FuNGI

R8BJW5

Protein Details

Accession

R8BJW5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-45	QEDPSAFPSTKRQRNQRSQPTSNNKSRSQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 13.5, cyto 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0004812 F:aminoacyl-tRNA ligase activity GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
KEGG	tmn:UCRPA7_4928 -
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MIMTSKRNLDDAAGSDQEDPSAFPSTKRQRNQRSQPTSNNKSRSQQPATDLTYGQRCVFPGIGDSLIHSDDDIDYEDEQDALAYLQSVRMSPLMDRSIYDSGRGDSRGYYYDGAYTAAPDSEEASDDDDYETGEPPENGASAYSDSPAHIQKAYSASLVAQFTSLRSALHQDPPPEALAALPRDHGFEVGRFGSGSKTFKIWEIRLRHTDPLPAQVAAMDKPSVLKLLRIILGGKFLRRGCELRERTSRWLWALLARLPDRGEMDFMEVGYVRELGKRAVLLLATLEEMAALRREVELEEGQQEEEDDDLEEGVYIDEDGTPQDEIEDTGDFAPRLPPSNGQDPIIEVADKGIAEDEEMEDGEVPDEGEVSATDLEADIAAAKARLLGDIEQIDSPEVETGPSRKGEDDEEAFDETRARINMRATLNMILTVAGEFYGQRDLLEFRAPFNGL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.25
3	0.24
4	0.23
5	0.19
6	0.16
7	0.13
8	0.18
9	0.17
10	0.17
11	0.28
12	0.38
13	0.47
14	0.56
15	0.64
16	0.69
17	0.8
18	0.89
19	0.9
20	0.9
21	0.89
22	0.91
23	0.91
24	0.9
25	0.88
26	0.84
27	0.78
28	0.75
29	0.75
30	0.74
31	0.7
32	0.65
33	0.61
34	0.62
35	0.61
36	0.57
37	0.49
38	0.44
39	0.42
40	0.39
41	0.35
42	0.28
43	0.24
44	0.24
45	0.24
46	0.2
47	0.17
48	0.17
49	0.17
50	0.16
51	0.16
52	0.15
53	0.15
54	0.14
55	0.12
56	0.1
57	0.09
58	0.1
59	0.11
60	0.1
61	0.1
62	0.11
63	0.11
64	0.1
65	0.1
66	0.09
67	0.07
68	0.06
69	0.05
70	0.05
71	0.05
72	0.07
73	0.08
74	0.08
75	0.09
76	0.1
77	0.11
78	0.11
79	0.16
80	0.17
81	0.17
82	0.18
83	0.21
84	0.25
85	0.24
86	0.26
87	0.21
88	0.2
89	0.23
90	0.23
91	0.19
92	0.15
93	0.17
94	0.17
95	0.19
96	0.18
97	0.16
98	0.16
99	0.15
100	0.16
101	0.13
102	0.12
103	0.1
104	0.09
105	0.09
106	0.07
107	0.08
108	0.08
109	0.09
110	0.08
111	0.1
112	0.1
113	0.11
114	0.11
115	0.09
116	0.09
117	0.09
118	0.1
119	0.08
120	0.09
121	0.08
122	0.08
123	0.09
124	0.09
125	0.08
126	0.07
127	0.08
128	0.08
129	0.09
130	0.09
131	0.09
132	0.09
133	0.12
134	0.13
135	0.14
136	0.13
137	0.12
138	0.14
139	0.16
140	0.17
141	0.15
142	0.13
143	0.12
144	0.15
145	0.15
146	0.12
147	0.1
148	0.09
149	0.09
150	0.11
151	0.11
152	0.07
153	0.08
154	0.12
155	0.14
156	0.21
157	0.24
158	0.23
159	0.24
160	0.25
161	0.25
162	0.21
163	0.18
164	0.12
165	0.12
166	0.12
167	0.12
168	0.11
169	0.11
170	0.12
171	0.12
172	0.13
173	0.1
174	0.09
175	0.11
176	0.11
177	0.11
178	0.09
179	0.1
180	0.11
181	0.13
182	0.14
183	0.12
184	0.13
185	0.13
186	0.17
187	0.22
188	0.22
189	0.27
190	0.3
191	0.35
192	0.4
193	0.42
194	0.41
195	0.37
196	0.39
197	0.32
198	0.31
199	0.27
200	0.21
201	0.18
202	0.16
203	0.17
204	0.13
205	0.13
206	0.08
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.08
211	0.07
212	0.07
213	0.08
214	0.1
215	0.11
216	0.11
217	0.12
218	0.1
219	0.15
220	0.15
221	0.14
222	0.16
223	0.16
224	0.17
225	0.19
226	0.2
227	0.19
228	0.29
229	0.32
230	0.34
231	0.42
232	0.44
233	0.46
234	0.48
235	0.46
236	0.36
237	0.35
238	0.28
239	0.23
240	0.22
241	0.19
242	0.22
243	0.2
244	0.2
245	0.19
246	0.19
247	0.18
248	0.15
249	0.14
250	0.1
251	0.12
252	0.1
253	0.1
254	0.09
255	0.08
256	0.08
257	0.08
258	0.08
259	0.06
260	0.07
261	0.08
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.07
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.05
274	0.04
275	0.04
276	0.05
277	0.05
278	0.04
279	0.04
280	0.05
281	0.05
282	0.06
283	0.09
284	0.09
285	0.1
286	0.11
287	0.12
288	0.12
289	0.11
290	0.11
291	0.08
292	0.07
293	0.06
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.05
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.03
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.06
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.08
317	0.09
318	0.09
319	0.09
320	0.12
321	0.11
322	0.15
323	0.16
324	0.2
325	0.24
326	0.32
327	0.33
328	0.31
329	0.31
330	0.28
331	0.29
332	0.25
333	0.2
334	0.12
335	0.11
336	0.11
337	0.1
338	0.09
339	0.07
340	0.06
341	0.06
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.07
350	0.06
351	0.06
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.04
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.05
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.09
374	0.09
375	0.13
376	0.14
377	0.16
378	0.15
379	0.15
380	0.15
381	0.14
382	0.13
383	0.1
384	0.09
385	0.08
386	0.11
387	0.13
388	0.16
389	0.18
390	0.19
391	0.19
392	0.21
393	0.24
394	0.28
395	0.29
396	0.29
397	0.29
398	0.31
399	0.3
400	0.28
401	0.26
402	0.2
403	0.21
404	0.19
405	0.19
406	0.2
407	0.22
408	0.29
409	0.3
410	0.33
411	0.31
412	0.33
413	0.31
414	0.28
415	0.26
416	0.18
417	0.15
418	0.12
419	0.1
420	0.06
421	0.06
422	0.06
423	0.07
424	0.1
425	0.1
426	0.1
427	0.12
428	0.14
429	0.16
430	0.23
431	0.22
432	0.21

R8BJW5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer