Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R8BEN1

Protein Details
Accession R8BEN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-34SAVEAKASKRKRSATKEPPKKRARSESSEENDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-26KASKRKRSATKEPPKKRAR
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 4.5, cyto_mito 3.5, cyto 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG tmn:UCRPA7_6728  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MPSAVEAKASKRKRSATKEPPKKRARSESSEENDPQAEILLLENAIFESKKNYNNITTLIEISQNHNGGAELALVAAVSLCRVFIKLLASGNLLRKKDSPEKEIVLVHWLRDRLAEYKTALLSMFDKEELATSALTVSMRLLKAEGQYLSEKDDITFPRVFLSQIVSSIMQPGVDDAVRKEYLEKFVDEFDDVRFYTFKAVTDLLASNDAETLDEALIGNVFDFLSSIEGVPASNEELGEFYVDTIKKKKGNPLFSISQHKKQAQEAWLALMSLGLTKDQKKSILDIMSKVVAPWFTKPELLMDFLTDCYNTGGSMSLLALSGVFYLIQERNLDYPLFYTKLYSLLDADILHSKHRSRFFRLLDTFLESSHLPAVLVASFIKRLARLSLNAPPSAIVTLIPWFYNLFKKHPLCTFMLHREPRTKEEKDTIVSEGLEDPFLPNEEDPMETHAIDSCLWEIVQLQSHYHPNVATITKIMSEQFTKQIYNLEDFLDHSYGSLLEAEMVKDVKKAPVIEFQIPKRVLLPQEPDSGVADNLLVKLWNFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.8
3 0.81
4 0.85
5 0.88
6 0.91
7 0.93
8 0.92
9 0.91
10 0.9
11 0.9
12 0.88
13 0.85
14 0.83
15 0.83
16 0.79
17 0.78
18 0.69
19 0.61
20 0.53
21 0.44
22 0.36
23 0.25
24 0.19
25 0.11
26 0.1
27 0.08
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.13
36 0.18
37 0.24
38 0.28
39 0.32
40 0.35
41 0.37
42 0.4
43 0.37
44 0.34
45 0.3
46 0.27
47 0.27
48 0.24
49 0.26
50 0.28
51 0.25
52 0.23
53 0.22
54 0.21
55 0.17
56 0.16
57 0.13
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.05
62 0.05
63 0.04
64 0.03
65 0.03
66 0.03
67 0.04
68 0.04
69 0.05
70 0.06
71 0.08
72 0.1
73 0.13
74 0.15
75 0.16
76 0.18
77 0.22
78 0.29
79 0.34
80 0.33
81 0.32
82 0.33
83 0.39
84 0.47
85 0.49
86 0.47
87 0.47
88 0.49
89 0.5
90 0.49
91 0.42
92 0.4
93 0.35
94 0.31
95 0.28
96 0.25
97 0.22
98 0.22
99 0.24
100 0.19
101 0.2
102 0.21
103 0.19
104 0.22
105 0.22
106 0.21
107 0.18
108 0.16
109 0.16
110 0.15
111 0.15
112 0.11
113 0.11
114 0.1
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.09
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.14
131 0.17
132 0.17
133 0.15
134 0.17
135 0.18
136 0.2
137 0.19
138 0.18
139 0.15
140 0.2
141 0.19
142 0.21
143 0.22
144 0.18
145 0.19
146 0.19
147 0.19
148 0.15
149 0.17
150 0.13
151 0.13
152 0.15
153 0.14
154 0.13
155 0.15
156 0.14
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.15
168 0.16
169 0.21
170 0.22
171 0.23
172 0.19
173 0.2
174 0.21
175 0.19
176 0.17
177 0.12
178 0.13
179 0.12
180 0.12
181 0.11
182 0.1
183 0.13
184 0.14
185 0.13
186 0.13
187 0.14
188 0.13
189 0.15
190 0.15
191 0.12
192 0.13
193 0.12
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.04
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.08
230 0.09
231 0.11
232 0.14
233 0.18
234 0.22
235 0.25
236 0.33
237 0.37
238 0.43
239 0.46
240 0.49
241 0.49
242 0.48
243 0.57
244 0.52
245 0.51
246 0.49
247 0.47
248 0.43
249 0.41
250 0.42
251 0.35
252 0.34
253 0.28
254 0.24
255 0.22
256 0.2
257 0.17
258 0.11
259 0.08
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.06
264 0.08
265 0.1
266 0.12
267 0.14
268 0.14
269 0.16
270 0.2
271 0.23
272 0.22
273 0.21
274 0.22
275 0.21
276 0.2
277 0.18
278 0.14
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.13
286 0.14
287 0.14
288 0.15
289 0.13
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.09
295 0.08
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.03
309 0.04
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.06
314 0.06
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.1
319 0.12
320 0.12
321 0.09
322 0.1
323 0.12
324 0.13
325 0.11
326 0.12
327 0.11
328 0.14
329 0.14
330 0.13
331 0.11
332 0.1
333 0.11
334 0.1
335 0.11
336 0.12
337 0.12
338 0.13
339 0.15
340 0.17
341 0.22
342 0.3
343 0.33
344 0.37
345 0.45
346 0.47
347 0.54
348 0.54
349 0.52
350 0.45
351 0.46
352 0.38
353 0.3
354 0.28
355 0.18
356 0.17
357 0.14
358 0.13
359 0.08
360 0.07
361 0.08
362 0.06
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.08
368 0.09
369 0.08
370 0.09
371 0.13
372 0.15
373 0.16
374 0.2
375 0.26
376 0.28
377 0.28
378 0.27
379 0.23
380 0.22
381 0.2
382 0.16
383 0.09
384 0.07
385 0.08
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.11
391 0.18
392 0.2
393 0.22
394 0.3
395 0.33
396 0.37
397 0.41
398 0.43
399 0.38
400 0.41
401 0.44
402 0.44
403 0.5
404 0.51
405 0.51
406 0.56
407 0.57
408 0.58
409 0.58
410 0.53
411 0.49
412 0.51
413 0.51
414 0.45
415 0.44
416 0.4
417 0.34
418 0.31
419 0.27
420 0.22
421 0.18
422 0.15
423 0.13
424 0.11
425 0.1
426 0.11
427 0.12
428 0.09
429 0.1
430 0.11
431 0.12
432 0.12
433 0.15
434 0.16
435 0.15
436 0.15
437 0.15
438 0.15
439 0.14
440 0.15
441 0.11
442 0.1
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.1
447 0.16
448 0.16
449 0.17
450 0.2
451 0.25
452 0.26
453 0.26
454 0.23
455 0.19
456 0.23
457 0.23
458 0.2
459 0.16
460 0.16
461 0.16
462 0.17
463 0.16
464 0.15
465 0.17
466 0.19
467 0.24
468 0.25
469 0.25
470 0.25
471 0.3
472 0.3
473 0.3
474 0.28
475 0.24
476 0.22
477 0.22
478 0.25
479 0.2
480 0.17
481 0.14
482 0.13
483 0.12
484 0.12
485 0.11
486 0.07
487 0.08
488 0.09
489 0.1
490 0.11
491 0.12
492 0.12
493 0.13
494 0.15
495 0.17
496 0.2
497 0.23
498 0.24
499 0.32
500 0.37
501 0.43
502 0.49
503 0.49
504 0.55
505 0.53
506 0.5
507 0.43
508 0.43
509 0.39
510 0.39
511 0.43
512 0.38
513 0.44
514 0.44
515 0.44
516 0.4
517 0.37
518 0.29
519 0.23
520 0.18
521 0.13
522 0.12
523 0.12
524 0.1