FuNGI

R8BL61

Protein Details

Accession

R8BL61

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-28	LTLFIRRKHLPTRHLNQQHPPQLL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 16, nucl 5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021605 CFIA_Pcf11_C IPR045154 PCF11-like
Gene Ontology	GO:0005849 C:mRNA cleavage factor complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000993 F:RNA polymerase II complex binding GO:0006379 P:mRNA cleavage GO:0006378 P:mRNA polyadenylation GO:0006369 P:termination of RNA polymerase II transcription
KEGG	tmn:UCRPA7_4457 -
Pfam	View protein in Pfam PF11526 CFIA_Pcf11

Amino Acid Sequences

MDNSLTLFIRRKHLPTRHLNQQHPPQLLHRINYHRMQLIDVSKADFARNPLDTSIQTRLKALLDLQKLLTSQNLPHDQLMLVKDRVTELAVAVKNQAPNSLTHAPTPPIAVQPYPPPQQVPVAAPVAPNPPASAPPAGVSLDSLFGKGALATLLARQTPTPQVSTPYMPPAAVAPIRSPTPQRVEPHKPTAPPPSDPMALLNMLRGAGILRGAPPAGGTPVNVTPVPPPPSAPPPIPPNLASILAAARGVVPPPPPQGGINSIELKASSLKLFRPHLLSLLYEDLGPPCTQCGRRFKTDDEGKKKKTAHMDWHFRVHQRIAEAERRGQHRSWYVDERDWINSREVIDTDHVETSEESKGGAASAASKAPKLKWIPVPDDGTNTVCPICQEKFEMKWLDEAQEWVWMDALRVGNRAYHASCYAEAYKDGGSTPLYSRNTPEPVLGKRKAEVSPGSFKKIKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.67
3	0.72
4	0.76
5	0.8
6	0.8
7	0.8
8	0.82
9	0.8
10	0.73
11	0.68
12	0.61
13	0.62
14	0.6
15	0.55
16	0.53
17	0.53
18	0.55
19	0.58
20	0.58
21	0.52
22	0.47
23	0.45
24	0.43
25	0.38
26	0.36
27	0.32
28	0.29
29	0.27
30	0.28
31	0.27
32	0.23
33	0.23
34	0.24
35	0.25
36	0.25
37	0.24
38	0.26
39	0.26
40	0.29
41	0.34
42	0.33
43	0.32
44	0.31
45	0.32
46	0.29
47	0.29
48	0.29
49	0.28
50	0.27
51	0.29
52	0.28
53	0.28
54	0.27
55	0.26
56	0.25
57	0.19
58	0.18
59	0.25
60	0.29
61	0.29
62	0.29
63	0.3
64	0.27
65	0.29
66	0.29
67	0.25
68	0.21
69	0.2
70	0.2
71	0.19
72	0.2
73	0.17
74	0.15
75	0.1
76	0.17
77	0.17
78	0.17
79	0.18
80	0.2
81	0.22
82	0.22
83	0.24
84	0.17
85	0.17
86	0.25
87	0.28
88	0.26
89	0.26
90	0.29
91	0.27
92	0.27
93	0.29
94	0.22
95	0.19
96	0.2
97	0.18
98	0.18
99	0.24
100	0.3
101	0.31
102	0.31
103	0.29
104	0.29
105	0.31
106	0.32
107	0.27
108	0.24
109	0.21
110	0.21
111	0.2
112	0.2
113	0.2
114	0.19
115	0.17
116	0.14
117	0.13
118	0.13
119	0.16
120	0.15
121	0.12
122	0.12
123	0.13
124	0.13
125	0.12
126	0.11
127	0.09
128	0.11
129	0.1
130	0.09
131	0.08
132	0.07
133	0.07
134	0.06
135	0.06
136	0.04
137	0.04
138	0.04
139	0.06
140	0.07
141	0.07
142	0.08
143	0.08
144	0.1
145	0.15
146	0.16
147	0.17
148	0.16
149	0.2
150	0.22
151	0.25
152	0.24
153	0.23
154	0.22
155	0.19
156	0.19
157	0.15
158	0.16
159	0.14
160	0.13
161	0.11
162	0.12
163	0.14
164	0.15
165	0.16
