Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R8BTD8

Protein Details
Accession R8BTD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
151-171GPPFERRRREHEEYRKKRDEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-10RRKA
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018545  Btz_dom  
IPR044796  MLN51_plant  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0035145  C:exon-exon junction complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0006417  P:regulation of translation  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG tmn:UCRPA7_1869  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09405  Btz  
Amino Acid Sequences MAALPRRRKAFGHRRRVEDEGEDEGGPEALDVDDDSLTEGSVISDDNDAADDSDTSNVDEASPTSPNISKAAANGAPKSGGRHQNGGASSAAAQPSQSTITDTELMLNGLHISNQPGSTEELQFDDAVRSPSKAAAPIVVSSSSAPQPQDGPPFERRRREHEEYRKKRDEDPAFVPNRGAFFMHDHRHAGPSANGFRPFGRARRGGRGGMGGPFAPINQFHNSTDPTTNAPWAHDMHEAVAEPNFVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.76
3 0.75
4 0.68
5 0.62
6 0.55
7 0.48
8 0.43
9 0.35
10 0.29
11 0.26
12 0.21
13 0.16
14 0.12
15 0.07
16 0.05
17 0.05
18 0.05
19 0.06
20 0.06
21 0.06
22 0.07
23 0.07
24 0.07
25 0.06
26 0.06
27 0.05
28 0.05
29 0.06
30 0.05
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.08
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.07
46 0.08
47 0.08
48 0.09
49 0.1
50 0.09
51 0.12
52 0.13
53 0.15
54 0.16
55 0.16
56 0.14
57 0.14
58 0.19
59 0.19
60 0.2
61 0.19
62 0.19
63 0.19
64 0.18
65 0.22
66 0.24
67 0.29
68 0.29
69 0.32
70 0.32
71 0.35
72 0.35
73 0.33
74 0.26
75 0.18
76 0.17
77 0.15
78 0.15
79 0.1
80 0.09
81 0.07
82 0.08
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.1
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.1
93 0.08
94 0.08
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.1
105 0.11
106 0.12
107 0.1
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.1
112 0.08
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.11
135 0.13
136 0.19
137 0.19
138 0.23
139 0.3
140 0.39
141 0.44
142 0.51
143 0.52
144 0.54
145 0.62
146 0.65
147 0.68
148 0.69
149 0.75
150 0.76
151 0.84
152 0.84
153 0.77
154 0.74
155 0.73
156 0.68
157 0.63
158 0.59
159 0.58
160 0.52
161 0.5
162 0.46
163 0.37
164 0.32
165 0.26
166 0.21
167 0.13
168 0.16
169 0.23
170 0.26
171 0.27
172 0.28
173 0.28
174 0.3
175 0.29
176 0.26
177 0.22
178 0.25
179 0.28
180 0.3
181 0.31
182 0.3
183 0.3
184 0.34
185 0.35
186 0.33
187 0.35
188 0.38
189 0.41
190 0.49
191 0.53
192 0.48
193 0.46
194 0.45
195 0.4
196 0.34
197 0.31
198 0.22
199 0.18
200 0.17
201 0.15
202 0.13
203 0.12
204 0.14
205 0.16
206 0.19
207 0.2
208 0.24
209 0.27
210 0.29
211 0.31
212 0.29
213 0.29
214 0.28
215 0.31
216 0.27
217 0.26
218 0.26
219 0.25
220 0.26
221 0.25
222 0.24
223 0.21
224 0.22
225 0.21
226 0.19
227 0.18