 0.15
431 0.16
432 0.2
433 0.28
434 0.32
435 0.39
436 0.43
437 0.47
438 0.45
439 0.47
440 0.45
441 0.4
442 0.38
443 0.37
444 0.34
445 0.32
446 0.3
447 0.27
448 0.26
449 0.22
450 0.22
451 0.13
452 0.12
453 0.11
454 0.11
455 0.1
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.1
460 0.09
461 0.1
462 0.11
463 0.09
464 0.09
465 0.09
466 0.07
467 0.08
468 0.08
469 0.06
470 0.05
471 0.07
472 0.08
473 0.07
474 0.08
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.09
480 0.12
481 0.14
482 0.18
483 0.21
484 0.23
485 0.27
486 0.3
487 0.29
488 0.27
489 0.27
490 0.33
491 0.33
492 0.33
493 0.29
494 0.26
495 0.26
496 0.25
497 0.24
498 0.15
499 0.14
500 0.13
501 0.12
502 0.15
503 0.19
504 0.24
505 0.24
506 0.29
507 0.36
508 0.44
509 0.52
510 0.57
511 0.63
512 0.67
513 0.74
514 0.75
515 0.69
516 0.66
517 0.62
518 0.54
519 0.46
520 0.36
521 0.28
522 0.22
523 0.17
524 0.11
525 0.06
526 0.05
527 0.04
528 0.03
529 0.03
530 0.03
531 0.03
532 0.03
533 0.03
534 0.03
535 0.03
536 0.03
537 0.03
538 0.03
539 0.03
540 0.05
541 0.06
542 0.07
543 0.09
544 0.1
545 0.13
546 0.2
547 0.26
548 0.29
549 0.37
550 0.45
551 0.49
552 0.57
553 0.56
554 0.51
555 0.46
556 0.41
557 0.34
558 0.25
559 0.18
560 0.1
561 0.08
562 0.06
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.07
567 0.1
568 0.11
569 0.12
570 0.16
571 0.17
572 0.21
573 0.22
574 0.21
575 0.2
576 0.2
577 0.2
578 0.15
579 0.15
580 0.12
581 0.13
582 0.14
583 0.12
584 0.13
585 0.14
586 0.16
587 0.16
588 0.16
589 0.14
590 0.14
591 0.15
592 0.15
593 0.14
594 0.13
595 0.14
596 0.14
597 0.15
598 0.13
599 0.13
600 0.12
601 0.11
602 0.12
603 0.12
604 0.12
605 0.1
606 0.12
607 0.14
608 0.17
609 0.18
610 0.18
611 0.17
612 0.2
613 0.21
614 0.27
615 0.3
616 0.28
617 0.33
618 0.33
619 0.33
620 0.35
621 0.35
622 0.29
623 0.33
624 0.32
625 0.28
626 0.3
627 0.36
628 0.33
629 0.33
630 0.32
631 0.25
632 0.26
633 0.23
634 0.24
635 0.2
636 0.21
637 0.26
638 0.32
639 0.29
640 0.28
641 0.27
642 0.25
643 0.21
644 0.19
645 0.14
646 0.07
647 0.07
648 0.07
649 0.08
650 0.08
651 0.09
652 0.09
653 0.09
654 0.1
655 0.11
656 0.12
657 0.12
658 0.11
659 0.1
660 0.11
661 0.1
662 0.08
663 0.07
664 0.06
665 0.06
666 0.05
667 0.05
668 0.05
669 0.05
670 0.05
671 0.05
672 0.04
673 0.04
674 0.05
675 0.04
676 0.04
677 0.04
678 0.04
679 0.04
680 0.04
681 0.04
682 0.03
683 0.03
684 0.03
685 0.04
686 0.04
687 0.04
688 0.04
689 0.04
690 0.05
691 0.12
692 0.15
693 0.15
694 0.18
695 0.24
696 0.27
697 0.28
698 0.3
699 0.28
700 0.27
701 0.27
702 0.25
703 0.26
704 0.26
705 0.26
706 0.23
707 0.24
708 0.25
709 0.29
710 0.31
711 0.29
712 0.33
713 0.34
714 0.34
715 0.32
716 0.3
717 0.3
718 0.27
719 0.27
720 0.23
721 0.25
722 0.25
723 0.23
724 0.22
725 0.21
726 0.2
727 0.25
728 0.25
729 0.21
730 0.23
731 0.24
732 0.24
733 0.25
734 0.24
735 0.16
736 0.17
737 0.2
738 0.19
739 0.22
740 0.21
741 0.2
742 0.2
743 0.2
744 0.16
745 0.13
746 0.12
747 0.09
748 0.11
749 0.11
750 0.11
751 0.12
752 0.14
753 0.16
754 0.18
755 0.18
756 0.23
757 0.31
758 0.32
