Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R8BW01

Protein Details
Accession R8BW01    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-34LSTQRRSAPRGRRTTRRASGKPHydrophilic
198-225KAAPAGKGPNKKQRKPRSARPAKKTAEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-63RSAPRGRRTTRRASGKPATTAPVGGVQKTSKPARGNATKPAPAKAG
195-221GNTKAAPAGKGPNKKQRKPRSARPAKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG tmn:UCRPA7_922  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSGKLDQSLDEILSTQRRSAPRGRRTTRRASGKPATTAPVGGVQKTSKPARGNATKPAPAKAGKATGESKVIVSNLPKDVSEGQIKHFEGTRGIVTILRGSDYFQQAVGQVKRVELSYGPGGVSKGTASVIFHHANGASLAFQKLNGLLIDNRPVKVEIVVANADLLPAPKTLSQRITQPKAQPKSAAADKHTGGNTKAAPAGKGPNKKQRKPRSARPAKKTAEELDSEMADYFVAGNANGENANGAAPAAAAAANGDAPMEDEIM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.25
4 0.28
5 0.33
6 0.42
7 0.49
8 0.53
9 0.63
10 0.69
11 0.74
12 0.79
13 0.84
14 0.84
15 0.85
16 0.8
17 0.78
18 0.79
19 0.74
20 0.71
21 0.63
22 0.57
23 0.47
24 0.42
25 0.34
26 0.32
27 0.27
28 0.23
29 0.23
30 0.21
31 0.23
32 0.29
33 0.31
34 0.3
35 0.32
36 0.36
37 0.43
38 0.5
39 0.51
40 0.53
41 0.57
42 0.58
43 0.56
44 0.54
45 0.49
46 0.42
47 0.41
48 0.36
49 0.34
50 0.29
51 0.32
52 0.31
53 0.29
54 0.29
55 0.27
56 0.23
57 0.19
58 0.18
59 0.16
60 0.15
61 0.17
62 0.17
63 0.17
64 0.17
65 0.17
66 0.18
67 0.2
68 0.24
69 0.22
70 0.22
71 0.27
72 0.28
73 0.26
74 0.27
75 0.24
76 0.19
77 0.2
78 0.17
79 0.12
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.13
89 0.14
90 0.14
91 0.12
92 0.12
93 0.13
94 0.19
95 0.18
96 0.17
97 0.16
98 0.16
99 0.17
100 0.16
101 0.16
102 0.1
103 0.12
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.09
110 0.09
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.07
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.09
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.08
137 0.15
138 0.16
139 0.16
140 0.16
141 0.17
142 0.16
143 0.15
144 0.16
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.07
153 0.07
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.09
158 0.11
159 0.15
160 0.18
161 0.19
162 0.27
163 0.35
164 0.4
165 0.42
166 0.48
167 0.55
168 0.56
169 0.57
170 0.5
171 0.43
172 0.45
173 0.46
174 0.42
175 0.35
176 0.35
177 0.33
178 0.36
179 0.36
180 0.31
181 0.26
182 0.26
183 0.24
184 0.21
185 0.24
186 0.19
187 0.18
188 0.19
189 0.27
190 0.3
191 0.38
192 0.44
193 0.52
194 0.61
195 0.69
196 0.77
197 0.8
198 0.84
199 0.84
200 0.87
201 0.88
202 0.89
203 0.92
204 0.9
205 0.89
206 0.82
207 0.78
208 0.73
209 0.66
210 0.59
211 0.51
212 0.45
213 0.37
214 0.33
215 0.28
216 0.23
217 0.18
218 0.13
219 0.1
220 0.08
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.04
246 0.06