166	0.17
167	0.23
168	0.27
169	0.31
170	0.38
171	0.46
172	0.5
173	0.56
174	0.56
175	0.51
176	0.5
177	0.54
178	0.49
179	0.41
180	0.39
181	0.34
182	0.32
183	0.3
184	0.27
185	0.19
186	0.17
187	0.15
188	0.12
189	0.08
190	0.07
191	0.07
192	0.06
193	0.05
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.05
203	0.06
204	0.06
205	0.05
206	0.07
207	0.08
208	0.1
209	0.1
210	0.1
211	0.1
212	0.15
213	0.19
214	0.17
215	0.18
216	0.18
217	0.23
218	0.25
219	0.24
220	0.23
221	0.23
222	0.25
223	0.26
224	0.24
225	0.22
226	0.2
227	0.2
228	0.17
229	0.13
230	0.1
231	0.09
232	0.08
233	0.06
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.06
238	0.07
239	0.09
240	0.11
241	0.12
242	0.12
243	0.12
244	0.14
245	0.16
246	0.17
247	0.19
248	0.18
249	0.18
250	0.17
251	0.16
252	0.15
253	0.13
254	0.11
255	0.09
256	0.09
257	0.11
258	0.16
259	0.19
260	0.2
261	0.23
262	0.22
263	0.23
264	0.22
265	0.21
266	0.17
267	0.17
268	0.15
269	0.11
270	0.11
271	0.1
272	0.1
273	0.1
274	0.08
275	0.07
276	0.11
277	0.15
278	0.21
279	0.3
280	0.35
281	0.42
282	0.45
283	0.47
284	0.53
285	0.59
286	0.63
287	0.63
288	0.67
289	0.64
290	0.68
291	0.67
292	0.62
293	0.62
294	0.58
295	0.59
296	0.6
297	0.66
298	0.62
299	0.68
300	0.66
301	0.59
302	0.56
303	0.47
304	0.39
305	0.3
306	0.31
307	0.29
308	0.32
309	0.33
310	0.34
311	0.37
312	0.39
313	0.41
314	0.38
315	0.38
316	0.37
317	0.39
318	0.41
319	0.42
320	0.43
321	0.42
322	0.44
323	0.41
324	0.4
325	0.39
326	0.35
327	0.29
328	0.27
329	0.25
330	0.24
331	0.22
332	0.19
333	0.18
334	0.18
335	0.18
336	0.17
337	0.16
338	0.15
339	0.15
340	0.15
341	0.15
342	0.13
343	0.11
344	0.1
345	0.1
346	0.09
347	0.09
348	0.07
349	0.07
350	0.08
351	0.12
352	0.12
353	0.14
354	0.17
355	0.17
356	0.25
357	0.26
358	0.32
359	0.36
360	0.43
361	0.47
362	0.5
363	0.55
364	0.49
365	0.49
366	0.44
367	0.39
368	0.33
369	0.29
370	0.23
371	0.17
372	0.17
373	0.18
374	0.17
375	0.17
376	0.21
377	0.24
378	0.27
379	0.34
380	0.37
381	0.33
382	0.38
383	0.37
384	0.35
385	0.31
386	0.3
387	0.23
388	0.25
389	0.25
390	0.18
391	0.18
392	0.16
393	0.15
394	0.18
395	0.21
396	0.16
397	0.18
398	0.18
399	0.19
400	0.21
401	0.25
402	0.22
403	0.21
404	0.22
405	0.23
406	0.24
407	0.26
408	0.27
409	0.24
410	0.24
411	0.22
412	0.21
413	0.19
414	0.19
415	0.16
416	0.14
417	0.15
418	0.17
419	0.24
420	0.27
421	0.27
422	0.31
423	0.36
424	0.4
425	0.38
426	0.41
427	0.38
428	0.44
429	0.52
430	0.53
431	0.49
432	0.47
433	0.52
434	0.49
435	0.49
436	0.47
437	0.44
438	0.49
439	0.51
440	0.56

R8BL61

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer