FuNGI

R8BDT9

Protein Details

Accession

R8BDT9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
408-440	PDVVLVKKHWPRKNKHKNRKWRLKRMAKDEGEL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
414-435	KKHWPRKNKHKNRKWRLKRMAK

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport
KEGG	tmn:UCRPA7_7067 -
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MASSMDLDAPISIAPSAGTAQTGATILCCNCGAPIDGTTAAGALCYDCVKLTVDISQGIQREAVLNFCRDCDRWLLPPSSWVAAAPESRELLALCLKKLKGLHKIRIVDASFVWTEPHSRRVKVKLTVQDSVSDGVLLQQSFEVVYIVAYQQCPECAKSYTANVWRASVQVRQKVLHKRTFLFLEQLILKHGAHRETLNIKEAKDGIDFFFSARNQAEKFVDFLTSVVPVKVKKSQELISQDIHTSVKSYKFTYSVELVPICKDDLVALPIKLAKQLGNISPLVLCHRIGTSVNFLDPNTLQTADLSSPIYWRAPFVSLADAKELVEFIVLDSEPTGPSKGRWLVSEVTVARAVDLGVNDKTYSVRTHLGHFLNAGDSVMGYMLTGTNFNNPQFEDIEESNTYGSRIPDVVLVKKHWPRKNKHKNRKWRLKRMAKDEGELLPKKSDQERMDNEYELFLRDVEEDEELRAALALYKNTNKKKLQQQAAGMDVDNMSIAGTEVTEDDDGPKVNMDELLEDFDELTVEDHEME

