Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R8BR47

Protein Details
Accession R8BR47    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-36ASKAGKKAPKNPLIEKRPRNFHydrophilic
238-261GIMGAKAQKKTEKKKKALESAIKVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-34KSGKKAAPAPFPASKAGKKAPKNPLIEKRPR
107-124KKERLLKEATAIKEGKKK
239-254IMGAKAQKKTEKKKKA
Subcellular Location(s) cyto 10.5, nucl 10, cyto_mito 9, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029064  L30e-like  
IPR001921  Ribosomal_L7A/L8  
IPR004038  Ribosomal_L7Ae/L30e/S12e/Gad45  
IPR018492  Ribosomal_L7Ae/L8/Nhp2  
IPR004037  Ribosomal_L7Ae_CS  
Gene Ontology GO:0022625  C:cytosolic large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG tmn:UCRPA7_2716  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01248  Ribosomal_L7Ae  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01082  RIBOSOMAL_L7AE  
Amino Acid Sequences MPPKSGKKAAPAPFPASKAGKKAPKNPLIEKRPRNFGIGQDIQPRRNLSRMVKWPEYIRLQRQKKILNLRLKVPPAISQFQHVLDKNTAAQAFKLLNKYRPETKTEKKERLLKEATAIKEGKKKEDVSKKPYVAKYGLNHVVGLIENKKASLVLIPNDVDPIELVIFLPALCRKMGVPYAIIKGKARLGTVVHKKTAAVLALTEVRSEDKSELSKLVSAIKDGYLAESEGARKHWGGGIMGAKAQKKTEKKKKALESAIKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.58
3 0.54
4 0.5
5 0.48
6 0.51
7 0.53
8 0.56
9 0.64
10 0.68
11 0.7
12 0.74
13 0.77
14 0.79
15 0.8
16 0.83
17 0.83
18 0.79
19 0.8
20 0.74
21 0.69
22 0.6
23 0.55
24 0.54
25 0.49
26 0.47
27 0.48
28 0.51
29 0.48
30 0.5
31 0.49
32 0.42
33 0.4
34 0.43
35 0.39
36 0.44
37 0.52
38 0.56
39 0.56
40 0.56
41 0.54
42 0.55
43 0.57
44 0.54
45 0.55
46 0.57
47 0.6
48 0.63
49 0.67
50 0.66
51 0.66
52 0.7
53 0.68
54 0.67
55 0.64
56 0.64
57 0.64
58 0.6
59 0.54
60 0.44
61 0.41
62 0.37
63 0.37
64 0.32
65 0.28
66 0.28
67 0.28
68 0.32
69 0.27
70 0.25
71 0.22
72 0.23
73 0.2
74 0.22
75 0.2
76 0.15
77 0.14
78 0.13
79 0.14
80 0.16
81 0.22
82 0.22
83 0.27
84 0.31
85 0.35
86 0.4
87 0.4
88 0.44
89 0.45
90 0.51
91 0.56
92 0.61
93 0.65
94 0.63
95 0.7
96 0.66
97 0.66
98 0.61
99 0.5
100 0.47
101 0.45
102 0.4
103 0.36
104 0.34
105 0.28
106 0.31
107 0.31
108 0.29
109 0.27
110 0.29
111 0.33
112 0.43
113 0.47
114 0.49
115 0.56
116 0.56
117 0.57
118 0.56
119 0.51
120 0.43
121 0.4
122 0.34
123 0.33
124 0.34
125 0.28
126 0.26
127 0.23
128 0.21
129 0.16
130 0.17
131 0.11
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.08
139 0.09
140 0.09
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.13
146 0.1
147 0.08
148 0.07
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.11
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.16
166 0.21
167 0.22
168 0.24
169 0.21
170 0.21
171 0.24
172 0.23
173 0.21
174 0.18
175 0.19
176 0.27
177 0.36
178 0.38
179 0.36
180 0.35
181 0.34
182 0.34
183 0.34
184 0.25
185 0.16
186 0.12
187 0.13
188 0.16
189 0.16
190 0.15
191 0.12
192 0.13
193 0.14
194 0.15
195 0.14
196 0.14
197 0.16
198 0.18
199 0.19
200 0.18
201 0.2
202 0.19
203 0.24
204 0.21
205 0.2
206 0.19
207 0.18
208 0.18
209 0.16
210 0.17
211 0.12
212 0.12
213 0.11
214 0.12
215 0.13
216 0.13
217 0.15
218 0.16
219 0.15
220 0.16
221 0.18
222 0.18
223 0.17
224 0.21
225 0.23
226 0.21
227 0.24
228 0.27
229 0.27
230 0.27
231 0.3
232 0.34
233 0.41
234 0.51
235 0.6
236 0.66
237 0.73
238 0.81
239 0.87
240 0.89
241 0.9