Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R8BJH0

Protein Details
Accession R8BJH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-121WLINKPKSGSSKKKGKKEDGDVDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-114KPKSGSSKKKGKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 15, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000232  HSF_DNA-bd  
IPR027725  HSF_fam  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
KEGG tmn:UCRPA7_5135  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00447  HSF_DNA-bind  
Amino Acid Sequences MTNKNSFLDESKNTDLIRWSDKGDSFIVLDEDEFAKTLIPELFKHNNYASFVRQLNMYGFHKRVGLSDNSMKASERKNKSPSEYYNPYFKRGHPNLLWLINKPKSGSSKKKGKKEDGDVDSDEENIIEEIPTAPYGVPAPQPGRALPQADVGPLQRRELTAVREQISQLQQQQKNISNIIQRLRGEHNQMLQQAIMFQNMHDRHENSINAILNFLANVFRKSLEDQGGNQNVAELLASILPTSQIPQGSVLDLGDFHQQTPSPAAMSPGKRQQRLLPPIPGRANTVVSTPGSNAGTASYNPAHHAPMGQVTEIFDNSPADTTSPNQIKHDLQANPQESMMKLIHETNAGNSPAIDMPEVVANTNVTLSDDQRNGLLNAFGAQNATPSHTTPAPAIATSATSVPAIPSIPDGRQPSNSISPTLRQNVLPPSIDHLNFNAEQLEELARLTEQSAKGIHDLQASLTPLSPSGRIPGLDADGNTDGSYFQDNGDLDYNDYLNNYLPGDDIGLFGGADPLGAPDGSDMFGTPPLGYAQDPGQAPGIDADGLPAQVENNTPSPTPTEEITRDDMESPVRDLKRQRRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.4
3 0.37
4 0.39
5 0.33
6 0.32
7 0.34
8 0.36
9 0.37
10 0.33
11 0.3
12 0.24
13 0.24
14 0.22
15 0.16
16 0.14
17 0.13
18 0.13
19 0.12
20 0.11
21 0.1
22 0.1
23 0.09
24 0.13
25 0.14
26 0.15
27 0.16
28 0.24
29 0.32
30 0.32
31 0.37
32 0.37
33 0.38
34 0.4
35 0.42
36 0.38
37 0.36
38 0.36
39 0.32
40 0.3
41 0.28
42 0.26
43 0.29
44 0.29
45 0.29
46 0.29
47 0.29
48 0.31
49 0.29
50 0.29
51 0.28
52 0.28
53 0.29
54 0.34
55 0.37
56 0.37
57 0.37
58 0.36
59 0.36
60 0.41
61 0.44
62 0.45
63 0.49
64 0.55
65 0.6
66 0.66
67 0.7
68 0.69
69 0.68
70 0.7
71 0.64
72 0.68
73 0.63
74 0.61
75 0.55
76 0.52
77 0.53
78 0.49
79 0.55
80 0.46
81 0.51
82 0.51
83 0.55
84 0.53
85 0.46
86 0.5
87 0.45
88 0.45
89 0.4
90 0.39
91 0.41
92 0.49
93 0.56
94 0.57
95 0.64
96 0.7
97 0.79
98 0.83
99 0.84
100 0.84
101 0.83
102 0.84
103 0.77
104 0.74
105 0.66
106 0.59
107 0.49
108 0.4
109 0.3
110 0.19
111 0.15
112 0.1
113 0.08
114 0.05
115 0.05
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.1
124 0.1
125 0.14
126 0.16
127 0.18
128 0.2
129 0.2
130 0.24
131 0.25
132 0.26
133 0.22
134 0.24
135 0.22
136 0.21
137 0.22
138 0.19
139 0.24
140 0.23
141 0.23
142 0.2
143 0.2
144 0.24
145 0.25
146 0.28
147 0.27
148 0.31
149 0.32
150 0.32
151 0.32
152 0.34
153 0.33
154 0.32
155 0.32
156 0.37
157 0.37
158 0.39
159 0.45
160 0.45
161 0.45
162 0.43
163 0.4
164 0.35
165 0.38
166 0.37
167 0.37
168 0.31
169 0.32
170 0.36
171 0.36
172 0.37
173 0.35
174 0.35
175 0.33
176 0.34
177 0.3
178 0.24
179 0.2
180 0.17
181 0.15
182 0.13
183 0.1
184 0.09
185 0.16
186 0.17
187 0.2
188 0.21
189 0.22
190 0.23
191 0.28
192 0.28
193 0.22
194 0.25
195 0.25
196 0.21
197 0.2
198 0.17
199 0.12
200 0.12
201 0.1
202 0.09
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.1
207 0.11
208 0.13
209 0.17
210 0.18
211 0.18
212 0.2
213 0.27
214 0.29
215 0.27
216 0.25
217 0.21
218 0.17
219 0.16
220 0.13
