Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R8BDA4

Protein Details
Accession R8BDA4    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
191-220EGDRTTTEPEKKKKKKRSGPKQPNPLAVKKBasic
242-269ETQSSDAPAKRKRKRKHKSHETGDTQAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
200-242EKKKKKKRSGPKQPNPLAVKKAKKKPAESQTGQKPKKAEIPAE
245-259SSDAPAKRKRKRKHK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto 10, mito_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG tmn:UCRPA7_7193  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MKQYAIHFGFREPYQCLLDADMIRDASRFVMDLVPALERTLHGQVKPMVTQCTMRHLYARNKEPGMDKVIDHAKTFERRRCGHHPDQFPEPQSTMDCLRSVVGTESNKHRYVVATQDHDVRRMFRQVPGVPLIYIERSIMLLEPMAGATSRVAAKEEREKFRGGITKVGAGVKRKREEEEENQSSADDDNEGDRTTTEPEKKKKKKRSGPKQPNPLAVKKAKKKPAESQTGQKPKKAEIPAETQSSDAPAKRKRKRKHKSHETGDTQAEAQQEAVSAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.28
3 0.26
4 0.23
5 0.28
6 0.25
7 0.24
8 0.23
9 0.21
10 0.2
11 0.19
12 0.17
13 0.12
14 0.12
15 0.1
16 0.09
17 0.1
18 0.1
19 0.11
20 0.12
21 0.12
22 0.12
23 0.12
24 0.11
25 0.09
26 0.13
27 0.19
28 0.21
29 0.2
30 0.24
31 0.28
32 0.31
33 0.33
34 0.32
35 0.28
36 0.27
37 0.32
38 0.28
39 0.33
40 0.33
41 0.31
42 0.32
43 0.37
44 0.45
45 0.48
46 0.55
47 0.52
48 0.5
49 0.52
50 0.51
51 0.47
52 0.43
53 0.36
54 0.29
55 0.28
56 0.34
57 0.32
58 0.29
59 0.28
60 0.27
61 0.34
62 0.41
63 0.41
64 0.42
65 0.44
66 0.51
67 0.58
68 0.62
69 0.63
70 0.65
71 0.67
72 0.63
73 0.67
74 0.64
75 0.57
76 0.51
77 0.41
78 0.34
79 0.27
80 0.25
81 0.21
82 0.19
83 0.16
84 0.14
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.11
89 0.13
90 0.13
91 0.16
92 0.23
93 0.27
94 0.28
95 0.27
96 0.27
97 0.23
98 0.24
99 0.27
100 0.26
101 0.24
102 0.24
103 0.31
104 0.31
105 0.32
106 0.31
107 0.26
108 0.23
109 0.25
110 0.25
111 0.2
112 0.26
113 0.25
114 0.27
115 0.27
116 0.26
117 0.2
118 0.2
119 0.18
120 0.12
121 0.11
122 0.08
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.07
140 0.07
141 0.1
142 0.19
143 0.26
144 0.29
145 0.31
146 0.32
147 0.31
148 0.35
149 0.39
150 0.31
151 0.29
152 0.25
153 0.25
154 0.25
155 0.27
156 0.25
157 0.25
158 0.3
159 0.33
160 0.36
161 0.36
162 0.38
163 0.41
164 0.45
165 0.48
166 0.52
167 0.48
168 0.45
169 0.43
170 0.4
171 0.35
172 0.28
173 0.2
174 0.1
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.12
183 0.17
184 0.24
185 0.31
186 0.4
187 0.52
188 0.62
189 0.72
190 0.79
191 0.84
192 0.88
193 0.91
194 0.93
195 0.93
196 0.95
197 0.94
198 0.94
199 0.9
200 0.88
201 0.83
202 0.77
203 0.74
204 0.71
205 0.7
206 0.69
207 0.72
208 0.72
209 0.74
210 0.75
211 0.77
212 0.78
213 0.78
214 0.74
215 0.74
216 0.76
217 0.79
218 0.75
219 0.68
220 0.6
221 0.54
222 0.57
223 0.53
224 0.48
225 0.42
226 0.48
227 0.5
228 0.52
229 0.48
230 0.4
231 0.34
232 0.32
233 0.3
234 0.26
235 0.29
236 0.33
237 0.44
238 0.53
239 0.63
240 0.7
241 0.78
242 0.86
243 0.9
244 0.92
245 0.93
246 0.94
247 0.95
248 0.95
249 0.91
250 0.86
251 0.78
252 0.69
253 0.58
254 0.49
255 0.39
256 0.29
257 0.22
258 0.15