Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R8BI18

Protein Details
Accession R8BI18    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
97-120EQAESTKKRSRGKTQNRTPYEKEMHydrophilic
432-473EHLLQRTERKKAPKRKLQDDEEQVIRAKKQNKKAEVPEKEELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
440-447RKKAPKRK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 10.999, mito_nucl 9.999, cyto_mito 8.666, cyto 8.5, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
KEGG tmn:UCRPA7_5441  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MKKAKTTAPAKALNSQLGFKVSKPLTTPDLKGEGANDLTGTQNSNIIEKDAQITAAPAPTKEDGDHFLVDHQILDASISVKREAQHGQTLPQETADEQAESTKKRSRGKTQNRTPYEKEMNGLPWHQTPFPDLVQPTAEACEEVHKLLAGQLMRKENRVISQPETVPPPSLEVAGCGEVPNILDALVRTLLSAATTFDNSDNALQSLIAKFGTITIEGPNSTRTNPEIVIKDQIDFMKIHHADVKAVEKAIECGGLGAVKSKFIKGILSQVYSENFLRVKAFRQEKLDGVKPDIPGVDALNQGQKDMEIWLWEHGVLSLDHHCSLDPEAAMNEFIKFPGIGVKTAACVILFCMRQPCFAVDTHIWRMCKWLNWAPAKADRNSAFAHLDVRVPDHLKYALHQLFIYHGKNCKKCKISNAKLEEDWENEECPLEHLLQRTERKKAPKRKLQDDEEQVIRAKKQNKKAEVPEKEELDVKPFAEEAGLEGQVEGADAAEVVLNPEVEDSLSAAVDVSHEDDTVAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.46
3 0.4
4 0.37
5 0.35
6 0.29
7 0.34
8 0.29
9 0.3
10 0.31
11 0.33
12 0.35
13 0.39
14 0.41
15 0.37
16 0.41
17 0.38
18 0.36
19 0.33
20 0.3
21 0.26
22 0.24
23 0.18
24 0.14
25 0.15
26 0.15
27 0.16
28 0.12
29 0.15
30 0.15
31 0.17
32 0.17
33 0.18
34 0.18
35 0.16
36 0.19
37 0.16
38 0.16
39 0.14
40 0.15
41 0.13
42 0.17
43 0.17
44 0.14
45 0.17
46 0.19
47 0.2
48 0.2
49 0.21
50 0.21
51 0.23
52 0.24
53 0.2
54 0.2
55 0.2
56 0.2
57 0.17
58 0.13
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.1
65 0.11
66 0.11
67 0.14
68 0.14
69 0.18
70 0.21
71 0.24
72 0.31
73 0.31
74 0.34
75 0.37
76 0.39
77 0.35
78 0.32
79 0.29
80 0.2
81 0.22
82 0.19
83 0.14
84 0.11
85 0.16
86 0.19
87 0.2
88 0.25
89 0.29
90 0.34
91 0.42
92 0.5
93 0.56
94 0.64
95 0.73
96 0.8
97 0.84
98 0.88
99 0.87
100 0.86
101 0.8
102 0.78
103 0.75
104 0.65
105 0.56
106 0.48
107 0.46
108 0.41
109 0.37
110 0.31
111 0.27
112 0.28
113 0.27
114 0.25
115 0.22
116 0.23
117 0.22
118 0.24
119 0.2
120 0.19
121 0.2
122 0.2
123 0.18
124 0.15
125 0.14
126 0.1
127 0.1
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.14
136 0.11
137 0.13
138 0.18
139 0.25
140 0.26
141 0.28
142 0.29
143 0.27
144 0.29
145 0.32
146 0.31
147 0.27
148 0.32
149 0.32
150 0.32
151 0.34
152 0.32
153 0.27
154 0.24
155 0.23
156 0.17
157 0.17
158 0.14
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.11
163 0.09
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.06
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.11
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.14
212 0.14
213 0.18
214 0.17
215 0.18
216 0.22
217 0.21
218 0.2
219 0.2
220 0.19
221 0.17
222 0.14
223 0.13
224 0.18
225 0.18
226 0.18
227 0.19
228 0.2
229 0.19
230 0.2
231 0.23
232 0.14
233 0.14
234 0.14
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.09
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.07
245 0.07
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.1
251 0.12
252 0.09
253 0.16
254 0.16
255 0.17
256 0.17
257 0.18
258 0.18
259 0.19
260 0.19
261 0.13
262 0.11
263 0.1
264 0.11
265 0.11
266 0.13
267 0.19
268 0.24
269 0.25
270 0.3
271 0.31
272 0.33
273 0.37
274 0.4
275 0.33
276 0.33
277 0.33
278 0.28
279 0.27
280 0.24
281 0.19
282 0.14
283 0.14
284 0.12
285 0.09
286 0.1
287 0.12
288 0.12
289 0.11
290 0.11
291 0.1
292 0.08
293 0.09
294 0.08
295 0.06
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.07
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.12
312 0.12
313 0.09
314 0.09
315 0.08
316 0.09
317 0.1
318 0.09
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.11
326 0.12
327 0.12
328 0.13
329 0.13
330 0.13
331 0.14
332 0.14
333 0.07
334 0.06
335 0.08
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.18
340 0.18
341 0.19
342 0.21
343 0.21
344 0.18
345 0.18
346 0.22
347 0.19
348 0.25
349 0.3
350 0.32
351 0.31
352 0.29
353 0.34
354 0.31
355 0.32
356 0.32
357 0.33
358 0.38
359 0.42
360 0.45
361 0.44
362 0.5
363 0.51
364 0.46
365 0.46
366 0.39
367 0.37
368 0.36
369 0.34
370 0.27
371 0.23
372 0.23
373 0.17
374 0.18
375 0.15
376 0.16
377 0.17
378 0.17
379 0.17
380 0.18
381 0.18
382 0.17
383 0.18
384 0.25
385 0.24
386 0.24
387 0.23
388 0.21
389 0.24
390 0.29
391 0.3
392 0.24
393 0.29
394 0.36
395 0.44
396 0.49
397 0.54
398 0.56
399 0.58
400 0.65
401 0.69
402 0.7
403 0.73
404 0.74
405 0.71
406 0.65
407 0.64
408 0.56
409 0.47
410 0.42
411 0.33
412 0.27
413 0.22
414 0.21
415 0.18
416 0.17
417 0.16
418 0.14
419 0.14
420 0.17
421 0.21
422 0.28
423 0.37
424 0.4
425 0.46
426 0.5
427 0.59
428 0.66
429 0.73
430 0.76
431 0.77
432 0.82
433 0.86
434 0.89
435 0.86
436 0.85
437 0.83
438 0.78
439 0.7
440 0.63
441 0.55
442 0.48
443 0.44
444 0.41
445 0.42
446 0.44
447 0.51
448 0.59
449 0.64
450 0.71
451 0.78
452 0.82
453 0.82
454 0.81
455 0.78
456 0.7
457 0.64
458 0.59
459 0.49
460 0.43
461 0.36
462 0.28
463 0.22
464 0.2
465 0.18
466 0.14
467 0.13
468 0.11
469 0.12
470 0.12
471 0.11
472 0.11
473 0.11
474 0.1
475 0.11
476 0.08
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.05
482 0.05
483 0.06
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.08
488 0.08
489 0.07
490 0.08
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.07
498 0.08
499 0.09
500 0.09
501 0.09