221 0.06
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.09
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.07
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.11
247 0.13
248 0.12
249 0.08
250 0.08
251 0.11
252 0.15
253 0.18
254 0.21
255 0.27
256 0.32
257 0.33
258 0.34
259 0.38
260 0.43
261 0.48
262 0.48
263 0.48
264 0.45
265 0.5
266 0.5
267 0.44
268 0.37
269 0.31
270 0.28
271 0.2
272 0.19
273 0.15
274 0.13
275 0.13
276 0.1
277 0.11
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.11
288 0.12
289 0.11
290 0.1
291 0.11
292 0.09
293 0.11
294 0.11
295 0.1
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.07
302 0.06
303 0.06
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.08
309 0.14
310 0.18
311 0.19
312 0.2
313 0.22
314 0.23
315 0.25
316 0.3
317 0.25
318 0.25
319 0.32
320 0.32
321 0.3
322 0.29
323 0.28
324 0.2
325 0.22
326 0.19
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.12
332 0.12
333 0.1
334 0.14
335 0.14
336 0.13
337 0.12
338 0.13
339 0.12
340 0.12
341 0.11
342 0.06
343 0.06
344 0.08
345 0.09
346 0.07
347 0.07
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.06
352 0.05
353 0.06
354 0.08
355 0.12
356 0.13
357 0.13
358 0.14
359 0.15
360 0.14
361 0.14
362 0.12
363 0.08
364 0.09
365 0.09
366 0.08
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.13
375 0.13
376 0.14
377 0.13
378 0.16
379 0.14
380 0.13
381 0.13
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.1
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.06
393 0.08
394 0.1
395 0.11
396 0.16
397 0.2
398 0.22
399 0.24
400 0.26
401 0.28
402 0.33
403 0.33
404 0.31
405 0.29
406 0.3
407 0.33
408 0.35
409 0.32
410 0.25
411 0.28
412 0.31
413 0.33
414 0.3
415 0.25
416 0.26
417 0.29
418 0.3
419 0.27
420 0.22
421 0.24
422 0.22
423 0.22
424 0.18
425 0.13
426 0.13
427 0.13
428 0.13
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.07
433 0.07
434 0.08
435 0.12
436 0.11
437 0.13
438 0.15
439 0.15
440 0.17
441 0.19
442 0.21
443 0.17
444 0.17
445 0.16
446 0.18
447 0.19
448 0.17
449 0.16
450 0.14
451 0.13
452 0.15
453 0.14
454 0.11
455 0.13
456 0.15
457 0.14
458 0.15
459 0.16
460 0.17
461 0.18
462 0.17
463 0.18
464 0.18
465 0.18
466 0.16
467 0.14
468 0.11
469 0.11
470 0.13
471 0.1
472 0.09
473 0.13
474 0.13
475 0.15
476 0.18
477 0.18
478 0.17
479 0.18
480 0.18
481 0.14
482 0.14
483 0.13
484 0.1
485 0.11
486 0.1
487 0.09
488 0.09
489 0.09
490 0.1
491 0.1
492 0.09
493 0.08
494 0.08
495 0.08
496 0.07
497 0.08
498 0.06
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.05
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.08
511 0.09
512 0.1
513 0.1
514 0.1
515 0.1
516 0.12
517 0.11
518 0.12
519 0.13
520 0.17
521 0.18
522 0.18
523 0.2
524 0.19
525 0.19
526 0.18
527 0.17
528 0.12
529 0.11
530 0.12
531 0.1
532 0.1
533 0.09
534 0.08
535 0.08
536 0.09
537 0.11
538 0.13
539 0.15
540 0.17
541 0.18
542 0.19
543 0.22
544 0.24
545 0.25
546 0.23
547 0.27
548 0.28
549 0.32
550 0.36
551 0.34
552 0.33
553 0.32
554 0.31
555 0.29
556 0.27
557 0.27
558 0.31
559 0.31
560 0.35
561 0.44