759 0.34
760 0.36
761 0.38
762 0.38
763 0.38
764 0.32
765 0.26
766 0.24
767 0.25
768 0.21
769 0.16
770 0.15
771 0.13
772 0.13
773 0.11
774 0.11
775 0.08
776 0.07
777 0.07
778 0.06
779 0.05
780 0.05
781 0.05
782 0.05
783 0.05
784 0.06
785 0.06
786 0.08
787 0.1
788 0.12
789 0.13
790 0.14
791 0.13
792 0.13
793 0.15
794 0.14
795 0.13
796 0.11
797 0.1
798 0.1
799 0.12
800 0.11
801 0.08
802 0.08
803 0.08
804 0.08
805 0.08
806 0.09
807 0.08
808 0.08
809 0.08
810 0.07
811 0.07
812 0.08
813 0.07
814 0.06
815 0.08
816 0.08
817 0.07
818 0.07
819 0.07
820 0.09
821 0.1
822 0.12
823 0.15
824 0.17
825 0.17
826 0.18
827 0.19
828 0.17
829 0.17
830 0.15
831 0.13
832 0.18
833 0.18
834 0.18
835 0.18
836 0.17
837 0.16
838 0.17
839 0.17
840 0.14
841 0.13
842 0.13
843 0.12
844 0.12
845 0.13
846 0.13
847 0.13
848 0.11
849 0.12
850 0.14
851 0.13
852 0.16
853 0.14
854 0.16
855 0.17
856 0.2
857 0.23
858 0.27
859 0.33
860 0.34
861 0.36
862 0.35
863 0.33
864 0.3
865 0.29
866 0.32
867 0.31
868 0.36
869 0.36
870 0.36
871 0.42
872 0.41
873 0.39
874 0.31
875 0.29
876 0.28
877 0.27
878 0.3
879 0.25
880 0.24
881 0.25
882 0.24
883 0.22
884 0.17
885 0.16
886 0.14
887 0.16
888 0.15
889 0.14
890 0.14
891 0.14
892 0.12
893 0.13
894 0.11
895 0.09
896 0.1
897 0.1
898 0.11
899 0.13
900 0.12
901 0.12
902 0.19
903 0.2
904 0.24
905 0.29
906 0.33
907 0.33
908 0.37
909 0.44
910 0.41
911 0.46
912 0.51
913 0.48
914 0.45
915 0.44
916 0.41
917 0.37
918 0.34
919 0.29
920 0.23
921 0.24
922 0.24
923 0.23
924 0.27
925 0.23
926 0.23
927 0.2
928 0.17
929 0.14
930 0.15
931 0.21
932 0.2
933 0.21
934 0.21
935 0.22
936 0.22
937 0.22
938 0.2
939 0.14
940 0.12
941 0.12
942 0.18
943 0.19
944 0.2
945 0.28
946 0.29
947 0.3
948 0.3
949 0.32
950 0.29
951 0.29
952 0.28
953 0.22
954 0.21
955 0.2
956 0.2
957 0.2
958 0.19
959 0.18
960 0.18
961 0.16
962 0.16
963 0.17
964 0.16
965 0.16
966 0.13
967 0.14
968 0.15
969 0.14
970 0.13
971 0.13
972 0.13
973 0.17
974 0.18
975 0.19
976 0.18
977 0.22
978 0.29
979 0.28
980 0.28
981 0.24
982 0.24
983 0.24
984 0.25
985 0.21
986 0.17
987 0.2
988 0.2
989 0.22
990 0.22
991 0.2
992 0.2
993 0.2
994 0.19
995 0.18
996 0.17
997 0.18
998 0.23
999 0.23
1000 0.22
1001 0.22
1002 0.23
1003 0.2
1004 0.2
1005 0.16
1006 0.08
1007 0.08
1008 0.07
1009 0.06
1010 0.05
1011 0.05
1012 0.05
1013 0.06
1014 0.07
1015 0.1
1016 0.13
1017 0.14
1018 0.15
1019 0.17
1020 0.18
1021 0.19
1022 0.21
1023 0.23
1024 0.23
1025 0.25
1026 0.28
1027 0.29
1028 0.3
1029 0.3
1030 0.3
1031 0.3
1032 0.31
1033 0.3
1034 0.31
1035 0.31
1036 0.33
1037 0.37
1038 0.42
1039 0.39
1040 0.38
1041 0.38
1042 0.38
1043 0.37
1044 0.35
1045 0.32
1046 0.33
1047 0.37
1048 0.38
1049 0.4
1050 0.35
1051 0.33
1052 0.32
1053 0.28
1054 0.24
1055 0.19
1056 0.21
1057 0.23
1058 0.26
1059 0.29
1060 0.31
1061 0.32
1062 0.31
1063 0.34
1064 0.32
1065 0.35
1066 0.4
1067 0.48
1068 0.53
1069 0.55
1070 0.55
1071 0.53
1072 0.53
1073 0.49
1074 0.46
1075 0.4
1076 0.39
1077 0.4
1078 0.44
1079 0.43
1080 0.42
1081 0.39
1082 0.42
1083 0.41
1084 0.4
1085 0.4