Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R8BTR2

Protein Details
Accession R8BTR2    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
164-185GKQHHHHQKDNGKKDRKDKGGSBasic
188-213KWFSSKDDSRKDKDKKDSKKSVVIAHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
172-207KDNGKKDRKDKGGSSSKWFSSKDDSRKDKDKKDSKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG tmn:UCRPA7_1723  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MPPSFSYAQSPSYYGYSPAPSTEQYSYGTSGASGSGSDYYGTYTDPPGMHQPAGLAPTAPPGGLVRTEQRGVLIREISRRASQAAVDKLLRDTAVNDAALIVEITIPVDKDRNPRGWATMMFSTTDAALRMINRINKIEFKGRRLSAKIFKEGEAVSVEGSASGKQHHHHQKDNGKKDRKDKGGSSSKWFSSKDDSRKDKDKKDSKKSVVIAHGSSYVKGKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.23
4 0.22
5 0.23
6 0.23
7 0.22
8 0.26
9 0.25
10 0.24
11 0.23
12 0.24
13 0.24
14 0.22
15 0.2
16 0.15
17 0.14
18 0.12
19 0.1
20 0.07
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.08
25 0.07
26 0.08
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.1
31 0.13
32 0.12
33 0.14
34 0.19
35 0.21
36 0.2
37 0.19
38 0.19
39 0.18
40 0.19
41 0.17
42 0.11
43 0.08
44 0.11
45 0.11
46 0.1
47 0.09
48 0.08
49 0.09
50 0.1
51 0.12
52 0.12
53 0.15
54 0.16
55 0.16
56 0.17
57 0.2
58 0.21
59 0.22
60 0.21
61 0.2
62 0.23
63 0.26
64 0.27
65 0.24
66 0.23
67 0.21
68 0.19
69 0.19
70 0.21
71 0.21
72 0.22
73 0.21
74 0.2
75 0.2
76 0.19
77 0.17
78 0.11
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.07
88 0.04
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.04
95 0.05
96 0.07
97 0.12
98 0.16
99 0.2
100 0.21
101 0.22
102 0.24
103 0.25
104 0.24
105 0.22
106 0.2
107 0.17
108 0.16
109 0.15
110 0.13
111 0.11
112 0.11
113 0.07
114 0.06
115 0.07
116 0.06
117 0.08
118 0.11
119 0.14
120 0.15
121 0.17
122 0.18
123 0.2
124 0.23
125 0.31
126 0.31
127 0.32
128 0.38
129 0.38
130 0.41
131 0.42
132 0.46
133 0.45
134 0.47
135 0.49
136 0.43
137 0.41
138 0.39
139 0.36
140 0.31
141 0.23
142 0.19
143 0.12
144 0.11
145 0.1
146 0.07
147 0.08
148 0.07
149 0.06
150 0.08
151 0.1
152 0.11
153 0.21
154 0.31
155 0.37
156 0.44
157 0.53
158 0.61
159 0.7
160 0.79
161 0.79
162 0.79
163 0.8
164 0.81
165 0.82
166 0.8
167 0.77
168 0.71
169 0.71
170 0.71
171 0.69
172 0.67
173 0.64
174 0.59
175 0.57
176 0.54
177 0.47
178 0.46
179 0.52
180 0.54
181 0.58
182 0.62
183 0.64
184 0.73
185 0.78
186 0.78
187 0.8
188 0.81
189 0.81
190 0.84
191 0.88
192 0.84
193 0.85
194 0.8
195 0.77
196 0.74
197 0.68
198 0.59
199 0.5
200 0.49
201 0.41
202 0.38