Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4RCI4

Protein Details
Accession F4RCI4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
259-278KPEIHTSPSKKKRRANGTDGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
265-272SPSKKKRR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.666, mito_nucl 12.333, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0046695  C:SLIK (SAGA-like) complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0016573  P:histone acetylation  
GO:0001403  P:invasive growth in response to glucose limitation  
GO:0007124  P:pseudohyphal growth  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG mlr:MELLADRAFT_47347  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MAVPSSSKTSKYATEISQMLFVFGEVKDPDEETVRYIEDVVRCQVAELVIQARALAQRRGLRVPTTEDLIFLIRHDRAKVNRLRNYLGWKDVRKKAKEDGTDEKDIESFEAESNGQTNRMKSQKLKLKIPWELSTIYTDMLVVNEENEDEEEDQDDKEAYEASEKRLREADEITRHMTREEYQHYSDCRQASFTYRKAKRFREFVGLSNYIEGNPKDEVVDVLGFLSYEMVRSLCERGLAVKRDYELARMARGQDSKPKPEIHTSPSKKKRRANGTDGHDDDYDGSEAYKRPKPSGPFSGPSTPQPNLPSFLTPSRASFLEDPFGITDESTGKVAEKEIEGGKVSVPEPTRSPLRIADVEDAYSMMQMGRVKTKTSALRNFTGGFVRNKVSLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.4
3 0.38
4 0.39
5 0.35
6 0.3
7 0.24
8 0.21
9 0.16
10 0.13
11 0.17
12 0.12
13 0.14
14 0.15
15 0.16
16 0.17
17 0.19
18 0.19
19 0.17
20 0.19
21 0.17
22 0.16
23 0.17
24 0.19
25 0.19
26 0.21
27 0.22
28 0.21
29 0.2
30 0.2
31 0.2
32 0.17
33 0.14
34 0.13
35 0.13
36 0.13
37 0.13
38 0.12
39 0.12
40 0.16
41 0.19
42 0.18
43 0.22
44 0.27
45 0.31
46 0.36
47 0.37
48 0.36
49 0.36
50 0.41
51 0.37
52 0.36
53 0.32
54 0.28
55 0.26
56 0.25
57 0.21
58 0.15
59 0.17
60 0.15
61 0.17
62 0.2
63 0.24
64 0.27
65 0.37
66 0.45
67 0.51
68 0.55
69 0.57
70 0.59
71 0.58
72 0.61
73 0.56
74 0.55
75 0.52
76 0.52
77 0.57
78 0.61
79 0.66
80 0.61
81 0.61
82 0.62
83 0.63
84 0.62
85 0.6
86 0.62
87 0.59
88 0.6
89 0.55
90 0.48
91 0.4
92 0.34
93 0.27
94 0.18
95 0.13
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.11
101 0.11
102 0.13
103 0.14
104 0.15
105 0.2
106 0.24
107 0.28
108 0.31
109 0.4
110 0.46
111 0.51
112 0.57
113 0.57
114 0.61
115 0.63
116 0.64
117 0.57
118 0.5
119 0.45
120 0.38
121 0.34
122 0.26
123 0.2
124 0.14
125 0.12
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.11
148 0.12
149 0.16
150 0.2
151 0.2
152 0.22
153 0.25
154 0.26
155 0.22
156 0.24
157 0.27
158 0.28
159 0.3
160 0.32
161 0.3
162 0.29
163 0.27
164 0.25
165 0.19
166 0.19
167 0.21
168 0.22
169 0.23
170 0.25
171 0.27
172 0.28
173 0.3
174 0.26
175 0.21
176 0.19
177 0.18
178 0.22
179 0.25
180 0.29
181 0.36
182 0.4
183 0.48
184 0.54
185 0.61
186 0.6
187 0.6
188 0.57
189 0.56
190 0.52
191 0.48
192 0.48
193 0.41
194 0.36
195 0.31
196 0.28
197 0.2
198 0.2
199 0.16
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.05
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.06
220 0.08
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.12
225 0.18
226 0.22
227 0.22
228 0.22
229 0.22
230 0.25
231 0.25
232 0.23
233 0.21
234 0.19
235 0.19
236 0.19
237 0.2
238 0.21
239 0.23
240 0.23
241 0.28
242 0.32
243 0.36
244 0.39
245 0.41
246 0.39
247 0.44
248 0.47
249 0.43
250 0.49
251 0.51
252 0.58
253 0.65
254 0.72
255 0.73
256 0.76
257 0.79
258 0.79
259 0.8
260 0.78
261 0.77
262 0.74
263 0.75
264 0.7
265 0.63
266 0.52
267 0.43
268 0.35
269 0.28
270 0.21
271 0.12
272 0.11
273 0.1
274 0.12
275 0.18
276 0.22
277 0.22
278 0.26
279 0.32
280 0.38
281 0.43
282 0.5
283 0.51
284 0.5
285 0.54
286 0.57
287 0.53
288 0.53
289 0.51
290 0.42
291 0.39
292 0.39
293 0.35
294 0.31
295 0.31
296 0.28
297 0.27
298 0.29
299 0.3
300 0.27
301 0.27
302 0.26
303 0.25
304 0.26
305 0.25
306 0.24
307 0.23
308 0.22
309 0.22
310 0.2
311 0.2
312 0.17
313 0.14
314 0.13
315 0.1
316 0.12
317 0.11
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.12
322 0.13
323 0.12
324 0.15
325 0.16
326 0.18
327 0.18
328 0.18
329 0.18
330 0.18
331 0.18
332 0.19
333 0.2
334 0.21
335 0.22
336 0.27
337 0.31
338 0.3
339 0.33
340 0.31
341 0.35
342 0.36
343 0.37
344 0.37
345 0.33
346 0.32
347 0.29
348 0.26
349 0.2
350 0.17
351 0.13
352 0.08
353 0.09
354 0.11
355 0.14
356 0.22
357 0.23
358 0.25
359 0.28
360 0.36
361 0.41
362 0.48
363 0.55
364 0.53
365 0.56
366 0.57
367 0.56
368 0.51
369 0.48
370 0.43
371 0.39
372 0.37
373 0.36