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.06
2	0.07
3	0.08
4	0.08
5	0.08
6	0.08
7	0.08
8	0.09
9	0.09
10	0.08
11	0.08
12	0.11
13	0.11
14	0.13
15	0.13
16	0.12
17	0.12
18	0.13
19	0.15
20	0.13
21	0.14
22	0.16
23	0.16
24	0.16
25	0.15
26	0.14
27	0.12
28	0.1
29	0.08
30	0.05
31	0.06
32	0.06
33	0.07
34	0.07
35	0.08
36	0.1
37	0.11
38	0.12
39	0.14
40	0.15
41	0.16
42	0.18
43	0.21
44	0.2
45	0.2
46	0.19
47	0.16
48	0.17
49	0.16
50	0.2
51	0.18
52	0.21
53	0.2
54	0.22
55	0.25
56	0.23
57	0.25
58	0.25
59	0.26
60	0.3
61	0.35
62	0.36
63	0.33
64	0.36
65	0.37
66	0.32
67	0.28
68	0.22
69	0.19
70	0.19
71	0.2
72	0.18
73	0.17
74	0.17
75	0.17
76	0.17
77	0.15
78	0.14
79	0.19
80	0.19
81	0.18
82	0.23
83	0.23
84	0.25
85	0.3
86	0.35
87	0.39
88	0.46
89	0.54
90	0.56
91	0.6
92	0.59
93	0.61
94	0.55
95	0.47
96	0.38
97	0.34
98	0.26
99	0.22
100	0.21
101	0.14
102	0.18
103	0.18
104	0.27
105	0.27
106	0.3
107	0.36
108	0.42
109	0.5
110	0.51
111	0.57
112	0.57
113	0.59
114	0.6
115	0.55
116	0.49
117	0.43
118	0.37
119	0.29
120	0.2
121	0.14
122	0.11
123	0.13
124	0.1
125	0.09
126	0.08
127	0.08
128	0.08
129	0.08
130	0.06
131	0.04
132	0.04
133	0.05
134	0.06
135	0.07
136	0.07
137	0.08
138	0.08
139	0.1
140	0.12
141	0.12
142	0.14
143	0.15
144	0.17
145	0.19
146	0.22
147	0.27
148	0.32
149	0.36
150	0.34
151	0.33
152	0.32
153	0.31
154	0.3
155	0.29
156	0.29
157	0.29
158	0.31
159	0.32
160	0.39
161	0.47
162	0.53
163	0.53
164	0.51
165	0.47
166	0.48
167	0.49
168	0.43
169	0.36
170	0.29
171	0.26
172	0.23
173	0.21
174	0.19
175	0.17
176	0.15
177	0.15
178	0.18
179	0.15
180	0.15
181	0.15
182	0.18
183	0.21
184	0.23
185	0.26
186	0.26
187	0.24
188	0.25
189	0.26
190	0.23
191	0.19
192	0.19
193	0.13
194	0.13
195	0.13
196	0.11
197	0.14
198	0.13
199	0.14
200	0.13
201	0.15
202	0.14
203	0.16
204	0.17
205	0.14
206	0.15
207	0.13
208	0.13
209	0.11
210	0.11
211	0.09
212	0.09
213	0.09
214	0.08
215	0.09
216	0.09
217	0.11
218	0.17
219	0.18
220	0.19
221	0.22
222	0.25
223	0.3
224	0.34
225	0.35
226	0.31
227	0.3
228	0.28
229	0.26
230	0.23
231	0.16
232	0.13
233	0.12
234	0.14
235	0.14
236	0.16
237	0.16
238	0.17
239	0.18
240	0.19
241	0.19
242	0.17
243	0.17
244	0.16
245	0.15
246	0.14
247	0.14
248	0.11
249	0.08
250	0.07
251	0.06
252	0.06
253	0.07
254	0.08
255	0.08
256	0.08
257	0.09
258	0.09
259	0.1
260	0.09
261	0.08
262	0.09
263	0.12
264	0.12
265	0.14
266	0.14
267	0.13
268	0.13
269	0.13
270	0.13
271	0.12
272	0.11
273	0.09
274	0.09
275	0.1
276	0.1
277	0.11
278	0.12
279	0.12
280	0.12
281	0.12
282	0.12
283	0.13
284	0.12
285	0.12
286	0.1
287	0.1
288	0.09
289	0.09
290	0.1
291	0.09
292	0.1
293	0.09
294	0.08
295	0.08
296	0.09
297	0.1
298	0.09
299	0.09
300	0.1
301	0.1
302	0.1
303	0.11
304	0.14
305	0.15
306	0.15
307	0.16
308	0.15
309	0.14
310	0.13
311	0.12
312	0.07
313	0.06
314	0.05
315	0.04
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.06
320	0.06
321	0.07
322	0.07
323	0.09
324	0.07
325	0.08
326	0.14
327	0.17
328	0.18
329	0.18
330	0.21
331	0.22
332	0.23
333	0.28
334	0.22
335	0.21
336	0.21
337	0.19
338	0.16
339	0.14
340	0.13
341	0.09
342	0.09
343	0.1
344	0.09
345	0.1
346	0.09
347	0.1
348	0.1
349	0.11
350	0.12
351	0.12
352	0.17
353	0.17
354	0.21
355	0.28
356	0.28
357	0.27
358	0.26
359	0.24
360	0.19
361	0.18
362	0.15
363	0.08
364	0.06
365	0.06
366	0.05
367	0.04
368	0.03
369	0.03
370	0.04
371	0.04
372	0.05
373	0.06
374	0.1
375	0.13
376	0.14
377	0.15
378	0.15
379	0.17
380	0.17
381	0.17
382	0.18
383	0.16
384	0.2
385	0.19
386	0.19
387	0.17
388	0.16
389	0.16
390	0.13
391	0.13
392	0.1
393	0.1
394	0.1
395	0.14
396	0.17
397	0.21
398	0.23
399	0.25
400	0.32
401	0.39
402	0.48
403	0.5
404	0.56
405	0.62
406	0.7
407	0.79
408	0.82
409	0.87
410	0.88
411	0.93
412	0.95
413	0.96
414	0.96
415	0.96
416	0.96
417	0.95
418	0.94
419	0.92
420	0.91
421	0.82
422	0.74
423	0.66
424	0.6
425	0.58
426	0.51
427	0.43
428	0.36
429	0.34
430	0.35
431	0.35
432	0.38
433	0.34
434	0.41
435	0.46
436	0.5
437	0.52
438	0.5
439	0.46
440	0.4
441	0.37
442	0.29
443	0.23
444	0.15
445	0.13
446	0.12
447	0.13
448	0.12
449	0.13
450	0.12
451	0.12
452	0.13
453	0.12
454	0.11
455	0.09
456	0.08
457	0.1
458	0.12
459	0.14
460	0.19
461	0.27
462	0.36
463	0.43
464	0.52
465	0.53
466	0.6
467	0.68
468	0.73
469	0.75
470	0.73
471	0.74
472	0.71
473	0.7
474	0.62
475	0.52
476	0.43
477	0.33
478	0.25
479	0.17
480	0.11
481	0.07
482	0.06
483	0.06
484	0.04
485	0.04
486	0.05
487	0.05
488	0.07
489	0.08
490	0.08
491	0.1
492	0.12
493	0.13
494	0.13
495	0.14
496	0.12
497	0.13
498	0.14
499	0.13
500	0.14
501	0.14
502	0.18
503	0.16
504	0.16
505	0.15
506	0.13
507	0.13
508	0.11
509	0.11
510	0.08

R8BDT9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer