Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R8BPU4

Protein Details
Accession R8BPU4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
209-230ADKIDKKTTQARPPRERRERGPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
144-172RRRQSTRGRGAKRGRGGAGRTRGGRDEKK
220-228RPPRERRER
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 13, nucl 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG tmn:UCRPA7_2992  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSAIAEKVADAVNDVTNALSNTSITGKAADDKSAANDAVLASAAEGRRLYIGNLAYATTEGELKDFFKGYLVESVSIPKNPRTDRPVGYAFVDLSTPSEAERAIAELSGKEILERKVSVQLARKPEPNAEKTEGTNGEGAEGTRRRQSTRGRGAKRGRGGAGRTRGGRDEKKEEGATTEAVAAPAAPAEVAATTEVQPLQDITNKDVDADKIDKKTTQARPPRERRERGPPADGIPSKNKVMVANLPYDLTEEKLKELFAAYEPSTAKIALRPIPRFMIKKLQARGEPRKGRGFGFVTLASEELQQKAVEEMNGKEIEGREIAVKVAIDSPDKTDEEANAPEHIEGETNGTEEAAAAPTTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.11
4 0.12
5 0.11
6 0.09
7 0.08
8 0.1
9 0.12
10 0.12
11 0.11
12 0.12
13 0.13
14 0.19
15 0.2
16 0.2
17 0.19
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.23
22 0.16
23 0.16
24 0.14
25 0.14
26 0.13
27 0.09
28 0.06
29 0.1
30 0.1
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.12
35 0.13
36 0.13
37 0.15
38 0.15
39 0.15
40 0.16
41 0.15
42 0.14
43 0.14
44 0.14
45 0.09
46 0.1
47 0.08
48 0.08
49 0.09
50 0.1
51 0.11
52 0.12
53 0.11
54 0.12
55 0.12
56 0.13
57 0.18
58 0.18
59 0.17
60 0.17
61 0.22
62 0.22
63 0.25
64 0.26
65 0.24
66 0.3
67 0.32
68 0.39
69 0.41
70 0.46
71 0.46
72 0.5
73 0.49
74 0.44
75 0.42
76 0.37
77 0.3
78 0.24
79 0.2
80 0.14
81 0.11
82 0.1
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.08
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.11
99 0.12
100 0.14
101 0.15
102 0.15
103 0.2
104 0.22
105 0.25
106 0.29
107 0.34
108 0.39
109 0.42
110 0.44
111 0.4
112 0.45
113 0.48
114 0.43
115 0.43
116 0.4
117 0.38
118 0.35
119 0.39
120 0.33
121 0.27
122 0.25
123 0.19
124 0.16
125 0.14
126 0.14
127 0.14
128 0.15
129 0.15
130 0.18
131 0.19
132 0.2
133 0.27
134 0.35
135 0.4
136 0.49
137 0.58
138 0.58
139 0.66
140 0.71
141 0.72
142 0.68
143 0.61
144 0.52
145 0.46
146 0.45
147 0.42
148 0.41
149 0.37
150 0.34
151 0.32
152 0.33
153 0.35
154 0.37
155 0.35
156 0.35
157 0.33
158 0.36
159 0.35
160 0.32
161 0.27
162 0.24
163 0.19
164 0.14
165 0.12
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.06
170 0.04
171 0.04
172 0.03
173 0.02
174 0.02
175 0.02
176 0.02
177 0.03
178 0.03
179 0.04
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.1
188 0.11
189 0.12
190 0.15
191 0.15
192 0.16
193 0.16
194 0.15
195 0.14
196 0.17
197 0.19
198 0.18
199 0.19
200 0.19
201 0.21
202 0.3
203 0.34
204 0.4
205 0.46
206 0.53
207 0.63
208 0.73
209 0.81
210 0.82
211 0.81
212 0.77
213 0.79
214 0.79
215 0.73
216 0.67
217 0.58
218 0.5
219 0.53
220 0.49
221 0.42
222 0.37
223 0.35
224 0.32
225 0.31
226 0.3
227 0.22
228 0.23
229 0.25
230 0.22
231 0.22
232 0.22
233 0.2
234 0.19
235 0.2
236 0.17
237 0.13
238 0.14
239 0.12
240 0.13
241 0.13
242 0.13
243 0.12
244 0.13
245 0.12
246 0.1
247 0.14
248 0.13
249 0.17
250 0.17
251 0.18
252 0.18
253 0.17
254 0.16
255 0.15
256 0.19
257 0.21
258 0.28
259 0.29
260 0.31
261 0.36
262 0.41
263 0.41
264 0.41
265 0.45
266 0.45
267 0.51
268 0.53
269 0.55
270 0.56
271 0.62
272 0.69
273 0.69
274 0.69
275 0.67
276 0.7
277 0.65
278 0.6
279 0.58
280 0.51
281 0.42
282 0.38
283 0.33
284 0.26
285 0.25
286 0.24
287 0.17
288 0.17
289 0.17
290 0.13
291 0.14
292 0.13
293 0.13
294 0.14
295 0.14
296 0.13
297 0.15
298 0.15
299 0.2
300 0.2
301 0.19
302 0.21
303 0.2
304 0.21
305 0.18
306 0.18
307 0.14
308 0.14
309 0.15
310 0.13
311 0.13
312 0.11
313 0.14
314 0.15
315 0.16
316 0.17
317 0.2
318 0.23
319 0.24
320 0.24
321 0.23
322 0.23
323 0.25
324 0.27
325 0.25
326 0.22
327 0.22
328 0.2
329 0.19
330 0.17
331 0.14
332 0.11
333 0.14
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.12
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.08